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What are the Evolutionary Origins of Mitochondria? A Complex Network Approach.

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Academic year: 2017

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Fig 1. Network distance δ ( σ , σ + Δσ ) (see eq (1) in Materials and Methods section) between two networks, constructed from the same similarity matrix S at nearby values of σ , as a function of σ for ATP synthase subunits 9 and c
Fig 2. Community structure revealed by the color representation of the neighborhood matrices (NM) of two networks based on the dataset for ATP synthase subunits 9 and c at the values of σ corresponding to two high peaks in Fig 1
Fig 3. Standard network representation for ATP synthase subunits 9 and c network at σ = σ max = 56% (using GePhi package [34])
Fig 4. Dendrogram obtained during the NG community finding algorithm (NGA), based on the successive elimination of links with highest value of betweenness centrality (as defined in the Network Analysis subsection within the Materials and Methods section) f
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