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Pesquisa de reações
Neste caso, o objetivo é encontrar informações sobre a clivagem oxidativa de ligações C-C (como as que ocorrem em estireno) em ácidos carboxílicos utilizando reagentes/catalisadores que contêm prata.
Mostramos exemplos neste fluxo de trabalho que incluem:
Como criar uma consulta de reação
Como mapear átomos entre materiais de partida e produtos
Como alterar os padrões de ligação
Como pesquisar por reações “Como subestrutura”
Como limitar os resultados iniciais para que contenham apenas os que tenham reagentes/catalisadores específicos
Crie uma consulta de estrutura
1. Na página inicial da ferramenta Reaxys, clique na caixa Create Structure or Reaction Drawing para abrir o editor de estruturas (Marvin JS da ChemAxon).
2. Desenhe um sistema aromático.
a. Selecione a ferramenta Benzene.
b. Crie dois anéis de benzeno como mostrado.
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3. Selecione a ferramenta Single Bond.
a. Adicione as ligações como mostrado.
4. Defina duas ligações duplas:
a. Com a ferramenta Single bond ainda selecionada, clique nas duas ligações como mostrado.
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5. Altere os átomos conforme necessário:
a. Clique em “O” na barra de ferramentas de átomos e clique no átomo “CH2”.
b. Clique no átomo “H3C”.
6. Crie uma reação:
a. Desenhe a seta usando a ferramenta de seta reta/reação.
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7. Mapeamento de átomos
a. Usando a mesma ferramenta de seta reta/reação, desenhe uma seta entre o átomo de carbono no reagente e o átomo de carbono análogo no produto.
Isto mapeará os dois átomos (como procedimento alternativo, clique com o botão direito do mouse no átomo de carbono no reagente e adicione o número 1 no campo Map da caixa de diálogo de propriedades Atom. Faça o mesmo para o átomo de carbono análogo no produto).
Esta é a aparência da consulta final:
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8. No painel Search this structure as:, há três opções:
• As drawn: Reaxys encontrará os resultados para a consulta como desenhada.
• As substructure: Reaxys oferece duas subopções:
• On all atoms substituirá qualquer átomo de hidrogênio explícito ou implícito por qualquer outro átomo ou grupo.
• On heteroatoms fará o mesmo, mas apenas nos heteroátomos.
• Similar: Reaxys encontrará resultados de uma pesquisa de similaridade com base na consulta desenhada.
a. Uma vez que esta é uma pesquisa de subestrutura e queremos substituições em todos os átomos, clique em As substructure + On all atoms.
9. Clique em Transfer to query e clique em Search.
A janela de visualização dos resultados será exibida. Cada opção de resultado tem um recurso Preview Results que apresenta os 3 principais resultados para a consulta. Você pode verificar os resultados da sua consulta antes de prosseguir para o conjunto de resultados completo.
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10. Clique em View Results para ver o conjunto de resultados.
Várias centenas de reações, como estas, são exibidas:
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Analise os resultados
Use o painel Filters and Analysis para visualizar informações sobre as substâncias envolvidas nas reações. Por exemplo: Vamos supor que o objetivo é determinar quais reações usam reagentes/catalisadores que contêm prata.
1. As substâncias são classificadas nos papéis que desempenham nas reações químicas e, na ferramenta Reaxys, os reagentes/catalisadores são geralmente agrupados sob o cabeçalho Catalysts Classes. A lista apresentada no painel do filtro é o primeiro nível de uma taxonomia organizada hierarquicamente.
a. Recolha os filtros Yield, Reagent/Catalyst e Solvent.
b. Expanda a taxonomia Catalyst Classes.
c. Clique em + More para visualizar os ramos da taxonomia das Catalyst Classes.
d. Clique no texto active center.
e. Marque a caixa Ag. Isto limitará o conjunto de resultados a 11 reações.
i. Óxido de prata, nitrato de prata e acetato de prata.
f. Clique em Apply.
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Os resultados são agora filtrados para mostrar apenas as reações de substâncias que utilizam reagentes/catalisadores que contêm prata.