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Application of QM and MM methodologies to cytochrome c3: charge parametrization of the heme group for classic force fields

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Academic year: 2021

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Figure 1.1: Most common heme groups found in proteins from anaerobes. Taken from [4].
Figure 1.2: Reduction potential range covered by heme proteins. Taken from [4].
Figure 1.3: Dv H-TpI-c 3 and respective heme structure. (a) Dv H-TpI-c 3 secondary structure with highlighted heme numbers
Figure 1.4: Oxidation states for Dv H-TpI-c 3 at pH 6.5. (a) Populations of the different oxidation stages versus solution potential (Roman numerals number of hemes oxidized)
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