Uma resposta para
O sequenciamento do exoma:
uma abordagem global do diagnóstico genético
Fluxograma do Diagnóstico das Doenças Genéticas
Suspeita de doença genética caracterizada por:
NIMGenetics oferece três possibilidades de análise dos resultados do sequenciamento.
Mutações associadas a um
fenótipo inespecífico e/ou de
alta heterogeneidade genética
Avaliação clínica
Histórico familiar, antecedentes pessoais, sinais, sintomas e exames complementares.
Aneuploidias, duplicações ou
deleções de uma região genômica Número limitado de mutações frequentes em um gene
Existem mais de 8.000 doenças mendelianas com alta heterogeneidade genética e/ou fenotípica. Isso dificulta a priorização dos genes a serem estudados, sendo necessária a análise simultânea de todas as mutações associadas às doenças ou deficiências de um indivíduo.
Nos éxons de um indivíduo estão localizadas as variações no
DNA responsáveis por 85% das doenças genéticas
1,2.
A identificação dos genes causais permite:
• Direcionar os exames diagnósticos e as medidas terapêuticas.
• Estabelecer um prognóstico.
• Proporcionar o aconselhamento genético ao paciente e seus familiares.
As informações genéticas do nosso organismo estão contidas em 19.000 genes, que constituem nosso genoma. Os éxons são as regiões dos genes que contêm as informações necessárias para produzir as proteínas, elementos fundamentais para que os organismos vivos se desenvolvam normalmente. O exoma é o conjunto de todos os éxons do genoma.
Cariótipo
MLPA aCGH Sanger
O sequenciamento do exoma permite a
análise simultânea de dezenas a milhares
de genes, de maneira rápida e econômica.
A genética médica está evoluindo dos painéis de genes para o sequenciamento do exoma devido ao seu potencial diagnóstico. O sucesso desta tecnologia está na sua flexibilidade e na sua capacidade de adaptação às necessidades do paciente. A partir do sequenciamento do exoma, podemos selecionar os genes que serão analisados (modelos personalizados) e estudar diferentes fenótipos simultânea ou sequencialmente (reanálise)3-5.……..a partir do sequenciamento de 19.000 genes,
uma análise que se adapta ao diagnóstico genético do seu paciente.
NIM
Genetics possui uma equipe multidisciplinar com experiência comprovada
•
relatório clínico de fácil interpretação
•
assessoria genética ao especialista
•
consulta e aconselhamento genético
Algoritmo de análise
• Comparação das variantes identificadas com os bancos de dados, permitindo selecionar as informações genéticas relevantes.
•Prognóstico de patogenicidade com algoritmos bioinformáticos.
• Revisão dos bancos de dados de mutações e publicações científicas.
• Categorização das variantes, de acordo com os critérios do ACMG*.
•Integração das informações clínicas.
• Determinação da associação entre o fenótipo e o genótipo.
• Definição do padrão de herança da variante.
* American College of Medical Genetics
Banco de Dados próprio
>1.000 exomas
Análise orientada
clinicamente
Validação por Sanger das variantes patogênicas Sequenciamento e análise bioinformática Identificação e anotação de variantes Seleção de variantes Priorização e Categorização Interpretação Clínica
• Recomendações clínicas em relação ao manejo do paciente, exames complementares e estudos de segregação familial.
• Resultados interpretados no contexto clínico, com informações relevantes obtidas nos bancos de dados e literatura científica.
• Reclassificação das variantes em função de novas evidências.
• Interpretação de variantes de acordo com as recomendações do ACMG.
• Validação de variantes patogênicas e provavelmente patogênicas pelo método de Sanger.
• Inclui informações relativas à qualidade do sequenciamento e às coberturas dos genes estudados.
• NIMGenetics indica e realiza os estudos de segregação necessários para definir a etiologia da variante e facilitar o aconselhamento genético.
dirigido
O que é?
• Exoma: sequenciamento simultâneo dos 19.000 genes do paciente.
• Dirigido: aos genes selecionados por sua associação com o fenótipo do paciente.
A serviço do diagnóstico
genético
O exoma é uma ferramenta
dinâmica
•
Os modelos de Exo
NIM
® Dirigido são atualizados
periodicamente, com base na literatura recente.
• NIM
Genetics oferece assessoria para a escolha do
desenho de Exo
NIM
® Dirigido mais adequado para o
seu paciente.
Neurologia
Pediatria
Dermatologia
Cardiologia
Imunologia
Otorrinolaringologia
Gastroenterologia
Hematologia
Endocrinologia
Nefrologia
Uma abordagem
multidisciplinar
ExoNIM® Dirigido: trabalhamos com você onde for necessário
Indicações
Síndromes com uma apresentação clínica característica e elevada heterogeneidade genética.
Vantagens
• Reanálise da sequência em caso de: 1) surgimento de novos sintomas, 2) redefinição do fenótipo e 3) inclusão de novos genes envolvidos na patologia em estudo.
• Em patologias com sobreposição do fenótipo, podem ser combinados diferentes exomas dirigidos disponíveis.
• Exomas personalizados e adaptados a cada paciente.
• Ampliação para ExoNIM® Clínico e ExoNIM® Trio sem necessidade de sequenciar novamente a amostra do paciente.
Neurologia
Gastroenterologia, endocrinologia e nefrologia
Colestase intra-hepática VP110
Déficit combinado de Hormônios Hipofisários e Hipotireoidismo VP74
Diabetes neonatal VP86
Diabetes congênita ou crônica de início precoce VP85 Erros inatos do metabolismo com hiperamonemia VP76
Febre recorrente VP80
Hipercolesterolemia familial VP94 Neuroacantocitose, Doença de Wilson e Doença por depósito de ferro VP78
Pancreatite Crônica VP47
Pseudo-hipoaldosteronismo VP100
Síndrome de Alport VP109
Síndrome de Bartter e patologias associadas a transtornos hidroeletrolíticos VP81 Síndrome Tricho-Hepato-Entérica VP18 Ortopedia, cardiologia, dermatologia e imunologia
Alterações genéticas da aorta (Aneurismas e Dissecções) VP75
Síndrome de Coffin-Lowry VP65
Doenças do tecido conjuntivo VP103
Cútis laxa VP99 Displasias Ectodérmicas VP68 Displasias Ósseas VP37 Hipermobilidade Articular VP33 Ictiose congênita VP24 Osteogênese imperfeita VP66 Osteopetrose VP107 Síndrome de Hiperimunoglobulinemia E VP52 Telangiectasia Hemorrágica Hereditária VP46
Polineuropatías hereditarias
Polineuropatias hereditárias VP32
Charcot-Marie Tooth e neuropatias hereditárias sensitivo-motoras
relacionadas VP3
Neuropatia Distal Hereditária VP11
Alterações de marcha
Ataxia espinocerebelar VP2
Ataxias VP36
Coreoatetose VP73
Distonias VP57
Hemiplegia alternante da infância VP97 Enxaqueca hemiplégica familiar VP101 Paraplegia Espástica Hereditária VP26
Doença de Parkinson VP58
Leucodistrofias
Angioma Cavernoso Familial VP35
Atrofia Muscular Espinal VP82
Doenças peroxissomais e lisossomais VP63
Doença de Fahr VP62
Doenças por transtorno do metabolismo do glicogênio VP105
Leucodistrofias VP27 Lipofuscinose Cerebral VP72 Síndrome de Aicardi-Gutieres VP1 Síndrome de Joubert VP22 Morfogênese Cerebral VP17 Hematologia Amiloidose VP64
Eritroblastopenia congênita de Blackfan-Diamond VP43 Neutropenia congênita sindrômica e não sindrômica VP42
Síndrome hemolítica urêmica VP14
Otorrinolaringologia
Discinesia Ciliar Primária VP25
Hipoacusias Familiais VP9
Síndrome do aqueduto vestibular alargado VP84
Surdez autossômica recessiva VP19
Síndromes poliformativas com ou sem deficiência intelectual
Artrogripose VP56 Cardiopatias congênitas VP102 Craniossinostose VP6 Disostose facial VP69 Doença de Hirschsprung VP51 Esclerose Tuberosa VP8
Fissura palatina e lábio leporino VP93 Microcefalia Primária Hereditária e Síndrome de Meier-Gorlin VP41
Rasopatias VP12
Síndrome de Bardet-Biedl VP95
Síndrome de Coffin-Siris VP59
Síndrome de Cornelia de Lange VP5
Síndrome de Donnai-Barrow VP40
Síndrome Kabuki VP23
Síndrome de Robinow VP67
Síndrome de Rubinstein-Taybi VP60
Supercrescimento e macrocefalia VP96
Miopatias e Doenças neuromusculares
Canalopatias Neuromusculares VP21
Distrofia Muscular de Cinturas (LGMD) VP39
Distrofias musculares VP61
Distrofinopatias VP55
Distroglicanopatias VP71
Esclerose lateral amiotrófica e síndromes incluídas no Diagnóstico diferencial VP48
Miastenia congênita VP70
Miopatia congênita centronuclear VP31
Miopatias VP50
Transtornos Hereditários do Colágeno VI VP20 Demências
Alzheimer de início precoce VP28
Demência Frontotemporal VP91
Transtornos do neurodesenvolvimento
Autismo VP83
Deficiência Intelectual VP7
Deficiência Intelectual Ligada ao cromossomo X VP79 Síndrome de Angelman e síndromes incluídas no diagnóstico diferencial VP98 Doenças Mitocondriais
Alterações mitocondriais secundárias a mutações do DNA nuclear VP10
clinico
O que é?
• Exoma: sequenciamento simultâneo dos 19.000 genes do paciente.
• Clínico: análise dirigida de mais de 5.700 genes OMIM7.
Indicações
Síndromes difíceis de diagnosticar clinicamente e caracterizadas por:
• Alta heterogeneidade genética
• Alta variabilidade fenotípica ou fenótipos complexos
Vantagens
• Análise de todos os genes associados a doenças mendelianas.
• Possibilidade de ampliação para ExoNIM® Trio.
• Minimiza a identificação de achados incidentais ou a identificação de variantes nos genes sem um fenótipo clínico associado.
O que é?
• Exoma: sequenciamento simultâneo dos 19.000 genes do paciente.
• Trio: Através das informações genéticas dos progenitores, são selecionadas as variantes responsáveis pelo fenótipo do paciente, contemplando tanto a apresentação clínica como o padrão de herança.
Indicações
• Síndromes com alta heterogeneidade genética e/ou fenotípica.
• Diagnóstico diferencial de síndromes que compartilham manifestações clínicas ou de doenças raras.
• Primeira escolha em casos de TEA e Transtorno do Neuro Desenvolvimento após array-CGH negativo.
• Ampliação do ExoNIM Dirigido/Clínico negativo.
Vantagens
• Permite identificar novos genes não incluídos inicialmente no diagnóstico diferencial.
• Máxima rentabilidade diagnóstica, superior a 40%.
• Permite definir o padrão de herança das variantes.
• Acelera o processo diagnóstico e evita exames desnecessários.
Abrindo portas
para o diagnóstico
de amplo espectro
Uma análise
Por que NIM
Genetics
• A qualidade do ExoNIM® está certificada (Thermo® Certified Service Provider).
• Os relatórios da NIMGenetcs foram qualificados como excelentes por líderes de opinião em Neurologia, Genética Clínica e outras especialidades.
• Empresa liderada por uma equipe multidisciplinar altamente qualificada, que serve de apoio para o especialista, oferecendo-lhe assessoria pré e pós-teste.
• Membros credenciados pela Asociación Española de Genética Humana (AEGH) e participação ativa na European Molecular Quality Network (EMQN).
• Soluções integrais. NIMGenetcs conta com uma ampla oferta de testes de genética molecular para cobrir as necessidades de cada paciente.
PEDIDO DE ExoNIM®
CONDIÇÕES E ENVIO DA AMOSTRA Sangue periférico: 2 tubos de 5mL de EDTA. Para outras amostras, consulte a Diretoria Técnica. Documentação necessária:
1. Envio da solicitação médica. 2. Consentimento informado. 3. Relatório clínico do paciente.
Bibliografia:
1. Choi M et al. (2009). Proc Natl Acad Sci U S A 106(45):19096-101. 2. Pussegoda KA (2010). Clin Genet 78(1):32-33.
3. Lee H et al. (2014). JAMA 312(18): 1880–87.
4. Van Nimwegen KJ et al. (2015). Eur J Paediatr Neurol 19(2):233-39. 5. Monroe GR et al. (2016). Genet Med [Epub ahead of print]. 6. Richards S et al. (2015). Genet Med 17(5):405-24.
MADRID
Parque Científico de Madrid Faraday, 7 (Campus de Cantoblanco) 28049 Madrid Tel.+34 91 804 77 60 M. +34 672 060 393
BRASIL
Rua Elvira Ferraz, nº250, Cj. 211. Itaim - São Paulo, SP. CEP: 04552-040 Tel. +55 11 3044 1813
MÉXICO
Guanajuato 92, Of. 601, Col. Roma Norte 06700 Ciudad de México Tel. +52 55 68232076
