UNIVERSIDADE FEDERAL DE SANTA CATARINA CENTRO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS (CCB)
Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia (MIP) Campus Trindade - CEP 88040-900 -Florianópolis SC
Tel: 48 3721-9353
PLANO DE ENSINO 2020.1
1I. IDENTIFICAÇÃO DA DISCIPLINA:
CÓDIGO NOME DA DISCIPLINA HORAS-AULA SEMANAIS HORAS-AULA
SEMESTRAIS TEÓRICAS PRÁTICAS
MIP5121 Ecologia Microbiana 2 1 54 horas
II. PROFESSOR(ES) MINISTRANTE(S) Prof. Rubens Tadeu Delgado Duarte Prof. Márcio J. Rossi
Prof. Cláudio R. F. S. Soares
MSc. Marianne G. Kreusch (estágio de docência PPGBTC)
[email protected] [email protected] [email protected] [email protected]
III. PRÉ-REQUISITO(S) (Código(s) e nome da(s) disciplina(s) MIP5131 MIP5117 MIP7013 Microbiologia Ambiental; OU Microbiologia Agrícola; OU Microbiologia Geral EQUIVALÊNCIA
Não há disciplinas equivalentes.
IV. CURSO(S) PARA O(S) QUAL(IS) A DISCIPLINA É OFERECIDA
(108) Ciências Biológicas – Licenciatura e Bacharelado (diurno). Disciplina Optativa. (110) Ciências Biológicas – Licenciatura (noturno). Disciplina Optativa.
(211) Engenharia Sanitária e Ambiental. Disciplina Optativa. (501) Agronomia. Disciplina Optativa.
V. EMENTA
Parâmetros ecológicos: determinantes ambientais, número, biomassa e atividade. Habitats e comunidades. Interações microbianas. Controle biológico. Atividade dos micro-organismos nos ciclos biogeoquímicos, no controle dos processos de biofermentação, no solo, água e tratamento de resíduos. Micro-organismos e poluição. Utilização dos micro-organismos na exploração mineral, produção de biomassa e energia.
VI. OBJETIVOS
Demonstrar aos alunos a importância da microbiologia no contexto ecológico e ambiental, de modo que sejam capazes de: -Descrever a estrutura de comunidade microbiana;
-Compreender os fatores ecológicos e determinantes ambientais;
-Compreender as interações microbianas e o papel dos microorganismos nos ciclos dos elementos; -Estudar as técnicas de avaliação da diversidade microbiana em amostras ambientais;
-Pesquisar temas atuais e relevantes na área ambiental, visando melhorar além do seu conhecimento a sua oralidade;
-Compreender o papel dos micro-organismos na biotecnologia ambiental: tratamento de efluentes, resíduos sólidos e biorremediação.
-Realizar trabalhos em grupo melhorando sua convivência com os colegas e sua aprendizagem;
-Participar ativamente das aulas teóricas e práticas assumindo uma postura de responsabilidade frente aos conteúdos estudados. VII. CONTEÚDO PROGRAMÁTICO
Conteúdo Teórico:
1. Introdução à Ecologia Microbiana. 2. Definição de espécie em microbiologia.
3. Métodos de cultivo no estudo da Ecologia Microbiana.
4. Métodos independentes de cultivo no estudo da Ecologia Microbiana. 5. Efeito dos fatores ambientais nos micro-organismos.
1 Plano de ensino adaptado, em caráter excepcional e transitório, para substituição de aulas presenciais por aulas em meios digitais, enquanto durar a pandemia do novo coronavírus – COVID-19, em atenção à Portaria MEC 344, de 16 de junho de 2020 e à Resolução 140/2020/CUn, de 24 de julho de 2020.
6. Ciclos Biogeoquímicos.
7. Interações micro-organismo x micro-organismo. 8. Interações micro-organismo x plantas/animais. 9. Populações e comunidades microbianas 10. Índices de diversidade.
11. Ecologia microbiana aplicada. Conteúdo Prático:
1. Preparo das Colunas de Winogradsky. 2. Contagem de células viáveis.
3. Seleção dos isolados.
4. Contagem de micro-organismos esporulantes. 5. Contagem de micro-organismos celulolíficos.
6. Contagem de micro-organismos solubilizadores de fosfato. 7. Contagem de micro-organismos fotossintetizantes
8. Ensaio de respiração do solo. 9. Biodegradação de xenobióticos.
VIII. METODOLOGIA DE ENSINO / DESENVOLVIMENTO DO PROGRAMA
A metodologia de ensino consistirá em aulas teóricas síncronas e assíncronas, bem como de aulas práticas presenciais que serão realizadas apenas na ocasião do retorno de atividades presenciais.
a) Conteúdo teórico
Aulas assíncronas: As aulas assíncronas serão realizadas por meio de vídeo-aulas, podcasts, vídeos da internet, leitura de bibliografia na forma digital, e outros recursos disponíveis para serem utilizados remotamente. As vídeo-aulas serão gravadas e disponibilizadas na internet com acesso privado e restrito aos alunos da disciplina. Apenas o conteúdo das vídeo-aulas, bem como das leituras bibliográficas, vídeos da internet, podcasts e outros utilizados nas aulas assíncronas serão cobrados nas avaliações.
Aulas síncronas: As aulas síncronas tem por objetivo desenvolver a interação docente-discente, sendo assim elas serão realizadas com a presença de um ou mais professores, ou ainda com a presença dos alunos que realizarem estágio de docência. As aulas síncronas tem como objetivo a discussão dos assuntos passados em aulas assíncronas e na bibliografia, bem como a solução de dúvidas dos alunos. Nenhum conteúdo novo será passado nas aulas síncronas. A presença dos alunos nas aulas síncronas não será obrigatória. As aulas síncronas só serão gravadas e/ou publicadas a pedido dos alunos e com anuência dos professores.
b) Conteúdo prático
As aulas práticas serão realizadas na ocasião de retorno das atividades presenciais. O conteúdo prático tem por objetivo o ensino de métodos de análise da ecologia microbiana, e para tal será realizado um estudo de caso: amostras ambientais serão coletadas e divididas em 3 grupos (amostra natural, amostra contaminada com esgoto doméstico, amostra contaminada com óleo diesel/gasolina). A turma será dividida em subgrupos para trabalhar com essas amostras, analisando o impacto das contaminações sobre a estrutura de comunidade microbiana e seus processos.
Neste momento, os alunos matriculados na disciplina receberão a menção “P” para realizar as aulas práticas após a pandemia de COVID-19. Alternativamente, outras formas de realização do conteúdo prático poderão ser aplicadas, desde que haja concordância entre todos os alunos e professores da disciplina.
c) Plataformas de ensino e sistema de comunicação
O Moodle será utilizado como plataforma centralizadora dos conteúdos da disciplina. Nele estarão disponíveis o plano de ensino, o cronograma, a bibliografia em formato digital, slides das aulas (quando for o caso), e os links para os outros conteúdos digitais como por exemplo as vídeo-aulas.
Os encontros síncronos serão realizados via plataforma de conferência a ser definida posteriormente (Zoom, Google Meeting, ConferênciaWeb, entre outros). A escolha da plataforma terá como base a estabilidade, facilidade de uso, possibilidade de compartilhar tela, entre outros recursos. A plataforma escolhida deverá ser de uso gratuito para os alunos.
d) Carga horária
Para fins de cômputo de carga horária, as atividades síncronas e assíncronas serão construídas com base nas recomendações da Secretaria de Educação à Distância (SEAD-UFSC), que considera: Leitura de texto (15 páginas = 5 horas), apresentação de slides (10 slides = 1 hora), assistir vídeo-aula (vídeo de 1 hora = 2 horas atividade), trabalhos e pesquisas complexas (2 horas), questionários simples (3 minutos por questão) e complexos (5 minutos por questão), e avaliação com questões múltipla escolha (10 questões = 1 hora).
e) Bibliografia
A bibliografia estará disponível em meio digital com link de acesso no Moodle.
f) Período de ambientação dos recursos tecnológicos a serem utilizados pelos discentes
A primeira semana de aula será utilizada para ambientação dos alunos e apresentação do plano de ensino ajustado. g) Controle de presença
A presença será registrada automaticamente no Moodle por meio do acesso aos links das aulas assíncronas. Em outras palavras, assim que o aluno acessar o link do conteúdo assíncrono (link da vídeo-aula), sua presença será registrada. Uma vez que não será obrigatória a participação do aluno nas atividades síncronas, essas não serão utilizadas no cômputo da frequência. IX. PRATICA PEDAGÓGICA COMO COMPONENTE CURRICULAR (PPCC)
A disciplina não contém PPCC.
X. METODOLOGIA DE AVALIAÇÃO
A metodologia avaliativa consistirá em 2 provas que serão realizadas de forma assíncrona (remota) e 1 relatório de aulas práticas.
As provas conterão questões objetivas e discursivas que irão contemplar um ou mais assuntos abordados nas aulas. Os conteúdos avaliados nas provas serão apenas aqueles apresentados nas aulas assíncronas.
O relatório de aulas práticas será preparado com base nos resultados obtidos nas aulas práticas, as quais serão oferecidas posteriormente (em ocasião de retorno de aulas presenciais). O relatório será elaborado em grupos de 3-5 alunos, a depender do número de alunos matriculados na disciplina. A substituição do relatório de aulas práticas por outro método avaliativo poderá ser realizada desde que haja concordância mútua entre alunos e professores.
XI. LEGISLAÇÃO
Não será permitido gravar, fotografar ou copiar as aulas disponibilizadas no Moodle. O uso não autorizado de material original retirado das aulas constitui contrafação – violação de direitos autorais – conforme a Lei nº 9.610/98 –Lei de Direitos Autorais.
XI. REFERÊNCIAS
As versões digitais da bibliografia estarão disponíveis no Moodle e foram obtidas por convênio da Biblioteca Universitária da UFSC ou disponibilizadas gratuitamente pela editora.
BIBLIOGRAFIA BÁSICA
MADIGAN, M.T.; MARTINKO, J. M.; BENDER, K.; BUCKLEY, D. H.; STAHL, D. A. Microbiologia de Brock. 14° Ed. Porto Alegre: Artmed, 2016, 960 p. ISBN 978-85-8271-298-6. (Biblioteca Central, versão digital disponível no Moodle)
PEPPER, I. L.; GERBA, C. P. Environmental Microbiology. San Diego: Elsevier Academic Press, 2004, 209 p. ISBN 0-12- 550656-2 (Biblioteca Central, versão digital disponível no Moodle).
MOREIRA, F. M. S.; SIQUEIRA, J. O. Microbiologia e Bioquímica do Solo. 2° Ed. Lavras: Editora UFLA, 2006, 730 p. ISBN 85-87692-33-X. (Versão digital disponível no Moodle).
BIBLIOGRAFIA COMPLEMENTAR
ATLAS, Ronald M.; BARTHA, Richard. Microbial ecology: fundamentals and applications. 3rd ed. Redwood: The Benjamin: Cummings Publishing, c1993. xii, 563p. ISBN 0805306536. Número de chamada: 576.8 A881m (Biblioteca Central, versão digital disponível no Moodle).
BARTON, Larry; NORTHUP, Diana E. Microbial ecology. Hoboken: John Wiley & Sons, c2011. xxv, 407 p. ISBN 9780470048177. Número de chamada: 576.8 B293m (Biblioteca Central, versão digital disponível no Moodle).
BERTRAND, J.-C., CAUMETTE, P., LEBARON, P., MATHERON, R., NORMAND, P., SIME-NGANDO, T. (Eds.) Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications. Springer Netherlands, 2015, 933 p. ISBN 978-94-017-9118-2. (Versão digital disponível no Moodle).
KIRCHMAN, D. L. Processes in Microbial Ecology. 1° Ed. Oxford: Oxford University Press, 2012, 312 p. (Biblioteca Central, versão digital disponível no Moodle).
VARMA, A.; BUSCOT, F. Microorganisms in Soils: Roles in Genesis and Functions. Berlin: Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2005. (Soil Biology, 1613-3382; 3). (Versão digital disponível no Moodle)
Aprovado ad referendum em 06/08/2020
_____________________________________ _____________________________________ Assinatura do professor responsável Assinatura Chefe de Departamento MIP/CCB
Ou Coordenação de Ensino MIP/CCB Assinado de forma digital por Aguinaldo Roberto Pinto:08387471836
DN: cn=Aguinaldo Roberto Pinto:08387471836, ou=UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina, o=ICPEdu Dados: 2020.08.07 09:30:48 -03'00'
Cronograma de Aulas Teóricas
Aula Data CH Conteúdo
1 09/03 2h
Introdução à Ecologia Microbiana (aula ministrada presencialmente) 2 16/03 2h
Aula presencial cancelada devido a restrições da UFSC (início pandemia COVID-19)
(início do calendário ajustado)
3 31/08 2h Definição de espécie em microbiologia (vídeo-aula)
Encontro virtual para apresentação do plano de ensino ajustado 4 07/09 2h
Feriado Independência do Brasil
5 14/09 2h Métodos de estudo da ecologia microbiana (vídeo-aula)
Encontro virtual para discussão da aula anterior (definição espécies) 6 21/09 2h Efeito dos fatores ambientais nos microrganismos (vídeo-aula)
Encontro virtual para discussão das aulas anteriores (métodos de estudo) 7 28/09 2h Ciclos biogeoquímicos sob a perspectiva da ecologia microbiana (vídeo-aula)
Encontro virtual para discussão da aula anterior (fatores ambientais) 8 05/10 2h Interações microrganismos x microrganismos (vídeo-aula)
Encontro virtual para discussão da aula anterior (ciclos biogeoquímicos) 9 12/10 2h
Feriado N.S. Aparecida
10 19/10 2h
Avaliação Teórica 1 (aulas assíncronas 3-7)
11 26/10 2h Interações microrganismos x plantas/animais (vídeo-aula).
Encontro virtual para discussão da aula anterior (interações microrganismos) 12 02/11 2h
Feriado Finados
13 09/11 2h Populações e comunidades microbianas (vídeo-aula)
Encontro virtual para discussão da aula anterior (interações plantas/animais) 14 16/11 2h Índices de diversidade (vídeo-aula)
Encontro virtual para discussão da aula anterior (populações e comunidades) 15 23/11 2h Microrganismos extremófilos (vídeo-aula)
Encontro virtual para discussão da aula anterior (índices de diversidade) 16 30/11 2h Ecologia microbiana aplicada: biorremediação (vídeo-aula)
Encontro virtual para discussão da aula anterior (extremófilos) 17 07/12 2h
Encontro virtual para discussão da aula anterior (biorremediação) 18 14/12 2h
Avaliação Teórica 2 (aulas assíncronas 11-17)
*Atividades assíncronas em azul *Atividades síncronas em vermelho Cronograma de Aulas Práticas
As aulas práticas da disciplina (equivalente a 18 horas aula) serão realizadas posteriormente, quando as atividades presenciais retornarem.
Nesta ocasião, a única aula prática realizada em 2020 “Preparo das Colunas de Winogradsky”, será novamente ministrada. Em outras palavras, todo o conteúdo prático da disciplina será ministrado integralmente no retorno das aulas presenciais.
