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sequências biológicas

Comparação paralela de sequências biológicas longas utilizando Unidades de Processamento Gráfico (GPUs)

Comparação paralela de sequências biológicas longas utilizando Unidades de Processamento Gráfico (GPUs)

... de sequências biológicas é uma operação muito importante na Bio- ...de sequências, es- tes métodos usualmente são preteridos por causa da complexidade quadrática de tempo e ...de sequências ...

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Algoritmos paralelos exatos e otimizações para alinhamento de sequências biológicas longas em plataformas de alto desempenho

Algoritmos paralelos exatos e otimizações para alinhamento de sequências biológicas longas em plataformas de alto desempenho

... de sequências biológicas é uma das operações mais importantes em Bi- oinformática, sendo executado milhares de vezes a cada dia ao redor do ...com sequências muito longas, tais como no es- copo do ...

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MASA-OpenCL: Comparação Paralela de Sequências Biológicas Longas em GPU

MASA-OpenCL: Comparação Paralela de Sequências Biológicas Longas em GPU

... de sequências biológicas é uma tarefa importante executada com frequência na análise genética de ...de sequências biológicas em pla- taformas heterogêneas de ...de sequências de DNA ...

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Comparação paralela exata de sequências biológicas em plataformas híbridas de alto desempenho

Comparação paralela exata de sequências biológicas em plataformas híbridas de alto desempenho

... de sequências biológicas utilizando diversas unidades de processa- mento, de diferentes arquiteturas, integradas utilizando políticas de alocação de tarefas e balanceamento de carga para diminuir o tempo de ...

88

Alinhamento primário e secundário de sequências biológicas em arquiteturas de alto desempenho

Alinhamento primário e secundário de sequências biológicas em arquiteturas de alto desempenho

... de sequências biológicas é um problema muito impor- tante em Biologia Molecular, pois permite que sejam detectadas similaridades e diferenças entre um conjunto de ...de sequências. As ...

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Estratégia paralela exata para o alinhamento múlltiplo de sequências biológicas utilizando Unidades de Processamento Gráfico (GPU)

Estratégia paralela exata para o alinhamento múlltiplo de sequências biológicas utilizando Unidades de Processamento Gráfico (GPU)

... Na nossa estrat´ egia de granularidade grossa, o limite de Carrillo-Lipman para se des- cartar c´ elulas ser´ a obtido atrav´ es da execu¸c˜ ao do programa MSA 2.0 (Se¸c˜ ao 2.5.4) e ´ e[r] ...

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Arquiteturas em FPGA para comparação de sequências biológicas em espaço linear

Arquiteturas em FPGA para comparação de sequências biológicas em espaço linear

... Nesta tese, foi feito um levantamento dos conceitos de biologia molecular relevantes para o entendimento do problema da comparação de seqüências biológicas. Este problema é muito intensivo em computação, em muitos ...

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Fickett-CUDAlign: Comparação Paralela de Sequências Ajustáveis

Fickett-CUDAlign: Comparação Paralela de Sequências Ajustáveis

... de sequências biológicas é uma operação importante na Bioinformática, que é realizada ...de sequências obtêm o resultado ótimo calculando uma ou mais matrizes de programação ...de sequências ...

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Caracterização genética e análise de polimorfismos da região promotora do gene da enzima esteraoil-coenzima a dessaturase em báfalas leiteiras

Caracterização genética e análise de polimorfismos da região promotora do gene da enzima esteraoil-coenzima a dessaturase em báfalas leiteiras

... Deve-se considerar, que a técnica GW monta a fita dupla de DNA a partir dos “primers” específicos (ALF I e ALF II) e esta síntese só termina quando a enzima Taq DNA polimerase encontra o sítio de terminação com o radical ...

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Diversidade molecular de Phakopsora pachyrhizi em genótipos de soja com diferentes genes de resistência a ferrugem

Diversidade molecular de Phakopsora pachyrhizi em genótipos de soja com diferentes genes de resistência a ferrugem

... 2,0 µL de DNA; 0,2 µL de Taq DNA Polimerase (Phoneutria); e água ultra pura autoclavada para completar o volume. As reações de PCR de colônia foram conduzidas com primers específicos e nas mesmas condições da primeira ...

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UNIVERSIDADE FEDERAL DE OURO PRETO INSTITUTO DE CIÊNCIAS EXATAS E BIOLÓGICAS DEPARTAMENTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS PROGRAMA DE PÓS

UNIVERSIDADE FEDERAL DE OURO PRETO INSTITUTO DE CIÊNCIAS EXATAS E BIOLÓGICAS DEPARTAMENTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS PROGRAMA DE PÓS

... Também foi demonstrado que, em T. cruzi, moléculas de RNA mensageiro, podem ser mantidas estáveis e não associadas aos polissomas, no citoplasma. (Goldenberg, 1985). Existem evidências que o controle da mobilização ...

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UNIVERSIDADE FEDERAL DE UBERLÂNDIA INSTITUTO DE CIENCIAS BIOMÉDICAS PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOLOGIA CELULAR E ESTRUTURAL APLICADAS FERNANDO VIEIRA RODRIGUES

UNIVERSIDADE FEDERAL DE UBERLÂNDIA INSTITUTO DE CIENCIAS BIOMÉDICAS PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOLOGIA CELULAR E ESTRUTURAL APLICADAS FERNANDO VIEIRA RODRIGUES

... A metodologia utilizada para a análise in silico dos peptídeos oriundos do terceiro ciclo do biopanning com maior reatividade ELISA, foi baseada na seleção de moléculas alvos por meio do BlastP do NCBI ...

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BRASÍLIA INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal Laboratório de Toxinologia

BRASÍLIA INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal Laboratório de Toxinologia

... Até o momento, 201 sequências peptídicas contendo pontes dissulfeto foram descritas para a peçonha de aranhas caranguejeiras (incluindo sequências preditas a partir da construção de[r] ...

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ELDON CARLOS QUERES GOMES DIVERSIDADE E BIOPROSPECÇÃO DE FUNGOS PRESENTES EM SOLOS ANTÁRTICOS

ELDON CARLOS QUERES GOMES DIVERSIDADE E BIOPROSPECÇÃO DE FUNGOS PRESENTES EM SOLOS ANTÁRTICOS

... As culturas purificadas foram cultivadas em YM por 7 a 15 dias e preservados em Castellani (Castellani, 1967). Para a criopreservação, os isolados foram cultivados em ágar YM por 7 a 15 dias, em seguida 15 fragmentos do ...

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Cálculo da distância de reversão e construção de árvores filogenéticas usando a ordem dos genes

Cálculo da distância de reversão e construção de árvores filogenéticas usando a ordem dos genes

... Heurísticas para explorar este espaço de busca no contexto da ordem dos genes não foram aplicadas, apesar disso para o caso quando são usadas sequências de caracteres (como sequências de[r] ...

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Ressurgência de comportamentos com diferentes níveis de dificuldade em contextos de extinção e variação

Ressurgência de comportamentos com diferentes níveis de dificuldade em contextos de extinção e variação

... Padrões temporais. Cançado e Lattal (2011) analisaram a ressurgência de padrões temporais da resposta de bicar um disco. Durante a Fase de Reforçamento, pombos foram expostos a um esquema de reforçamento múltiplo que ...

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MECANISMOS DE EXPRESSÃO GÊNICA EM EUCARIOTOS

MECANISMOS DE EXPRESSÃO GÊNICA EM EUCARIOTOS

... Essas sequências são importantes porque nelas encontramos sinais pelos quais é possível regular a expressão, uma vez que apresentam sequências específicas para interação de proteínas que fazem a transcrição ...

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planificação de 16 de novembro 1

planificação de 16 de novembro 1

... - Elaborar sequências de números segundo uma dada lei de formação e investigar regularidades em sequências e em tabelas de números; - Realizar cálculos através da percepção do con[r] ...

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Importância da variabilidade genética de Helicobacter pylori na construção de uma vacina de DNA

Importância da variabilidade genética de Helicobacter pylori na construção de uma vacina de DNA

... Em relação aos estudos efectuados para os genes alvo napA, hpaA, vacA e homB, observou-se que o principal mecanismo que está na origem de variabilidade genética depende do tipo de gene, sendo que para os genes napA e ...

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Investigação do processo de negociação interpessoal infantil em situação lúdica:...

Investigação do processo de negociação interpessoal infantil em situação lúdica:...

... Marcuschi (1998), nesse sentido, discorre sobre a organização de sequências na conversação, enfatizando as sequências mínimas, que se estendem por dois ou três turnos e pode[r] ...

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