ATG…Spe
Anexo 5 Alinhamento dos resultados de sequenciação
Figura VII.2 – Alinhamento da sequência codificante da AQP3 de Rattus norvegicus com os resultados da sequenciação do plasmídeo extraído das colónias 3.5 (equivalente 2.2) e e 3.7 (equivalente a 3.2). O múltiplo alinhamento das sequências foi realizado com a ferramenta ClustalW do software BioEdit versão 7.2.0.
10 20 30 40 50 60 70 80 90
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 2.2 CCCCATCCATACTCTAGAACTAGTCCTATGGGTCGACAGAAGGAGTTGATGAACCGTTGCGGGGAGATGCTCCACATCCGCTACCGGCTG
3.2 CCCCATCCATACTCTAGAACTAGTCCTATGGGTCGACAGAAGGAGTTGATGAACCGTTGCGGGGAGATGCTCCACATCCGCTACCGGCTG
rAQP3 cds ---ATGGGTCGACAGAAGGAGTTGATGAACCGTTGCGGGGAGATGCTCCACATCCGCTACCGGCTG
Clustal Consensus ***************************************************************
100 110 120 130 140 150 160 170 180
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 2.2 CTTCGCCAGGCTCTGGCGGAGTGCCTGGGGACCCTCATCCTTGTGATGTTCGGCTGTGGTTCCGTGGCTCAAGTGGTGCTCAGCCGAGGG
3.2 CTTCGCCAGGCTCTGGCGGAGTGCCTGGGGACCCTCATCCTTGTGATGTTCGGCTGTGGTTCCGTGGCTCAAGTGGTGCTCAGCCGAGGG
rAQP3 cds CTTCGCCAGGCTCTGGCGGAGTGCCTGGGGACCCTCATCCTTGTGATGTTCGGCTGTGGTTCCGTGGCTCAAGTGGTGCTCAGCCGAGGG
Clustal Consensus ******************************************************************************************
190 200 210 220 230 240 250 260 270
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 2.2 ACCCATGGTGGCTTCCTCACCATCAACTTGGCTTTTGGCTTCGCTGTCACCCTTGCCATCTTGGTGGCTGGCCAAGTGTCTGGAGCCCAC
3.2 ACCCATGGTGGCTTCCTCACCATCAACTTGGCTTTTGGCTTCGCTGTCACCCTTGCCATCTTGGTGGCTGGCCAAGTGTCTGGAGCCCAC
rAQP3 cds ACCCATGGTGGCTTCCTCACCATCAACTTGGCTTTTGGCTTCGCTGTCACCCTTGCCATCTTGGTGGCTGGCCAAGTGTCTGGAGCCCAC
Clustal Consensus ******************************************************************************************
280 290 300 310 320 330 340 350 360
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 2.2 TTGAACCCTGCTGTGACCTTTGCAATGTGCTTCCTGGCACGAGAGCCCTGGATCAAGCTGCCCATCTACACACTGGCACAGACCCTCGGG
3.2 TTGAACCCTGCTGTGACCTTTGCAATGTGCTTCCTGGCACGAGAGCCCTGGATCAAGCTGCCCATCTACACACTGGCACAGACCCTCGGG
rAQP3 cds TTGAACCCTGCTGTGACCTTTGCAATGTGCTTCCTGGCACGAGAGCCCTGGATCAAGCTGCCCATCTACACACTGGCACAGACCCTCGGG
Clustal Consensus ******************************************************************************************
370 380 390 400 410 420 430 440 450
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 2.2 GCCTTCTTGGGTGCTGGGATTGTTTTTGGGCTCTACTATGATGCAATCTGGGCCTTTGCTGGCAATGAGCTTGTTGTCTCCGGCCCCAAT
3.2 GCCTTCTTGGGTGCTGGGATTGTTTTTGGGCTCTACTATGATGCAATCTGGGCCTTTGCTGGCAATGAGCTTGTTGTCTCCGGCCCCAAT
rAQP3 cds GCCTTCTTGGGTGCTGGGATTGTTTTTGGGCTCTACTATGATGCAATCTGGGCCTTTGCTGGCAATGAGCTTGTTGTCTCCGGCCCCAAT
Clustal Consensus ******************************************************************************************
460 470 480 490 500 510 520 530 540
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 2.2 GGCACAGCTGGTATCTTTGCCACCTATCCCTCTGGACACTTGGATATGGTCAATGGCTTCTTTGATCAGTTCATAGGCACAGCAGCCCTT
3.2 GGCACAGCTGGTATCTTTGCCACCTATCCCTCTGGACACTTGGATATGGTCAATGGCTTCTTTGATCAGTTCATAGGCACAGCAGCCCTT
rAQP3 cds GGCACAGCTGGTATCTTTGCCACCTATCCCTCTGGACACTTGGATATGGTCAATGGCTTCTTTGATCAGTTCATAGGCACAGCAGCCCTT
Clustal Consensus ******************************************************************************************
550 560 570 580 590 600 610 620 630
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 2.2 ATTGTGTGTGTGCTGGCCATTGTTGACCCTTATAACAACCCTGTGCCCCGGGGCCTGGAGGCCTTCACTGTGGGCCTTGTGGTCCTGGTC
3.2 ATTGTGTGTGTGCTGGCCATTGTTGACCCTTATAACAACCCTGTGCCCCGGGGCCTGGAGGCCTTCACTGTGGGCCTTGTGGTCCTGGTC
rAQP3 cds ATTGTGTGTGTGCTGGCCATTGTTGACCCTTATAACAACCCTGTGCCCCGGGGCCTGGAGGCCTTCACTGTGGGCCTTGTGGTCCTGGTC
Clustal Consensus ******************************************************************************************
640 650 660 670 680 690 700 710 720
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 2.2 ATTGGGACCTCCATGGGCTTCAATTCTGGCTATGCCGTCAACCCAGCTCGTGACTTTGGACCTCGCCTTTTCACTGCCCTGGCTGGCTGG
3.2 ATTGGGACCTCCATGGGCTTCAATTCTGGCTATGCCGTCAACCCAGCTCGTGACTTTGGACCTCGCCTTTTCACTGCCCTGGCTGGCTGG
rAQP3 cds ATTGGGACCTCCATGGGCTTCAATTCTGGCTATGCCGTCAACCCAGCTCGTGACTTTGGACCTCGCCTTTTCACTGCCCTGGCTGGCTGG
Clustal Consensus ******************************************************************************************
730 740 750 760 770 780 790 800 810
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 2.2 GGTTCAGAAGTCTTTACGACTGGCCAGAACTGGTGGTGGGTACCCATCGTCTCTCCACTCCTGGGTTCCATTGGTGGTGTCTTCGTGTAC
3.2 GGTTCAGAAGTCTTTACGACTGGCCAGAACTGGTGGTGGGTACCCATCGTCTCTCCACTCCTGGGTTCCATTGGTGGTGTCTTCGTGTAC
rAQP3 cds GGTTCAGAAGTCTTTACGACTGGCCAGAACTGGTGGTGGGTACCCATCGTCTCTCCACTCCTGGGTTCCATTGGTGGTGTCTTCGTGTAC
Clustal Consensus ******************************************************************************************
820 830 840 850 860 870 880 890 900
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 2.2 CAGCTCATGATTGGCTGCCACCTGGAGCAGCCCCCGCCTTCCACTGAGGCAGAGAATGTGAAGCTGGCCCACATGAAGCACAAGGAGCAG
3.2 CAGCTCATGATTGGCTGCCACCTGGAGCAGCCCCCGCCTTCCACTGAGGCAGAGAATGTGAAGCTGGCCCACATGAAGCACAAGGAGCAG
rAQP3 cds CAGCTCATGATTGGCTGCCACCTGGAGCAGCCCCCGCCTTCCACTGAGGCAGAGAATGTGAAGCTGGCCCACATGAAGCACAAGGAGCAG
Clustal Consensus ******************************************************************************************
910 920 930
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . 2.2 ATCTCCATCGATACCGTCGACCTCGACATGTCTAAAGG
3.2 ATCTCCATCGATACCGTCGACCTCGACATGTCTAAAGG
rAQP3 cds ATCTGA---
87
Figura VII.3 - Alinhamento da sequência codificante da AQP7 de Homo sapiens com os resultados da sequenciação do plasmídeo extraído das colónias 7.7 (equivalente a 4.3) e 7.8 (equivalente a 4.4). O múltiplo alinhamento das sequências foi realizado com a ferramenta ClustalW do software BioEdit versão 7.2.0.
10 20 30 40 50 60 70 80 90
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 4.3 CCCCATCCATACTCTAGAACTAGTCCTATGGTTCAAGCATCCGGGCACAGGCGGTCCACCCGTGGCTCCAAAATGGTCTCCTGGTCCGTG
4.4 CCCCATCCATACTCTAGAACTAGTCCTATGGTTCAAGCATCCGGGCACAGGCGGTCCACCCGTGGCTCCAAAATGGTCTCCTGGTCCGTG
hAQP7 cds ---ATGGTTCAAGCATCCGGGCACAGGCGGTCCACCCGTGGCTCCAAAATGGTCTCCTGGTCCGTG
Clustal Consensus ***************************************************************
100 110 120 130 140 150 160 170 180
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 4.3 ATAGCAAAGATCCAGGAAATACTGCAGAGGAAGATGGTGCGAGAGTTCCTGGCCGAGTTCATGAGCACATATGTCATGATGGTATTCGGC
4.4 ATAGCAAAGATCCAGGAAATACTGCAGAGGAAGATGGTGCGAGAGTTCCTGGCCGAGTTCATGAGCACATATGTCATGATGGTATTCGGC
hAQP7 cds ATAGCAAAGATCCAGGAAATACTGCAGAGGAAGATGGTGCGAGAGTTCCTGGCCGAGTTCATGAGCACATATGTCATGATGGTATTCGGC
Clustal Consensus ******************************************************************************************
190 200 210 220 230 240 250 260 270
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 4.3 CTTGGTTCCGTGGCCCATATGGTTCTAAATAAAAAATATGGGAGCTACCTTGGTGTCAACTTGGGTTTTGGCTTCGGAGTCACCATGGGA
4.4 CTTGGTTCCGTGGCCCATATGGTTCTAAATAAAAAATATGGGAGCTACCTTGGTGTCAACTTGGGTTTTGGCTTCGGAGTCACCATGGGA
hAQP7 cds CTTGGTTCCGTGGCCCATATGGTTCTAAATAAAAAATATGGGAGCTACCTTGGTGTCAACTTGGGTTTTGGCTTCGGAGTCACCATGGGA
Clustal Consensus ******************************************************************************************
280 290 300 310 320 330 340 350 360
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 4.3 GTGCACGTGGCAGGCCGCATCTCTGGAGCCCACATGAACGCAGCTGTGACCTTTGCTAACTGTGCGCTGGGCCGCGTGCCCTGGAGGAAG
4.4 GTGCACGTGGCAGGCCGCATCTCTGGAGCCCACATGAACGCAGCTGTGACCTTTGCTAACTGTGCGCTGGGCCGCGTGCCCTGGAGGAAG
hAQP7 cds GTGCACGTGGCAGGCCGCATCTCTGGAGCCCACATGAACGCAGCTGTGACCTTTGCTAACTGTGCGCTGGGCCGCGTGCCCTGGAGGAAG
Clustal Consensus ******************************************************************************************
370 380 390 400 410 420 430 440 450
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 4.3 TTTCCGGTCTATGTGCTGGGGCAGTTCCTGGGCTCCTTCCTGGCGGCTGCCACCATCTACAGTCTCTTCTACACGGCCATTCTCCACTTT
4.4 TTTCCGGTCTATGTGCTGGGGCAGTTCCTGGGCTCCTTCCTGGCGGCTGCCACCATCTACAGTCTCTTCTACACGGCCATTCTCCACTTT
hAQP7 cds TTTCCGGTCTATGTGCTGGGGCAGTTCCTGGGCTCCTTCCTGGCGGCTGCCACCATCTACAGTCTCTTCTACACGGCCATTCTCCACTTT
Clustal Consensus ******************************************************************************************
460 470 480 490 500 510 520 530 540
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 4.3 TCGGGTGGACAGCTGATGGTGACCGGTCCCGTCGCTACAGCTGGCATTTTTGCCACCTACCTTCCTGATCACATGACATTGTGGCGGGGC
4.4 TCGGGTGGACAGCTGATGGTGACCGGTCCCGTCGCTACAGCTGGCATTTTTGCCACCTACCTTCCTGATCACATGACATTGTGGCGGGGC
hAQP7 cds TCGGGTGGACAGCTGATGGTGACCGGTCCCGTCGCTACAGCTGGCATTTTTGCCACCTACCTTCCTGATCACATGACATTGTGGCGGGGC
Clustal Consensus ******************************************************************************************
550 560 570 580 590 600 610 620 630
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 4.3 TTCCTGAATGAGGCGTGGCTGACCGGGATGCTCCAGCTGTGTCTCTTCGCCATCACGGACCAGGAGAACAACCCAGCACTGCCAGGAACA
4.4 TTCCTGAATGAGGCGTGGCTGACCGGGATGCTCCAGCTGTGTCTCTTCGCCATCACGGACCAGGAGAACAACCCAGCACTGCCAGGAACA
hAQP7 cds TTCCTGAATGAGGCGTGGCTGACCGGGATGCTCCAGCTGTGTCTCTTCGCCATCACGGACCAGGAGAACAACCCAGCACTGCCAGGAACA
Clustal Consensus ******************************************************************************************
640 650 660 670 680 690 700 710 720
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 4.3 GAGGCGCTGGTGATAGGCATCCTCGTGGTCATCATCGGGGTGTCCCTTGGCATGAACACAGGATATGCCATCAACCCGTCCCGGGACCTG
4.4 GAGGCGCTGGTGATAGGCATCCTCGTGGTCATCATCGGGGTGTCCCTTGGCATGAACACAGGATATGCCATCAACCCGTCCCGGGACCTG
hAQP7 cds GAGGCGCTGGTGATAGGCATCCTCGTGGTCATCATCGGGGTGTCCCTTGGCATGAACACAGGATATGCCATCAACCCGTCCCGGGACCTG
Clustal Consensus ******************************************************************************************
730 740 750 760 770 780 790 800 810
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 4.3 CCCCCCCGCATCTTCACCTTCATTGCTGGTTGGGGCAAACAGGTCTTCAGCAATGGGGAGAACTGGTGGTGGGTGCCAGTGGTGGCACCA
4.4 CCCCCCCGCATCTTCACCTTCATTGCTGGTTGGGGCAAACAGGTCTTCAGCAATGGGGAGAACTGGTGGTGGGTGCCAGTGGTGGCACCA
hAQP7 cds CCCCCCCGCATCTTCACCTTCATTGCTGGTTGGGGCAAACAGGTCTTCAGCAATGGGGAGAACTGGTGGTGGGTGCCAGTGGTGGCACCA
Clustal Consensus ******************************************************************************************
820 830 840 850 860 870 880 890 900
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 4.3 CTTCTGGGTGCCTATCTAGGTGGCATCATCTACCTGGTCTTCATTGGCTCCACCATCCCACGGGAGCCCCTGAAATTGGAGGATTCTGTG
4.4 CTTCTGGGTGCCTATCTAGGTGGCATCATCTACCTGGTCTTCATTGGCTCCACCATCCCACGGGAGCCCCTGAAATTGGAGGATTCTGTG
hAQP7 cds CTTCTGGGTGCCTATCTAGGTGGCATCATCTACCTGGTCTTCATTGGCTCCACCATCCCACGGGAGCCCCTGAAATTGGAGGATTCTGTG
Clustal Consensus ******************************************************************************************
910 920 930 940 950 960 970 980 990
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | 4.3 GCGTATGAAGACCACGGGATAACCGTATTGCCCAAGATGGGATCTCATGAACCCACGATCTCTCCCCTCACCCCCGTCTCTGTGAGCCCT
4.4 GCGTATGAAGACCACGGGATAACCGTATTGCCCAAGATGGGATCTCATGAACCCACGATCTCTCCCCTCACCCCCGTCTCTGTGAGCCCT
hAQP7 cds GCGTATGAAGACCACGGGATAACCGTATTGCCCAAGATGGGATCTCATGAACCCACGATCTCTCCCCTCACCCCCGTCTCTGTGAGCCCT
Clustal Consensus ******************************************************************************************
1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060
. . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . | . . . . 4.3 GCCAACAGATCTTCAGTCCACCCTGCCCCACCCTTACATGAATCCATGGCCCTAGAGCACTTCCATCGTTTNNN
4.4 GCCAACAGATCTTCAGTCCACCCTGCCCCACCCTTACATGAATCCATGGCCCTAGAGCACTTCCATCGNNNNNN
hAQP7 cds GCCAACAGATCTTCAGTCCACCCTGCCCCACCCTTACATGAATCCATGGCCCTAGAGCACTTCTAA---
88