Foi então realizada a comparação entre as sequências dos marcadores do mapa com o genoma de C. sinensis. A partir da visualização gráfica dos resultados do blastn (Figura 18), foi possível verificar que basicamente que todos os grupos de ligação apresentam completa sintenia com o genoma de referência utilizado, com exceção de marcadores que foram localizados no cromossomo Un (Chr unassigned) ou aqueles que não estavam presentes no genoma de C.sinensis (Chr N).
Figura 7 - Comparação dos grupos de ligação construídos com o genoma de C. sinensis, disponível em: http://citrus.hzau.edu.cn/orange/. Posicionadas à esquerda as siglas LG representam os grupos de ligação construídos (LG1a, LG1b, LG2, LG3, LG4a, LG4b, LG5, LG6a, LG6b, LG7a, LG7b, LG8, LG9), os quais representam o mapa integrado da população ‘Pera’ x ‘Murcott’. Os grupos de ligações com “a” (tangor ‘Murcott’) e “b”(laranja ‘Pera’) se referem a grupos parcialmente integrados. Já as abreviações Chr (Chr1, Chr2, Chr3, Chr4, Chr5, Chr6, Chr7, Chr8, Chr9), ilustram os cromossomos do genoma de referência utilizado. O Chr Un (Chr unassigned) é um segmento do genoma de referência onde estão todas as sequências que não foram posicionadas nos pseudocromossomos. O Chr N representa todas as sequências que não foram alinhadas no genoma de Citrus sinensis
Dentre as sequências, 69,3% foram localizadas nos cromossomos de correspondência, 9,97% foram localizadas no Chr Un, e 20,7% das sequências dos marcadores não foram encontrados no genoma de referência utilizado (Chr N), o que revela que o mapa de ligação construído contém sequências que anteriormente não estavam posicionadas no genoma de referência.
Uma análise abrangente do projeto do genoma de laranja doce (Citrus sinensis) proposta por Xu et al., (2012) mostrou que 87,3% do genoma estimado de laranja foi coberto. 75% das sequência montadas do genoma foram ancoradas aos nove grupos de ligação com os marcadores genéticos correspondentes utilizados, os outros 15% foram não atribuído aos nove grupos de ligação. Nesta parte, o estudo das sequências Un que foram distribuídas dentros os treze grupos que representam os nove cromossomos podem contribuir para montagem do genoma de referência.
Uma vez que o mapa se mostrou sintênico com o genoma, foi possível analisar a co-linearidade entre as sequências presentes no genoma da laranja doce e o mapa de ligação inte-grado construído no presente trabalho (Figura 8).
Figura 8 - Comparação entre as posições dos marcadores dispostos nos grupos de ligação do mapa integrado e pseudocromossomos de C. sinensis (Chr). Os grupos de ligações obtidos neste estudo estão representados por 1a, 1b, 2, 3, 4a, 4b, 5, 6a, 6b, 7a, 7b, 8 e 9, os Chr1, Chr2, Chr3, Chr4, Ch5, Ch6, Chr7, Chr8, Chr9 representam os cromossomos do genoma de C. sinensis. As linhas que horizontais que ligam os grupos e os cromossomos representam a ordenação e colinearidade dos marcadores ancorados no mapa com as sequências do genoma.
A análise comparativa do genoma de C. sinensis e o mapa de ligação mostraram uma colinearidade significativa. No entanto, evidenciam-se eventos de rearranjo cromossômico, tanto inversões e translocações. Os grupos de ligação 1, 2, 8 e 9 apresentaram total colinearidade com o genoma de referência, ou seja, a ordem dos marcadores ancorados é a mesma que se encontra nas sequências do genoma. Já nos demais grupos, 3, 4, 5, 6 e 7, foram localizadas regiões onde ocorreram inversões e mudança na ordem dos marcadores, possivelmente devido á recombinação ocorrida nos gametas dos genitores da população. Esta análise comparativa só é possível quando há disponibilidade do genoma sequenciado da espécie, ou marcadores comuns entre os diferentes mapas de ligação (THUMMA et al., 2010).
5.4 Conteúdo gênico nos intervalos de QTLs detectados
Os marcadores DArTseqTM, que flanquearam os QTLs detectados para as características estudadas, foram então posicionados na atual versão do genoma de referência de Citrus (http://citrus.hzau.edu.cn/orange/) e suas coordenadas foram usadas para buscar os genes presentes nos intervalos. No total, 19 regiões foram analisadas quanto ao conteúdo gênico, somando 17 modelos gênicos. Em média, foi obtido um modelo gênico por QTL detectado. O QTL detectado para a alturados frutos no grupo de ligação 5 foi o que apresentou maior conteúdo gênico presumível (2), dentre os demais analisados. Por outro lado, não foram identificados genes no genoma referência nas regiões dos QTLs para o rendimento de suco e para o índice tecnológico (Tabela 6).
Tabela 6 - QTLs detectados para cada característica e os modelos gênicos preditos observados nos intervalos genômicos correspondentes na versão atual do genoma de referência de Citrus sinensis
Características GL Gene Função
Altura 4b Cs4g03340 Mitochondrial outer membrane protein porin of 36 kDa
Altura 5 orange1.1t01158 Cs5g13910
HAT family dimerisation domain containing protein, expressed;Putative AC transposase; Putative AC9
transposase
Putative uncharacterized protein
Diâmetro 8 Cs8g03420 Branched-chain-amino-acid aminotransferase 2, chloroplastic
A/D 4b Cs4g03340 Mitochondrial outer membrane protein porin of 36 kDa Número de gomos 5 orange1.1t008 27 N.D. Número de
sementes 3 Cs3g07490 DNA polymerase epsilon catalytic subunit A
Número de
sementes 8 Cs8g02790
Putative uncharacterized protein Sb01g041340;Actin-depolymerizing factor 5; Actin-Sb01g041340;Actin-depolymerizing factor (Fragment); Putative actin-depolymerizing factor 8;
Actophorin; Cofilin; Cofilin-1B; Cofilin-1A; Cofilin/actin-depolymerizing factor homolog;
Cofilin-4; Destrin Facilidade de
descasque 3 Cs3g07400
Transposable element protein, putative, Retrotrans_gag
Rendimento
de suco 3 N.D.
Rendimento
de suco 6b Cs6g02380
Serine carboxypeptidase-like 29;Virulence-related protein Nf314;Similar to Hordeum vulgare
carboxypeptidase D
Acidez 8 Cs6g07720
Mitogen-activated protein kinase-binding protein 1; WD repeat-containing protein 62; Echinoderm microtubule-associated protein-like 5;Novel protein similar to vertebrate mouse mitogen-activated protein kinase binding protein 1-like (MAPKBP1) (Fragment) Sólidos
Solúveis 5 N.D.
Ratio 6b Cs6g07610
Putative acetyl co-enzyme A carboxylase carboxyltransferase alpha subunit;Acetyl-coenzyme A
carboxylase carboxyl transferase subunit alpha, chloroplastic; Acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl
transferase subunit alpha
IT 4 Cs4g03200
Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 23; Xyloglucan
endotransglucosylase/hydrolase protein 22; Brassinosteroid-regulated protein BRU1
Conclusão
Tabela 6 - QTLs detectados para cada característica e os modelos gênicos preditos observados nos intervalos genômicos correspondentes na versão atual do genoma de referência de Citrus sinensis
IT 5 Cs5g14460
Coiled-coil domain-containing protein 94 homolog; Coiled-coil domain-containing protein 94; Cell cycle
control protein cwf16; Protein CWC16;Synaptic vesicle transporter SVOP and related transporters
(Major facilitator superfamily) (ISS)
IT 6b Cs6g01810
IT 8 Cs7g05440
Lectin protein kinase family protein, putative, expressed;G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-5; Probable
receptor-like protein kinase At5g20050
IT 8
Frutos por
caixa 6b Cs8g03420
Branched-chain-amino-acid aminotransferase 2, chloroplastic; Branched-chain-amino-acid aminotransferase 6; Putative
branched-chain-amino-acid aminotransferase 7
A co-localização de QTLs tem sido utilizada principalmente em espécies florestais, como em Pinus taeda (BROWN et al., 2003), Pinus pinaster (POT et al., 2006) e Picea glauca (PELGAS et al., 2011; PETROLI, 2013), como uma maneira de sugerir possíveis genes candidatos ou para validar genes candidatos de forma indireta. No entanto, esta abordagem pode apontar para diversos genes, com funções conhecidas ou desconhecidas (GION et al., 2011).
No presente trabalho, por exemplo, foram identificadas sequências em regiões QTLs associadas com o índice tecnológico (IT), com elevada homologia com a enzima xiloglucano endotransglicosilase/hidrolase (XTH) (Tabela 6). Esta enzima estaria relacionada com o processo de amadurecimento de frutos de morango (OPAZO et al., 2010). O IT, do presente trabalho, está relacionado com o amadurecimento da fruta, pois é baseado no conteúdo solúvel sólido e de suco. Assim, este gene e outros relacionados com esta função podem ser bons candidatos para análise funcional visando ao melhoramento de citros.
6 CONCLUSÕES
Os marcadores DArTseq, assim como a estratégia de mapeamento utilizada, possibilitou a construção do mapa integrado para tangor ‘Murcott’ e laranja ‘Pera’, que representa o número haploide de cromossomos da espécie e alta cobertura genômica.
Devido às restrições operacionais do programa utilizado (OneMap) não foi possível utilizar os 9.939 marcadores DArTseq para a construção do mapa integrado.
Através do estudo de sintenia e colinearidade, foi possível concluir que o mapa construído, possui alta sintenia e colinearidade com o genoma de referência utilizado.
Dentre as características estudadas, foi possível identificar 19 QTLs. Apenas para as características peso e espessura da casca não foram detectados QTLs.
A co-localização entre QTLs para os intervalos dos mesmos, sugere a existência de regiões genômicas possivelmente relacionadas com as características analisadas. Esta abordagem contribuiu para identificar genes candidatos para as características quantitativas relacionadas à qualidade dos frutos de citros.
REFERÊNCIAS
AGUSTÍ, M. Citricultura. Madri: Ediciones Mundi-Prensa, 2003.
AGUSTÍ, M.; ALMELA, V. Aplicación de fitorreguladores en citricultura. Barcelona: AEDOS, 1991. 263p.
BALDWIN, E.A. Citrus fruit. In: SEYMOUR, G.B.; TAYLOR, J.E.; TUCKER, G.A. (Ed.). Biochemistry of fruit ripening. London: Chapman & Hall, 1993. 107-149.
BARRETT, H.C. Hybridization of Citrus and related genera. Fruit Varieties Journal, University Park, v.39, p.11-16, 1985.
BARRETT, H.C.; RHODES, A.M.A. Numerical taxonomic study of affinity relationships in cultivated citrus and its close relatives. Systematic Botany, Kent, v. 1, n. 2, p.105-136, 1976. DOI: 10.2307/2418763.
BARTHOLOMEW, E.T.; SINCLAIR, W.B.; Soluble constituents and buffer properties of orange juice. Plant Physiology, Rockville, v. 18, n. 2, p. 185-206, 1943.
BASSAN, M.; MOURÃO FILHO, F.; MENDES, B.; FREIRE, B.; CANTUARIAS-AVILÉS, T.; BELTRAME, A. Reação de híbridos somáticos de citros à infecção por Phytophthora nicotianae. Revista Brasileira de Fruticultura, Cruz das Almas, v. 32, n. 2, p. 429-435, 2010. BEAVIS, W.D. The power and deceit of QTL experiments: Lessons from comparative QTL studies. In: ANNUAL CORN AND SORGHUM RESEARCH CONFERENCE, 49., 1994, Beltsville. Proceedings…Alexandria, VA: ASTA, 1994. p.250-266.
BERNARDO, R. Breeding for quantitative traits in plants. Woodburry, Minnesota: Stemma Press, 2002. 369p.
BOTEON, M. Mercados de frutas cítricas de qualidade. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE FRUTICULTURA PRODUÇÃO E QUALIDADE DE FRUTOS CÍTRICOS, 1999, Botucatu. Anais...Botucatu: FAPESP, 1999. p. 9-31.
BROWN, G.R.; BASSONI, D.L.; GILL, G.P.; FONTANA, J.R.; WHEELER, N.C.; MEGRAW, R.A.; DAVIS, M.F.; SEWELL, M.M.; TUSKAN, G.A.; NEALE, D.B. Identification of quantitative trait loci influencing wood property traits in loblolly pine (Pinus taeda L.). III. QTL Verification and candidate gene mapping. Genetics, Austin, v.164, p.1537-1546, 2003.
BUDAHN, H.; PETERKA, H.; MOUSA, M. A. A.; DING, Y.; ZHANG, S.; LI, J. Molecular mapping in oil radish (Raphanus sativus L.) and QTL analysis of resistance against beet cyst nematode (Heterodera schachtii). Theoretical and Applied Genetics, Berlin, v. 118, p. 775-782, 2009.
BUTCHER, P.A.; WILLIAMS, E.R.; WHITAKER, D.; LING, S.; SPEED, T.P.; MORAN, G.F. Improving linkage analysis in outcrossed forest trees: an example from Acacia mangium. Theoretical and Applied Genetics, Berlin, v. 104, p. 1185-1191, 2002.
CAI, Q.; GUY, C.L.; MOORE, G.A. Extension of the linkage map in Citrus using random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers and RFLP mapping of cold-acclimation-responsive loci. Theoretical and Applied Genetics, Berlin, v.89, p.606-614, 1994.
CAMERON, J.W.; FROST, H.B. Genetics, breeding and nucellar embryony. In: REUTHER, W.; BATCHELOR, L.D.; WEBBER, H.J. (Ed.). The citrus industry. Berkeley: University of California Press, 1968. v.2, p.325-370.
CANTERI, M.G.; ALTHAUS, R.A.; VIRGENS FILHO, J.S.; GIGLIOTI, E.A.; GODOY, C.V. SASM - Agri: sistema para análise e separação de médias em experimentos agrícolas pelos métodos Scoft - Knott, Tukey e Duncan.Revista Brasileira de Agrocomputação, Ponta Grossa, v. 1, n. 2, p. 18-24, 2001.
CARDOSO, S.C.; BARBOSA-MENDES, J.M.; BOSCARIOL-CAMARGO, R.L.; CHRISTIANO, R.S.C.; BERGAMIN FILHO, A.; VIEIRA, M.L.C.; MENDES, B.M.L.; MOURÃO FILHO, F.A.A. Transgenic sweet Orange (Citrus sinensis L. Osbeck) expressing the attacin A gene for resistance to Xanthomonas citri subsp. Citri. Plant Molecular Biology, Dordrecht, v. 28, n. 2, p. 185-192, 2010.
CARLIER, J.D.D. Mapeamento genético do ananaseiro (Ananas comosus (L.) Merrill). 2006. 37 p. Tese (Doutorado em Biologia) - Universidade do Algarve, Faro, Portugal, 2006. CARVALHO, V.D.; NOGUEIRA, D.J.P. Qualidade, maturação e colheita dos citros. Informe Agropecuário, Belo Horizonte, v.5, n.52, p.62-67, 1979.
CHEN, C.;BOWMAN, K.D.; CHOI, Y.A.; DANG, P.M.; RAO, M.N.; HUANG, S.; SONEJI, J.R.; MCCOLLUM, T.G.; GMITTER JUNIOR, F.G. EST-SSR genetic maps for Citrus sinensis and Poncirus trifoliata. Tree Genetics & Genomes, Heidelberg, v. 4, n. 1, p. 1-10, 2007. CHEN, L.; STOREY, J.D. Relaxed significance criteria for linkage analysis. Genetics, Austin, v. 173, n. 4, p.2371-2381, 2006. DOI: 10.1534/genetics.105.052506.
CHITARRA, M.F.I.; CAMPOS, M.A.P. Caracterização de alguns frutos cítricos cultivados em Minas Gerais. I. Laranjas doces comuns (Citrus sinensis L. Osbeck) em fase de maturação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 6., 1981, Recife. Anais... Recife: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 1981. v.2, p.396-430.
CHURCHILL, G.A.; DOERGE, R.W. Empirical threshold values for quantitative trait mapping. Genetics, Austin, v. 138, p. 963–971, 1994.
CITRUSBR – Associação Nacional dos Exportadores de Sucos Cítricos. Mundo: exportações totais de suco de laranja em toneladas de FCOJ equivalente e milhares de US$ FOB. Secex,
Citrus BR, 2014.
CLOUTIER, S., CAPPADOCIA, M.; LANDRY, B.S. Analysis of RFLP mapping inaccuracy in Brassica napus L. Theoretical and Applied Genetics, Berlin, v.95, p.83-91, 1997.
COSTA, L. Qualidade pós-colheita de citros. Informe Agropecuário, Belo Horizonte, v.17, n.80, p.45-51, 1994.
CRISTOFANI, M.; MACHADO, M.A.; GRATTAPAGLIA, D. Genetic linkage maps of Citrus sunki Hort. ex. Tan. and Poncirus trifoliata (L.) Raf. and mapping of Citrus tristeza virus resistance gene. Euphytica, Dordrecht, v.109, n. 1, p. 25-32, 1999.
CRUZ, V.M.V.; KILIAN, A.; DIERIG D.A. Development of DArT marker platforms and genetic diversity assessment of the U.S. collection of the new oilseed crop lesquerella and related species. PLoS ONE, San Francisco, v.8, n. 5, p. e64062. DOI:10.1371/journal.pone.0064062, 2013.
DALKILIC, Z.; TIMMER, L.W.; GMMITTER JUNIOR, F.G. Linkage of an Alternaria disease resistance gene in mandarin hybrids with RAPD fragments. Journal of the American Society for Horticultural Science, Alexandria, v. 130, n. 2, p. 191–195, 2005.
DAVIES, F.S.; ALBRIGO, L.G. Citrus. Wallingford: CAB International, 1994. 254p.
DENG, Z.; XIAO, S.; HUANG, S.; GMITTER JUNIOR, F.G. Development and characterization of SCAR markers linked to the Citrus tristeza virus resistance gene from Poncirus trifoliata. Genome, Ottawa, v. 40, n. 5, p. 697-704, 1997.
DEOKAR, A.A.; RAMSAY, L.; SHARPE, A.G.; DIAPARI, M.; SINDHU, A.; BETT, K.; WARKENTIN, T.D.; TAR’AN, B. Genome wide SNP identification in chickpea for use in development of a high density genetic map and improvement of chickpea reference genome assembly. BMC Genomics, London, v. 15, n. 1, 2014. DOI: 10.1186/1471-2164-15-708. DI GIORGI, F.; IDE, B.Y.; DIB, K.; MARCHI, R.J.; TRIBONI, H.R.; WAGNER, R.L. Contribuição ao estudo do comportamento de algumas variedades de citros e suas implicações agroindustriais. Laranja, Cordeirópolis, v.11, n.2, p.567-612, 1990.
DOERGE, R.W. Constructing genetic maps by rapid chain delineation. Journal of Quantitative Trait Loci, Madison, v.2, n.6, 1996. Disponível em: http://wheat.pw.usda.gov/jag/papers96/paper696/doerge2.htm.
DONADIO, L.C.; MOURÃO FILHO, F.A.A.; MOREIRA, C.S. Centros de origem, distribuição geográfica das plantas cítricas e histórico da citricultura no Brasil. In: MATTOS JUNIOR, D.; DE NEGRI, J.D.; PIO, R.M.; POMPEU JUNIOR, J. (Org.). Citros. Campinas: Instituto Agronômico/FUNDAG, 2005. p. 3-18.
DURHAM, R.E.; LIOU, P.C.; GMITTER JUNIOR, F.G.; MOORE, G.A. Linkage of restriction fragment length polymorphisms and isozymes in Citrus. Theoretical and Applied Genetics, Berlin, v. 84, p. 39-48, 1992.
FANG, D.Q.; FEDERICI, C.T.; ROOSE, M.L. A high-resolution linkage map of the Citrus Tristezavirus resistance gene region in Poncirus trifoliata (L.) Raf. Genetics, Austin, v. 150, p.883–890, 1998.
FEBRES, J.;LEE, R.; MOORE, G. Genetic transformation of citrus for pathogen resistance. In: KHAN, I. (Ed.). Citrus. Genetics, breeding and biotechnology. Wallingford: CAB International, 2007. p. 307-327.
FROST, H.B.; SOOST, R.K. Seed reproduction: development of gametes and embryos. In: REUTHER, W.; BATCHELOR, L.D.; WEBBER, H.J. (Ed.). The citrus industry. Berkeley: University of California Press, 1968. v.2 , p. 292-334.
GARCÍA, A.A.F.; KIDO, E.A.; MEZA, A.N.; SOUZA, H.M.B.; PINTO, L.R.; PASTINA, M.M.; LEITE, C.S.; SILVA, J.A.G. da; ULIAN, E.C.; FIGUEIRA, A.; SOUZA, A.P. Development of an integrated genetic map of a sugarcane (Saccharum spp.) commercial cross, based on a maximum-likelihood approach for estimation of linkage and linkage phases. Theoretical and Applied Genetics, Berlin, v. 112, p. 298-314, 2006.
GARCÍA, M.R.; ASINS, M.J.; CARBONELL, E.A. QTL analysis of yield and seed number in Citrus. Theoretical and Applied Genetics, Berlin, v. 101, n. 3, p.487-493, 2000. DOI: 10.1007/s001220051507.
GAZAFFI, R.; MARGARIDO, G.R.A.; PASTINA, M.M.; MOLLINARI, M.; GARCIA, A.A.F. Garcia A model for quantitative trait loci mapping, linkage phase, and segregation pat-tern estimation for a full-sib progeny. Tree Genetics & Genomes, Heidelberg, v. 10, p. 791– 801, 2014.
GENÚ, P.J.C.; PEDRAZZI, R.G. Caracterização física e química da laranja 'Bahia' (Citrus sinensis L. Osb.) cultivada nos Cerrados do Distrito Federal. Revista Brasileira de Fruticultura, Cruz das Almas, v. 3, p. 29-31, 1981.
GILLILAND, L.U.; PAWLOSKI, L.C.; KANDASAMY, M.K.; MEAGHER, R.B. Arabidopsis actin gene ACT7 plays an essential role in germination and root growth. Plant Journal, Oxford, v. 33, p.319-328, 2003.
GION, J.-M.; CAROUCHÉ, A.; DEWEER, S.; BEDON, F.; PICHAVANT, F.; CHARPENTIER, J.P.; BAILLÈRES, H.; ROZENBERG, P.; CAROCHA, V.; OGNOUABI, N.; VERHAEGEN, D.; GRIMA-PETTENATI, J.; VIGNERON, P.; PLOMION, C. Comprehensive genetic dissection of wood properties in a widely-grown tropical tree: Eucalyptus. BMC Genomics, London, v. 12, n. 1, p. 301-310, 2011. http://dx.doi.org/10.1186/1471-2164-12-301. GMITTER JUNIOR, F.G.; XIAO, S.Y.; HUANG, S.; HU, X.L.; GARNSEY, S.M.; DENG, Z. A localized linkage map of the citrus tristeza virus resistance gene region. Theoretical and Applied Genetics, Berlin, v. 92, n. 6, p. 688-695, 1996. DOI: 10.1007/bf00226090.
GOLDENBERG, L.; YANIV, Y.; KAPLUNOV, T.; DORON-FAIGENBOIM, A.; PORAT, R.; CARMI, N. Genetic diversity among mandarins in fruit-quality traits. Journal of Agricultural and Food Chemistry, Washington, DC, v. 62, n. 21, p.4938-4946, 2014. DOI: 10.1021/jf5002414.
GOLDSCHMIDT, E.E.; MONSELISE, S.P. Physiological assumptions toward the development of a citrus fruiting model. In: INTERNATIONAL CITRUS CONGRESS, 2., 1977, Orlando. Proceedings… Riverside, CA: International Society of Citriculture, 1977. p. 668-672.
GONDA, I.; LEV, S.; BAR, E.; SIKRON, N.; PORTNOY, V.; DAVIDOVICH-RIKANATI, R.; BURGER, J.; SCHAFFER, A.A.; TADMOR, Y.; GIOVANNONNI, J.J.; HUANG, M.Y.; FEI, Z.J.; KATZIR, N.; FAIT, A.; LEWINSOHN, E. Catabolism of L-methionine in the formation of sulfur and other volatiles in melon (Cucumis melo L.) fruit. Plant Journal, Oxford, v. 74, p. 458–472, 2013.
GRATTAPAGLIA, D.; SEDEROFF, R. Genetic linkage maps of Eucalyptus grandis and Eucalyptus urophylla using a pseudo-testcross mapping strategy and RAPD markers. Genetics, Austin, v. 137, n. 4, p. 1121-1137, 1994.
GROSSER, J.W.; GMITTER JUNIOR, F.G. 2004 SIVB Congress symposium proceedings “Thinking outside the cell”: Applications of somatic hybridization in crop improvement, with citrus as a model. In Vitro Cellular Developmental Biology- Plant, Columbia, v. 41, p. 220-225, 2005.
GROSSER, J.W.; GMITTER JÚNIOR, F.G. Protoplast fusion and citrus improvement. Plant Breeding Reviews, Westport, v. 8, p. 339-374, 1990.
GROSSER, J.W.; JIANG, J.; MOURÃO FILHO, F.F.A.; LOUZADA, E.S.; BAERGEN, K.; CHANDLER, J.L.; GMITTER JUNIOR, F.G. Somatic hybridization, An integral component of citrus cultivar improvement: Scion Improvement. HortScience, Alexandria, v. 33, n. 6, p. 1057-1059, 1998.
GUARDIOLA, J.L.; MONERRI, C.; AGUSTI, M. The inhibitory effect of gibberellic acid on flowering in Citrus. Physiologia Plantarum, Copenhagen, v. 55, n. 2, p. 136-142, 1982. GUERRA, M.; PEDROSA, A.; BARROS E SILVA, A.; CORNÉLIO, M.T.M.; SANTOS, K.G.B.; SOARES-FILHO, W. Chromosome number and secondary constriction variation in 51 accessions of a citrus germoplasm bank. Brazilian Journal of Genetics, Ribeirão Preto, v. 20, n. 3, p.1-2, 1997. DOI: 10.1590/S0100-84551997000300021.
GUERRA, M.; SANTOS, K.G.; SILVA, A.E.B.; EHRENDORFER, F. Heterochromatin banding patterns in Rutaceae-Aurantioideae - a case of parallel chromosomal evolution. American Journal of Botany, Baltimore, v.87, p.735-747, 2000.
GUDENSCHWAGER,O.;GARCÍA-ROJAS, M.; DEFILIPPI, B.G.; GONZÁLEZ-AGÜERO, M. Identification and characterization of two putative genes encoding acetyl-coenzyme A carboxylase subunits that are possibly associated with internal browning during cold storage of 'Hass' avocados (Persea Americana Mill.). Postharvest Biology and Technology. Amsterdam, v. 84, p. 74-80, 2013.
GULSEN, O.; UZUN, A.; CANAN, I.; SEDAY, U.; CANIHOS, E. A new citrus linkage map based on SRAP, SSR, ISSR, POGP, RGA and RAPD markers. Euphytica, Dordrecht, v. 173, p. 265- 277, 2010. DOI: 10.1007/s10681-010-0146-7.
INSTITUTO BRASILEIRO DE GEOGRAFIA E ESTATÍSTICA - IBGE. Banco de Dados
Agregados. Brasília, DF, 2015. Disponível em:
<http://www.sidra.ibge.gov.br/bda/tabela/protabl.asp?c=1613&z=p&o=37&i=P>. Acesso em: 7 maio 2015.
IWATA, H.; NINOMIYA, S. AntMap: Constructing Genetic Linkage Maps Using an Ant Colony Optimization Algorithm. Breeding Science, Tokyo, v. 56, n. 4, p.371-377, 2006. DOI: 10.1270/jsbbs.56.371.
JACCOUD, D. Diversity arrays: a solid state technology for sequence information independent genotyping. Nucleic Acids Research, Oxford, v. 29, n. 4, p.25-25, 2001. DOI: 10.1093/nar/29.4.e25.
JACKSON, L.K. Citrus growing in Florida. 3. ed. Gainesville: University of Florida Press, 1991. 293p.
JANSEN, R.C.; STAM, P. High resolution of quantitative traits into multiple loci via interval mapping. Genetics, Austin, v. 140, p. 1111-1127, 1994.
JARRELL, D.C.; ROOSE, M.L.; TRAUGH, S.N.; KUPPER, R.S. A genetic map of citrus based on the segregation of isozymes and RFLPs in an intergeneric cross. Theoretical and Applied Genetics, Berlin, v. 84, n. 1-2, p. 1-2, 1992. DOI: 10.1007/bf00223980.
KANDASAMY, M.K.; GILLILAND, L.U.; MCKINNEY, E.C.; MEAGHER, R.B. One plant actin isovariant, ACT7, induced by auxin and required for normal callus formation. The Plant Cell, Rockville, v.13, p. 1541-1554, 2001.
KIJAS, J.M.H.; THOMAS, M.R.; FOWLER, J.C.S.; ROOSE, M.L. Integration of trinucleotide microsatellites into a linkage map of Citrus. Theoretical and Applied Genetics, Berlin, v. 94, p. 701-701, 1997.
KILIAN, A.; HUTTNER, E.; WENZL, P.; JACCOUD, D.; CARLING, J.; CAIG, V.; EVERS, M.; HELLER-USZYNSKA, K.; CAYLA, C.; PATARAPUWADOL, S.; XIA, L.; YANG, S.; THOMSON, B. The fast and the cheap: SNP and DArT-based whole genome pro Wling for crop improvement. In: INTERNATIONAL CONGRESS IN THE WAKE OF THE DOUBLE HELIX: FROM THE GREEN REVOLUTION TO THE GENE REVOLUTION, 2003, Bologna, Italy. Proceedings… Bologna, Italy: Avenue Media, 2005.p. 443–461.
KIMBALL, D.A. Citrus processing: quality control and technology. New York: Van Nostrand, 1991. 473p.
KOCHEVENKO, A.; ARAÚJO, W.L.; MALONEY, G.S.; TIEMAN, D.M.; DO, P.T.; TAYLOR, M.G.; KLEE, H.J.; FERNIE, A.R. Catabolism of branched chain amino acids supports respiration but not volatile synthesis in tomato fruits.Molecular Plant, Oxford, v. 5, n. 2, p.366-375, 2012. DOI: 10.1093/mp/ssr108.
KOSAMBI, D.D. The estimation of map distances from recombination values.Annals of Eugenics, London, v. 12, n. 1, p.172-175, 1943. DOI: 10.1111/j.1469-1809.1943.tb02321.x. KUMAR, K.; GILL, M.; KAUR, H.; CHOUDHARY, O.; GOSAL, S. In vitro mutagenesis and somaclonal variation assisted salt tolerance in ‘Rough Lemon’ (Citrus jambhiri Lush.). European Journal of Horticultural Science, Stuttgart, v. 75, n. 6, p.233-238, 2010.
LANDER, E.; BOTSTEIN, D. Mapping Mendelian factors underlying quantitative traits using RFLP linkage maps. Genetics, Austin, v. 121, n. 1, p.185-199, 1989.
LANDER, E.S.; GREEN, P.; ABRAHAMSON, J.; BARLOW, A.; DALY, M.J.; LINCOLN, E.E.; NEWBURG, L. An interactive computer package for constructing primary genetic linkage maps of experimental and natural populations. Genomics, Ottawa, v. 1, n. 2, p.174-181, 1987. DOI: 10.1016/0888-7543(87)90010-3.
LAPERUTA, L. di C. Estudo de uma população segregante (F1) de maracujá-doce: enriquecimento do mapa de ligação e mapeamento de QTL para produção e qualidade de frutos. Piracicaba SP. 2011. 135p. Tese (Doutorado em Ciências) -Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2011.
LIU, B.H.; KNAPP, S.J. Gmandel: a program for Mendelian segregation and linkage analysis of individual or multiple progeny populations using log-likelihood ratios. Journal of Heredity, New York, v.81, n.5, p.407-418, 1992.
LIU, S.R.; LI, W.Y.; LONG, D.; HU, C.G.; ZHANG, J.Z. Development and characterization of genomic and expressed SSRs in citrus by genome-wide analysis. PLoS ONE, San Francisco, v. 8, n. 10, p. e75149. DOI: 10.1371/journal.pone.0075149.
LURO, F.; BOVÉ, J.M.; OLLITRAULT, P.DNA Amplified fingerprinting, a useful tool for determination of genetic origin and diversity analysis in Citrus. Hort Science, Alexandria, v.30, n.5, p.1063-1067, 1995.
LYNCH, M.; WALSH, B. Genetics and analysis of quantitative traits. Sunderland: Sinauer, 1998. 980p.
MACHADO, M.A.; COLETTA FILHO, H.D.; TARGON, M.L.P.N.;POMPEU JUNIOR, J.Geneticrelationship of Mediterranean mandarins (C. deliciosaTenore) using RAPD markers.Euphytica, Dordrecht, v. 92, p. 321-326, 1996.
MACHADO, M.A.; CRISTOFANI-YALY, M.; AMARAL, A.M.; OLIVEIRA, A.C. Genética, melhoramento e biotecnologia de citros. In: MATTOS JUNIOR, D.; NEGRI, J.D.; PIO, R.M.; POMPEU JÚNIOR, J. Citros. Campinas: Instituto Agronômico/FUNDAG, 2005. p. 243-246. MACHADO, M.A.; CRISTOFANI-YALY, M.; BASTIANEL, M. Breeding genetic and genomic of citrus for disease resistance. Revista Brasileira de Fruticultura, Cruz das Almas,