CHAPTER 2 – Association of polymorphisms of the Heart Fatty Acid Binding
2.4. Análises estatísticas
As análises estatísticas para associação dos genótipos com as características avaliadas foram feitas utilizando-se modelo:
yijklm = µ + Gi + Sj + Lk + b(Cijklm - C)+ pl + eijklm
em que:
yijklm = característica observada no animal m, do genótipo i, do sexo j, do lote k, filho do pai l;
µ = constante inerente a todas as observações; Gi = efeito fixo do genótipo i;
Sj = efeito fixo do sexo j;
Lk = efeito fixo de época de nascimento (lote) k (k = 1, 2, 3, 4 e 5);
b = coeficiente de regressão linear da característica em função da covariável; Cijklm= valor observado da covariável no animal m, do genótipo i, do sexo j, do
lote k, do pai l;
C= média da covariável;
pl = efeito aleatório do pai l, com l variando de 1 a 11; e
eijklm = erro aleatório associado a cada observação.
As covariáveis utilizadas foram:
- tamanho de leitegada ao nascimento (TLN) para PNAS;
- tamanho de leitegada ao desmame (TLD) para P21, P42, P63, P77, P105 e PVIVO;
- peso aos 77 dias (P77) para CONSRAC, GPD e CA;
- peso de carcaça (PCARC) para as características de carcaça;
- peso da banda direita resfriada (PBDIRres) para as características de corte de carcaça;
-
idade ao abate (IDABATE) para as características de qualidade da carne.3. RESULTADOS E DISCUSSÃO
Na Figura 1 pode-se observar o padrão de bandas gerado pela digestão do DNA amplificado pela enzima Hinf I.
Figura 1 – Gel de poliacrilamida 8%, corado com nitrado de prata 0,2%. Padrão de bandas resultantes da digestão pela enzima Hinf I do DNA amplificado. A canaleta 1 apresenta o padrão de banda da amostra não digerida, com 478 pares de base (pb). Na canaleta 2 se encontra o padrão de peso molecular 1Kb, usado como referência para os tamanhos de bandas. As canaletas 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 e 11 referem-se a animais homozigotos (HH) para o reconhecimento do sítio polimórfico, com 3 tamanhos de bandas (314, 105 e 59 pb). Nas canaletas 10 e 12, encontram- se amostras de DNA de animais heterozigotos (Hh) para a clivagem do polimorfismo pela Hinf I, com fragmentos de 314, 164, 105 e 59 pb.
Todos os 246 animais F2 genotipados apresentaram o sítio monomórfico para a enzima, cuja clivagem resultava em 2 fragmentos de 314 e 164 pb. Nos animais em que o polimorfismo Hinf I estava ausente, o fragmento de 164pb era digerido em outros dois fragmentos menores de 105 e 59pb.
As canaletas 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 e 11 do gel mostrado na Figura 1, representam animais denominados homozigotos (HH). As amostras das canaletas 10 e 12 (Figura 1) representam os animais denominadas de heterozigotos (Hh).
As freqüências dos genótipos encontrados são apresentadas nas Tabela 2. Não foram encontrados genótipos hh na população de animais genotipados.
Tabela 2 – Frequências dos genótipos HH e Hh do gene da H-FABP na população de animais genotipados
Genótipo N % dos animais genotipados
HH 198 80,49
Hh 48 19,51
Na Tabela 3, são apresentadas as freqüências dos alelos H e h do gene da H-FABP no grupo de animais estudados.
Tabela 3 – Frequências dos alelos H e h do gene da H-FABP na população de animais genotipados
Alelo Freqüência alélica (%)
H 90,24
h 9,76
O número de observações, a média dos genótipos e os valores do teste F para as características de desempenho são apresentados na Tabela 4.
Tabela 4 – Número de observações (N) e média para características de desempenho de acordo com os genótipos HH e Hh do gene da H-FABP Genótipos HH Hh Características N Média + DP N Média + DP SIG NTETAS 196 13,17 + 1,30 48 12,96 + 1,24 0,6302 PNAS(kg) 197 1,16 + 0,25 48 1,13 + 0,27 0,9174 P21(kg) 195 4,73 + 0,98 46 4,85 + 1,21 0,2364 P42(kg) 188 8,28 + 1,79 45 7,98 + 2,17 0,3848 P63(kg) 191 15,54 + 3,27 45 15,68 + 3,62 0,1528 P77(kg) 188 20,42 + 3,88 44 20,46 + 4,04 0,2611 CONSRAC (kg) 188 37,24 + 7,68 41 38,34 + 8,58 0,2036 P105(kg) 182 34,18 + 5,74 39 34,74 + 6,21 0,4220 GPD(kg) 187 0,48 + 0,13 39 0,50 + 0,14 0,9569 CA(kg/kg) 186 2,87 + 0,72 39 2,95 + 0,84 0,4795 PVIVO(kg) 151 65,20 + 5,39 37 64,78 + 5,75 0,9733 IDABATE(dias) 158 152,15 + 10,25 38 147,32 + 9,13 0,0110 DP=Desvio Padrão.
SIG=Limite de significância para o teste F.
NTETAS=número de tetas; PNAS, P21, P42, P63, P77, P105=peso ao nascer, aos 21, 42, 63, 77 e aos 105 dias de idade, respectivamente; PVIVO=peso ao abate; GPD=ganho de peso médio diário; CONSRAC e CA=consumo de ração à vontade e conversão alimentar dos 77 aos 105 dias de idade e IDABATE=idade ao abate.
Foram verificados efeitos significativos para idade ao abate (p<0,05) e peso aos 63 dias (p<0,20). Não foram encontrados, na literatura consultada, trabalhos que tenham efetuado associação entre características de desempenho e polimorfismos no gene da H–FABP.
Na Tabela 5 são apresentados o número de observações, a média dos genótipos e os valores do teste F para as características de carcaça.
Tabela 5 – Número de observações (N) e média para características de carcaça de acordo com os genótipos HH e Hh do gene da H- FABP Genótipos HH Hh Características N Média + DP N Média + DP SIG PCARC(kg) 159 53,80 + 5,48 37 53,27 + 5,08 0,5695 RCARC(%) 153 81,72 + 2,32 37 81,68 + 1,91 0,7935 MBCC(cm) 161 85,89 + 4,48 39 86,99 + 4,17 0,2327 MLC(cm) 158 71,66 + 3,25 39 72,32 + 3,62 0,1789 SH(mm) 161 41,34 + 5,56 39 39,92 + 6,53 0,4568 UC(mm) 161 20,04 + 4,67 39 18,36 + 4,89 0,0449 UL(mm) 161 29,18 + 6,06 39 27,10 + 6,31 0,1199 L(mm) 164 45,11 + 1,95 40 45,44 + 1,90 0,2316 P2(mm) 160 16,79 + 3,50 39 16,28 + 4,28 0,2694 ETO(mm) 153 21,90 + 5,22 37 20,55 + 5,78 0,1377 PROFLOMB(mm) 143 43,73 + 4,63 38 43,48 + 3,91 0,7837 AOL(cm2) 148 26,63 + 3,87 39 26,76 + 3,22 0,5874 PULMÃO(kg) 157 0,45 + 0,08 38 0,46 + 0,07 0,8796 CORAÇÃO(kg) 160 0,24 + 0,03 39 0,24 + 0,03 0,6040 FÍGADO(kg) 159 1,27 + 0,16 39 1,30 + 0,17 0,4204 BAÇO(kg) 160 0,09 + 0,02 39 0,09 + 0,02 0,7501 INTEST (m) 161 18,24 + 1,91 39 18,32 + 2,07 0,0287 DP=Desvio Padrão.
SIG=Limite de significância para o teste F.
PCARC, PULMÃO, CORAÇÃO, FÍGADO e BAÇO=pesos de carcaça com cabeça e pés; pulmão, coração, fígado e baço, respectivamente; RCARC=rendimento de carcaça com cabeça e pés; MBCC e MLC=comprimento de carcaça pelo método brasileiro e método americano; SH, UC, UL, L e P2=espessuras de toucinho em diversas posições; ETO=espessura de toucinho, a 6,5 cm da linha dorso- lombar (equivalente à P2); PROFLOMB=profundidade de lombo;INTEST=comprimento total do intestino delgado; AOL=área de olho de lombo.
Efeitos significativos foram encontrados para as características espessura de toucinho UC, e comprimento de intestino (p<0,05), comprimento
de carcaça pelo método americano e espessuras de toucinho UL e ETO (p<0,20).
Não foram encontrados trabalhos que tenham verificado efeito significativo para o conjunto de características da tabela 5, exceto para ETO, que apresentou contraste significativo em estudo realizado por GERBENS et al. (1999).
Na Tabela 6 são apresentados o número de observações, a média dos genótipos e os valores do teste F para as características de corte de carcaça.
Tabela 6 – Número de observações (N) e média para características de corte de carcaça de acordo com os genótipos HH e Hh do gene da H-FABP Genótipos HH Hh Características N Média + DP N Média + DP SIG PBDIRres(kg) 161 26,46 + 3,11 39 26,36 + 2,93 0,9105 PTPERNIL(kg) 159 7,22 + 0,90 39 7,24 + 0,83 0,6669 PPERNIL(kg) 156 5,06 + 0,64 39 5,08 + 0,52 0,8589 PTCOPA(kg) 161 2,34 + 0,36 39 2,38 + 0,40 0,1623 PCOPA(kg) 161 1,70 + 0,28 39 1,74 + 0,28 0,1271 PTPALETA(kg) 160 4,81 + 0,68 37 4,78 + 0,65 0,4679 PPALETA(kg) 160 2,73 + 0,44 39 2,78 + 0,42 0,5764 PTCARRE(kg) 157 3,50 + 0,50 39 3,40 + 0,49 0,0442 PLOMBO(kg) 160 1,08 + 0,18 39 1,08 + 0,17 0,9653 PBACON(kg) 158 2,71 + 0,48 39 2,66 + 0,47 0,7310 ESPBACON(cm) 158 25,72 + 6,12 38 25,76 + 7,82 0,9549 COSTELA(kg) 161 1,56 + 0,25 38 1,59 + 0,26 0,7989 PAPADA(kg) 160 0,72 + 0,20 38 0,82 + 0,25 0,0195 CABEÇA(kg) 160 1,52 + 0,22 39 1,52 + 0,24 0,7621 FILEZIN(kg) 160 0,24 + 0,04 38 0,23 + 0,04 0,0867 BARAMA(kg) 160 0,49 + 0,15 38 0,46 + 0,14 0,3841 RIM(kg) 160 0,12 + 0,02 39 0,13 + 0,02 0,0028 DP=Desvio Padrão.
SIG=Limite de significância para o teste F.
PBDIRres, PPERNIL, PTPERNIL, PCOPA, PTCOPA, PPALETA, PTPALETA, PTCARRE, PLOMBO, PBACON, COSTELA, PAPADA, CABEÇA, FILEZIN, BARAMA e RIM=pesos de carcaça com cabeça e pés, banda direita resfriada, pernil limpo, pernil total, copa sem pele e sem capa de gordura, total de copa, paleta limpa, paleta total, carré, lombo, bacon, costela, papada, cabeça, filezinho, banha
Foram verificados efeitos significativos para peso de rim (p<0,01); peso de carré e peso de papada (p<0,05); peso de filezinho (p<0,10) e peso total de copa e peso decopa sem pele e sem capa de gordura (p<0,20). URBAN et al. (2002), ao trabalharem com suínos das raças Large White e Landrace não verificaram efeitos significativos dos genótipos do gene da H–FABP sobre pesos e rendimentos de cortes.
Na Tabela 7 são apresentados o número de observações, a média dos genótipos e os valores do teste F para as características de qualidade da carne.
Tabela 7 – Número de observações (N) e média para características de qualidade da carne de acordo com os genótipos HH e Hh do gene da H-FABP Genótipos HH Hh Características N Média N Média SIG pH45 163 6,60 +0,28 38 6,62 + 0,31 0,1256 pH24 163 5,74 + 0,19 40 5,75 + 0,16 0,4201 LUM 164 45,11 + 1,95 40 45,44 + 1,90 0,2710 A 162 0,79 + 0,58 40 0,68 + 0,49 0,5123 B 165 6,70 + 0,58 40 6,75 + 0,50 0,4085 GORINT(%) 152 1,65 + 0,56 37 1,58 + 0,51 0,5456 GOTEJ(%) 164 3,04 + 1,74 40 3,20 + 1,54 0,9844 COZ(%) 165 32,48 + 2,39 40 32,58 + 2,54 0,5578 MACIEZ(g/1,2 cm) 162 5638,26 + 803,97 38 5635,16 + 959,92 0,8453 PERDATOT(%) 165 34,39 + 2,65 38 34,18 + 2,60 0,3165 H 155 83,05 + 5,06 39 84,27 + 4,20 0,5712 C 159 6,74 + 0,57 39 6,80 + 0,50 0,3384 DP=Desvio Padrão.
SIG=Limite de significância para o teste F.
pH45 e pH24=pH medido 45 minutos e 24 horas post-morten, respectivamente; GOTEJ, COZ e PERDATOT=perda de peso por gotejamento, cozimento e perda de peso total; GORINT=gordura intramuscular; MACIEZ=maciez objetiva (força de cisalhamento); LUM=luminosidade; A=índice de vermelho; B=índice de amarelo; C e H= índices de saturação e tonalidade, respectivamente.
Verificaram-se efeitos significativos dos genótipos sobre pH medido 45 minutos pos-morten (p<0,20). URBAN et al. (2002) e NECHTELBERGER et al. (2001) não verificaram efeitos dos genótipos sobre as características descritas na tabela 7. Por outro lado, foram encontrados efeitos significativos sobre
gordura intramuscular em suínos de duas populações da raça Duroc (GERBENS et al., 1999) e em suínos das raças Meishan e ocidentais (GERBENS et al., 2000). No último estudo, os autores sugerem que o gene FABP3 pode ser aplicado em programas de seleção para aumentar o teor de gordura intramuscular sem que haja aumento concomitante da espessura de toucinho, uma vez que encontraram efeitos significativos do gene na característica gordura intramuscular e não detectaram na espessura de toucinho.
Neste estudo, a ausência de efeitos significativos dos genótipos sobre grande maioria das características pode ter sido causada pela ausência do terceiro genótipo (hh), que poderia ser visualizado em gel apenas como duas bandas de DNA (314 e 164 pb). Outro fator que poderia contribuir para a detecção de efeitos significativos sobre outras características seria a genotipagem de maior número de animais.
A utilização de cruzamentos divergentes possui algumas vantagens como a segregação dos alelos de grande efeito na população F2. Entretanto, em populações comerciais, os alelos podem estar com efeito diminuído ou até mesmo anulado. Desta forma, devem ser confirmados primeiramente em populações comerciais para que se possa utilizar o gene como marcador molecular em programas de seleção (ANDERSSON et al., 1998).
4. CONCLUSÕES
A partir dos efeitos significativos encontrados para as variantes alélicas do gene da Proteína de Ligação dos Ácidos Graxos – Tipo Coração, pode-se concluir que o gene possui potencial para aplicação em programas de seleção assistida por marcadores moleculares para características de interesse econômico na cadeia produtiva de suínos; no entanto, deve ser, primeiramente, testado em populações comerciais.
5. REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS
ANDERSSON, L.; ANDERSSON, K.; ANDERSSON – EKLUND, L. et al. Case history in animal improvement: genetic mapping of QTLs for growth and fatness in the pig. In: Molecular Dissection of Complex Traits. Ed. Paterson, A. H., CRC Press, New York. p.241-254, 1998.
GERBENS, F., VAN ERP, A.J.M., HARDERS, F.L., VERBURG, F.J., MEUWISSEN, T.H.E., VEERKAMP, J.H, te PAS, M.F.W. Effect of genetic variants of the Heart Fatty Acid-binding Protein Gene on intramuscular fat and performance traits in pigs. J. Anim. Sci., 77:846-852, 1999.
GERBENS, F.; DE KONING, D.J.; HARDERS, F.L.; MEUWISSEN, T.H.; JANSS, L.L.; GROENEN, M.A.; VEERKAMP, J.H.; VAN ARENDONK , J.A.; TE PAS, M.F. The effect of adipocyte and heart fatty acid-binding protein genes on intramuscular fat and backfat content in Meishan crossbred pigs. J. Anim. Sci., 78:552-559, 2000.
NECHTELBERGER, D.; PIRES, V.; SOOLKNET, J.; STUR BREM, G.; MUELLER, M.; MUELLER, S. Intramuscular fat content and genetic variants at fatty acid-binding protein loci in Austrian pigs. J. Anim. Sci., 79:2798-2804, 2001.
URBAN, T.; MIKOLASOVA, R.; KUCIEL, J.; ERNST, M.; INGR, I. A study of associations of the H-FABP genotypes with fat and meat production of pigs. J. Appl. Genet., 43:505-509, 2002.