A maioria dos fungicidas é transform ada predom inantem ente por processos biológicos. Os resíduos desses compostos podem ser m ineralizados por um simples m icrorg an ism o ou en volv er o e fe ito in te ra tiv o das c o m u n id a d e s m istas de microrganismos e conta com a versatilidade m etabólica das bactérias e fungos. As transformações bióticas dos fungicidas geralmente resultam na degradação da estrutura molecular em formas mais simples, no entanto a molécula pode persistir se as condições ambientais forem desfavoráveis para a atividade degradativa.
Quando a biodegradação é o principal processo de degradação, a aplicação repetida dos com postos leva ao en riquecim ento das populações degradadoras, originando um desaparecimento acelerado da m olécula com atividade fungicida. A biodegradação acelerada de fungicidas é uma ameaça significativa para a eficácia destes produtos. Embora seja conseqüência de processos naturais de adaptação metabólica, este processo pode ser considerado por dois ângulos: do ponto de vista agronômico aumenta a necessidade de utilização do produto, diminui a eficácia e leva a necessidade de aumento de doses para obtenção do m esm o resultado, podendo resultar em prejuízo econômico ao produtor. Já do ponto de vista ecológico, é um dos maiores mecanismos para a biodegradação e detoxificação no controle de poluição. Muitos autores questionam se a adaptação m icrobiana responsável pela biodegradação acelerada é resultado do aumento do núm ero de m icrorganism os ou do aumento na atividade enzim ática. A capacidade dos m icrorganism os crescerem usando um composto orgânico específico como fonte de carbono não significa que a inoculação do microrganismo em um ambiente natural causará a degradação do composto. A capacidade para metabolizar o composto orgânico é necessária, mas não é condição suficiente para que o organismo efetue a transformação, pois as moléculas do fungicida ou seus metabólitos podem persistir sob condições desfavoráveis para a biodegradação.
Desta forma, deve-se levar em consideração o custo/ benefício social e ambiental do uso de fungicidas, para que ocorra m inimização de riscos e maximização do retomo de benefícios do uso destes compostos na agricultura, visando a qualidade do ambiente.
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