3.2 Construção da biblioteca genômica de C violaceum
3.2.5 Seleção de clones por coloração azul-branco
O vetor plasmidial pBC-SK permite seleção por coloração azul-branco em função da complementação do lacZ M15 em cepas que apresentam esse genótipo,
como a DH10B. A seleção das colônias brancas pode ser obtida em placas de LB contendo 25 µg/mL de cloranfenicol, 80 µg/mL de X
O X-gal fo
soluções foram armazenadas a em LB ágar por 16
placas e inoculados em me agitação por 16
através da análise fenotípica de cor a antibiótico (cloranfenicol).
da cultura
foram lacradas com adesivo e acondicionadas clone da biblioteca genômica.
e caracterização de clones candidatos envolvidos com resposta ao estresse por luz ultravioleta, como apresentado adiante (Figura 7).
Figura 7. Fluxograma das ativi
Funcional (Curvas)
Clones Inteiros
como a DH10B. A seleção das colônias brancas pode ser obtida em placas de LB contendo 25 µg/mL de cloranfenicol, 80 µg/mL de X
gal foi preparado em dimetill formamida e o IPTG em água destilada estéril e as soluções foram armazenadas a
em LB ágar por 16
placas e inoculados em me agitação por 16
através da análise fenotípica de cor a antibiótico (cloranfenicol).
Após confi da cultura foram
foram lacradas com adesivo e acondicionadas clone da biblioteca genômica.
A partir desta biblioteca genômica foram realizados ensaios para identificação e caracterização de clones candidatos envolvidos com resposta ao estresse por luz ultravioleta, como apresentado adiante (Figura 7).
Figura 7. Fluxograma das ativi
Ensaios de Complementação Funcional (Curvas) para confirmar atividade (UVC) Clones Inteiros Análises para predição de
como a DH10B. A seleção das colônias brancas pode ser obtida em placas de LB contendo 25 µg/mL de cloranfenicol, 80 µg/mL de X
i preparado em dimetill formamida e o IPTG em água destilada estéril e as soluções foram armazenadas a
em LB ágar por 16 h a 37 placas e inoculados em me
agitação por 16 h a 37 °C. Foram novamente plaqueados para confirmar genótipo através da análise fenotípica de cor
a antibiótico (cloranfenicol).
Após confirmação, os clones foram estocados em placas de 96 poços foram adicionad
foram lacradas com adesivo e acondicionadas clone da biblioteca genômica.
rtir desta biblioteca genômica foram realizados ensaios para identificação e caracterização de clones candidatos envolvidos com resposta ao estresse por luz ultravioleta, como apresentado adiante (Figura 7).
Figura 7. Fluxograma das ativi
Ensaios de Complementação Funcional (Curvas) para confirmar atividade (UVC) ORF- específicos Análises in silico para predição de proteínas
como a DH10B. A seleção das colônias brancas pode ser obtida em placas de LB contendo 25 µg/mL de cloranfenicol, 80 µg/mL de X
i preparado em dimetill formamida e o IPTG em água destilada estéril e as soluções foram armazenadas a - 20 °C. As colônias foram obtidas após incubação a 37 °C. Os clones (colônias brancas) foram repicados das placas e inoculados em meio LB líquido contendo cloranfenicol 25
°C. Foram novamente plaqueados para confirmar genótipo através da análise fenotípica de cor (coloração azul e branco)
a antibiótico (cloranfenicol).
rmação, os clones foram estocados em placas de 96 poços adicionados em 100
foram lacradas com adesivo e acondicionadas clone da biblioteca genômica.
rtir desta biblioteca genômica foram realizados ensaios para identificação e caracterização de clones candidatos envolvidos com resposta ao estresse por luz ultravioleta, como apresentado adiante (Figura 7).
Figura 7. Fluxograma das atividades realizadas a partir de clones candidatos. Clones Candidatos in silico para predição de proteínas Confirmar Operon
como a DH10B. A seleção das colônias brancas pode ser obtida em placas de LB contendo 25 µg/mL de cloranfenicol, 80 µg/mL de X
i preparado em dimetill formamida e o IPTG em água destilada estéril e as °C. As colônias foram obtidas após incubação °C. Os clones (colônias brancas) foram repicados das
io LB líquido contendo cloranfenicol 25
°C. Foram novamente plaqueados para confirmar genótipo (coloração azul e branco)
rmação, os clones foram estocados em placas de 96 poços em 100 µL de glicerol 100
foram lacradas com adesivo e acondicionadas a
rtir desta biblioteca genômica foram realizados ensaios para identificação e caracterização de clones candidatos envolvidos com resposta ao estresse por luz ultravioleta, como apresentado adiante (Figura 7).
dades realizadas a partir de clones candidatos. Clones Candidatos
proteínas RT-PCR
Confirmar Operon
como a DH10B. A seleção das colônias brancas pode ser obtida em placas de LB contendo 25 µg/mL de cloranfenicol, 80 µg/mL de X-gal fresco e de 20 mM de IPTG. i preparado em dimetill formamida e o IPTG em água destilada estéril e as °C. As colônias foram obtidas após incubação °C. Os clones (colônias brancas) foram repicados das
io LB líquido contendo cloranfenicol 25
°C. Foram novamente plaqueados para confirmar genótipo (coloração azul e branco)
rmação, os clones foram estocados em placas de 96 poços de glicerol 100
a - 80 °C - cada poço representa um
rtir desta biblioteca genômica foram realizados ensaios para identificação e caracterização de clones candidatos envolvidos com resposta ao estresse por luz ultravioleta, como apresentado adiante (Figura 7).
dades realizadas a partir de clones candidatos. Clones Candidatos proteínas PCR Níveis de Expressão Gênica
como a DH10B. A seleção das colônias brancas pode ser obtida em placas de LB gal fresco e de 20 mM de IPTG. i preparado em dimetill formamida e o IPTG em água destilada estéril e as °C. As colônias foram obtidas após incubação °C. Os clones (colônias brancas) foram repicados das
io LB líquido contendo cloranfenicol 25
°C. Foram novamente plaqueados para confirmar genótipo (coloração azul e branco) e teste de resistência
rmação, os clones foram estocados em placas de 96 poços
% por poço, em seguida cada poço representa um
rtir desta biblioteca genômica foram realizados ensaios para identificação e caracterização de clones candidatos envolvidos com resposta ao estresse por luz
dades realizadas a partir de clones candidatos.
proteínas Expressão Ensaio de Mutagênese Direta (Rifampicina) Mutagenicidade gene Diminuição da afinidade do antibiótico = SOBREVIVÊNCIA
como a DH10B. A seleção das colônias brancas pode ser obtida em placas de LB gal fresco e de 20 mM de IPTG. i preparado em dimetill formamida e o IPTG em água destilada estéril e as °C. As colônias foram obtidas após incubação °C. Os clones (colônias brancas) foram repicados das io LB líquido contendo cloranfenicol 25 µg/mL, sob °C. Foram novamente plaqueados para confirmar genótipo e teste de resistência
rmação, os clones foram estocados em placas de 96 poços, 100 por poço, em seguida cada poço representa um
rtir desta biblioteca genômica foram realizados ensaios para identificação e caracterização de clones candidatos envolvidos com resposta ao estresse por luz
dades realizadas a partir de clones candidatos.
proteínas Ensaio de Mutagênese Direta (Rifampicina) Mutagenicidade gene rpoB Diminuição da afinidade do antibiótico = SOBREVIVÊNCIA 26
como a DH10B. A seleção das colônias brancas pode ser obtida em placas de LB gal fresco e de 20 mM de IPTG. i preparado em dimetill formamida e o IPTG em água destilada estéril e as °C. As colônias foram obtidas após incubação °C. Os clones (colônias brancas) foram repicados das µg/mL, sob °C. Foram novamente plaqueados para confirmar genótipo e teste de resistência
100µL por poço, em seguida cada poço representa um
rtir desta biblioteca genômica foram realizados ensaios para identificação e caracterização de clones candidatos envolvidos com resposta ao estresse por luz
dades realizadas a partir de clones candidatos.
Mutagênese Direta
Mutagenicidade Diminuição da
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