3 Trabalhar com Análise de pacientes
3.7 Trabalhar com gráficos
A aplicação fornece vários tipos de gráficos para exibir e analisar dados de paciente.
Nota
Na Análise de pacientes, os gráficos exibem dados de paciente agregados. Por motivos de privacidade, existe um número mínimo de pacientes configurados para os gráficos. Os resultados de filtragem que contêm menos pacientes que esse número mínimo não são exibidos nos gráficos para garantir que você não pode identificar pacientes individuais neles.
Ícone Tipo de gráfico Descrição
Gráfico de barras Os grupos são organizados ao longo do eixo x; os valores numéricos são organizados ao longo do eixo y. Desloque seu cursor sobre uma coluna para uma visão rápida dos atributos que formam o grupo e o respectivo valor numérico.
Você pode selecionar um segundo atributo para o eixo y para criar grupos sobrepostos. Isso permite a você comparar o valor de cada grupo nos grupos de pacientes representados no eixo x.
Diagrama de caixa Se o atributo no eixo y puder ser definido em quartis, você pode exibir os dados em diagrama de caixa. O diagrama de caixa divide os dados em metades com base no valor da mediana. Cada uma das metades é dividida de novo em metades com base no valor da própria mediana. Como resultado, os dados são divididos em quatro quartis com os dois quartis do meio exibidos como caixas e os dois quartis externos como linhas com os valores mínimo e máximo indicados.
Esse diagrama exibe a distribuição de valores para os atributos selecionados.
Curva de Kaplan-Meier
A curva de Kaplan-Meier estima a esperança de vida global de pacientes ou a porcentagem de pacientes ainda vivos em vários intervalos de tempo a seguir a uma interação, como um diagnóstico ou tratamento. Por exemplo, ela pode estimar a esperança de vida a seguir a uma interação, como um diagnóstico ou tratamento.
Para ver a esperança de vida global, você seleciona Data de nascimento como Data de início e Data do óbito como Evento de interesse.
A curva de Kaplan-Meier também pode analisar os dados do tempo antes do evento entre dois momentos selecionados, por exemplo, entre a primeira ocorrência de um tumor e uma recorrência de tumor subsequente. Para isso, você seleciona a interação para o primeiro diagnóstico do tumor como Data de início e a interação para a recorrência de tumor subsequente como Evento de interesse.
Nota
Existem algumas coisas que você deve conhecer ao trabalhar com gráficos, como:
● Os gráficos são exibidos somente para um número mínimo de pacientes. Os resultados da filtragem que contêm menos pacientes que esse número mínimo não são exibidos nos gráficos. Isso acontece por motivos de privacidade. Isso impede que você possa identificar pacientes individuais a partir dos gráficos.
● Os pacientes podem ser representados em mais do que um grupo. Por exemplo, se você selecionar um atributo que representa um código CID para criar grupos de pacientes, os pacientes que têm vários diagnósticos são representados em mais do que um grupo.
● Por vezes, podem faltar valores em seus dados de paciente para determinados atributos, como a data de diagnóstico ou o ano de nascimento. Se um grupo em seu gráfico de barras ou diagrama de caixa contiver pacientes para os quais falta um valor para o atributo indicado como medida no eixo y, esses pacientes não são incluídos nos cálculos para a medida. Contudo, eles ainda são incluídos como pacientes pertencentes a esse grupo no diagrama.
Informações relacionadas
Eixo X, eixo Y e agrupamento de pacientes [página 39]
Gráfico de barras [página 40]
Diagrama de caixa [página 42]
Curva de Kaplan-Meier [página 44]
3.7.1 Eixo X, eixo Y e agrupamento de pacientes
Para representar dados do paciente em um gráfico, você deve selecionar atributos para formar os grupos e as medidas ao longo do eixo x e do eixo y e na sua visualização.
Os atributos que você pode selecionar para o eixo x, eixo y e seletores de Refinar agrupamento de pacientes dependem das interações configuradas.
Quando você seleciona um atributo a partir do menu Mais cartões de filtro, o cartão de filtro correspondente é adicionado automaticamente à ficha Incluído de seus Filtros atuais. Quando você seleciona um atributo a partir do menu Cartões de filtro atuais, ou seja, de um cartão de filtro já adicionado em Incluído, o atributo é
adicionado a esse cartão de filtro se não tiver sido adicionado antes.
Se você quiser anular qualquer atributo que tenha selecionado para o eixo x, o eixo y ou seletores de Refinar agrupamento de pacientes, selecione Reinicializar seleção na caixa drop-down que você deseja reinicializar.
Você pode deslocar seu mouse sobre uma coluna, um segmento ou uma curva para exibir os atributos que formam o grupo e o respectivo valor numérico.
Grupos de pacientes
Você utiliza os seletores do eixo x, x1, x2 e x3 ou seletores de Refinar agrupamento de pacientes de um gráfico para criar grupos. Um grupo é uma combinação dos valores possíveis para os atributos selecionados. Você pode selecionar até três atributos para formar grupos. Cada grupo representa um subconjunto da população de pacientes definida por seus filtros.
Os grupos são utilizadas nos gráficos disponíveis do seguinte modo:
● No gráfico de barras, os grupos se organizam ao longo do eixo x. A altura da coluna representa o valor numérico de cada grupo. Você pode exibir grupos adicionais ao longo do eixo y como segmentos de coluna com código de cor. A altura do segmento representa o valor numérico de cada grupo.
● No diagrama de caixa, é exibida uma caixa para cada grupo que você indica no eixo x.
● Na curva de Kaplan-Meier, é plotada uma curva para cada grupo que você indica em Refinar agrupamento de pacientes.
Nota
Se você estiver tentando exibir um grande número de grupos ao longo do eixo x em seu gráfico de barras ou diagrama de caixa, o número elevado de grupos pode impedir que todas as etiquetas correspondentes sejam exibidas. Em seguida, você pode notar espaçamento inconsistente ou não uniforme entre as
etiquetas ao longo do eixo. Se você desejar visualizar as etiquetas para essas categorias, você pode pesquisar os níveis mais inferiores selecionando os grupos de interesse no gráfico e, em seguida, (Filtrar por seleção).
Medidas
Utilize o seletor do eixo y para selecionar a medida utilizada para calcular o valor de cada grupo. Nos gráficos de barras e de caixa, os valores numéricos são exibidos no eixo y.
Nota
A medida mais básica é o número de pacientes e essa pode ser configurada como a medida padrão. A altura da coluna representa o número de pacientes em cada grupo. Contudo, você pode selecionar outros atributos que têm um formato numérico como medida. Por exemplo, você pode selecionar a idade do paciente com a qual um determinado tipo de interação (como um diagnóstico de doença) ocorreu. Nesse caso, a altura da coluna no gráfico de barras representa a idade média com a qual a interação ocorreu para todos os pacientes em cada grupo. Para ver como os valores para a idade dos pacientes são distribuídos para cada grupo ou parar ver quais são os valores atípicos ou os valores medianos, você seleciona o diagrama de caixa.
3.7.2 Gráfico de barras
Em um gráfico de barras, os grupos são organizados ao longo do eixo x e os valores numéricos são organizados ao longo do eixo y.
Indicar grupos em seu gráfico
Para indicar os grupos para o gráfico de barras, proceda do seguinte modo:
1. Defina filtros para limitar os dados à sua população de interesse.
2. Selecione (Gráfico de barras).
3. Utilize os seletores do eixo x para selecionar até três atributos para formar grupos de pacientes.
4. Utilize o seletor do eixo y para selecionar uma medida.
Nota
A medida mais básica é o número de pacientes e essa pode ser configurada como a medida padrão.
5. Para exibir um gráfico de barras sobreposto, você seleciona um atributo para o seletor do gráfico de barras sobreposto para criar grupos sobrepostos com códigos de cor.
Nota
Quando você exibe um gráfico de barras sobreposto, também é exibida uma legenda para os grupos com código de cor.
Ordenar os grupos do eixo x em seu gráfico de barras
Você utiliza os seletores do eixo x, x1, x2 e x3 ou seletores de Refinar agrupamento de pacientes de um gráfico para criar grupos. Um grupo é uma combinação dos valores possíveis para os atributos selecionados. Você pode selecionar até três atributos para formar grupos. Cada grupo representa um subconjunto da população de pacientes definida por seus filtros.
Os grupos em seu eixo x estão por ordem alfabética ou numérica crescente por padrão. Mas, no gráfico de barras, você pode utilizar a caixa drop-down Ordenar eixo x por: para ajustar essa ordenação. Você pode ordenar com base nos valores de atributo que formam seus grupos no eixo x ou com base nos valores do eixo y. Suas opções de ordenação são as seguintes:
Opção Comportamento de ordenação
Grupo - ascendente Por ordem numérica ou alfabética crescente com base nos
valores de atributo que formam seus grupos no eixo x Group - descendente Por ordem numérica decrescente ou alfabética inversa com
base nos valores de atributo que formam seus grupos no eixo x
Valor - ascendente Por ordem numérica crescente com base nos valores no eixo y.
Valor - descendente Por ordem numérica decrescente com base nos valores no
eixo y.
Se você tiver selecionado mais do que um atributo para seus seletores do eixo x, a ordenação é aplicada em cada nível. Primeiro é aplicada a x1, depois a x2 dentro de x1 e depois a x3 dentro de x2 dentro de x1.
Filtrar por seleção
Você pode selecionar as colunas do gráfico que você deseja utilizar e filtrar as colunas restantes selecionando
(Filtrar por seleção).
Ao selecionar colunas, você pode executar as seguintes ações:
● Para selecionar colunas, selecione as colunas individuais ou arraste o cursor sobre várias colunas.
● Para anular a seleção de uma coluna, selecione a coluna enquanto pressiona a tecla CTRL.
Depois de você selecionar (Filtrar por seleção), os cartões de filtro na ficha Incluído são atualizados para refletir os valores selecionados.
Agrupamento de dados
Você pode reduzir o número de grupos exibidos no gráfico de barras combinando grupos em um intervalo indicado. Isso se chama agrupamento. Você só pode agrupar valores para atributos de filtro numéricos.
Alguns atributos de filtro representam dados distribuídos em valores mais ou menos contínuos. Nesse caso, pode ser útil agrupar essas colunas. Por exemplo, se você desejar exibir como os pacientes com um tipo específico de câncer são distribuídos em grupos de idades, você pode definir que cada coluna no diagrama deve representar uma faixa etária de dez anos. Para isso, proceda do seguinte modo:
1. No cartão de filtro do diagnóstico do tumor, selecione o diagnóstico do câncer.
2. No seletor do eixo x, selecione o atributo Dados básicos> Ano de nascimento.
3. Selecione (Agrupamento de dados) junto ao campo seletor do eixo x e indique o tamanho do agrupamento de dados como 10.
Nota
Se você aplicar o agrupamento de dados ou tiver indicado pelo menos dois valores para o eixo x de seu gráfico e isso resultar em qualquer grupo sem valores, esses grupos podem não ser exibidos em seu gráfico. A inclusão desses grupos em seu gráfico depende das configurações definidas por seu administrador do sistema.
Informações relacionadas
Comparar grupos de pacientes [página 49]
3.7.3 Diagrama de caixa
Para examinar a distribuição de valores numéricos, você pode utilizar o diagrama de caixa.
Para exibir o diagrama de caixa, selecione ( Diagrama de caixa) e selecione uma medida compatível para o eixo y.
O gráfico exibe um diagrama de caixa para cada grupo. Você pode selecionar um diagrama de caixa para ver uma tabela com a mediana, os quartis superior e inferior, os valores máximo e mínimo e o número de pacientes para o grupo.
Você pode selecionar diagramas de caixa e filtrar os diagramas de caixa restantes selecionando (Filtrar por seleção). Depois de você selecionar essa opção de pesquisa de nível inferior, os cartões de filtro são
atualizados para refletir os valores selecionados.
Você também pode selecionar diagramas de caixa e filtrar os diagramas de caixa restantes selecionando a opção Pesquisar nível inferior na caixa de diálogo para um diagrama de caixa selecionado. Isso filtra todos os diagramas de caixa selecionados e não só o diagrama de caixa para o qual você está exibindo a caixa de diálogo.
Nota
Se você aplicar o agrupamento de dados ou tiver indicado pelo menos dois valores para o eixo x de seu gráfico e isso resultar em algumas categorias sem valores, essas categorias podem não ser exibidas em seu gráfico. A inclusão dessas categorias em seu gráfico depende de suas definições de configuração.
Informações relacionadas
Comparar grupos de pacientes [página 49]
3.7.4 Curva de Kaplan-Meier
Você pode plotar curvas de sobrevivência de Kaplan-Meier para estimar a porcentagem de pacientes ainda vivos em vários intervalos de tempo a seguir a uma interação, como um diagnóstico ou um tratamento.
Criar e compreender curvas
Depois de você ter filtrado seus pacientes de interesse, você pode exibir a curva de sobrevivência de Kaplan-Meier. Você efetua isso selecionando (Curva de Kaplan-Meier) e, em seguida, especificando o que você deseja utilizar como ponto de partida e ponto final para sua análise. A aplicação plota uma curva de
sobrevivência para cada combinação de grupo-valor que você indica para os atributos em Refinar agrupamento de pacientes.
Lembrete
Você utiliza estes atributos para criar grupos em seu gráfico. Quanto mais atributos você selecionar para refinar seu agrupamento de pacientes, mais detalhado será o nível de granularidade que você verá em seu gráfico. Na curva de Kaplan-Meier, é plotada uma curva para cada grupo criado. Por isso, quanto mais atributos você selecionar, mais grupos serão plotados em seu gráfico.
É exibida uma legenda codificada por cor, fazendo corresponder os grupos às curvas no gráfico. Ao mover o cursor sobre a curva no gráfico, você pode exibir para cada grupo em qualquer posição na curva:
● Os valores do grupo, com base no que você definiu para o eixo x
● Pacientes: o número total de pacientes no grupo
● Período de sobrevivência: o período sobrevivido expresso em dias
● Taxa de sobrevivência: a probabilidade de sobrevivência expressa como porcentagem
● Número em risco: o número de pacientes ainda vivos e cuja monitorização se estende pelo menos até esse momento na curva
Nota
O valor da Taxa de sobrevivência na informação rápida deve ser considerado somente para seções de linha horizontal da curva.
Especificar pontos de partida e de fim
Para indicar seus próprios pontos de partida e de fim para a análise de Kaplan-Meier, selecione suas opções para o seguinte:
● Data de início: A data de início padrão para a sua análise é Data de nascimento. As opções adicionais que você pode selecionar para sua data de início se baseiam nos cartões de filtro que você adicionou à ficha Incluído com o operador lógico E. Por isso, quanto mais cartões de filtro você tiver adicionado com E, mais opções poderá selecionar a partir daqui, além da opção Data de nascimento. Quando você seleciona um cartão de filtro que adicionou à ficha Incluído como sua data de início, se existirem várias ocorrências da
interação para este cartão de filtro, é utilizada a primeira ocorrência. Mas você também pode selecionar a última ocorrência da interação antes de seu evento de interesse.
● Evento de interesse: a data do óbito é o ponto final padrão para sua análise. Mas você também pode selecionar entre outras interações. O que você pode selecionar depende do que foi configurado por seu administrador do sistema. Você também pode indicar se deseja que a primeira ou última ocorrência da interação seja utilizada para a análise.
Nota
Se você não tiver selecionado opções, por exemplo, quando a curva de Kaplan-Meier abre pela primeira vez, a primeira ocorrência da Data de início e a primeira ocorrência do Evento de interesse são aplicadas por padrão.
Nota
Quaisquer interações com datas no futuro são excluídas como eventos de interesse. A hora à qual você executa sua análise de Kaplan-Meier é considerada a última data possível para que as interações sejam consideradas eventos de interesse.
Executando ações para uma curva
Para uma curva de sobrevivência de Kaplan-Meier, você também pode executar as seguintes ações:
● Exibir ou ocultar o intervalo de confiança para as curvas de sobrevivência
As linhas de erro exibem o intervalo de confiança, tal como calculado utilizando o método linear (Greenwood).
● Exibir ou ocultar linhas que indicam o número de eventos de censura e o número de pacientes censurados em cada intervalo de tempo
Os eventos de censura são as datas após as quais um paciente é removido do número de sobreviventes na análise de Kaplan-Meier. Isso pode ser necessário se o contato com um paciente for perdido ou se um paciente abandonar um estudo, uma vez que o evento de interesse não existe. Por isso, se o evento de interesse do paciente não existir, o evento de censura é a data do último contato conhecido, que o SAP Medical Research Insights define como a interação mais recente que verifica o estado vital.
Nota
Quaisquer interações com datas no futuro são excluídas como eventos de censura. A hora à qual você executa sua análise de Kaplan-Meier é considerada a última data possível para que as interações sejam consideradas eventos de censura.
● Modifique a escala de tempo e o nível de zoom para o gráfico utilizando uma ou mais das seguintes opções:
○ Na caixa drop-down à direita do deslizador abaixo do eixo x, indique a unidade de tempo que você deseja aplicar (Dias, Semanas, Meses ou Anos).
○ Passe com o mouse sobre o deslizador para exibir campos de entrada e insira diretamente valores para as unidades de tempo de início e fim.
○ Desloque o deslizador para a esquerda ou para a direita.
Nota
Para a censura, são utilizadas interações que verificam o estado vital dos pacientes. Se você desejar ver quais interações foram definidas como interações que verificam o estado vital de um paciente, selecione Exibir lista de interações. Essa lista deve ser utilizada somente como referência e só pode ser modificada por seu administrador do sistema.
Informações relacionadas
Comparação de curvas de Kaplan-Meier [página 46]
Cálculo de estatísticas de curva [página 47]
Comparar grupos de pacientes [página 49]
3.7.4.1 Comparação de curvas de Kaplan-Meier
Você pode utilizar funcionalidades na curva de Kaplan-Meier para comparar as curvas em seu gráfico e exibir estatísticas e comparações para combinações dessas curvas.
Se você desejar uma comparação de suas curvas de Kaplan-Meier, você pode exibir o resultado do teste de log-rank. Esse teste de hipóteses compara as distribuições de sobrevivência de todas as curvas em sua curva de Kaplan-Meier. Quanto mais baixo for o valor p retornado pelo teste, maior a diferença estatística entre as curvas incluídas no teste.
Nota
O resultado do teste de log-rank só é calculado quando seu gráfico tem pelo menos duas curvas. Caso contrário, nenhum valor p é calculado e exibido.
Se você desejar exibir estatísticas para cada par de curvas em seu gráfico, selecione Visualizar estatística de curva.
Nota
Você pode exibir essas estatísticas para um mínimo de duas curvas e um máximo de cinco curvas. Você poderá desejar ajustar seus critérios de cartão de filtro ou os atributos que selecionou para os seletores de Refinar agrupamento de pacientes, para que seu gráfico tenha o número correto de curvas.
O diálogo Estatísticas de curva de Kaplan-Meier exibe as seguintes informações:
Tabela Campo Descrição
Teste de log-rank Graus de liberdade O número de valores no cálculo de esta
tística que podem variar. Esse é o nú
mero de curvas em seu gráfico menos um.
Tabela Campo Descrição
Significância Esse é o valor p global para todas as curvas em seu gráfico.
Razões de risco, intervalos de confiança de 95% e valores p
Subgrupo Para cada par de curvas em seu gráfico,
a tabela exibe as seguintes estatísticas:
● A razão de risco
● O intervalo de confiança (entre pa
rênteses)
● O valor p
Para mais informações sobre como es
ses valores são calculados, consulte Cálculo de estatísticas de curva [página 47].
% de taxa de sobrevivência (número em risco)
Colunas Essa tabela indica a porcentagem das
taxas de sobrevivência de paciente jun
tamente o número em risco para cada curva em seu gráfico.
Especificamente, as colunas que são exibidas nessa tabela dependem do se
guinte:
● O nível de zoom do deslizador abaixo do gráfico, pois isso indica o período de tempo
● Qual unidade de tempo você apli
cou a seu gráfico (dias, semanas, meses ou anos)
● Quantos atributos você definiu para seus seletores de Refinar agrupamento de pacientes É sempre exibida uma coluna indicando o número de pacientes.
Linhas Especificamente, as linhas que são exi
bidas na tabela dependem das curvas em seu gráfico. É adicionada uma linha para cada grupo de pacientes represen
tado por uma curva.
3.7.4.2 Cálculo de estatísticas de curva
A curva de Kaplan-Meier permite a você exibir estatísticas de suas curvas de Kaplan-Meier, como valores p, razões de risco e intervalos de confiança. Para utilizar essas estatísticas como base para uma decisão, você poderá desejar compreender como esses valores são calculados.