q g m - centre f o r quan t u m g e o m etry o f m o dulis p a c es

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Figure 1: Basic fatgraph model of proteins. Idealised peptide units are glued together, before edges representing the hydrogen bonds are added.

Figure 2: A protein diagram with an untwisted backbone.

Table 4: Average ∆GDT for the two methods, together with re- re-sults from all models in CASP10 [55] and CASP12 [56]

Figure 6: Two fatgraphs with two three-valent vertices, drawn with their associated surfaces.

Referências

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Matrix model Recursion relation for RNA model Enumeration of RNA chord diagrams via matrix models Recursion relation for the protein model Protein metastructure Binary classification of candidate structures by their topol- Results Discussion Discussion

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