Análise multivariada na agricultura
Jaboticabal - SP
Introdução
Análise de Componentes Principais (ACP)
Análise de Agrupamentos (Análise de Cluster) Análise de Correlação Canônica (ACC)
Análise multivariada na agricultura
Introdução
Análise de Componentes Principais (ACP)
Análise de Agrupamentos (Análise de Cluster) Análise de Correlação Canônica (ACC)
Análise multivariada na agricultura
Introdução
Análise multivariada na agricultura
Introdução
Análise multivariada na agricultura
Diversidade de Solos
Classificação numérica
Marbut (1927) Dokuchaev (1873-1875)
Witney (1901) Glinka (1914)
Q ua
lita tiv a
Q ua nti tati
va
Kellog (1902-1977)
Smith (1960/1980) Diversidade
de Solos
Exemplo:
Classe de textura:
Arenoso <15%
Média entre 15-35%
Argilosa entre 35-65%
Muito argilosa >65%
Os limites quantitativos observados no laboratório são atribuídos nas classes
qualitativas
Soil Survey Stalf, 1951
Soil Taxonomy
Camargo (1987) Embrapa (1999)
Introdução
Análise multivariada na agricultura
Brasil
E.U.A
Limites laboratorias quantitativos
Sistema de classificação de solos
Introdução
Análise multivariada na agricultura
Levantamento: Nível Exploratório
Levantamento: Nível Semi-detalhado
Levantamento: Nível detalhado
Introdução
Análise multivariada na agricultura
Escala 1: 250.000
Escala 1: 50.000
Escala 1: 5.000
Subjetivo
? amts/ ha
Peso genético: 30 %
Peso dos fatores ambientais: 70 %
Introdução
Análise multivariada na agricultura
Estabilidade do agregado
Volume de poros
Densidade
Infiltração de Água no solo
Resistência a penetração Disponibilidade
de nutrientes
CO
2Suscetibilidade Cor
magnética
Introdução
Análise multivariada na agricultura
Introdução
Análise multivariada na agricultura
A análise multivariada se divide em dois grupos:
- Técnicas exploratórias de simplificação:
Análise de componentes principais (CP), análise fatorial, análise de correlações canônicas (ACC), análise de agrupamentos ou cluster, análise discriminante e análise de correspondência;
- Técnicas de inferência estatística:
Métodos de estimação de parâmetros, testes de
hipóteses e análise de variância, covariância e
regressão multivariada.
Introdução
Análise de Componentes Principais (ACP)
Análise de Agrupamentos (Análise de Cluster) Análise de Correlação Canônica (ACC)
Análise multivariada na agricultura
PC1 PC2
Análise de Componentes Principais (ACP)
Análise multivariada na agricultura
Análise de Componentes Principais (ACP)
Análise multivariada na agricultura
Análise de Componentes Principais (ACP)
Análise multivariada na agricultura
Análise de Componentes Principais (ACP)
Análise multivariada na agricultura
CP 1 41,92% SM=25,51% ~ 11%
Exemplo 1
Análise multivariada na agricultura
SIQUEIRA, D.S; MARQUES, JR. J.; MATIAS, S.S.R.; BARRÓN, V.; TORRENT, J.; BAFFA, O.; OLIVEIRA, L.C.
Correlation of properties of Brazilian Haplustalfs with magnetic susceptibility measurements. Soil Use and Management , 2010, v. 26, p.425-431.
Município de Guimarânea, região do Alto Paranaíba, a suldoeste do Estado de Minas Gerais
(18 de produção de café var. Catuaí)
31,7 hectares (145 pontos )
Análise multivariada na agricultura
Exemplo 2
Relação solo-relevo em áreas sob cultivo de café no sudoeste de Minas Gerais. 101f. Dissertação (Mestrado) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Universidade Estadual Paulista, Jaboticabal, 2009.
Unidade amostral amostragem do fruto (média de 9 plantas)
145 pontos
Análise multivariada na agricultura
Exemplo 2
Análise multivariada na agricultura
Exemplo 2
Análise de componentes principais
Análise multivariada na agricultura
Exemplo 2
Análise multivariada na agricultura
Exemplo 2
Análise multivariada na agricultura
Exemplo 2
% peneira
litros pé
-1litros pé
-1Análise multivariada na agricultura
Exemplo 2
Análise multivariada na agricultura
Exemplo 2
Análise multivariada na agricultura
Exemplo 3
Cortez et al. (2011), Energia na Agricultura
Introdução
Análise de Componentes Principais (ACP)
Análise de Agrupamentos (Análise de Cluster) Análise de Correlação Canônica (ACC)
Análise multivariada na agricultura
Análise de Agrupamentos (Análise de Cluster)
Análise multivariada na agricultura
Diferentes Ambientes
Classificação taxonômica Solo A ≠ Solo B
Comportamento (relações)
Solo A = Solo B
Análise de Agrupamentos (Análise de Cluster)
Análise multivariada na agricultura Distância
Euclideana
Distância
Euclideana Média
Distância de Manhattan
Distância de Chebychev
Distância Potência
Diferentes ambientes
2 2
2 2 2 1
1 x ) (x x ) ... (x x )
x (
dAB A B A B mA mB
2 2
2 2 2 1 1
1 (x x ) (x x ) ... (x x ) dAB m A B A B mA mB
mB mA B
A B A
AB x x x x ... x x
d 1 1 2 2
r p
mB mA p
B A p B A
AB (x x ) (x x ) ... (x x ) d 1 1 2 2
Análise de Agrupamentos (Análise de Cluster)
Análise multivariada na agricultura
Não ponderado de Agrupamento aos Pares Ligação Completa
Ligação Simples (problemas com Outline)
Análise de Agrupamentos (Análise de Cluster)
Análise multivariada na agricultura
Análise de Agrupamentos (Análise de Cluster)
Análise multivariada na agricultura
Análise de Agrupamentos (Análise de Cluster)
Análise multivariada na agricultura
Análise de Agrupamentos (Análise de Cluster)
Análise multivariada na agricultura
5 4 6 3 2 1
0 .5 1 .0 1 .5 2 .0 2 .5 3 .0
Exemplos 4
Análise multivariada na agricultura
Caracterização da área
Município: Pereira Barreto – SP
Material de origem: arenitos da Formação Santo Anastácio e basaltos da Formação Serra Geral
Solos: Latossolos Vermelhos textura média, Latossolos Vermelhos Eutroférricos textura argilosa
Uso: cana-de-açúcar Área: 530 ha
Pontos amostrados: 67 pontos (~1 pt / 8 ha)
Soil 1 – Dystrophic Red Latosol (Haplutox) Soil 2 – Eutrophic Red Latosol (Eutrustox) Soil 3 – Eutroferric Red Latosol (Haplustox)
Soil 4 – Typical eutrophic Litholic Neosol (Orthents)
Exemplo 4
Análise multivariada na agricultura
Dendograms classes of soil built based on attributes of greater relevance to PC1
in depth 0.0-0.2 m (a) and 0.8-1.0 m (b). Geomorphic surfaces I (LVd = Dystrophic
Red Latosol - Haplustox); Geomorphic surfaces II ( LVe” = Eutrophic Red Latosol -
Eutrustox); Geomorphic surfaces III (LVe’’’ = Eutrophic Red Latosol; LVef =
Eutrophic Red Latosol - Haplustox; Rle = typical eutrophic Litholic Neosol –
Orthents).
Introdução
Análise de Componentes Principais (ACP)
Análise de Agrupamentos (Análise de Cluster) Análise de Correlação Canônica (ACC)
Análise multivariada na agricultura
Análise de Correlação Canônica (ACC)
Análise multivariada na agricultura
P ro d uç ão
Resistência à penetração
Produção= a – b.RP
% fibra Teor de açúcar Produção (…)
Resistência à penetração, CTC, Mg, Ca, Umidade, (…)
Análise multivariada
P= a.RP+ b.CTC+ c.Ca+ d.Umidade + (...) S = índice do solo
P = índice da planta
30 variáveis da planta (% fibra, teor açúcar, TCH, pol do caldo ... ) 30 variáveis do solo ( densidade, teor de argila, CTC,... ) Relações de causa e efeito (inviável e pouco esclarecedora) Estudo das relações de causa e efeito
Análise de Correlação Canônica (ACC)
Análise multivariada na agricultura
Análise de Correlação Canônica (ACC)
Análise multivariada na agricultura
Y1 Y2
Caracterização da área
Município: Gavião Peixoto – SP
Material de origem: arenitos do Grupo Bauru, Formação Adamantina
Solos: Latossolo Vermelho Escuro distrófico, com horizonte A moderado e textura média a argilosa
Uso: laranja Área: 95,6 ha
Pontos amostrados: 312 (~ 1pt / 0,3 ha)
Exemplo 5
Análise multivariada na agricultura
Siqueira et al. (2010), Geoderma
Exemplo 5
Análise multivariada na agricultura
Siqueira et al. (2010), Geoderma
Índice de qualidade física do solo Índice da fruta
0.18 0.39
“DMG, teor de argila, teor de matéria orgânica, condutividade hidráulica, resistência do solo à penetração, teor de água, VTP e densidade do solo na profundidade de 0.00 – 0.20 m”
“Sólidos solúveis totais, acidez total titulavel, produção e tamanho da frua, em três épocas diferentes”
côncava
côncava
Exemplo 5
Análise multivariada na agricultura
Siqueira et al. (2010), Geoderma
7.248,73 kg
Preço médio do suco concentrado e congelado na Bolsa de Nova Iorque,
2007 (US$/t): 2223*
* Fonte: Centro de Estudos Avançados em Economia Aplicada CEPEA ESALQ/USP
~ 16 mil dólares/ha
Exemplo 5
Análise multivariada na agricultura
Cortez et al. (2011), Energia na agricultura
Côncava
Literatura consultada
Apostila
Análise Exploratória de Dados - Estatística Multivariada –
Prof. Dr. Antonio Sérgio Ferraudo