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Functional turnover and community assemblage during tropical forest succession
Vinícius Marcilio-Silva, Valério D. Pillarand Márcia C. M. Marques
Figure S1. Distribution of the coastal Atlantic Forest, and the studied region (vertical lines) in Southern Brazil (A). Distribution of the 23 forest areas in Southern Brazil (B).
Figure S2. Scaling up of trait-based data to the community level to reveal trait- convergence and trait-divergence assembly patterns and phylogenetic signal related to ecological gradients. The squares represent full matrices and the triangles distance matrices. Input data matrices needed for the analysis are in (a) W with presence or abundance of species in communities, B with traits describing the species, SF with phylogenetic pairwise similarities of species, and E with the ecological gradient of interest. The procedure in (b) finds trait-
convergence assembly patterns (TCAP) related to E, via the computation of ρ (TE), the matrix correlation between dissimilarity matrices DT and DE computed after T and E, where T=B’W. The procedure in (c) finds trait-based community patterns related to E, which express both trait divergence and convergence, via the computation of ρ(XE), the matrix correlation between DX and DE computed after X and E, where X=U’W, and U contains degrees of belonging of species (or any operational taxonomic units) to a priori defined types that in this case are the species, based in their traits similarities. The outcome in (d) are matrix correlations measuring of phylogenetic signal at the species level ρ(BF) and phylogenetic signal at the metacommunity level (PSMT) ρ(PT). See Pillar et al.
(2009) and Pillar and Duarte (2010) for details.
Table S1. Forest areas studied in present study, and respective reference number (in Figure S1), age, locality and the source. * no information (point-quarter sampling).
Community
number Age Locality (City and State)
Coordinates Sampling size (m²)
Species
Richness Source
Lat Long
1 4 Antonina - PR -25.32 -48.7 3,000 16 Cheung et al. (2009)
2 13 Blumenau - SC -27.06 -49.1 600 26 Schorn & Galvão (2006)
3 15 Antonina - PR -25.53 -48.83 300 17 Borgo (2010)
4 15 Iporanga - SP -24.6 -48.6 1,000 39 Aidar et al. (2001)
5 15 Iporanga - SP -24.52 -48.68 500 31 Torezan (1995)
6 15 Morretes - PR -25.5 -48.63 2,000 24 Guapyassú (1994)
7 20 Antonina - PR -25.31 -48.7 1,000 9 Liebsch et al. (2007)
8 20 Blumenau - SC -27.06 -49.1 600 78 Schorn & Galvão (2006)
9 22.5 Antonina - PR -25.53 -48.69 600 46 Borgo (2010)
10 25 Angra dos Reis - RJ -23.18 -44.31 2,600 62 Oliveira (2004)
11 25 Iporanga - SP -24.52 -48.68 1,000 30 Aidar et al. (2001)
12 25 Morretes - PR -25.5 -48.63 2,000 37 Guapyassú (1994)
13 35 Antonina - PR -25.53 -48.69 1,800 77 Borgo (2010)
14 36 Iporanga - SP -24.52 -48.68 1,000 53 Aidar et al. (2001)
15 50 Antonina - PR -25.53 -48.69 1,750 95 Borgo (2010)
16 50 Iporanga - SP -24.6 -48.61 980 69 Torezan (1995)
17 50 Peruíbe - SP -24.28 -47 2,000 36 Oliveira et al. (2001)
18 60 São Pedro de
Alcântara - SC -27 -48.8 1,800 47
Siminski et al. (2004)
19 80 Antonina - PR -25.31 -48.7 1,500 61 Liebsch et al. (2007)
20 120 Antonina - PR -25.31 -48.7 1,500 51 Liebsch et al. (2007)
21 120 Blumenau - SC -27.06 -49.1 600 78 Schorn & Galvão (2006)
22 120 Morretes - PR -25.5 -48.63 * 73 Silva (1994)
23 120 Morretes - PR -25.5 -48.63 3,800 57 Guapyassú (1994)
Table S2. Mantel correlation of communities sampling size (Table S1) and site localization (coordinates in Table S1) with diversity (taxonomic, Rao
Phylogenetic diversity and Rao Functional diversities (based on all traits, TCAP’s traits and TDAP’s traits, see main methods for more details). Mantel statistic based on Pearson's product-moment correlation and 999 permutations.
Sampling Size Localization
r P r P
Taxonomic diversity (S) -0.08 0.747 -0.09 0.728 Phylogenetic diversity (Rao) -0.04 0.548 -0.09 0.697 Functional diversities (Rao):
Rao All traits -0.07 0.731 -0.16 0.931
Rao TCAP -0.00 0.422 -0.18 0.954
Rao TDAP 0.20 0.075 -0.16 0.904
Table S3. Bibliographical source of plant traits.
Traits Source
Growth (arboreal habitus, tree guild) and leaf
functions (leaf compoundness, leaf slenderness and leaf area)
von Martius 1906; Reitz 1965; Lorenzi 2002, 2008, 2009; Carvalho 2003, 2006, 2008.
Reproduction (pollination and dispersal syndromes)
Marques & Britez 2005; Melo & Mantovani 1994; Matallana et al. 2005; Goldenberg &
Reginato 2006.
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