Microbiologia do solo e ar
Microbiologia Industrial 2015
Minerais:
− Sílica (SiO2), Fe, Al, Ca, Mg, K
− P, S, Mn, Na, N .
Água:
− livre: poros do solo;
− adsorvida: ligada aos coloides (argilas)
Gases:
− CO2, O2, N2 .
− composição variável em função dos processos biológicos.
Plantas;
Animais;
Micro-organismos: grande diversidade e abundância.
Componentes bióticos
→ origem vegetal, animal e microbiana;
→ insolúvel (húmus): resultado da
decomposição microbiana de
resíduos de plantas e animais;
incluindo a massa microbiana
envolvida no processo;
− melhora a estrutura do solo, libera nutrientes;
− efeito tampão, retenção de água
→ solúvel: produtos da degradação de polímeros complexos:
Organismos metabolismo diversos convivendo lado a lado, interagindo em equilíbrio dinâmico, muitas vezes com dependência associada e gerando alta biodiversidade.
→
Estão em associação com componentes abióticos. Direta ou indiretamente recebe todos os dejetos dos seres vivos;
local de transformação da matéria orgânica em substâncias nutritivas;
os micro-organismos do solo desempenham papel fundamental na manutenção da vida na terra, pois são elos de ligação entre animais e plantas.
Componentes bióticos e abióticos do solo
Água Ar Areia Silte Hifas de fungosComplexo matéria orgânica e argila
Argila Bactérias
Diâmetro (mm) Classe
0,0002 a 0,002 Argila
0,002 a 0,05 Silte
0,05 a 0,2 Areia fina
0,2 a 2,0 Areia grossa
Presença de microrganismos nas várias profundidades do solo
Profundidade Umidade Mat. orgânica Bactérias Fungos
(cm) (%) (%) (x 106)/g (m/g) aeróbias anaeróbias 0 - 8 18,2 4,4 24 2,7 280 8- 20 10,0 1,5 3,1 0,4 43 20-40 11,5 0,5 1,9 0,4 0 40-60 13,5 0,6 0,9 0,04 0 60-80 7,9 0,4 0,7 0,03 0 80-100 5,3 0,4 0,15 0,01 0
Fonte: Lindegreen & Jensen, 1973
Solos
O solo é a região da crosta terrestre onde a geologia e a biologia se encontram;
se compararmos as características físicas e químicas dos solos de desertos, florestas, pântanos, pastagens de animais e fazendas, observamos que existem diferenças marcantes entre elas.
Solos
Os solos são caracterizados
pelos horizons, camadas
paralelas de várias espessuras e estruturas.
Cada camada difere das outras,
em propriedades como
conteúdo orgânico e mineral, cor, textura, estrutura, porosidade e pH.
Estas propriedades são
influenciadas por umidade, conteúdo de gases e conteúdo biológico do horízon.
Um horízon que é rico em matéria orgânica tem grande atividade biológica e é bastante diferente de um que é constituído por rocha.
A matéria orgânica entra no solo a partir de várias fontes. Por ex., celulose, lignina e glicanas como a pectina são provenientes de restos de plantas mortas.
As proteínas vem de animais mortos, a quitina, do exoesqueleto de insetos,
e polissacarídeos complexos, da parede celular de fungos e outros micro-organismos.
• A urina e as fezes de
animais também
contribuem com
Micro-organismos do solo
A quantidade os tipos de micro-organismos presentes no
solo dependem de muitos fatores ambientais:
1. Quantidade e tipo de nutrientes disponíveis;
2. Umidade disponível;
3. Grau de aeração;
4. Temperatura;
5. pH;
6. Práticas e eventos que podem introduzir grande número de micro-organismos no solo, como a aplicação de adubos ou dejetos de esgotos e a ocorrência de enchentes, ou aqueles que podem remover os micro-organismos, como as tempestades de poeira.
A quantidade os tipos de micro-organismos presentes
no solo dependem de muitos fatores ambientais:
− A presença de raízes e a extensão do sistema radicular no solo também podem afetar o número e os tipos de micro-organismos presentes. Isso é denominado efeito rizosfera;
− Interações de espécies microbianas também tem um importante efeito na população microbiana no solo. Protozoários predatórios e actinomicetes produtores de antibióticos podem eliminar certas espécies de micro-organismos. Por outro lado, bactérias que decompõem celulose e proteínas podem fornecer nutrientes para espécies bioquimicamente menos versáteis.
Bactérias
• Grupo de micro-organismos mais numeroso e mais
diversificado;
• 3 x 106 a 5 x 108 por g de solo seco;
Bactérias aproximado por porção de
solo
aproximada (libras/acre)
Junto com os fungos são o grupo maisimportante na decomposição da matéria orgânica. Compostos extracelulares ajudam a se ligarem às partículas
dos solos nos agregados.
300 milhões
– 50 bilhões
400 – 4.000
Grupos mais frequentes: Bacillus, Clostridium, Arthrobacter, Pseudomonas, Nocardia, Streptomyces, Micromonospora, Rizóbios Cianobactérias.Gêneros mais frequentes de bactérias
Os actinomicetes podem degradar muitas substâncias complexas e, desta forma, são importantes no melhoramento da fertilidade do solo. Também são conhecidos pela capacidade de produzir antibióticos em laboratório.
Cianobactérias: bactérias fotossintéticas produtoras de oxigênio. Crescem na superfície de rochas recentemente expostas e suas células acumulam-se como depósitos orgânicos, também auxiliam no fornecimento de N2para certas plantações.
Actinomicetos aproximado (porção de
solo)
(libras/acre)
• Tipos de bactéria com crescimento e funções semelhante aos fungos;
• Produzem compostos
que proporcionam ao solo um aroma típico.
100 milhões– 2 bilhões
Fungos
5 x 103 - 9 x 105 por g de solo seco;
limitados à superfície do solo;
favorecidos em solos ácidos;
ativos decompositores de tecidos vegetais;
melhoram a estrutura física do solo.
Fungos aproximado (porção de
solo)
(libras/acre)
•Grupo mais envolvido na
decomposição de compostos resistentes (cellulose, lignina, pectina)
• Crescimento da hifa
através do solo ajuda sua ligação aos agregados
• Fungos em simbiose com
raizes de plantas aumentam a absorção de nutrientes e água diminuindo a incidência de doenças. 5.000 – 900.000 500 – 5.000 •Penicillium, Mucor, Rhizopus, Fusarium, Aspergillus,Trichoderma
Fungos
− As condições físicas e químicas (nutrientes no solo determinam as espécies predominantes; − As leveduras são encontradas com frequência no solo de vinhedo, de pomares e de apiários, uma vez que são abundantes em folhas troncos e frutas que caem no solo. 103 - 5 x 105por g de solo seco – população menor que bactérias e fungos;
Podem se associar a fungos e auxiliar na transformação de material rochosos;
Principais espécies: algas verdes Chlorophyta e as diatomáceas Chysophyta;
Por serem fotoautotróficos, as algas estão predominantemente próximas da superfície do solo;
Em terras improdutivas e com erosões, elas podem iniciar o acumulo de matéria orgânica devido às suas atividades fotossintéticas.
Protozoários e Vírus
− O número de protozoários em solos ricos e úmidos varia de poucas centenas a várias centenas de milhares por grama (1x 103 - 5x 105).
− Muitos protozoários do solo alimentam-se de bactérias e outros materiais orgânicos;
− Vírus de plantas e de animais também ocorrem no solo, em tecidos de plantas e animais mortos e em excretas de animais.
Nematóides aproximado por grama de solo (libras/acre) • Auxiliam outros microrganismos na decomposição da matéria orgânica 50 – 200 50-100
26 Artrópodes Número aproximado (porção de solo) Biomassa (libras/acre) • Auxiliam outros microrganismos na decomposição da matéria orgânica 100 - 1000 1-10
Minhocas aproximado (porção de solo) (libras/acre) • Auxiliam outros microrganismos na decomposição da matéria orgânica 0 - 2 10-40
Contagem e isolamento de micro-organismos do solo
Algumas das técnicas utilizadas para estimar o número e os tipos de micro-organismos do solo incluem a técnica da cultura em placa, exame microscópico direto e a técnica de enriquecimento.
Técnica da cultura em placa
− Na técnica da cultura em placa, diluições da amostra do solo são adicionadas a tubos contendo meio liquefeito e resfriado, e posteriormente o conteúdo desses tubos é distribuído em placas de Petri. As diluições podem ser semeadas também na superfície do meio solidificado em placa para permitir o desenvolvimento de colônias;
− A partir do número de colônias desenvolvidas na placa, podemos calcular o número de organismos vivos por grama de solo;
− Entretanto somente uma parte da população microbiana total será capaz de crescer sob qualquer condição especifica de cultivo.
Exame microscópico direto
− Para o exame microscópico direto, uma diluição da amostra do solo é espalhada em camada fina sobre uma lâmina de vidro. Após fixação e coloração do esfregaço, os micro-organismos podem ser contados pelo exame microscópico;
− Embora este método possa ser utilizado para estimar a população microbiana total, técnicas de colorações especiais são necessárias para distinguir micro-organismos vivos de mortos. Além do mais, muitas vezes é difícil diferenciar partículas microscópicas do solo de células microbianas.
Contagem e isolamento de micro-organismos do solo
Técnica de enriquecimento
− A técnica de enriquecimento não fornece informações quantitativas sobre a flora microbiana presente em dada amostra. Mas auxilia no isolamento de microrganismos que são capazes de metabolizar um de terminado substrato e que podem estar presentes em pequena quantidade na amostra original;
− No isolamento de micro-organismos do solo que podem
degradar um composto fenólico como o ácido
Principal fonte de enzimas no solo;
Responsável por toda a atividade biológica; Catalisa transformações bioquímicas;
Representam fonte e dreno de carbono;
Troca de nutrientes entre o ecossistema solo-planta e a atmosfera.
− Decomposição (aeróbica, anaeróbica);
− Degradação de moléculas orgânicas complexas (Pseudomonas
sp.);
− Transformações de nutrientes (Solubilização de fosfato, mineralização);
− Interações mutualísticas.
Bactérias
− Decomposição (aeróbica e fermentação por leveduras);
− Degradação de moléculas orgânicas complexas (Basidiomicetos – lignina);
− Produção de antibióticos (Penicillium - penicilina);
− Solubilizadores de fosfato (Aspergillus);
− Micorrizas;
− Agregação do solo.
Rizosfera
− Região onde o solo e as raízes das plantas entram em contato;
− O número de micro-organismos na raiz e a sua volta é muito maior do que no solo livre;
− Os tipos de micro-organismos na rizosfera também diferem do solo livre de raiz;
− Na rizosfera as bactérias são os micro-organismos predominantes;
− O crescimento bacteriano é estimulado por nutrientes como
− Os produtos do metabolismos que são liberados na rizosfera
estimulam o crescimento das plantas;
− Assim, uma troca de nutrientes ocorre entre o sistema radicular da planta e os micro-organismos.
Compostos Excretados pelas Plantas na Rizosfera
(Rizodeposição)
Minerais
e
partículas
orgânicas
são
intimamente ligadas
→
formando vários tipos de
agregados
Formação dos agregados - etapas
− Floculação: quando partículas primárias permanecem íntimamente unidas devido a forças interativas (eletrostática, Van der Waals, e/ou pontes de hidrogênio);
− Cimentação: estabilização dos flóculos pela ação de agentes cimentantes (compostos orgânicos, carbonatos, Fe e óxidos de Al).
Matéria orgânica dispersa
Polissacarídeos extracelulares de micro-organismos com
ação cimentante
Polissacarídeo Micro-organismo
Xantana Xanthomonas campestris
Dextrana Aerobacter spp,
Streptococcus bovis Curdlana Alcaligenes faecalis
Agregados ou partículas Raízes Hifas de fungos Poros Sólido Principais agentes ligantes
Raízes e hifas de
fungos
Fatores que afetam a agregação do solo
Fatores Efeitos ou contribuição
Tamanho das partículas Balanço / densidade de cargas e superfície específica
Regime hídrico Ciclos de umedecimento/ secagem
Matéria orgânica do solo Substrato microbiano e ação cimentante
Cultivo do solo Promove a dispersão das partículas
Micro-organismos Adesão das partículas e produção de agentes cimentantes
Macro-organismos Promovem aglomeração das partículas
Raízes finas Decomposição favorece microrganismos; ação mecânica que promove aproximação
beneficiadas
Pinusspp.(Pine) Endomicorrizas arbuscular
A planta, através da fotossíntese, fornece energia e carbono para a sobrevivência e multiplicação dos fungos, enquanto estes absorvem nutrientes minerais e água do solo, transferindo-os para as raízes da planta, estabelecendo assim a mutualista da simbiose.
Micoriza: Associação harmônica entre fungos e raízes
Nódulos de Rhizobium: associação harmônica
Pisumsativum(pea)
Beneficia
Microrganismo
A
Microrganismo
B
• Conversão de substratos Fungos → bactérias52
Parasitismo
-Associação
desarmônica
53 Microrganismo A Microrganismo B
Espaço
Nutrientes
Água
Oxigênio
Mesmo Microhabitat Maior habilidade genéticaMicrorganismo A
Secreção de produtos tóxicos
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Microbiologia ar
Microbiologia Industrial 2015
Microbiologia do ar
− A população microbiana do ar é transitória e variável. O ar não é um meio no qual podem crescer micro-organismos;
− é um portador de poeiras e gotículas que carregam micro-organismos;
− Alguns micros morrem em questão de segundos, outros meses e anos.
− Exposição de placa de Petri com meio nutritivo;
− Aparelho de impacto
sólido;
− Aparelho de impacto
Tipos de micro-organismos presente no ar
− Bactérias; − Bolores; − Leveduras; − Algas; − Protozoários.Altitude (m) Bactérias (gênero) Bolores(gênero) 450-1.350 Alcaligenes Bacillus Aspergillus Macrosporium 1.350 – 2.250 Bacillus Aspergillus Cladosporium 2.250 - 3150 Bacillus Sarcina Aspergillus Hormodendrum 3150 – 4.050 Bacillus Kurthia Aspergillus 4.050 – 4.950 Bacillus Micrococcus Penicillium
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