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aula15_Microbiologia do solo e ar

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Microbiologia do solo e ar

Microbiologia Industrial 2015

(2)
(3)

Minerais:

Sílica (SiO2), Fe, Al, Ca, Mg, K

P, S, Mn, Na, N .

Água:

livre: poros do solo;

adsorvida: ligada aos coloides (argilas)

Gases:

CO2, O2, N2 .

composição variável em função dos processos biológicos.

(4)

Plantas;

Animais;

Micro-organismos: grande diversidade e abundância.

Componentes bióticos

(5)

origem vegetal, animal e microbiana;

insolúvel (húmus): resultado da

decomposição microbiana de

resíduos de plantas e animais;

incluindo a massa microbiana

envolvida no processo;

melhora a estrutura do solo, libera nutrientes;

efeito tampão, retenção de água

solúvel: produtos da degradação de polímeros complexos:

(6)

Organismos metabolismo diversos convivendo lado a lado, interagindo em equilíbrio dinâmico, muitas vezes com dependência associada e gerando alta biodiversidade.

Estão em associação com componentes abióticos.

(7)

Direta ou indiretamente recebe todos os dejetos dos seres vivos;

local de transformação da matéria orgânica em substâncias nutritivas;

os micro-organismos do solo desempenham papel fundamental na manutenção da vida na terra, pois são elos de ligação entre animais e plantas.

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Componentes bióticos e abióticos do solo

Água Ar Areia Silte Hifas de fungos

Complexo matéria orgânica e argila

Argila Bactérias

(9)

Diâmetro (mm) Classe

0,0002 a 0,002 Argila

0,002 a 0,05 Silte

0,05 a 0,2 Areia fina

0,2 a 2,0 Areia grossa

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Presença de microrganismos nas várias profundidades do solo

Profundidade Umidade Mat. orgânica Bactérias Fungos

(cm) (%) (%) (x 106)/g (m/g) aeróbias anaeróbias 0 - 8 18,2 4,4 24 2,7 280 8- 20 10,0 1,5 3,1 0,4 43 20-40 11,5 0,5 1,9 0,4 0 40-60 13,5 0,6 0,9 0,04 0 60-80 7,9 0,4 0,7 0,03 0 80-100 5,3 0,4 0,15 0,01 0

Fonte: Lindegreen & Jensen, 1973

Solos

(11)

O solo é a região da crosta terrestre onde a geologia e a biologia se encontram;

se compararmos as características físicas e químicas dos solos de desertos, florestas, pântanos, pastagens de animais e fazendas, observamos que existem diferenças marcantes entre elas.

(12)

Solos

Os solos são caracterizados

pelos horizons, camadas

paralelas de várias espessuras e estruturas.

Cada camada difere das outras,

em propriedades como

conteúdo orgânico e mineral, cor, textura, estrutura, porosidade e pH.

Estas propriedades são

influenciadas por umidade, conteúdo de gases e conteúdo biológico do horízon.

(13)

Um horízon que é rico em matéria orgânica tem grande atividade biológica e é bastante diferente de um que é constituído por rocha.

A matéria orgânica entra no solo a partir de várias fontes. Por ex., celulose, lignina e glicanas como a pectina são provenientes de restos de plantas mortas.

As proteínas vem de animais mortos, a quitina, do exoesqueleto de insetos,

e polissacarídeos complexos, da parede celular de fungos e outros micro-organismos.

A urina e as fezes de

animais também

contribuem com

(14)

Micro-organismos do solo

A quantidade os tipos de micro-organismos presentes no

solo dependem de muitos fatores ambientais:

1. Quantidade e tipo de nutrientes disponíveis;

2. Umidade disponível;

3. Grau de aeração;

4. Temperatura;

5. pH;

6. Práticas e eventos que podem introduzir grande número de micro-organismos no solo, como a aplicação de adubos ou dejetos de esgotos e a ocorrência de enchentes, ou aqueles que podem remover os micro-organismos, como as tempestades de poeira.

(15)

A quantidade os tipos de micro-organismos presentes

no solo dependem de muitos fatores ambientais:

A presença de raízes e a extensão do sistema radicular no solo também podem afetar o número e os tipos de micro-organismos presentes. Isso é denominado efeito rizosfera;

Interações de espécies microbianas também tem um importante efeito na população microbiana no solo. Protozoários predatórios e actinomicetes produtores de antibióticos podem eliminar certas espécies de micro-organismos. Por outro lado, bactérias que decompõem celulose e proteínas podem fornecer nutrientes para espécies bioquimicamente menos versáteis.

(16)

Bactérias

Grupo de micro-organismos mais numeroso e mais

diversificado;

3 x 106 a 5 x 108 por g de solo seco;

(17)

Bactérias aproximado por porção de

solo

aproximada (libras/acre)

Junto com os fungos são o grupo mais

importante na decomposição da matéria orgânica.  Compostos extracelulares ajudam a se ligarem às partículas

dos solos nos agregados.

300 milhões

– 50 bilhões

400 – 4.000

Grupos mais frequentes: Bacillus, Clostridium, Arthrobacter, Pseudomonas, Nocardia, Streptomyces, Micromonospora, Rizóbios Cianobactérias.

(18)

Gêneros mais frequentes de bactérias

Os actinomicetes podem degradar muitas substâncias complexas e, desta forma, são importantes no melhoramento da fertilidade do solo. Também são conhecidos pela capacidade de produzir antibióticos em laboratório.

Cianobactérias: bactérias fotossintéticas produtoras de oxigênio. Crescem na superfície de rochas recentemente expostas e suas células acumulam-se como depósitos orgânicos, também auxiliam no fornecimento de N2para certas plantações.

(19)

Actinomicetos aproximado (porção de

solo)

(libras/acre)

Tipos de bactéria com crescimento e funções semelhante aos fungos;

• Produzem compostos

que proporcionam ao solo um aroma típico.

100 milhões– 2 bilhões

(20)

Fungos

5 x 103 - 9 x 105 por g de solo seco;

limitados à superfície do solo;

favorecidos em solos ácidos;

ativos decompositores de tecidos vegetais;

melhoram a estrutura física do solo.

(21)

Fungos aproximado (porção de

solo)

(libras/acre)

•Grupo mais envolvido na

decomposição de compostos resistentes (cellulose, lignina, pectina)

• Crescimento da hifa

através do solo ajuda sua ligação aos agregados

• Fungos em simbiose com

raizes de plantas aumentam a absorção de nutrientes e água diminuindo a incidência de doenças. 5.000 – 900.000 500 – 5.000 •Penicillium, Mucor, Rhizopus, Fusarium, Aspergillus,Trichoderma

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Fungos

As condições físicas e químicas (nutrientes no solo determinam as espécies predominantes;As leveduras são encontradas com frequência no solo de vinhedo, de pomares e de apiários, uma vez que são abundantes em folhas troncos e frutas que caem no solo.

(23)

103 - 5 x 105por g de solo seco – população menor que bactérias e fungos;

Podem se associar a fungos e auxiliar na transformação de material rochosos;

Principais espécies: algas verdes Chlorophyta e as diatomáceas Chysophyta;

Por serem fotoautotróficos, as algas estão predominantemente próximas da superfície do solo;

Em terras improdutivas e com erosões, elas podem iniciar o acumulo de matéria orgânica devido às suas atividades fotossintéticas.

(24)

Protozoários e Vírus

O número de protozoários em solos ricos e úmidos varia de poucas centenas a várias centenas de milhares por grama (1x 103 - 5x 105).

Muitos protozoários do solo alimentam-se de bactérias e outros materiais orgânicos;

Vírus de plantas e de animais também ocorrem no solo, em tecidos de plantas e animais mortos e em excretas de animais.

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Nematóides aproximado por grama de solo (libras/acre) • Auxiliam outros microrganismos na decomposição da matéria orgânica 50 – 200 50-100

(26)

26 Artrópodes Número aproximado (porção de solo) Biomassa (libras/acre) • Auxiliam outros microrganismos na decomposição da matéria orgânica 100 - 1000 1-10

(27)

Minhocas aproximado (porção de solo) (libras/acre) • Auxiliam outros microrganismos na decomposição da matéria orgânica 0 - 2 10-40

(28)

Contagem e isolamento de micro-organismos do solo

Algumas das técnicas utilizadas para estimar o número e os tipos de micro-organismos do solo incluem a técnica da cultura em placa, exame microscópico direto e a técnica de enriquecimento.

Técnica da cultura em placa

Na técnica da cultura em placa, diluições da amostra do solo são adicionadas a tubos contendo meio liquefeito e resfriado, e posteriormente o conteúdo desses tubos é distribuído em placas de Petri. As diluições podem ser semeadas também na superfície do meio solidificado em placa para permitir o desenvolvimento de colônias;

A partir do número de colônias desenvolvidas na placa, podemos calcular o número de organismos vivos por grama de solo;

Entretanto somente uma parte da população microbiana total será capaz de crescer sob qualquer condição especifica de cultivo.

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Exame microscópico direto

Para o exame microscópico direto, uma diluição da amostra do solo é espalhada em camada fina sobre uma lâmina de vidro. Após fixação e coloração do esfregaço, os micro-organismos podem ser contados pelo exame microscópico;

Embora este método possa ser utilizado para estimar a população microbiana total, técnicas de colorações especiais são necessárias para distinguir micro-organismos vivos de mortos. Além do mais, muitas vezes é difícil diferenciar partículas microscópicas do solo de células microbianas.

(30)

Contagem e isolamento de micro-organismos do solo

Técnica de enriquecimento

A técnica de enriquecimento não fornece informações quantitativas sobre a flora microbiana presente em dada amostra. Mas auxilia no isolamento de microrganismos que são capazes de metabolizar um de terminado substrato e que podem estar presentes em pequena quantidade na amostra original;

No isolamento de micro-organismos do solo que podem

degradar um composto fenólico como o ácido

(31)

Principal fonte de enzimas no solo;

Responsável por toda a atividade biológica;Catalisa transformações bioquímicas;

Representam fonte e dreno de carbono;

Troca de nutrientes entre o ecossistema solo-planta e a atmosfera.

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Decomposição (aeróbica, anaeróbica);

Degradação de moléculas orgânicas complexas (Pseudomonas

sp.);

Transformações de nutrientes (Solubilização de fosfato, mineralização);

Interações mutualísticas.

Bactérias

(33)

Decomposição (aeróbica e fermentação por leveduras);

Degradação de moléculas orgânicas complexas (Basidiomicetos – lignina);

Produção de antibióticos (Penicillium - penicilina);

Solubilizadores de fosfato (Aspergillus);

Micorrizas;

Agregação do solo.

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Rizosfera

Região onde o solo e as raízes das plantas entram em contato;

O número de micro-organismos na raiz e a sua volta é muito maior do que no solo livre;

Os tipos de micro-organismos na rizosfera também diferem do solo livre de raiz;

Na rizosfera as bactérias são os micro-organismos predominantes;

− O crescimento bacteriano é estimulado por nutrientes como

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− Os produtos do metabolismos que são liberados na rizosfera

estimulam o crescimento das plantas;

Assim, uma troca de nutrientes ocorre entre o sistema radicular da planta e os micro-organismos.

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Compostos Excretados pelas Plantas na Rizosfera

(Rizodeposição)

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Minerais

e

partículas

orgânicas

são

intimamente ligadas

formando vários tipos de

agregados

(40)

Formação dos agregados - etapas

Floculação: quando partículas primárias permanecem íntimamente unidas devido a forças interativas (eletrostática, Van der Waals, e/ou pontes de hidrogênio);

Cimentação: estabilização dos flóculos pela ação de agentes cimentantes (compostos orgânicos, carbonatos, Fe e óxidos de Al).

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Matéria orgânica dispersa

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Polissacarídeos extracelulares de micro-organismos com

ação cimentante

Polissacarídeo Micro-organismo

Xantana Xanthomonas campestris

Dextrana Aerobacter spp,

Streptococcus bovis Curdlana Alcaligenes faecalis

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Agregados ou partículas Raízes Hifas de fungos Poros Sólido Principais agentes ligantes

Raízes e hifas de

fungos

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Fatores que afetam a agregação do solo

Fatores Efeitos ou contribuição

Tamanho das partículas Balanço / densidade de cargas e superfície específica

Regime hídrico Ciclos de umedecimento/ secagem

Matéria orgânica do solo Substrato microbiano e ação cimentante

Cultivo do solo Promove a dispersão das partículas

Micro-organismos Adesão das partículas e produção de agentes cimentantes

Macro-organismos Promovem aglomeração das partículas

Raízes finas Decomposição favorece microrganismos; ação mecânica que promove aproximação

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beneficiadas

Pinusspp.(Pine) Endomicorrizas arbuscular

A planta, através da fotossíntese, fornece energia e carbono para a sobrevivência e multiplicação dos fungos, enquanto estes absorvem nutrientes minerais e água do solo, transferindo-os para as raízes da planta, estabelecendo assim a mutualista da simbiose.

Micoriza: Associação harmônica entre fungos e raízes

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Nódulos de Rhizobium: associação harmônica

Pisumsativum(pea)

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Beneficia

Microrganismo

A

Microrganismo

B

Conversão de substratos Fungos → bactérias

(52)

52

Parasitismo

-Associação

desarmônica

(53)

53 Microrganismo A Microrganismo B

Espaço

Nutrientes

Água

Oxigênio

Mesmo Microhabitat Maior habilidade genética

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Microrganismo A

Secreção de produtos tóxicos

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56

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(59)
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(61)
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Microbiologia ar

Microbiologia Industrial 2015

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Microbiologia do ar

A população microbiana do ar é transitória e variável. O ar não é um meio no qual podem crescer micro-organismos;

é um portador de poeiras e gotículas que carregam micro-organismos;

Alguns micros morrem em questão de segundos, outros meses e anos.

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Exposição de placa de Petri com meio nutritivo;

Aparelho de impacto

sólido;

Aparelho de impacto

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Tipos de micro-organismos presente no ar

Bactérias;Bolores;Leveduras;Algas;Protozoários.

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Altitude (m) Bactérias (gênero) Bolores(gênero) 450-1.350 Alcaligenes Bacillus Aspergillus Macrosporium 1.350 – 2.250 Bacillus Aspergillus Cladosporium 2.250 - 3150 Bacillus Sarcina Aspergillus Hormodendrum 3150 – 4.050 Bacillus Kurthia Aspergillus 4.050 – 4.950 Bacillus Micrococcus Penicillium

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Microbiologia ar

Microbiologia Industrial 2015

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