CENTRO DE CIÊNCIAS
DEPARTAMENTO DE QUÍMICA ORGÂNICA E INORGÂNICA PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM QUÍMICA
FRANCISCO CARLOS DE OLIVEIRA
ESTUDO QUÍMICO DE FUNGOS ENDOFÍTICOS ASSOCIADOS A PLANTAS DO BIOMA CAATINGA
FRANCISCO CARLOS DE OLIVEIRA
ESTUDO QUÍMICO DE FUNGOS ENDOFÍTICOS ASSOCIADOS À PLANTAS DO BIOMA CAATINGA
Tese submetida apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Química da Universidade Federal do Ceará, como requisito para obtenção do título de doutor em Química. Área de Concentração em Química Orgânica.
Orientador: Prof. Dr. Francisco Geraldo Barbosa.
Co-orientador: Prof. Dr. Jair Mafezoli.
FORTALEZA
FRANCISCO CARLOS DE OLIVEIRA
ESTUDO QUÍMICO DE FUNGOS ENDOFÍTICOS ASSOCIADOS À PLANTAS DO BIOMA CAATINGA
Tese submetida apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Química da Universidade Federal do Ceará, como requisito para obtenção do título de doutor em Química. Área de Concentração em Química Orgânica.
Aprovada em: 16/01/2017.
BANCA EXAMINADORA
____________________________________ Prof. Dr. Francisco Geraldo Barbosa (Orientador)
Universidade Federal do Ceará (UFC)
____________________________________ Profa. Dra. Ângela Martha Campos Arriaga
Universidade Federal do Ceará (UFC)
____________________________________ Prof. Dr. Aluísio Marques da Fonseca
Universidade da Integração Internacional da Lusofonia Afro-Brasileira (UNILAB)
____________________________________ Dr. Francisco das Chagas de Oliveira Freire
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa/CE)
A Deus, por me conceder disposição, força, saúde, amor, paz e fé para superar os obstáculos da vida.
À minha amada esposa Elieuda, que sempre com muito amor e carinho, me incentivou para a realização deste trabalho, simplesmente muito obrigado.
AGRADECIMENTOS
A Deus, por estar sempre comigo, me orientando e auxiliando em todos os momentos da minha vida.
Ao meu orientador Prof. Dr. Francisco Geraldo Barbosa, pela orientação, dedicação, atenção, sugestões e muitos conhecimentos que foram transmitidos, que foram fundamentais para a realização deste trabalho.
Aos colegas do LABFITO (Adriano, Alex, Diana Kelly, Aierta), pela amizade. Ao Prof. Jair Marfezoli, pela co-orientação e ajuda nas determinações estruturais. Aos colegas e amigos de Pós-graduação: Felipe, André, Sebastião, João Vitor, Irvila, Diego, Paula, Bruno, Carol, Daniele, Reinaldo, entre outros.
À Profa. Dra. Mary Anne pela disponibilidade do equipamento de CLAE e a profa. Antonia pela ajuda na operação do mesmo.
Ao Prof. Dr. Edilberto pela disponibilidade dos equipamentos de RMN do CENAUREMN.
Aos operadores dos equipamentos de RMN: Renata, Regivaldo e Prof. Dr. Daniel, pela obtenção dos espectros de RMN.
Aos Drs. Freire e Francisco, da EMBRAPA, pelo isolamento e identificação das cepas fungicas.
À Profa. Dra. Leticia pela realização dos ensaios de atividade anticâncer.
Aos demais professores do programa de Pós-Graduação em Química da UFC, queue contribuíram com minha formação.
Aos funcionários da UFC (Laurilane –“Lana”, Célia e Orlando).
O estudo químico de fungos endofíticos associados a plantas do bioma Caatinga foi realizado através da identificação de compostos orgânicos voláteis (COVs) e do isolamento de metabolitos não voláteis produzidos por dez fungos da família Botryosphaeriaceae e um da família Nectriaceae. Na identificação de COVs produzidos pelo fungo Albonectria rigidiuscula (Nectriaceae) foram utilizados quatros meios de cultura diferentes (BD, BDA, peptona e arroz) e em três períodos de incubação (7, 14 e 21 dias), empregando-se as mesmas técnicas de extração e análise. No estudo de identificação de COVs, os fungos Lasiodiplodia citricola, L. gonubiensis, L. parva, L. pseudotheobromae, L. theobromae, Neosicoccum ribis, N. cordaticola, N. parvum, Botrysphaeria mamane e Pseudofusicoccum stromaticum foram cultivados em BD, sob as mesmas condições. Como técnica de extração e análise, utilizou-se a micro-extração em fase sólida por headspace (HS-MEFS), aliada à cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massas (CG-EM). Os dados das análises foram ainda submetidos a tratamentos estatísticos de ACP e AAH. A identificação de COVs fúngicos se mostrou adequada para discriminar dez espécies da família Botryosphaeriaceae. A discriminação do complexo N. parvum/N. ribis apontou a importância de COVs como uma ferramenta quimiotaxonômica auxiliar. Além disso, o α-bisabolol que foi produzido em alto teor (88,83%) pelo fungo P. stromaticum, pode ser apontado como um marcador químico para a espécie. A produção de COVs pelo fungo A. rigidiuscula mostrou maiores variações qualitativas e quantitativas nos meios de cultura mais pobres em nutrientes. Os fungos N.parvum, L. gonubiensis e A. rigidiuscula apresentaram potencial citotóxico e o estudo de compostos não voláteis apontou variações significativas nos ácidos graxos produzidos nos micélios e meios líquidos extraídos. A partir dos extratos fúngicos ativos foram isolados os metabólitos (3S, 4S)-4-hidroximeleina, ciclo (Leu-Pro), ciclo (S-Phe-S-Pro), (3S, 4R)-4-hidroximeleína, (R)-meleina, pestalopirona, xilitol, ciclo (L-Pro-L-Tyr) e tirosol. O isolamento de dicetopiperazinas sugere uma relação destes compostos com o potencial citotóxico dos extratos ativos, uma vez que o potencial anticâncer desta classe é relatada na literatura.
ABSTRACT
The chemical study of endophytic fungi associated with plants of the Caatinga biome was carried out through the identification of volatile organic compounds (VOCs) and the isolation of non-volatile metabolites produced by ten fungi of the family Botryosphaeriaceae and one of the family Nectriaceae. In the identification of VOCs produced by the fungus Albonectria rigidiuscula (Nectriaceae), four different culture media (BD, BDA, peptone and rice) and three incubation periods (7, 14 and 21 days) were used, using the same techniques of extraction and analysis. In the study of identification of VOCs, the fungi were: L. gonubiensis, L. parva, L. pseudotheobromae, L. theobromae, Neosicoccum ribis, N. cordaticola, N. parvum, Botrysphaeria mamane and Pseudofusicoccum stromaticum cultivated in BD under the same conditions. As extraction and analytical technique, headspace solid phase microextraction (SPME-HS), coupled with gas chromatography coupled to mass spectrometry (GC-MS), was used. The data of the analyzes were also submitted to statistical treatments of PCA and HCA. The identification of fungal VOCs was adequate to discriminate ten species of the family Botryosphaeriaceae. The discrimination of the N. parvum / N. Ribis pointed out the importance of VOCs as an auxiliary chemotaxonomic tool. In addition, α-bisabolol, which was produced at high level (88.83%) by the P. stromatium fungus, can be identified as a chemical marker for this specie. The production of VOCs by the A.rigidiuscula fungus showed greater qualitative and quantitative variations in nutrient poor media. The fungi N.parvum, L. gonubiensis and A. rigidiuscula presented cytotoxic potential and the study of non-volatile compounds showed significant variations in the fatty acids produced in the mycelia and extracted liquid media. The metabolites (3S, 4S)-4-hydroxymellein, cyclic (Leu-Pro), cyclic (S-Phe-S-(Leu-Pro), (3S, 4R)-4-hydroxymellein mellein, pestalopyrone, xylitol, cyclo (L-Pro-L-Tyr) and tyrosol. The isolation of diketopiperazines suggests a relationship of these compounds with the cytotoxic potential of active extracts, since the anticâncer potential of this class is reported in the literature.
Figura 1 - Fungos da família Botryosphaeriaceae: L. theobromae, N. parvum, B. dothidea e D. mutila, Dothiorella iberica, Neoscytalidium hyalinum, Pseudofusicoccum stromaticum, Sphaeropsis citrigena... 32
Figura 2 F. decemcellulare (A), Sintomas de cancrose em tronco em pinha (B) e A. rigidiuscula (C)... 34
Figura 3 Cepas fúngicas de isolados dos fungos endofíticos estudados... 35
Figura 4 Relação das estruturas dos metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Lasiodiplodia, segundo a literatura... 39 Figura 5 Relação das estruturas dos metabólitos secundários isolados de fungos do
gênero Neofusicoccum, segundo a literatura... 42
Figura 6 Relação de metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Botryosphaeria, segundo a literatura... 47 Figura 7 Relação das estruturas dos metabólitos secundários isolados de fungos do
gênero Diplodia, segundo a literatura... 51 Figura 8 Relação das estruturas dos metabólitos secundários isolados de fungos do
gênero Dothirela, segundo a literatura... 52
Figura 9 Relação das estruturas metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Guignardia segundo a literatura... 53
Figura 10 Relação das estruturas dos metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Guignardia, segundo a literatura... 56
Figura 11 Via metabólica para produção de compostos orgânicos voláteis liberados após crescimento em duas fontes diferentes de carbono (glicose e octacosano)... 67
Figura 12 Esquema geral da MEFS... 69
Figura 15 Utilização da ACP na triagem de compostos bioativos... 75
Figura 16 Utilização da ACP na avaliação do ciclo de vida... 75
Figura 17 Utilização da ACP com ferramenta para auxiliar o rastreio da composição química de espécies... 76
Figura 18 Utilização da AAH para auxiliar na identificação de gases nocivos... 78
Figura 19 Utilização da AAH para ajudar a avaliar a lipolificidade de compostos farmacologicamente importantes... 79
Figura 20 Utilização da AAH para avaliar a influência das nos parâmetros sensoriais dos cultivares de marcieiras... 79
Figura 21 Utilização da AAH para auxiliar no da composição química de espécies... 80
Figura 22 Cepas fungos endofíticos estudados... 82
Figura 23 Cultivo do fungo A. rigidiuscula em quatro meios de cultura diferentes (BD, BDA, peptona e arroz)... 85
Figura 24 Gráfico do efeito dos valores mínimos e máximos de cada parâmetro (A – temperatura e B - tempo) e gráfico de Pareto (C) das condições de otimização para extração de COVs por HS-MEFS dos fungos endofíticos da família Botryosphaeriaceae... 86
Figura 25 Gráfico do efeito dos valores mínimos e máximos de cada parâmetro (A - temperatura, B – tipo de fibra e C - tempo) e gráfico de Pareto (D) das condições de otimização para extração de COVs por HS-MEFS do fungo A. rigidiuscula... 87
Figura 26 Gráfico dos escores das 34 variáveis das dez amostras de ACP dos dados
de CG-EM de dez fungos da família Botryosphaeriaceae... 93
Figura 27 Dendrograma de AAH dos dados de CG-EM de dez fungos da família Botryosphaeriaceae... 93
fungo A. rigidiuscula em diferentes condições de cultivo... 97
Figura 30 Espectro de massas do isobutanol... 98
Figura 31 Espectro de massas do álcool isopentílico... 99
Figura 32 Espectro de massas do 2-metilbutan-1-ol... 99
Figura 33 Espectro de massas do octan-1-ol... 99
Figura 34 Espectro de massas do álcool feniletílico... 99
Figura 35 Espectro de massas do 2-butiloctan-1-ol... 99
Figura 36 Espectro de massas do 2-etildecan-1-ol... 100
Figura 37 Espectro de massas do decan-1-ol... 100
Figura 38 Espectro de massas do undecan-2-ona... 100
Figura 39 Espectro de massas do α-copaeno... 100
Figura 40 Espectro de massas do -elemeno... 100
Figura 41 Espectro de massas do aristoleno... 101
Figura 42 Espectro de massas do calareno... 101
Figura 43 Espectro de massas do eremofileno... 101
Figura 44 Espectro de massas do δ-amorfeno... 101
Figura 45 Espectro de massas do germacreno D... 101
Figura 46 Espectro de massas do aristoloqueno... 102
Figura 47 Espectro de massas do valenceno... 102
Figura 48 Espectro de massas do α-selineno... 102
Figura 51 Espectro de massas do zonareno... 103
Figura 52 Espectro de massas do trans-cadina-1(2), 4-dieno... 103
Figura 53 Espectro de massas do palustrol... 103
Figura 54 Espectro de massas do globulol... 103
Figura 55 Espectro de massas do α-cedreno epóxido... 103
Figura 56 Espectro de massas do -cedren-9-ona... 104
Figura 57 Espectro de massas do α-cadinol... 104
Figura 58 Espectro de massas do junipercanfor... 104
Figura 59 Espectro de massas do 5-neo-cedrenol... 104
Figura 60 Espectro de massas do α-bisabolol... 104
Figura 61 Espectro de massas do acetato de guaiol... 105
Figura 62 Espectro de massas do 13-hidroxi-valenceno... 105
Figura 63 Espectro de massas do hexadecan-3-ona... 105
Figura 64 Espectro de massas do 3-metilbutan-1-ol... 105
Figura 65 Espectro de massas do 2-metilbutan-1-ol... 106
Figura 66 Espectro de massas do octano... 106
Figura 67 Espectro de massas do etilbenzeno... 106
Figura 68 Espectro de massas do acetato de 3-metilbutila... 106
Figura 69 Espectro de massas do acetato de 2-metilbutila... 107
Figura 70 Espectro de massas do acetato de estireno... 107
Figura 71 Espectro de massas do heptan-1-ol... 107
Espectro de massas do eucaliptol... 108
Figura 75 Espectro de massas do (E)-oct-2-enal... 108
Figura 76 Espectro de massas do 4-etilanisol... 108
Figura 77 Espectro de massas do 2-feniletanol... 109
Figura 78 Espectro de massas do acetato de octan-3-ol... 109
Figura 79 Espectro de massas do 4-metoxi-estireno... 109
Figura 80 Espectro de massas do 4-etilfenol... 109
Figura 81 Espectro de massas do borneol... 110
Figura 82 Espectro de massas do naftaleno... 110
Figura 83 Espectro de massas do 2-metilisoborneol... 110
Figura 84 Espectro de massas do decan-3-ona... 110
Figura 85 Espectro de massas do isoborneol... 111
Figura 86 Espectro de massas do decanal... 111
Figura 87 Espectro de massas de composto não identificado... 111
Figura 88 Espectro de massas do 4-etilguaiacol... 111
Figura 89 Espectro de massas de composto não identificado... 112
Figura 90 Espectro de massas do (5Z, 7E)-1,5,7-dodecatrieno... 112
Figura 91 Espectro de massas do (5E)-5-dodecen-7-ino... 112
Figura 92 Espectro de massas do (5Z)-5-dodecen-7-ino... 112
Figura 93 Espectro de massas de composto não identificado... 113
Figura 94 Espectro de massas do 4-etil-1,2-dimetilbenzeno... 113
Figura 97 Espectro de massas do decanoato de etila... 114
Figura 98 Espectro de massas de -cariofileno... 114
Figura 99 Espectro de massas de composto não identificado... 114
Figura 100 Espectro de massas de composto não identificado... 114
Figura 101 Espectro de massas do geranilacetona... 115
Figura 102 Espectro de massas do -muuroleno... 115
Figura 103 Espectro de massas do -selineno... 115
Figura 104 Espectro de massas do valenceno... 115
Figura 105 Espectro de massas do epizonareno... 116
Figura 106 Espectro de massas do α-muuroleno... 116
Figura 107 Espectro de massas do -cadineno... 116
Figura 108 Espectro de massas do trans- -cadineno... 116
Figura 109 Espectro de massas do acetato do cis-nerolidol... 117
Figura 110 Espectro de massas de composto não identificado... 117
Figura 111 Espectro de massas do hexanodecanoato de etila... 117
Figura 112 Espectro de massas do linoleato de etila... 117
Figura 113 Espectro de massas do linoleato de etila... 118
Figura 114 Sistema utilizado para reação de saponificação das frações hexânicas... 132
Figura 115 Cromatograma de análise da fração 474-p3 por CLAE... 135
Figura 116 Cromatograma de análise da fração 600-p3 por CLAE... 136
Figura 117 Cromatograma de análise da fração 533-p2 por CLAE... 136
Estrutura da dicetopiperazina ciclo (Leu-Pro), 474-p5b... 140
Figura 121 Espectro na região de infravermelho de 474-p5... 141
Figura 122 Espectro de massas (IE, 70 eV) de 474-p5a... 141
Figura 123 Espectro de massas (IE, 70 eV) de 474-p5b... 141
Figura 124 Espectro de RMN 1H de 474-p5 (MeOD, 600 MHz)... 142
Figura 125 Espectro de RMN 13C de 474-p5 (MeOD, 150 MHz)... 142
Figura 126 Espectro de RMN 1 H, 1H-COSY de 474-p5 (MeOD, 600 MHz)... 143
Figura 127 Espectro de RMN 1 H, 13C-HSQC de 474-p5 (MeOD, 600 x 150 MHz)... 143
Figura 128 Espectro de RMN 1 H, 13C-HMBC de 474-p5 (MeOD, 600 x 150 MHz)... 144
Figura 129 Principais correlações de COSY e HMBC da substância 474-p6... 146
Figura 130 Estrutura da dicetopiperazina ciclo (S-Phe-S-Pro)... 146
Figura 131 Espectro na região de infravermelho de 474-p6... 147
Figura 132 Espectro de massas (IE, 70 eV) de 474-p6... 147
Figura 133 Espectro de RMN 1H de 474-p6 (MeOD, 600 MHz)... 148
Figura 134 Espectro de RMN 13C de 474-p6 (MeOD, 150 MHz)... 148
Figura 135 Espectro de RMN 1H, 1H-COSY de 474-p6 (MeOD, 600 MHz)... 149
Figura 136 Espectro de RMN 1H, 13C-HSQC de 474-p6 (MeOD, 600 x 150 MHz)... 149
Figura 137 Espectro de RMN 1H, 13C-HMBC de 474-p6 (MeOD, 600 x 150 MHz)... 150
Figura 138 Principais correlações de COSY da substância 474-p7... 152
Figura 139 Principais correlações de HMBC da substância 474-p7... 153
Figura 140 Estrutura da isocumarina de trans-(3S, 4R)-4-hidroximeleina... 153
Figura 143 Espectro de RMN 1
H de 474-p7 (MeOD, 300 MHz)... 155
Figura 144 Espectro de RMN 13C de 474-p7 (MeOD, 75 MHz)... 155
Figura 145 Espectro de RMN 13C - DEPT 135º de 474-p7 (MeOD, 75 MHz)... 156
Figura 146 Espectro de RMN 1H, 1H-COSY de 474-p7 (MeOD, 300 MHz)... 156
Figura 147 Espectro de RMN 1H, 13C-HSQC de 474-p7 (MeOD, 300 x 75 MHz)... 157
Figura 148 Espectro de RMN 1H, 13C-HMBC de 474-p7 (MeOD, 300 x 75 MHz)... 157
Figura 149 Principais correlações de COSY da substância 474-p12... 159
Figura 150 Principais correlações de HMBC da substância 474-p12... 160
Figura 151 Estrutura da isocumarina (R)-meleina... 160
Figura 152 Espectro na região de infravermelho de 474-p12... 161
Figura 153 Espectro de massas (IE, 70 eV) de 474-p12... 161
Figura 154 Espectro de RMN 1 H de 474-p12 (CDCl3, 300 MHz)... 162
Figura 155 Espectro de RMN 13C de 474-p12 (CDCl3, 75 MHz)... 162
Figura 156 Espectro de RMN 13C - DEPT 135º de 474-p12 (CDCl3, 75 MHz)... 163
Figura 157 Espectro de RMN 1H, 1H-COSY de 474-p12 (CDCl3, 300 MHz)... 163
Figura 158 Espectro de RMN 1H, 13C-HSQC de 474-p12 (CDCl3, 300 x 75 MHz)... 164
Figura 159 Espectro de RMN 1H, 13C-HMBC de 474-p12 (CDCl3, 300 x 75 MHz)... 164
Figura 160 Principais correlações de COSY da substância 474-p13... 166
Figura 161 Principais correlações de HMBC da substância 474-p13... 166
Figura 162 Estrutura do policetídeo pestalopirona... 167
Figura 163 Espectro na região de infravermelho de 474-p13... 167
, 75 MHz)... 169
Figura 167 Espectro de RMN 13C - DEPT 135º de 474-p13 (CDCl3, 75 MHz)... 169
Figura 168 Espectro de RMN 1H, 1H-COSY de 474-p13 (CDCl3, 300 MHz)... 170
Figura 169 Espectro de RMN 1H, 13C-HSQC de 474-p13 (CDCl3, 300 x 75 MHz)... 170
Figura 170 Espectro de RMN 1H, 13C-HMBC de 474-p13 (CDCl3, 300 x 75 MHz)... 171
Figura 171 Estrutura do poliol xilitol... 172
Figura 172 Espectro de RMN 1 H de 474-BD-M (CDCl3, 300 MHz)... 173
Figura 173 Espectro de RMN 13 C de 474-BD-M (CDCl3, 75 MHz)... 173
Figura 174 Espectro de RMN 13 C – DEPT 135º de 474-BD-M (CDCl3, 75 MHz)... 174
Figura 175 Principais correlações de COSY e HMBC da substância 533-p1... 175
Figura 176 Estrutura da dicetopiperazina ciclo (L-Pro-L-Tyr)... 176
Figura 177 Espectro de massas (IE, 70 eV) de 533-p1... 177
Figura 178 Espectro de RMN 1H de 533-p1 (DMSO-d6, 500 MHz)... 177
Figura 179 Espectro de RMN 13 APT de 533-p1 (DMSO-d6, 125 MHz)... 178
Figura 180 Espectro de RMN 1H, COSY de 533-p1 (DMSO-d6, 500 x 500 MHz)... 178
Figura 181 Espectro de RMN 1H, 13C-HSQC de 533-p1 (DMSO-d6, 500 x 125 MHz).. 179
Figura 182 Espectro de RMN 1H, 13C-HMBC de 533-p1 (DMSO-d6, 500 x 125 MHz).. 179
Figura 183 Principais correlações de HMBC da substância 533-p2... 180
Figura 184 Estrutura química do tirosol... 181
Figura 185 Espectro de massas (IE, 70 eV) de 533-p2... 181
Figura 186 Espectro de RMN 1 H de 533-p2 (DMSO-d6, 500 MHz)... 182
Figura 189 Espectro de RMN 1
H, 13C-HMBC de 533-p2 (DMSO-d6, 500 x 125 MHz).. 183
Figura 190 Gráfico dos escores das 36 variáveis e das doze amostras da ACP, de CG-EM e CG-DIC dos fungos N. parvum, L. gonubiensis e A. rigidiuscula... 186
Figura 191 Gráfico dos escores das 36 variáveis e das doze amostras da AHC de CG-EM e CG-DIC dos fungos N. parvum, L. gonubiensis e A. rigidiuscula... 187
Figura 192 Espectro de massas de butanoato de octila... 189
Figura 193 Espectro de massas de 2-metilpropanoato de 2-etil-3-hidroxihexila... 190
Figura 194 Espectro de massas de 9-oxononanoatode metila... 190
Figura 195 Espectro de massas de acetato de 1-metil-3-(2,6,6-trimetil-1-ciclohexen-1-il)propila... 190
Figura 196 Espectro de massas de acetato de nonanedioatode dimetila... 190
Figura 197 Espectro de massas de meleina... 191
Figura 198 Espectro de massas de jasmonato de metila... 191
Figura 199 Espectro de massas de miristoleato de metila... 191
Figura 200 Espectro de massas de tetradecanoato de metila... 191
Figura 201 Espectro de massas de cis-10-pentadecenoato de metila... 192
Figura 202 Espectro de massas de pentadecanoato de metila... 192
Figura 203 Espectro de massas de palmitoleato de metila... 192
Figura 204 Espectro de massas de hexadecanoato de metila... 192
Figura 205 Espectro de massas de 14-metilhexadecanoato de metila... 193
Figura 206 Espectro de massas de hexadecanoato de etila... 193
Figura 207 Espectro de massas de cis-10-heptadecenoato de metila... 193
Espectro de massas de linoleato de metila... 194
Figura 211 Espectro de massas de elaidato de metila... 194
Figura 212 Espectro de massas de oleato de metila... 194
Figura 213 Espectro de massas de estearato de metila... 195
Figura 214 Espectro de massas de oleato de etila... 195
Figura 215 Espectro de massas de nonadecanoate de metila... 195
Figura 216 Espectro de massas de araquidonato de metila... 195
Figura 217 Espectro de massas de 8,11,14-eicosanotrienoato de metila... 196
Figura 218 Espectro de massas de cis-11,14,17-eicosanotrienoato de metila... 196
Figura 219 Espectro de massas de araquidato de metila... 196
Figura 220 Espectro de massas de docosanoato de metila... 196
Tabela 1 Fungos endofíticos isolados de plantas da Caatinga... 35
Tabela 2 Relação dos metabólitos secundários isolados de fungos do gênero
Lasiodiplodia e suas respectivas espécies... 36
Tabela 3 Relação dos metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Neofusicoccum e suas respectivas espécies, segundo a literatura... 41
Tabela 4 Relação dos metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Botryosphaeria e suas respectivas espécies, segundo a literatura... 42
Tabela 5 Relação das estruturas dos metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Diplodia e suas respectivas espécies, segundo a literatura... 50
Tabela 6 Relação dos metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Dothiorela e suas respectivas espécies, segundo a literatura... 51
Tabela 7 Relação dos metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Fusicoccum e suas respectivas espécies, segundo a literatura... 52
Tabela 8 Relação dos metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Sphaeropsis e suas respectivas espécies, segundo a literatura... 53
Tabela 9 Relação dos metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Guignardia e suas respectivas espécies, segundo a literatura... 54
Tabela 10 Fungos endofíticos isolados de plantas da Caatinga... 82
Tabela 11 Matriz de planejamento experimental 22 e respostas para otimização das condições de extração de COVs dos fungos da família Botryosphaeriaceae 85
Tabela 12 Matriz de planejamento experimental 23e respostas para otimização das condições de extração de COVs do fungo A. rigidiuscula... 87
Tabela 13 Composição de COVs produzidos por fungos endofíticos da família Botryosphaeriaceae... 91
Tabela 14 Composição química volátil do fungo A. rigidiuscula em diferentes condições de cultivo... 96
extratos obtidos cultivo em pequena escala dos fungos estudados... 129
Tabela 17 Massas dos extratos obtidos dos fungos 600, 474 e 533, cultivados em grande escala nos meios de cultura BD, peptona e arroz... 130
Tabela 18 Massas das frações acetonitrila oriundas do desengorduramento dos extratos obtidas cultivo em grande escala dos fungos 600, 474 e 533... 130
Tabela 19 Massas das frações hexânicas oriundas do desengorduramento dos extratos obtidas do cultivo em grande escala dos fungos 600, 474 e 533... 131
Tabela 20 Massas dos ácidos graxos livres dos fungos 600, 474 e 533... 132
Tabela 21 Massas dos ésteres metílicos dos ácidos graxos obtidos dos fungos 600, 474 e 533... 133
Tabela 22 Porcentagem de ésteres metílicos dos ácidos graxos obtidos dos fungos 600, 474 e 533... 133
Tabela 23 Dados do fracionamento cromatográfico dos extratos obtidos do cultivo em grande escala dos fungos 600, 474 e 533... 134
Tabela 24 Dados espectroscópicos de RMN 1H, 13C, HSQC e HMBC (MeOD) de 474-p5, comparado com dados da literatura (HOLKER e SIMPSON, 1981 – CDCl3)... 138
Tabela 25 Dados espectroscópicos de RMN 1H, 13C, HSQC e HMBC (MeOD) de 474-p5b, comparado com dados da literatura (CAMILLO, 2007)... 140 Tabela 26 Dados espectroscópicos de RMN 1H, 13C, HSQC e HMBC (MeOD) de
474-p6, comparado com dados da literatura (WANG et al., 2010 – CDCl3) 146
Tabela 27 Padrão de hidrogenação dos carbonos determinada através da análise comparativa entre os espectros de RMN 13C e DEPT 135º 474-p7... 152
comparativa entre os espectros de RMN 13C e DEPT 135º 474-p12... 159
Tabela 30 Dados espectroscópicos de RMN 1
H, 13C, HSQC e HMBC (CDCl3) de
474-p12, comparado com dados da literatura (ISLAM et al., 2007 – CDCl3)... 160
Tabela 31 Padrão de hidrogenação dos carbonos determinada através da análise comparativa entre os espectros de RMN 13C e DEPT 135º 474-p13... 165
Tabela 32 Dados espectroscópicos de RMN 1H, 13C, HSQC e HMBC (MeOD) de 474-p13, comparado com dados da literatura (XU et al., 2011 - MeOD)... 166 Tabela 33 Dados espectroscópicos de RMN 1
H e 13C (DMSO) de 474-BD-M, comparados com dados da literatura (MISRA et al., 2011 – D2O)... 172
Tabela 34 Dados espectroscópicos de RMN 1H, 13C, (DMSO-d6) de 533-p1, comparado com dados da literatura (ZANARDI, 2010 – MDSO-d6)... 176
Tabela 35 Dados espectroscópicos de RMN 1
H, 13C, (DMSO-d6) de 533-p2, comparado com dados da literatura (DASCALIUC et al., 2008 - (DMSO-d6)... 181
Tabela 36 Composição de ácidos graxos dos fungos N. parvum; L. gonubiensis e A. rigidiuscula em diferentes condições de cultivo... 185
Botryosphaeriaceae, obtenção, extração e análise dos COVs... 84
Fluxograma 2 Obtenção dos extratos dos fungos a partir dos meios de cultivo... 127
Fluxograma 3 Obtenção dos extratos dos fungos a partir do meio de cultivo em arroz... 127
IV Infravermelho
RMN 1H Ressonância Magnética Nuclear de Hidrogênio RMN 13C Ressonância Magnética Nuclear de Carbono-13 EM-IE Espectrometria de Massas por Impacto Eletrônico
p.f Ponto de fusão
J Constante de Acoplamento
Δ Deslocamento químico
d Dubleto
Dd Duplo dubleto
Hz Hertz
S Singleto
COSY Correlated Spectroscopy
DEPT Distortionless Enhancement by Polarization Transfer HSQC Heteronuclear Single Quantum Coherence
HMQC Heteronuclear Multiple Quantum Coherence
BB Broad Band decoupling
1D Unidimensional
2D Bidimensional
M Multipleto
IK Indice de Kolvats
CG-DIC Cromatografia Gasosa acoplada a Detector por Ionização de Chama CG-EM Cromatografia Gasosa acoplada a Espectrometria de Massas
CCD Cromatografia em Camada Delgada
Rf Índice de Retenção
CLAE Cromatografia Líquida de Alta Eficiência
CENAUREMN Centro Nordestino de Aplicação e Uso da Ressonância Magnética Nuclear
Θ Ângulo de nutação
ºC/min Grau Celsius por Minuto
eV ElétronVolt
MTT 3-(4,5-dimetil-2-tiazolil)-2,5-difenil-2H-brometo tetrazolina
Ф Diâmetro
HS Headspeace
PDMS Polidimetilsiloxano
DBV Divenilbenzeno
rDNA Ribossomal Deoxiribo Nucleico Ácido COVs Compostos orgânicos voláteis
BD Batata dextrose
DBA Batata dextrose agar
Pep Peptona
AR Arroz
LSU Large subunit
ITS Internal transcribed spacer
BT Beta tubulin
ACT Actin
TEF Translocation elongation factot pH Potencial hidrogeniônico GUI
R
1 CAPÍTULO 1 – INTRODUÇÃO: ASPECTROS GERAIS E OBJETIVOS DO TRABALHO...
26 1.1 1.1 Aspectos gerais... 27 1.2 Objetivos e estrutura do trabalho... 28 REFERÊNCIAS... 29 2 CAPÍTULO 2 - CONSIDERAÇÕES TAXONÔMICAS E LEVANTAMENTO
BIBLIOGRÁFICO...
30 2.1 Considerações taxonômicas sobre a família Botryosphaeriaceae...
31 2.2 Considerações taxonômicas sobre a família Nectriaceae e a espécie Albonectria
rigidiuscula...
32 2.3 Fungos endofitícos estudados...
34 2.4 Levantamento bibliográfico...
36
2.4.1 Gênero Lasiodiplodia... 36
2.4.2 Gênero Neofusicoccum... 40
2.4.3 Gênero Botryosphaeria... 42
2.4.4 Gênero Diplodia... 50
2.4.5 GêneroDothiorela...
51
2.4.6 Gênero Fusicoccum... 52
2.4.7 Gênero Sphaeropsis...,,... 53
2.4.8 Gênero Guignardia... 54 2.5 Considerações finais... 57 REFERÊNCIAS... 58
3 CAPÍTULO 3 - COMPOSTOS ORGÂNICOS VOLÁTEIS (COVS) DOS
FUNGOS ENDOFÍTICOS... 65 3.1 Produção de COVs por fungos... 66 3.2 Considerações sobre metodologias para estudo de COVs fúngicos... 68
3.2.1 Microextração em fase sólido (MEFS)... 68
3.2.2 Planejamento experimental... 71
plantas da Caatinga... 80
3.3.1 Cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massas (CG-EM)... 80
3.3.2 Fungos endofíticos estudadas... 81
3.3.3 Reagentes e materiais... 83
3.3.4 Cultivo dos fungos da família Botryosphaeriaceae e obtenção dos compostos orgânicos voláteis (COVs)... 83
3.3.5 Cultivo do fungo A. rigidiuscula e obtenção dos compostos orgânicos voláteis (COVs)... 84
3.3.6 Otimização das condições de HS-MEFS para extração dos COVs dos fungos da família Botryosphaeriaceae... 85
3.3.7 Otimização das condições de HS-MEFS para extração dos COVs do fungo A. rigidiuscula... 86
3.3.8 Análise multivariada de dados de CG-EM dos fungos da família Botryosphaeriaceae... 88
3.3.9 Análise multivariada de dados de CG-EM do fungo A. rigidiuscula... 88 3.4 Resultados e discussão... 89
3.4.1 Identificação e análise de dados multivariados de fungos da família Botryosphaeriaceae... 89
3.4.2 Identificação de COVs e análise multivariada de dados do fungo A. rigidiuscula em diferentes condições de cultivo... 94 3.5 Considerações finais... 98 REFERÊNCIAS... 119 4 CAPÍTULO 4 - COMPOSTOS ORGÂNICOS NÃO VOLÁTEIS DOS FUNGOS
ENDOFÍTICOS ESTUDADOS...
122 4.1 Produção de metabólitos secundários por fungos endofíticos... 123 4.2 Metodologia do estudo... 124
4.2.1 Métodos cromatográficos... 124 4.2.1.1 Cromatografia de adsorção... 124 4.2.1.2 Cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE)... 124
4.2.2.3 Espectroscopia de absorção na região do infravermelho (IV)... 126
4.2.3 Obtenção dos extratos fúngicos... 126 4.2.3.1 Estudo químico dos fungos endofíticos da família Botryosphaeriaceae... 126 4.2.3.2 Processo de desengorduramento dos extratos obtidos dos 11 fungos cultivados
em BD e peptona... 128 4.2.3.3 Obtenção dos extratos em grande escala... 129 4.2.3.4 Processo de desengorduramento dos extratos obtidos do cultivo em grande
escala dos fungos 600, 474 e 533... 130
4.2.4 Estudo dos ácidos graxos dos fungos endofíticos... 132 4.2.4.1 Reação de saponificação... 132 4.2.4.2 Reação de esterificação dos ácidos graxos (metilação em meio ácido)... 133 4.2.4.3 Purificação dos ésteres metílicos dos ácidos graxos em micro-coluna
cromatográfica... 133 4.2.4.4 Análise dos ésteres metilícos dos ácidos graxos dos fungos 600, 474 e 533... 134
4.2.5 Fracionamento cromatográfico dos extratos dos fungos 600,474 e 533...
134
4.2.6 Ensaio de atividade de citotoxicidade in vitro frente à linhagem de células cancerígenas... 137 4.3 Resultados e Discussão... 137
4.3.1 Determinação estrutural de p5 como uma mistura (p51 e 474-p5b)... 137
4.3.2 Determinação estrutural de 474-p6... 145
4.3.3 Determinação estrutural de 474-p7... 151
4.3.4 Determinação estrutural de 474-p12... 158
4.3.5 Determinação estrutural de 474-p13... 165
4.3.6 Determinação estrutural de 474-BD-M... 172
4.3.7 Determinação estrutural de 533-p1... 175
4.3.8 Determinação estrutural de 533-p2... 180
4.3.9 Ácidos graxos... 184 4.3.9.1 Resultados da analise multivariada de dados e identificação dos ácidos
graxos dos fungos N. parvum, L, gonubiensis A. rigidiuscula em diferentes condições de cultivo... 184
CAPÍTULO 1
INTRODUÇÃO: ASPECTROS GERAIS E
OBJETIVOS DO TRABALHO
OH N N H
O
1.1 Aspectros gerais
Os fungos endofíticos vivem nos órgãos internos de plantas, mas sem causar efeitos patogênicos aparentes ao hospedeiro. Nessa associação simbiótica, a planta hospedeira abriga e fornece nutrientes para o desenvolvimento do fungo, que por sua vez ajuda na proteção contra herbívoros e patógenos da planta. Os fungos endofíticos, também são responsáveis pela adaptação das plantas aos estresses bióticos e abióticos (GUNATILAKA, 2006).
Cada vez mais, fungos endofíticos tem despertado interesse para estudos (GUTIERREZ, GONZALEZ e RAMIRREZ, 2012). Neste contexto, espécies de fungos da família Botryosphaeriaceae possuem grande ocorrência e distribuição em plantas endêmicas do bioma Caatinga, onde as espécies mais frequentes são as pertencentes aos gêneros Lasiodiplodia, Neofusicoccum e Pseudofusicoccum (GONÇALVES, 2014). Devido a grande diversidade de espécies fúngicas, endofíticas e fitopatógenas, a taxonomia da família Botryosphaeriaceae é bastante confusa, principalmente, devido à sobreposição de características morfológicas (CROUS et al., 2006).
Rico em espécies fúngicas da família Botryosphaeriaceae, o bioma Caatinga é bastante heterogêneo e apresenta grande biodiversidade de espécies endêmicas com um patrimônio biológico não encontrado em nenhum outro local do planeta. Compreendendo uma área de 935 mil km2, totalizando 11% do território brasileiro, esse ecossistema estenden-se pelos estados de Alagoas, Bahia, Ceará, Paraíba, Pernambuco, Piaui, Rio Grande do Norte, Sergipe e o norte de Minas Gerais (MAIA, 2004).
Especialistas em biodiversidade, principalmente, aqueles que estudam fungos endofíticos tem demonstrado que plantas pertencentes ao bioma Caatinga são mais ricas em espécies fúngicas. Freire e Gonçalves (2012), relataram a ocorrência de 332 espécies de fungos endofíticos, associados a plantas do bioma Caatinga, somente no estado do Ceará.
linhagens fora da família Botryosphaeriaceae. De acordo com PHILLIPS et al (2013), estudos isolados de caracteres morfológicos são inadequados para definir gêneros ou identificar espécies fúngicas, e que os táxons mais antigos relacionados com Botryosphaeriaceae, para os quais os dados de sequenciamento de DNA não estão disponíveis, não devem ser agrupados dentro dessa família.
Portanto, estudos de quimiotaxonomia utilizando os compostos orgânicos voláteis de microrganismos (COVs) como biomarcadores podem auxiliar na identificação de espécies da família Botryosphaeriaceae.
Apartir da produção de COVs, a interação entre fungos endofíticos e plantas possibilita o surgimento de uma ampla gama de metabólitos secundários de diversas classes químicas. Estudos tem demostrado que os fungos endofíticos representam uma fonte para busca de novas moléculas biologicamente ativas, pois, eles habitam ambientes ecológicos ainda pouco explorados (GUTIERREZ, GONZALEZ e RAMIRREZ, 2012). Desta forma, estudos químicos de fungos endofíticos associados a plantas do bioma Caatinga poderão contribuir para um melhor conhecimento do potencial dessa microbiota, além de auxiliarem na quimiotaxonomia da família Botryosphaeriaceae.
1.2 Objetivos e estrutura do trabalho
Considerando-se a disposição de fungos endofíticos da família Botryosphaeriaceae em plantas do bioma Caatinga, este trabalho teve como objetivo principal realizar um estudo de investigação química de fungos endofíticos, a partir da obtenção e análise de COVs e ésteres metílicos de ácidos graxos; isolamento e caracterização estrutural de metabólitos secundários; além da investigação de atividade citotóxica de extratos e substâncias isoladas.
Para facilitar o entendimento, o trabalho foi estruturado em quatro capítulos. No primeiro capítulo é feita uma introdução geral e apresentação do trabalho. No segundo capítulo são apresentados dados relativos às considerações taxonômicas e levantamento bibliográfico de metabólitos secundários dos fungos estudados. Já no terceiro capítulo são discutidos aspectros teóricos e práticos da produção e análise de COVs pelos fungos investigados. No quarto e último capítulo são apresentados os dados de isolamento e caracterização estrutural dos metabólitos secundários dos fungos endofíticos estudados.
REFERÊNCIAS
CROUS, P. W.; SLIPPERS, B.; WINFIELD, M. J.; RHEEDER, J.; MARASAS, W. F. O.; PHILIPS, A. J. L.; ALVES, A.; BURGESS, T.; BARBER, P.; GROENEWALD, J. Z. Phylogenetic lineages in the Botryosphaeriaceae. Stud. Mycol., Netherlands, v. 55 p. 235-256, 2006.
FREIRE, F. C. O.; GONÇALVES, F. J. T. A diversidade microbiológica da Caatinga cearence. Essentia, Sobral,v. 14, p.11-34, 2012.
GONÇALVES, F. J. T. Identificação de espécies de Botryosphaeriaceae endofíticas de plantas da Caatinga do estado do Ceará e patogenicidade em manga e ramos de umbu-cajá. 2014. 88 f. Tese (Doutorado em Fitopatologia) – Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife, 2014.
GUNATILAKA, A. A. L. Natural products from plant-associated microorganisms: distribution, structural diversity, bioactivity, and implications of their occurrence. J. Nat. Prod., Washington, v. 69, p. 509-526, 2006.
GUTIERREZ, R. M. P; GONZALE, A. M. N., RAMIREZ, A. M. Compounds derived from endophytes: A review de phytochemistry and pharmacology. Curr. Med. Chem., Cambridge, v. 19, p. 2992-3030, 2012.
MAIA, G. N. Caatinga: árvores e arbustos e suas utilidades. 1ª ed. São Paulo: D&Z Computação Gráfica e Editora, 2004. 413 p.
CAPÍTULO 2
CONSIDERAÇÕES TAXONÔMICAS E
LEVANTAMENTO BIBLIOGRÁFICO
N N H
O
O
N N H
O
2.1 Considerações taxonômicas sobre a família Botryosphaeriaceae
Fungos da família Botryosphaeriaceae constituem um grupo bastante diverso, incluindo espécies endofíticas, fitopatógenas ou saprófitas com distribuição mundial sobre uma grande variedade de hospedeiros (CROUS et al., 2006; PHILLIPIS et al., 2013). Embora os fungos endofíticos desenvolvam uma relação mutualista no interior dos tecidos de plantas sem causar danos aparentes, sob certas condições, eles podem desenvolver uma relação parasitária com o hospedeiro e tornarem-se fitopatógenos (SCHULZ et al., 2005). Desta forma, fungos da família Botryosphaeriaceae são comumente encontrados em plantas de importância agroeconômica como fitopatogênicos e são bastante estudados (PHILLIPIS et al., 2013; HANTAO et al., 2013). Dentre esses fungos estão Lasiodiplodia theobromae, Neofusicoccum luteum, N.parvum, N.australe, Botryosphaeria dothidea, Diplodia mutila, D.seriata, Dothiorella iberica e D.viticola (Figura 1, p. 32). Esses fungos são altamente patogênicos para a espécie Vitis vinifera, causando cancros e descoloração vascular (ÚRBEZ-TORRES et al., 2009). Os fungos dessa família também são responsáveis por doenças em plantas como Eucalyptus globulus (HANTAO et al., 2013) E.urophylla (MOHALI et al., 2009) e Mangifera indica (SLIPPERS et al., 2005), dentre outras.
A idenficação de espécies e gêneros da família Botryosphaeriaceae, com base apenas nas características morfológicas é inadequado, e causa confusão na identificação. Assim, muitos táxons mais antigos relacionados à Botryosphaeriaceae, para os quais as culturas ou dados de sequências de DNA não estejam disponíveis não podem ser agrupados nesta família. Portanto, as descrições morfológicas devem ser complementadas apenas por ITS ou ITS + EF1-α, para as espécies de cada gênero (PHILLIPS et al., 2013).
A classificação taxonomica de anamorfos tem gerado muitas discordâncias ao longo do tempo, principalmente, devido a sobreposição de características. Sutton (1980) coloca o gênero Macrophoma como sinônimo de Sphaeropsis. Já a distinção entre Sphaeropsis e Diplodia também não tem sido bem evidente. Segundo Sutton (1980), proliferação de célula conidiogênica percorrente tem sido considerada mais típica para o gênero Sphaeropsis do que para Diplodia. No entanto, Phillips (2002), afirma que a proliferação percorrente também é encontrada em isolados de Diplodia.
Botrospharia com características morfológicas intermediários entre Diplodia e Fusicoccum (CROUS et al., 2006).
Embora os estudos filogenéticos utilizando dados de biologia molecular terem contribuído significativamente para a taxonomia da família Botryosphaeriaceae, alguns problemas ainda persistem (CROUS et al., 2006; PHILLIPS et al., 2013 e SLIPPERS, WINGFIELD, 2007). Por exemplo, as espécies Neofusicocum parvum e Neofusicocum ribis estão intimamente relacionadas e sua diferenciação é bastante confusa, sendo classificadas como um complexo N. parvum/N. ribis (POLIZZI et al., 2012). Até mesmo os dados de biologia molecular, utilizados na diferenciação dessas duas espécies geram resultados inconsistentes (POLIZZI et al., 2012; PAVLIC et al., 2009; PILLAY et al., 2013).
Figura 1 – Fungos da família Botryosphaeriaceae: L. theobromae, N. parvum, B. dothidea e D. mutila, Dothiorella iberica, Neoscytalidium hyalinum, Pseudofusicoccum stromaticum, Sphaeropsis citrigena
Fonte: PHILLIPS et al., 2013.
2.2 Considerações taxonômicas sobre a família Nectriaceae e a espécie Albonectria rigidiuscula
quatro espécies conhecidas: A. rigidiuscula, A. albosuccinea, A. verrucosa e A. albida (GUU, JU, HSIEH, 2007).
A espécie A. rigidiuscula tem como anamorfo o fungo Fusarium decemcellulare (Figura 2A, p. 34). Esse fungo tem outros nomes, como o ascomiceto Calonectria rigidiuscula e Nectria rigidiuscula (ROSSMAN et al., 1999). É considerado fitopatógeno e ataca espécies de plantas da família Anacardiaceae, Annonaceae, Sterculiaceae, Malvaceae, Apocynaceae, Euphorbiaceae, Meliaceae, Moraceae e Myrtaceae, causando, principalmente a morte de ponteiras, cancro, galhos, podridão dos frutos, cancro-do-ramo, superbrotamento (ROSSMAN et al., 1999).
Esse fungo já foi relatado como fitopatógeno em vários países, tais como China (QI et al., 2013), Cuba (VICENTE et al., 2012), México, Marrocos, Camarrões (SFALSIN, 2012) e Equador (LOMBARD et al., 2008). No Brasil foi isolado em diversas espécies de plantas coletadas na Bahia, Amazonas, Espírito Santo, Minas Gerais, Paraná (SFALSIN, 2012), Goiás e Distrito Federal (JUNQUEIRA et al., 2001).
Figura 2 – F. decemcellulare (A) e sintomas de cancrose em tronco em pinha (B); A. rigidiuscula (C).
Fonte: BRIOSO, 2012 Fonte: JUNQUEIRA et al., 2012
2.3 Fungos endofitícos estudados neste trabalho
Os fungos endofíticos estudados neste trabalho foram isolados a partir de plantas dispersas no bioma Caatinga no estado do Ceará e encontram-se depositados no laboratório de Fitopatologia da Embrapa Agroindústria Tropical - CNPAT sob a supervisão do Dr. Francisco das Chagas Oliveira Freire. Todos os fungos foram identificados por estudos filogenéticos de biologia molecular, com sequenciamento da região ITS e foram identificados como Lasiodiplodia theobromae (71); L. pseudotheobromae (277); L. citricola (258); L. gonubiensis (474); L. parva (511); Neofusicoccum cordaticola (434); N. parvum (600); N. ribis (683); Botryosphaeria mamane (20) e Pseudofusicoccum stromaticum (477) Tabela 1 e Figura 3, p. 35.
Já o fungo Albonectria rigidiuscula (533) foi identificado com sequenciamento de DNA das regiões LSU, ITS, BT, ACT e TEF. O DNA a partir da estirpe foi extraído a partir do micélio utilizando os laboratórios Bio-Mo; Kit de isolamento de DNA UltraClean Microbial. Fragmentos contendo os genes do RNA ribossomal 26S, Subunidade Grande D1 e D2 região (LSU) foram amplificados utilizando os iniciadores LR0R (ACCCGCTGAACTTAAGC) e LR5 (TCCTGAGGGAAACTTCG). Os fragmentos contendo o Espaçador Interno Transcrito 1 e 2 e o gene 5.8.S (STI) foi amplificado utilizando
os iniciadores LS266 (GCATTCCCAAACAACTCGACTC) e V9G
(TTACGTCCCTTTGTA). Os fragmentos contendo o fragmento parcial do gene da beta tubulina (BT) foi amplificado utilizando os iniciadores BT2a (GGTAACCAAATCGGTGCTGCTTTC) e BT2b (ACCCTCAGTGTAGTGACCCTTGGC). Os fragmentos contendo o fragmento parcial do gene da actina (TCA) foi amplificado
utilizando os iniciadores de ACT-512F (ATGTGCAAGGCCGGTTTCGC) e ACT-783R (TACGAGTCCTTCTGGCCCAT). Fragmentos contendo a translocação fator de elongação 1 alfa (TEF) foi amplificado utilizando os iniciadores EF1-728F (CATCGAGAAGTTCGAGAAGG) e EF2 (AACTTGCAGGCAATGTGG). Os fragmentos foram sequenciados com o v.3.0 pronto Reação Kit seqüenciamento Ciclo ABI Prim® Big DyeTM Terminator. As amostras foram analisadas em um ABI PRISM 3700 Genetic Analyzer e contigs foram montadas utilizando as sequências direto e inverso, com o programa do pacote SeqMan Lasergene. Uma análise de multigenes foi efetuada por comparação destas sequências em GenBank, em http://www.cbs.knaw.nl/ e na base de dados interna de CBS com as últimas espécies.
Tabela 1 – Fungos endofíticos isolados de plantas da Caatinga
Hospedeiro Endofítico associado Cód.
Espécie vegetal Nome comum
Croton campestris Velame-do-campo Lasiodiplodia citricola 258
Croton sp. - Lasiodiplodia gonubiensis 474
Spondias lútea Cajá Lasiodiplodia parva 511
Auxemma oncocalyx Pau branco Lasiodiplodia pseudotheobromae 277 Croton sonderianus Marmeleiro Lasiodiplodia theobromae 71
Psidium guajava Goiabeira Neofusicoccum ribis 683
Centrolobium microchaete Putumuju Neofusicocum cordaticola 434 Psidium guyanensis Araçá azedo Neofusicoccum parvum 600
Licania rígida Oiticica Botryosphaeria mamane 20
Schinopsis brasiliensis Pau-preto Pseudofusicoccum stromaticum 477
Psidium guajava Goiabeira Albonectria rigidiuscula 533
Fonte: Próprio autor.
Figura 3 – Cepas fúngicas de isolados dos fungos endofíticos estudados
2.4 Levantamento bibliográfico
Este levantamento bibliográfico apresenta os dados de estudos químicos realizados com espécies de fungos endofíticos da família Botryosphaeriaceae, mostrando os metabólitos secundários isolados. Os dados foram coletados através de pesquisa em bases de dados Scirus, SciFinder e Science Direct, usando os nomes dos gêneros dos fungos como palavras-chave de entrada, em artigos publicados no períodos de 1986 a 2016. Foram encontrados 246 compostos, que estão compilados nas Tabelas de 2-7. Já as estruturas dos respectivos compostos encontram-se agrupados nas Figuras de 4-12.
Os metabólitos secundários isolados de fungos endofíticos podem ser reunidos em diversas classes química, incluindo policetídeos, alcalóides, terpenos, isocumarinas, quinonas, fenilpropanóides, lignanas, ácidos fenólicos, benzopiranos, tetralonas, ciclopeptídeos entre outros. De acordo com o levantamento realizado para o gênero Botryospheria foi encontrada a maior quantidade de metabólitos secundários (114). Deste total, foram isolados 44 compostos do fungo B. rhodina. Além disso, várias dicetopiperazinas foram isoladas desses fungos; sendo que esta classe de substâncias apresenta uma ampla gama de atividades biológicas relatadas.
2.4.1 Gênero Lasiodiplodia
Dentro do perfil químico de fungos do gênero Lasiodiplodia, foram relatados 64 compostos, divididos em vários tipos de metabólitos secundários. O ácido jasmônico e seus derivados foram as substâncias mais descritas, seguidas de alguns policetídeos, tais como lasiodiplodina, lasioplinas e isocumarinas (Tabela 2, Figura 4).
Tabela 2- Relação de metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Lasiodiplodia e suas respectivas espécies, segundo a literatura
Nº Nome Fungo Referência
1 Lasiodiplodina L. theobromae SULTAN et al., 2014
XU et al., 2014 KASHIMA et al., 2009
2 de-O-Metil-lasiodiplodina L. theobromae SULTAN et al., 2014 3
(3R,4R)-4-Hidroxi-de-O-metil-lasiodiplodina
L. theobromae SULTAN et al., 2014
4 (3R),(4S)-4-Hidroxilasiodiplodina L. theobromae YANG et al., 2000 5 (3R),(6R)-6-Hidroxi-de-O- L. theobromae YANG et al., 2000
metillasiodiplodina SULTAN et al., 2014 6
(3R),(5R)-5-Hidroxi-de-O-metillasiodiplodina
L. theobromae YANG et al., 2000
7 5-Oxo-Lasiodiplodina L. theobromae MATSUURA et al.,
1998
8 (3R),(5S)-5-Hidroxilasiodiplodina L. theobromae MATSUURA et al., 1998
9 (3R),(5R)-5-Hidroxilasiodiplodina L. theobromae MATSUURA et al., 1998
10 6-Oxo-de-O-metil-lasiodiplodina L. theobromae SULTAN et al., 2014 11 (E)-9-Eteno-lasiodiplodina L. theobromae SULTAN et al., 2014 12 (E)-9-Eteno-de-O-metil-lasiodiplodina L. theobromae SULTAN et al., 2014 13 (3R),(6S)-6-Hidroxilasiodiplodina L. theobromae LI et al., 2005
14 (3R),(5S)-5-Hidroxi-de-O-metillasiodiplodina
L. theobromae KASHIMA et al., 2009
15 (3S),(4R)-3-Carboxi-2-metileno-heptan-4-olido
L. theobromae HE et al., 2004
16 Ácido decumbico L. theobromae HE et al., 2004
17 (1S,4R,5S,6R)-7,9-Dioxa-3-metil-8-oxobiciclo[4.3.0.]-2 nonena-4,5-diol
L. theobromae MATSUURA et al., 1998
18 2-Octeno-t5-lactona L. theobromae MATSUMOTO et al.,
1994 19
(6'R)-2,4-diidroxi-6-(6'-hidroxiheptil)benzoato de etila
L. theobromae YANG et al., 2000
20 (6'R)-2,4-diidroxi-6-(6'-hidroxiheptil)-benzoato de isobutila
L. theobromae YANG et al., 2000
21 Ergosterol L. theobromae NUNES et al., 2008
22 Ácido 2,4,6-trimetiloct-2-enoico, 1,2,6,8a-tetrahidro-7-hidroxi-1,8a-dimetil-6-oxo-2-naftalenil éster
L. theobromae NUNES et al., 2008
23 cis-4-Hidroximeleina L. theobromae NUNES et al., 2008 LIM et al., 1998 24 Colestanol glicosídeo L. theobromae JINU et al., 2015
25 Taxol L. theobromae PANDI et al., 2011
26 4,5-Diidroxi-3-metil-ciclohex-2-ona L. theobromae KITAOKA et al., 2009
27 (1S,2R,5S,6R)-30-Metil-7-oxa-biciclo-[4.1.0]hept-3-en-2,5-diol
L. theobromae KITAOKA et al., 2009
28 (1S,4R,5S,6R)-7,9-Dioxa-3-metil-8-oxobiciclo[4.3.0.]-2-nonena-4,5-diol
L. theobromae KITAOKA et al., 2009
29 (4S,5S)-4,5-Diidroxi-2-metil-ciclohex-2-enona
L. theobromae KITAOKA et al., 2009
30 Ácido jasmônico
L. theobromae
ANDOLFI et al., 2014 DHANDHUKIA et al., 2008
DHANDHUKIA et al., 2007
NAKAMORI et al., 1994
MIERSCH, 1991 ALDRIDGE et al., 1967
31 Meleina L. theobromae
QIAN et al., 2014 NAKAMORI et al., 1994
ALDRIDGE et al., 1967
LIM et al., 1998
32 Teobroxido L. theobromae NAKAMORI et al.,
1994
33 trans-Resorcilídeo L. theobromae XU et al., 2014
34 Ácido 5ȕ-cucurbico L. theobromae MIERSCH, 1989
35 Etil (+)-7-iso-jasmônico L. theobromae MIERSCH, 1989 36 Etil (-)-7-iso-jasmônico L. theobromae MIERSCH, 1989 37 Ácido (+)-4,5-desidro-7-iso-jasmônico L. theobromae MIERSCH, 1989 38 Ácido (-)-4,5-desidro-7-iso-jasmônico L. theobromae MIERSCH, 1989 39 Ácido (11S)-(-)- hidroxijasmônico L. theobromae MIERSCH, 1991 40 Ácido (11R)-(-)- hidroxijasmônico L. theobromae MIERSCH, 1991 41 Ácido (-)-12-hidroxijasmônico L. theobromae MIERSCH, 1991
42 Lasiodiplina A L. pseudo
theobromae
WEI et al., 2014
43 Lasiodiplina B L. pseudo
theobromae
WEI et al., 2014
44 Lasiodiplina C L. pseudo
theobromae
WEI et al., 2014
45 Lasiodiplina D L. pseudo
theobromae
WEI et al., 2014
46 Lasiodiplina E L. pseudo
theobromae
WEI et al., 2014
47 Lasiodiplina F L. pseudo
theobromae
WEI et al., 2014
48 Ciclo-(Trp-Ala) L. pseudo
theobromae
WEI et al., 2014 QIAN et al., 2014
49 Palmarumicina LP1 L. pseudo
theobromae
LU et al., 2014
50 Cladospirona B L. pseudo
theobromae
LU et al., 2014
51 Ascocitatina L. pseudo
theobromae
LU et al., 2014
52 Sch 50676 L. pseudo
theobromae
LU et al., 2014
53 Lasiojasmonato A Lasiodiplodia sp. ANDOLFI et al., 2014 54 Lasiojasmonato B Lasiodiplodia sp. ANDOLFI et al., 2014 55 Lasiojasmonato C Lasiodiplodia sp. ANDOLFI et al., 2014 56 16-O-Acetilbotriosfaerilactona A Lasiodiplodia sp. ANDOLFI et al., 2014 57 16-O-Acetilbotriosfaerilactona C Lasiodiplodia sp. ANDOLFI et al., 2014 58 Botriosfaerilactona A Lasiodiplodia sp. ANDOLFI et al., 2014 59 (1R,2R)-Metil jasmonato Lasiodiplodia sp. ANDOLFI et al., 2014 60 (3S,4R,5R)-4-Hidroximetil-3,5- Lasiodiplodia sp. ANDOLFI et al., 2014 Continuação
dimetildiidro-2-furanona
61 (3R,4S)-Botriodiplodina Lasiodiplodia sp. ANDOLFI et al., 2014 62 Ácido indol-3-carboxílico Lasiodiplodia sp. QIAN et al., 2014 63 Indol-3-carbaldeido Lasiodiplodia sp. QIAN et al., 2014
64 2-Feniletanol Lasiodiplodia sp. QIAN et al., 2014
Fonte: Próprio autor.
Figura 4 - Relação das estruturas dos metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Lasiodiplodia, segundo a literatura
O OMe O H O OH O OMe O H O OH O OMe O H O OH
4 5 6
O OMe O H O O 7 O OMe O H O OH 8 O OMe O H O OH 9 O OR1 O H O R2 OR3 O OMe O H O O 10 O OMe O H O 11 O OH O H O 12 O OMe O H O OH 13 O OMe O H O OH 14 O O COOH 15 O O COOH 16 O O OH OH O
17 O18 O
O OH O O H OH O OH O O H OH 19
20 HO 21
O OH O O 22 O OH O OH 23 O O H OzB
cAO O OH
O OcA O OH Ph NH O Ph O O OH OH O H OH 24 25 OH OH O26 OH OH O 27 OH OH O O O 28 O OH OH 29 O COOH 30 OH OH O 32 O O O O H OH 33 OH COOH 34 O
COOC2H5
35
O
COOC2H5
Fonte: Próprio autor.
O
COOH 38
39 40 41
NH N O X O R2 R1 S N H N S N H O H O O 45 N H N H N S O S O 46 N H NH S NH O O
47 NH
N H N H O O 48 49 OH OH O OH O O OH 50 OH OH O OH O O 51 OH OH OH O O OH O 52 OH OH O O O O O O O O 53 O O O O R O O O
54 R = -H
55 R = -H
56 R1 = -H, R2 = Ac
57 R1 = -H, R2 = Ac 58 R1 = -H, R2 = H
O
O O
O R1
OR2 COOMe
O 59 O O OH 60 O O H O
61 NH
OH O 62 N H H O 63 OH 64 α β β β α O COOH OH O COOH OH O COOH OH
Fonte: Próprio autor.
2.4.2 Gênero Neofusicoccum
derivados da meleina sugerem também, a ocorrência de biossíntese via rota policetídica para metabólitos deste gênero. (Tabela 3, Figura 5).
Tabela 3 - Relação de metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Neofusicoccum, segundo a literatura
Nº Nome Fungo Referência
65 (-)-Terremutina N. parvum ABOU et al., 2015
66 (+)-Terremutina hidratada N. parvum ABOU et al., 2015 67 (+)-epi-Esfaeropsidona N. parvum ABOU et al., 2015 68 (-)-4-Cloro-terremutina hudratada N. parvum ABOU et al., 2015 69 (+)-4-Hidroxisuccinato-Terremutina
hidratada
N. parvum ABOU et al., 2015
70 (6S,7R)-Asperlina N. parvum ABOU et al., 2015
71 (6R,7S)-dia-Asperlina N. parvum ABOU et al., 2015
31 (R)-(-)-Meleina N. parvum ABOU et al., 2015
72 (3R,4R)-4-Hidroximeleina N. parvum ABOU et al., 2015 EVIDENTE et al., 2010 73 (3R,4S)-4-Hidroximeleina N. parvum ABOU et al., 2015
EVIDENTE et al., 2010 74 (R)(-)-3-Hidroximeleina N. parvum ABOU et al., 2015 75 Ácido 6-metil-salicílico N. parvum ABOU et al., 2015 76 Ácido 2-hidroxipropil salicílico N. parvum ABOU et al., 2015
77 Isosclerona N. parvum EVIDENTE et al., 2010
78 Tirosol N. parvum EVIDENTE et al., 2010
79 Ciclobotrióxido N. australe ANDOLFI et al., 2012
80 Ciclobotrióxido acetil N. australe ANDOLFI et al., 2012
81 3-Metilcatecol N. australe ANDOLFI et al., 2012
78 Tirosol N. australe ANDOLFI et al., 2012
82 Botriosfaerona D N. australe ANDOLFI et al., 2012
83 (3S,4S)-3,4,8-Triidroxi-6-metoxi-3,4-diidro-1(2H)-naftalenona
N. australe ANDOLFI et al., 2012
Figura 5 - Relação das estruturas dos metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Neofusicoccum, segundo a literatura
65 O OH OH O 66 O OH OH O H O H 67 O OMe OH O 68 O OH Cl O H O H 69 O OH O O H O H O O OH O AcO O 70 O AcO O 71 O OH O OH 72 O OH O OH 73 O OH O OH OH O OH 75 OH O OH OH 76 O OH
OH77 OH
OH 78 OH OMe O O 79 OAc OMe O O 80 O H OH 81 MeO OH O OH OH 83 MeO OH O OH OH 83 74
Fonte: Próprio autor.
2.4.3 Gênero Botryosphaeria
Dentro do perfil químico de fungos do gênero Botryosphaeria, foram relatados 114 compostos pertencentes à diversas classes químicas (Tabela 4 e Figura 6). A diversidade estrutural dos metabólitos variou desde compostos mais simples, passando por compostos aromáticos, alcalóides, diterpenos e esteroides.
Tabela 4 - Relação de metabólitos secundários isolados de fungos do gênero Botryosphaeria e suas respectivas espécies, segundo a literatura
Nº Nome Fungo Referência
84 Botriorodina A B. rhodina ABDOU et al., 2010
85 Botriorodina B B. rhodina ABDOU et al., 2010
86 Botriorodina C B. rhodina ABDOU et al., 2010
87 Botriorodina D B. rhodina ABDOU et al., 2010
88 Ácido indol-ȕ-carboxílico B. rhodina ABDOU et al., 2010
89 Botriosfaerilactona A B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et
al., 2009
90 Botriosferilactona B B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et
al., 2009
91 Botriosfaerilactona C B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et al., 2009
92 Botriosfaeridiona B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et
al., 2009
93 Botriosfaerihidrofurana B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et
al., 2009
94 Botriosfaerinona B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et
al., 2009 95
Diidro-4-(hidroximetil)-3,5-dimetil-2(3H)-furanona
B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et al., 2009
96 Botriosfaeriodiplodina B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et
al., 2009
8 (5S)-Hidroxilasiodiplodina B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et al., 2009
97 (3S)-Hidroxilasiodiplodina B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et al., 2009
9 (5S)-Hidroxilasiodiplodina B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et al., 2009
98 (R)-(-)-5-Hidroximeleina B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et
al., 2009
31 (R)-(-)-Meleina B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et
al., 2009 72 cis-(3R,4R)-(-)-4-
Hidroximeleina
B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et al., 2009
74 trans-(3R,4S)-(-)-4-Hidroximeleina
B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et al., 2009
99 (R)-(-)-2-Octeno-d- lactona B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et al., 2009
100 tetraidro-4-hidroxi-6-propilpiran-2-ona
B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et al., 2009
101 Ácido 6-metilsalicílico B. rhodina RUKACHAISIRIKUL et
al., 2009
1 Lasiodiplodina B. rhodina VEIGA et al., 2007
SILVA, 2007 102 p-Hidroxifeniletanol B. rhodina VEIGA et al., 2007
103 Inosina B. rhodina VEIGA et al., 2007
21 Ergosterol B. rhodina VEIGA et al., 2007
SILVA, 2007
104 Desmetil-lasiodiplodina B. rhodina SILVA, 2007
72 Trans-hidromeleina B. rhodina SILVA, 2007
74 Cis-hidroximeleina B. rhodina SILVA, 2007
105 5 -Propil-4-carboxi-3-metil-Ȗ-butirolactona
B. rhodina SILVA, 2007
106 5-Propil-4-metil-3-carboxi--but-3-enlactona
B. rhodina SILVA, 2007
107 Ácido 11-hidroxijasmônico B. rhodina SILVA, 2007
108 5-Hidroximetilfurfural B. rhodina SILVA, 2007
78 Tirosol B. rhodina SILVA, 2007
110 Peróxido de ergosterol B. rhodina SILVA, 2007
111 Estigmastenona B. rhodina SILVA, 2007