Revisão do conceito de probabilidade: variáveis aleatórias. Modelos probabilísticos em Biologia: distribuição Binomial, Poisson e normal.

CONTEÚDO PROGRAMÁTICO PARA REALIZAÇÃO DAS PROVAS:

BIOESTATÍSTICA

Estatística descritiva: utilização da estatística nas Ciências Biológicas. População e amostra, tipos de variáveis e distribuições de freqüências, Representações gráficas e elaboração de tabelas. Medidas de dispersão e posição (tendência central).

Noções de amostragem: população alvo e população amostrada, tipos de amostragem, técnicas de amostragem probabilística em biologia. Saída de campo: escolha da unidade amostral para obter estimadores adequados de densidade de organismos litorâneos.

Revisão do conceito de probabilidade: variáveis aleatórias. Modelos probabilísticos em Biologia: distribuição Binomial, Poisson e normal.

Inferência estatística por intervalos de confiança: estimação da média populacional, estimação da variância populacional, estimação de proporções, estimação por intervalos de confiança, construção de intervalos de confiança para a média e a proporção populacional.

Testes de hipóteses: erro do tipo I e II, teste para uma média e uma proporção populacional, teste de igualdade entre duas médias populacionais, teste de igualdade entre duas proporções, testes não paramétricos de ajustamento e elaboração de tabelas de contingência, testes não paramétricos à igualdade de duas distribuições (Mann-Whitney; comparação entre duas amostras emparelhadas – o teste do sinal e o teste de Wilcoxon). Saída de campo: obtenção de dados para testar padrões de distribuição de organismos litorâneos.

Correlação e regressão linear simples: teoria e laboratório. Análise de variância: teoria e laboratório.

BIOLOGIA CELULAR

1- Métodos de estudo das células.

2- Organização geral das células. Diferenças entre eucariontes e procariontes e entre células animais e vegetais.

3- A membrana plasmática: estrutura molecular, diferenciações e glicocalix. 4- Núcleo interfásico: constituição química. Cromatina

5- Replicação de DNA. Cromossomas. Transcrição de RNA 6- Síntese protéica. Sistema de endomembranas - REL, RER e Golgi 7- Endocitose: pinocitose e fagocitose. Lisossomo e digestão intracelular 8- Organelas oxidativas : mitocôndrias, cloroplastos e peroxissomos 9- Citoesqueleto: caracterização e funções.

10- Mitose, Meiose e Morte celular. 11- Matriz Extracelular

12- Receptores de membrana e comunicação química entre as células.

BIOQUÍMICA

1. ESTRUTURA E PROPRIEDADES DOS AMINOÁCIDOS

1.1. Estrutura e classificação de aminoácidos comuns nas proteínas 1.2. Propriedades ácido-básicas dos aminoácidos

2. BIOENERGÉTICA 2.1. Energia livre

2.2. ATP como transportador de energia 3. ENZIMAS

3.1. Nomenclatura e classificação

3.2. Efeito da concentração de substrato, pH e temperatura 3.3. Efeito de inibidores

3.4. Enzimas reguladoras

4. METABOLISMO DE CARBOIDRATOS 4.1. Via glicolítica e destinos do piruvato 4.2. Neoglicogênese

4.3. Metabolismo do glicogênio 4.4. Ciclo do ácido cítrico 4.5. Cadeia respiratória 5. FOTOSSÍNTESE

5.1. Absorção de luz e Conversão de Energia 5.2. Ciclo de Benson-Calvin

5.3. Fotorrespiração 5.4. Fotossíntese de C4 6. METABOLISMO MINERAL 6.1. Fixação do nitrogênio

6.2. Absorção de nitrato e redução 6.3. Assimilação de Amônia 6.4. Enzimologia

7. SÍNTESE E METABOLISMO DE FITOHORMÔNIOS 7.1.Giberelinas, citocininas, auxinas, etileno 7.2. Ácido jasmônico, ácido salicílico e poliaminas 8. METABOLISMO DE LIPÍDIOS

8.1. Estrutura e função dos lipídios 8.2. Vias de oxidação de ácidos graxos 8.3. Corpos cetônicos e sua utilização

8.4. Triacilgliceróis e colesterol 8.5. Biossíntese de ácidos graxos 9. METABOLISMO DE AMINOÁCIDOS 9.1. Oxidação de aminoácidos

9.2. Metabolismo e excreção do nitrogênio 9.3. Metabolismo dos esqueletos de carbono 9.4. Biossíntese de proteínas

10. INTEGRAÇÃO METABÓLICA

10.1. Integração entre carboidratos e lipídios

10.2. Integração entre proteínas, lipídios e carboidratos

FILOSOFIA, ETICA E METODOLOGIA CIENTÍFICA

- Aprender a aprender: organização pessoal e em equipe; - Leitura: importância, prática, estratégias e tipos. 2 - Introdução à Filosofia da Ciência

- Aspectos históricos e filosóficos da Ciência: - Pré-socráticos, Sócrates e Pós-Socraticos; - Filosofia Medieval;

- Filosofia Renascentista; - Filosofia Moderna; - Filosofia Contemporânea.

- Correntes Filosóficas e o método científico: - Método dedutivo;

- Método indutivo;

- Método hipotético-dedutivo; - Método dialético;

- Método fenomenológico.

- A base filosófica da Universidade: integração entre pesquisa, ensino e extensão. 3 - Princípios, Normas e Técnicas aplicadas a Metodologia Científica

- Tema;

- Objetivos/Hipótese; - Método;

- Justificativa. - Redação Científica:

- Qualidade do texto científico;

- Elaboração de resumos (organização e tipos - NBR 6028); - Elaboração de resenhas (redação e estilo).

- Citação bibliográfica (NBR 10520) - Elaboração de projetos de pesquisa: - Elementos da Introdução; - Elementos da Justificativa;

- Objetivos (geral e específicos) e formulação de hipóteses; - Elementos dos Materiais e Métodos;

- Plano de Trabalho e Cronograma; - Elaboração de Referências (NBR 6023).

- Normas para elaboração de trabalhos acadêmicos (NBR 14724): - Elementos pré-textuais;

- Elementos textuais; - Elementos pós-textuais.

- Apresentação de relatórios técnico-científicos (NBR 10719). 4 - Ética

- A ética como área da filosofia; - A ética na pesquisa científica.

GEOLOGIA

Astrofísica e formação do universo e da Terra A estrutura da Terra

Geologia Histórica Minerais e Rochas Ciclo das rochas

Tectônica de Placas e dinâmicas interna Fósseis

Intemperismo Pedologia

Processos Sedimentares continentais e marinhos Quantificação ambiental dos processos geológicos Trabalho de campo e relatórios

HISTOLOGIA

- Tecido Epitelial de Revestimento – Morfologia, Histofisiologia e Classificação; - Tecido Epitelial Glandular – Morfologia, Histofisiologia e Classificação;

- Tecido Conjuntivo – Fibras e Substância Fundamental Amorfa – Morfologia, Histofisiologia, Variedades e Classificação;

- Tecido Conjuntivo – Células – Morfologia e Histofisiologia; - Tecido Cartilaginoso – Classificação. Morfologia e Histofisiologia; - Tecido Ósseo – Morfologia, Variedades, Histofisiologia e Ossificações; - Tecido Nervoso – Morfologia e Histofisiologia;

- Tecido Muscular – Morfologia, Classificação, Histogênese e Histofisiologia; - Sistema Circulatório – Morfologia e Histofisiologia;

- Células do Sangue – Classificação, Morfologia e Histofisiologia; - Hemocitopoese – Morfologia e Histofisiologia;

- Sistema Linfóide – Nódulos, Linfonodo, Timo, Baço e Amigdalas – Morfologia e Histofisiologia;

- Tubo Digestivo – Cavidade Oral, Faringe, Esôfago, Estômago e Intestino – Morfologia e Histofisiologia.

- Glândulas Anexas do Tubo Digestivo – Glândulas Salivares, Pâncreas, Fígado e Vesícula Biliar – Morfologia e Histofisiologia;

- Aparelho Respiratório – Fossas Nasais, Laringe, Traquéia, Brônquios, Bronquíolos e Pulmões – Morfologia e Histofisiologia;

- Aparelho Urinário – Rim, Ureteres e Bexiga – Morfologia e Histofisiologia;

- Sistema Endócrino – Hipófise, Tireóide, Paratireóide, Adrenal, Ilhotas de langerhans e - Pineal – Morfologia e Histofisiologia;

- Aparelho Reprodutor Masculino – Testículos, Ductos Genitais e Glândulas Acessórias – Morfologia e Histofisiologia;

- Aparelho Reprodutor Feminino – Ovário, Tuba Uterina, Útero, Vagina – Morfologia e Histofisiologia;

- Citologia Esfoliativa. Relações Endócrinas;

- Glândulas Mamárias – Morfologia e Histofisiologia;

Órgãos dos Sentidos – Receptores Sensoriais, Olho, Aparelho Vestíbulo Coclear. Morfologia e Histofisiologia.

MATEMATICA

1.1 Número, Variável e Função

 Números Reais;

 Sistemas de coordenadas e vetores;

 Efeito de Coriolis*;

 Funções: definição;

 Funções elementares; funções algébricas e trigonométricas;

 Modelos analíticos a partir de dados experimentais*. 1.2 Limites e continuidade da Função

 Definição;

 Teoremas e limites fundamentais;

 Continuidade e propriedades das funções contínuas; assíntotas.

 Aplicação: saturação de uma solução*;

1.3 Introdução ao Cálculo Diferencial.

 Derivada e diferencial;

 Definição de derivada como o limite da razão incremental;

 Interpretação geométrica da derivada;

 Taxas de variação;

 Técnicas de diferenciação;

 Regra da Cadeia;

 Funções deriváveis e regras de derivação.

1.4 Aplicação do Cálculo Diferencial.

 Derivada das funções constante, polinomial, logarítmica e trigonométrica;

 Principais fórmulas de derivação;

 Derivação de funções compostas;

 Regra de L'Hôpital;

 Derivadas sucessivas;

 Derivadas de diferentes ordens e interpretação mecânica das derivadas primeira e segunda*;

 Diferencial de uma função;

 Taxas de crescimento e mortalidade de organismos*.

1.5 Análise de Funções

 Crescimento e decrescimento das funções;

 Análise de extremos: máximo e mínimo;

 Estudo da concavidade e ponto de inflexão;

 Representação gráfica: concentração de material em suspensão na coluna de água*;

 Aplicações: mini e maximização de funções contínuas*.

1.6 Introdução ao Cálculo Integral

 Primitiva e integral indefinido;

 Quadro de integrais;

 Integração por partes;

 Trabalho;

 Cálculo de áreas e outras aplicações práticas: consumo de energia de determinado organismo*.

1.7 Aplicações em Biologia e Ciências do Mar*

 Equações diferenciais ordinárias: métodos numéricos;

 Modelo de crescimento contínuo para uma espécie simples;

 Equação da onda e solução;

 Ondas: freqüência, número de onda e período;

METODOS COMPUTACIONAIS EM BIOMATEMÁTICA

Noções básicas de lógica, conceito de máquina, sistema e software, conceito de periféricos, estruturação de programas e sistemas operacionais (Linux, Windows, MacOS). Introdução ao Windows e suas principais ferramentas: Microsoft Office. Criação de documentos, manipulação, correção ortográfica, tabelas e ferramentas, planilhas e cálculos básicos, funções e exportação/importação de dados.

2) Técnicas Digitais de Vizualização

Apresentações e produção científica, vizualização e impressão, técnicas de agrupamento de dados, conceitos e “pre”conceitos na apresentação de resultados.

3) Programação Lógica

Introdução à programação de algoritmos (Matlab, Octave, Scilab e clones), métodos de programação Prática com Scilab (Openware): abertura e leitura de arquivos, vetores e matrizes, operações básicas, programação seriada, plotagem e exportação de gráficos.

4) Métodos Computacionais (I)

derivadas e integrais no computador, métodos variacionais, análise numérica e integração de equações diferenciais. Modelos numéricos e análise de funções.

5) Métodos Computacionais (II)

Funções de crescimento e decaimento, análise de sinais periódicos, Técnicas de Fourier e Periodogramas, sinais biológicos cíclicos e estabilidade de modelos biológicos.

6) Softwares de apoio: Internet, WWW e outros

Navegadores de rede, Explorer e Netscape, Internet Mail e segurança, protocolos de “boas maneiras” na internet, tradutores, “Web of Science” e Portal de Periódicos, ferramentas de busca. Gerenciador de referências e citações bibliográficas, manipulação de imagens e scanners, produção de mapas e layout de documentos.

I - Célula Vegetal:

- Organização Geral; - Parede celular;

- Componentes protoplasmáticos: citoplasma, núcleo, plastos e outros organelas; - Componentes não protoplasmáticos: vacúolos, pigmentos, substâncias ergásticas.

II – Tecidos Vegetais: - Meristemas; - Tecidos adultos;

- Simples: Parênquima, Colênquima, Esclerênquima; - Complexos: Epiderme, Periderme, Xilema e Floema.

III – Órgãos: RAIZ

- Morfologia Externa. Tipos; - Anatomia:

- Estrutura primária; - Estrutura Secundária;

- Variações do Crescimento Secundário; CAULE

- Morfologia Externa. Tipos; - Anatomia:

- Estrutura primária;

- Estrutura Secundária. Lenho;

- Variações do Crescimento Secundário; FOLHA

- Morfologia Externa. Filotaxia; - Anatomia:

- Estrutura Básica e Desenvolvimento - Variações da Estrutura;

- Estrutura Foliar e Ambiente; - Abscisão Foliar.

FLOR

- Morfologia Externa. Diagrama Floral e Inflorescências; - Anatomia;

- Formação do Óvulo e do Grão de Pólen. Polinização e Fecundação; - Formação do Fruto e da Semente;

FRUTO E SEMENTE

- Morfologia Externa. Tipos; Estrutura Básica. Dispersão.

QUÍMICA

1. ESTEQUIMETRIA DE REAÇÕES - Mol – Conceito atual

- Estequiometria de soluções: Concentração em quantidade de Matéria

2. FÍSICO-QUÍMICA DE SOLUÇÕES

- Teoria Moderna dos Eletrólitos (Debye-Huckel-Onsager): Atração Interiônica entre eletrólitos; - Conceitos de: Força Iônica, atividade e Coeficiente de atividade

- Equilíbrio Iônico (Ácido-Base): Ácidos/Bases – conceitos atuais, Cálculo do Potencial Hidrogênionico (pH);

- Hidrólise, Soluções Tampão;

- Equilíbrio com Formação de Precipitados: Conceito de Kps, Precipitação Fracionada; - Equilíbrio Envolvendo Reações de Óxido-Redução

- Equilíbrio Envolvendo Íons Complexos

QUÍMICA ANALÍTICA

1. INTRODUÇÃO À QUÍMICA ANALÍTICA

- Classificação dos Métodos de Análise Química (Conceito e importância da Análise Quantitativa, procedimento geral de uma análise)

- Amostragem e preparação da amostra para análise (Amostra e amostragem, processo de amostragem, solubilização por ataque ácido, após fusão e ataque ácido, mineralização da matéria orgânica por vias seca e úmida)

- Expressão dos resultados e Erros em Química Analítica (Precisão e exatidão de uma análise, erros determinados e indeterminados, algarismos significativos e arredondamento de dados, meios de melhorar precisão e exatidão em uma análise);

2. ANÁLISE GRAVIMÉTRICA

- Efeito do íon comum. Formação, contaminação e tratamento dos precipitados

- Condições ideais para a análise gravimétrica. Operações na gravimetria. Aplicações em matrizes biológicas

3. ANÁLISE VOLUMÉTRICA

- Volumetria de neutralização: Teoria dos indicadores ácido/base, curvas de neutralização, escolha do indicador para a titulação, aplicações do método;

- Volumetria de precipitação: Indicadores de adsorção e indicadores específicos, Argentimetria (Mohr e Volhard), aplicações do método;

- Volumetria de complexação: Constante de formação ou de estabilidade, indicadores metalocrômicos, quelatometria com EDTA, aplicações do método;

- Volumetria de redução: Potenciais de redução, reações e equivalentes de óxido-redução, permanganimetria, dicromatometria e tiossulfatometria, aplicações do método;

4. MÉTODOS INSTRUMENTAIS DE ANÁLISE QUÍMICA

- Espectroscopia – Espectrofotometria de absorção molecular- Absorciometria. Lei de Lambert-Beer. Relações entre trasmitância, a absorbância e as concentrações. Fenômeno da cor.

Comprimento de onda e trajeto óptico ideais para as análises espectrofotométricas. Análise colorimétrica. Aplicação em amostras.

- Eletroanalítica – Noções de potenciometria. Equação de Nernst e sua aplicação no pH. Medida direta do pH. Titulação pHmetrica.

SISTEMÁTICA E BIOGEOGRAFIA

2. O que é – Filosofia e Princípios Básicos 3. Relacionamento com outras disciplinas 4. Histórico da Biogeografia

5. Padrões, Processos e Escala.

6. A Dinâmica Biogeográfica no Fanerozóico. 7. Especiação e Extinção.

8. Dispersão, Endemismo e Disjunção. 9. Reconstruindo as Histórias Biogeográficas. 10. Panbiogeografia e Vicariância.

11. A Teoria dos Refúgios. 12. A Biogeografia de Ilhas.

13. Gradientes Latitudinais e Diversidade 14. Biogeografia Filogenética.

ZOOLOGIA DE INVERTEBARDOS I

 Introdução à Zoologia dos Invertebrados = Biodiversidade animal; Caracterização dos ambientes marinhos; “Bauplan” e nível de organização dos organismos; Filogenia geral dos invertebrados;

 Reino Protista = Organização celular; Características gerais do grupo e características específicas dos representantes do Filo Euglenida, Kinetoplastida, F. Ciliophora, F. Apicomplexa, F. Dinoflagellata, F. Stramenopila, F. Rhizopoda, F. Actinopoda, F. Granuloreticulosa, F. Diplomonadina, F. Parabasilida, F. Cryptomonada, F. Microspora, F. Ascetospora, F. Choanoflagellata, F. Chlorophyta e F. Opalinida; Reprodução e ciclo de vida das principais espécies; Filogenia dos Protista;

 Filo Porifera = Evolução dos Metazoa; Características gerais do grupo e características específicas dos representantes da Classe Calcarea, C. Hexactinellida e C. Demospongiae; Morfotipos estruturais (áscon, sycon e leucon) e seu sistema aquífero; Tipos celulares; Reprodução, desenvolvimento e ciclo de vida; Aspectos ecológicos; Filogenia dos Porifera;

Filo Cnidaria = Características gerais do grupo e características específicas dos representantes da Classe Hydrozoa, C. Anthozoa, C. Cubozoa e C. Scyphozoa; Calcarea, C. Hexactinellida e C. Demospongiae; Morfotipos estruturais (polipóide e medusóide); Corais (tipos e formação); Tipos celulares, formação dos tecidos e organização colonial; Estruturas de defesa (cnidoblastos); Locomoção (esqueleto hidrostático); Reprodução, desenvolvimento e ciclo de vida; Filogenia dos Cnidaria;

 Filo Ctenophora = Características gerais do grupo e características específicas dos representantes da Ordem Beroida, O. Cestida, O. Cyppida, O. Ganeshida, O. Lobata, O. Platyctenida e O. Thalassocalyda; Morfologia estrutural (fileiras de pentes); Reprodução, desenvolvimento e ciclo de vida; Filogenia dos Ctenophora;

 Filo Platyhelminthes = Evolução dos Bilateria; Características gerais do grupo e características específicas dos representantes da Classe Turbellaria, C. Monogenea e C. Cestoda; Espécies parasitas e adaptações à vida parasitária; Reprodução, desenvolvimento e ciclo de vida dos principais representantes; Filogenia dos Platyhelminthes;

 Filo Nemertea = Características gerais do grupo e características específicas dos representantes da Classe Anopla e C. Enopla; Reprodução, desenvolvimento e ciclo de vida; Filogenia dos Nemertea;

 Animais Pseudocelomados (Aschelminthes) = Características gerais do grupo e características específicas dos representantes do Filo Rotifera, F. Gastrotricha; F. Sipuncula, F. Echiura, F. Nematoda e F. Priapulida; Epitélios sinciciais e suas funções; Criptiobiose; Reprodução, desenvolvimento e ciclo de vida dos principais representantes; Considerações filogenéticas dos animais pseudocelomados;

 Filo Mollusca = Características gerais do grupo e características específicas dos representantes da Classe Aplacophora, C. Monoplacophora, C. Polyplacophora, C. Gastropoda, C. Scaphopoda, C. Bivalvia e C. Cephalopoda; Manto e Cavidade do Manto; Formação, diversidade e evolução da concha nas classes; Cefalização, evolução da circulação hídrica e das trocas gasosas; Estratégias de defesa e alimentação; Evolução dos órgãos sensoriais; Reprodução, desenvolvimento e ciclo de vida dos principais representantes; Filogenia dos Mollusca;

 Filo Annelida = Características gerais do grupo e características específicas dos representantes da Classe Oligochaeta, C. Polychaeta e C. Hirudinea; Metameria, locomoção e evolução da cutícula; Diversidade e modos de vida; Reprodução, desenvolvimento e ciclo de vida dos principais representantes; Filogenia dos Annelida;

ZOOLOGIA DE INVERTEBRADOS II

INTRODUÇÃO AOS ARTHROPODA: História taxonômica e classificação. O arquétipo dos Arthropoda. A parede do corpo. Os apêndices. Suporte e locomoção. Crescimento. Sistemas do corpo e órgãos sensoriais. Reprodução e desenvolvimento. A evolução dos Arthropoda.

FILO ARTHROPODA: CRUSTACEA: O arquétipo dos crustáceos. Locomoção. Alimentação. Sistemas do corpo e órgãos sensoriais. Reprodução e desenvolvimento. Classificação dos Crustacea. Filogenia. FILO ARTHROPODA: HEXAPODA: O arquétipo dos Hexapoda. Morfologia geral. Locomoção. Alimentação e digestão. Sistemas do corpo e órgãos sensoriais. Reprodução e Desenvolvimento. Classificação. Evolução. A origem dos Hexapoda e dos Insetos voadores. Evolução dentro dos Hexapoda. FILO ARHTROPODA: MYRIAPODA: O arquétipo dos Miriapoda. Cabeça e partes da boca. Locomoção. Alimentação e Digestão. Sistemas do corpo e órgãos sensoriais. Reprodução e Desenvolvimento. Embriogenia. Classificação. Filogenia.

FILO ARTHROPODA: CHELICERIFORMES: O arquétipo dos Cheliceriformes. Fiandeiras, a seda das aranhas e aranhas tecedoras. Locomoção. Alimentação e digestão. Sistemas do corpo e órgãos sensoriais. Reprodução e Desenvolvimento. A Classe Pycnogonida. O arquétipo dos Pycnogonida. Anatomia externa. Locomoção. Alimentação e Digestão. Sistemas do corpo e órgãos sensoriais. Reprodução e desenvolvimento. Classificação de Cheliceriformes. Filogenia.

LOFOFORADOS: O arquétipo dos lofoforados. História taxonômica. FILO PHORONIDA. O arquétipo dos Phoronida. Parede e cavidade do corpo, suporte. O lofóforo, alimentação e digestão. Sistemas do corpo. Reprodução e desenvolvimento. FILO ECTOPROCTA. O arquétipo dos Ectoprocta. A parece do corpo, celoma, músculos e movimento. Interconexões dos zoóides. O lofóforo, alimentação e digestão. Sistemas do corpo. Reprodução e desenvolvimento. FILO BRACHIOPODA. O arquétipo dos Brachiopoda. A parede do corpo, celoma e suporte. O lofóforo, alimentação e digestão. Sistemas do corpo. Reprodução e desenvolvimento. Filofenia de Lofoforados.

FILO ECHINODERMATA: O arquétipo dos Echinoderma. Parede do corpo e celoma. Sistema vascular de água. Suporte e locomoção. Alimentação e digestão. Sistemas do corpo. Reprodução e desenvolvimento. Classificação. Filogenia.

FILO CHAETOGNATHA E HEMICHORDATA: O arquétipo e classificação.

FILO CHORDATA: FILO UROCHORDATA: O arquétipo dos Tunicados. FILO CEPHALOCHORDATA: O arquétipo dos Cephalocordata. Considerações filogenéticas.