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Aspectos históricos Pasteur bacilo que após s contacto com o ar cessava o movimento. 1ª Guerra Mundial ( ) 18) gangrena / tétanot

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Texto

(1)

Aspectos históricos

1690

1690

Van

Van

Leuwenhoek

Leuwenhoek

:

:

anim

anim

á

á

culos

culos

existindo na ausência de ar

existindo na ausência de ar

1861

1861

Pasteur

Pasteur

bacilo que ap

bacilo que ap

ó

ó

s contacto com o ar cessava o movimento

s contacto com o ar cessava o movimento

1908

1908

Von

Von

Hibler

Hibler

:

:

Bacillus

Bacillus

oedema

oedema

maligni

maligni

1

1

ª

ª

Guerra Mundial (1914

Guerra Mundial (1914

-

-

18)

18)

gangrena / t

gangrena / t

é

é

tano

tano

1916

1916

Mclntosh

Mclntosh

e

e

Field

Field

:

:

jarra de anaerobiose

jarra de anaerobiose

Altmeier

Altmeier

(1938): importância dos anaer

(1938): importância dos anaer

ó

ó

bios não

bios não

Clostridia

Clostridia

at

at

é

é

anos 60: bact

anos 60: bact

é

é

rias do G

rias do G

é

é

nero

nero

Clostridium

Clostridium

são a principal preocupa

são a principal preocupa

ç

ç

ão

ão

ap

ap

ó

ó

s anos 60: anaer

s anos 60: anaer

ó

ó

bios não

bios não

Clostridia

Clostridia

agentes

agentes

terr

terr

í

í

ficos

ficos

T

T

é

é

tano:

tano:

Areteu

Areteu

da Capad

da Capad

ó

ó

cia; Hip

cia; Hip

ó

ó

crates

crates

Gangrena gasosa: Hip

Gangrena gasosa: Hip

ó

ó

crates

crates

(2)

ANAERÓBIO: definição

Bact

Bact

é

é

rias que exigem O2 como aceitador terminal de electrões: aer

rias que exigem O2 como aceitador terminal de electrões: aer

ó

ó

bio

bio

obrigat

obrigat

ó

ó

rio

rio

Bact

Bact

é

é

rias que crescem em

rias que crescem em

aerobiose

aerobiose

e são capazes de obter energia

e são capazes de obter energia

pela fermenta

pela fermenta

ç

ç

ão de compostos orgânicos:

ão de compostos orgânicos:

aer

aer

ó

ó

bio facultativo

bio facultativo

Bact

Bact

é

é

rias incapazes de usar O2 e que são por ele inibidas:

rias incapazes de usar O2 e que são por ele inibidas:

anaer

anaer

ó

ó

bio

bio

obrigat

obrigat

ó

ó

rio/estrito

rio/estrito

Anaer

Anaer

ó

ó

bio obrigat

bio obrigat

ó

ó

rio/estrito

rio/estrito

a)

a)

extremamente sens

extremamente sens

í

í

vel: não tolera concentra

vel: não tolera concentra

ç

ç

ão O2 > 0.5%

ão O2 > 0.5%

b)

b)

moderadamente sens

moderadamente sens

í

í

vel: tolera concentra

vel: tolera concentra

ç

ç

ão O2 at

ão O2 at

é

é

2

2

-

-

8%

8%

a)

a)

são tipicamente membros de popula

são tipicamente membros de popula

ç

ç

ões microbianas aut

ões microbianas aut

ó

ó

ctones

ctones

humanas

humanas

b)

(3)

Porque motivo o O2

Porque motivo o O2

é

é

t

t

ó

ó

xico para estas bact

xico para estas bact

é

é

rias ?

rias ?

• Do normal metabolismo bacteriano, na presenDo normal metabolismo bacteriano, na presençça de O2a de O2

-- perperóóxido de hidrogxido de hidrogéénionio

-- radiciasradicias hidroxilohidroxilo

-- radicais livres de O2radicais livres de O2

-- O2O2

-- O2O222-- (anião (anião supersuper--óóxidoxido))

• Anião Anião supersuper--óóxidoxido –– agressivo para a cagressivo para a céélula bacteriana:lula bacteriana:

-- oxida oxida liplipíídeosdeos intraintra--celularescelulares e da paredee da parede

-- provoca provoca ““quebraquebra”” DNADNA

-- inactiva enzimas bacterianasinactiva enzimas bacterianas •

• BactBactéérias aerrias aeróóbias e aerbias e aeróóbias facultativas bias facultativas –– produproduçção de enzimas:ão de enzimas:

-- dismutasedismutase do do supersuper--óóxidoxido

-- catcatáálaselase

-- peroxperoxíídasedase Conceito cl

Conceito cláássicossico::toxicidade do O2 para os anaertoxicidade do O2 para os anaeróóbios por falta destas enzimasbios por falta destas enzimas McCord

McCord (1971): bact(1971): bactéérias anaerrias anaeróóbias estritas geralmente não produzem bias estritas geralmente não produzem catcatáálaselase e nunca produzem

(4)

Conhecimento actual

Conhecimento actual

Catalase Catalase

• demonstrada a produdemonstrada a produçção de ão de catcatáálaselase em espem espéécies de cies de BacterBacteróóidesides, , Peptoestreptococcus

Peptoestreptococcus e e PropionibacteriumPropionibacterium; não se correlaciona com a tolerância ao O; não se correlaciona com a tolerância ao O22 Peroxidase

Peroxidase

• não foi definitivamente demonstrada a produnão foi definitivamente demonstrada a produçção de ão de peroxidaseperoxidase em bactem bactéérias rias anaer

anaeróóbias estritasbias estritas Dismutase

Dismutase supersuper-ó-óxidoxido

• produproduçção induzida por exposião induzida por exposiçção ao Oão ao O22 (ex. (ex. BacteroidesBacteroides)) •

EubacteriumEubacterium limosumlimosum e e ClostridiumClostridium oroticumoroticum -- quantidades significativas desta quantidades significativas desta enzima; incapazes de sobreviverem em

enzima; incapazes de sobreviverem em aerobioseaerobiose 

 de um modo geral, o teor da enzima de um modo geral, o teor da enzima éé maior em bactmaior em bactéérias rias gramgram negativo que negativo que gramgram positivo

positivo



 correlacorrelaçção com o grau de tolerância ao O2 nas anaerão com o grau de tolerância ao O2 nas anaeróóbias obrigatbias obrigatóórias moderadasrias moderadas Potencial de

Potencial de oxi-oxi-redureduççãoão do meio (Eh):do meio (Eh): factor muito importante, masfactor muito importante, mas…… •

• adiadiçção de agentes redutores não permite crescimento de todas as estião de agentes redutores não permite crescimento de todas as estirpes bacterianas rpes bacterianas anaer

(5)

Distribui

Distribui

ç

ç

ão de bact

ão de bact

é

é

rias anaer

rias anaer

ó

ó

bias no corpo humano

bias no corpo humano

3-5:1 108-109 endocolo 3-5:1 108-109 vagina

Aparelho genital feminino

1000:1 1011-1012 colon 1:1 104 -107 delgado distal 1:1 102 -104 delgado proximal 1:1 102 -105 estômago Tubo digestivo 3-5:1 103 -104 Fossas nasais 1000:1 1011-1012 suco gengival 1:1 1010 -1011 superfície dentária 1:1 108 -109 saliva Boca anaerob/aerob Total (por ml ou g) Local

(6)

Incidência de diferentes estirpes anaer

Incidência de diferentes estirpes anaeróóbias bias nas popula

nas populaçções microbianas autões microbianas autóóctonesctones

0: raro/ não isolado; ±: irregularmente presente;

1: usualmente presente; 2: usualmente presente, em grande número

1 0 ± 1 2 Propionibacterium 2 ± 1 1 0 Lactobacillus ± 0 2 1 0 Eubacterium ± 0 2 1 0 Bifidobacterium ± 0 1 1 0 Actinomyces ± ± 2 ± ± Clostridium 1 ± 2 2 1 Petostreptococcus bactérias gram+ 1 0 1 2 0 Veillonela ± 1 1 2 0 Fusobacterium 1 1 2 2 0 Bacteroides bactérias gram-Vagina Uretra Intestino Ap. respiratório Pele Género

(7)

Anaer

Anaeró

ó

bios e Popula

bios e Popula

ç

ç

ão Microbiana Aut

ão Microbiana Aut

ó

ó

ctone (PMA)

ctone (

PMA)





As bact

As bact

é

é

rias anaer

rias anaer

ó

ó

bias predominam no nosso corpo,

bias predominam no nosso corpo,

em rela

em rela

ç

ç

ão

ão

à

à

s aer

s aer

ó

ó

bias

bias





A maioria das infec

A maioria das infec

ç

ç

ões por anaer

ões por anaer

ó

ó

bios tem ponto de

bios tem ponto de

partida end

partida end

ó

ó

geno

geno





a

a

identidade

identidade

das estirpes envolvidas numa determinada

das estirpes envolvidas numa determinada

infec

(8)

Bact

Bact

é

é

rias anaer

rias anaer

ó

ó

bias e doen

bias e doen

ç

ç

a humana

a humana

Incidência relativa de bactérias anaeróbias

<1 +++ +++ 100 73 74 92 >55 >50 90-95 76 85 94 85-90 94-100 100 30-60 50 38 rara 10 89 5-20 Incidência (%) Aparelho urinário fasciite necrotizante celulite crepitante gangrena gasosa Tecidos moles abortamento séptico abcesso vulvo-vaginal abcesso tubo-ovárico

salpingite, peritonite pélvica

Aparelho genital feminino

abcesso hepático peritonite/ abcesso Intra-abdominal empiema pneumonia necrotizante abcesso pulmonar pneumonia aspiração Pleuropulmonar

outras infecções orais abcesso periodontal otite média crónica sinusite crónica ocular Cabeça e pescoço meningite empiema subdural abcesso cerebral SNC Bacteriemia Tipo de infecção

(9)

Pistas

Pistas

para uma infec

para uma infec

ç

ç

ão por bact

ão por bact

é

é

rias anaer

rias anaer

ó

ó

bias

bias

odor p

odor p

ú

ú

trido da lesão ou descarga

trido da lesão ou descarga

localiza

localiza

ç

ç

ão foco infeccioso pr

ão foco infeccioso pr

ó

ó

ximo a superf

ximo a superf

í

í

cie mucosa

cie mucosa

necrose

necrose

tecidular

tecidular

forma

forma

ç

ç

ão abcesso

ão abcesso

infec

infec

ç

ç

ão secund

ão secund

á

á

ria a mordedura humana ou animal

ria a mordedura humana ou animal

g

g

á

á

s nos tecidos ou no exsudado

s nos tecidos ou no exsudado

tromboflebite

tromboflebite

s

s

é

é

ptica

ptica

quadro cl

quadro cl

á

á

ssico

ssico

gangrena gasosa

gangrena gasosa

terapêutica com

terapêutica com

aminoglicos

aminoglicos

í

í

deos

deos

/

/

antimicrobianos

antimicrobianos

de largo

de largo

espectro

espectro

fluorescência avermelhada com luz U.V. (

fluorescência avermelhada com luz U.V. (

Bacteroides

Bacteroides

ou

ou

Porphyromonas

Porphyromonas

)

)

presen

presen

ç

ç

a de

a de

grãos de enxofre

grãos de enxofre

no exsudado (

no exsudado (

Actinomyces

Actinomyces

)

)

culturas negativas em

culturas negativas em

aerobiose

aerobiose

/pr

/pr

é

é

via observa

via observa

ç

ç

ão de

ão de

microrganismos

(10)

Procedimentos recomendados para a colheita de amostras

Procedimentos recomendados para a colheita de amostras

Regras gerais

Regras gerais





por aspira

por aspira

ç

ç

ão com agulha e seringa

ão com agulha e seringa





amostra de tecido por

amostra de tecido por

bi

bi

ó

ó

psia

psia

zaragatoas

zaragatoas

devem ser, sempre que poss

devem ser, sempre que poss

í

í

vel, rejeitadas

vel, rejeitadas

são mais suscept

são mais suscept

í

í

veis de serem contaminadas

veis de serem contaminadas

ficam mais expostas ao O2 ambiente e

ficam mais expostas ao O2 ambiente e

à

à

disseca

disseca

ç

ç

ão

ão

colhem um pequeno volume de produto para amostra

colhem um pequeno volume de produto para amostra

(11)

Amostras

Amostras

inaceit

inaceit

á

á

veis

veis

para cultura em anaerobiose

para cultura em anaerobiose

zaragatoas

zaragatoas

nasais ou da

nasais ou da

orofaringe

orofaringe

zaragatoas

zaragatoas

gengivais

gengivais

expectora

expectora

ç

ç

ão

ão

expectorada

expectorada

expectora

expectora

ç

ç

ão colhida por aspira

ão colhida por aspira

ç

ç

ão oro ou

ão oro ou

nasotraqueal

nasotraqueal

amostras colhidas por

amostras colhidas por

broncoscopia

broncoscopia

, colhidas sem cateter de ponta

, colhidas sem cateter de ponta

protegida

protegida

conte

conte

ú

ú

do g

do g

á

á

strico ou do intestino delgado (excepto

strico ou do intestino delgado (excepto

sdrs

sdrs

. em

. em

ansa

ansa

cega

cega

)

)

conte

conte

ú

ú

do intestino grosso, de

do intestino grosso, de

ileostomias

ileostomias

, de

, de

colostomias

colostomias

ou fezes

ou fezes

(excepto suspeita de

(excepto suspeita de

C.

C.

difficile

difficile

ou

ou

C.

C.

botulinum

botulinum

)

)

urina colhida por mic

urina colhida por mic

ç

ç

ão ou por sonda de

ão ou por sonda de

Folley

Folley

zaragatoas

zaragatoas

vaginais ou cervicais

vaginais ou cervicais

amostras colhidas da superf

amostras colhidas da superf

í

í

cie de

cie de

ú

ú

lceras de dec

lceras de dec

ú

ú

bito, de feridas,

bito, de feridas,

escaras

escaras

ou f

ou f

í

í

stulas

stulas

amostras colhidas em zonas adjacentes

amostras colhidas em zonas adjacentes

à

à

pele ou a membranas

pele ou a membranas

mucosas que não tenham sido devidamente descontaminadas

(12)

Transporte da amostra

Transporte da amostra

Regras gerais

Regras gerais





as amostras, durante o transporte at

as amostras, durante o transporte at

é

é

ao laborat

ao laborat

ó

ó

rio,

rio,

devem ser mantidas a 37

devem ser mantidas a 37

º

º

C

C





evitar a refrigera

evitar a refrigera

ç

ç

ão das amostras

ão das amostras

>>> diminui

>>> diminui

ç

ç

ão do n

ão do n

º

º

de microrganismos vi

de microrganismos vi

á

á

veis

veis

Do r

Do r

á

á

pido e adequado transporte depende

pido e adequado transporte depende

o sucesso do isolamento correcto dos

o sucesso do isolamento correcto dos

anaer

(13)

Transporte da amostra

Transporte da amostra

Em condi

Em condiçções ideais, a amostra serões ideais, a amostra seráá enviada ao laboratenviada ao laboratóório numa atmosfera rio numa atmosfera anaer

anaeróóbia, hbia, húúmida e mida e àà temperatura ambientetemperatura ambiente Recorre

Recorre--se a um dispositivo e/ou meio de transporte, quando se prevê um se a um dispositivo e/ou meio de transporte, quando se prevê um atraso atraso superior a 15

superior a 15--20 minutos entre a colheita e o processamento ou quando se utili20 minutos entre a colheita e o processamento ou quando se utilizou zou uma

uma zaragatoazaragatoa Na pr

Na práática ditica diááriaria

• um volume de 2 ml ou mais, em seringa com agulha um volume de 2 ml ou mais, em seringa com agulha ““ocluidaocluida””, tolera 1 ou 2 horas, , tolera 1 ou 2 horas, mas

mas……

dependendo do agente implicado

dependendo do agente implicado versusversusrisco de picada acidental !!!risco de picada acidental !!! •

• uma uma ““grandegrande”” amostra de tecido mantamostra de tecido mantéém os microrganismos vim os microrganismos viááveis durante veis durante “

“algumas horasalgumas horas”” 

recorrer a dispositivos e meios de transporterecorrer a dispositivos e meios de transporte * muitos são incompat

* muitos são incompatííveis com certas amostras, principalmente veis com certas amostras, principalmente bibióópsiaspsias * a maioria foi concebido para transporte de

(14)

Exame directo da amostra

Exame directo da amostra

1.

1.

Exame macrosc

Exame macrosc

ó

ó

pico

pico





Inspec

Inspec

ç

ç

ão visual:

ão visual:

pistas

pistas

sobre a

sobre a

natureza

natureza

e a

e a

qualidade

qualidade

da amostra

da amostra

Sugerem a presen

Sugerem a presen

ç

ç

a de bact

a de bact

é

é

rias anaer

rias anaer

ó

ó

bias:

bias:

purulência

purulência

odor p

odor p

ú

ú

trido

trido

tecidos

tecidos

necrosados

necrosados

p

p

ú

ú

s

s

com

com

grãos de enxofre

grãos de enxofre





Exame com luz U.V. (360

Exame com luz U.V. (360

nm

nm

): pesquisa de fluorescência

): pesquisa de fluorescência

(15)

Exame directo da amostra

Exame directo da amostra

2. Exame microsc

2. Exame microsc

ó

ó

pico

pico





Esfrega

Esfrega

ç

ç

o

o

corado pelo

corado pelo

gram

gram





em conjun

em conjun

ç

ç

ão com os dados cl

ão com os dados cl

í

í

nicos,

nicos,

é

é

o exame laboratorial mais

o exame laboratorial mais

ú

ú

til

til





permite a observa

permite a observa

ç

ç

ão da morfologia t

ão da morfologia t

í

í

pica de muitas

pica de muitas

bact

bact

é

é

rias,como

rias,como

:

:





Bacteroides

Bacteroides

: bacilo

: bacilo

gram

gram

-

-

,

,

p

p

á

á

lido

lido

,

,

pleom

pleom

ó

ó

rfico

rfico





Fusobacterium

Fusobacterium

: bacilo fino,

: bacilo fino,

gram

gram

-

-

,

,

fusiforme

fusiforme





Veillonella

Veillonella

:

:

diplococo

diplococo

pequeno,

pequeno,

gram

gram

-

-



Actinomyces

Actinomyces

: bacilo

: bacilo

gram

gram

+, em grupos,

+, em grupos,

ramifica

ramifica

ç

ç

ões

ões





Imunofluorescência

Imunofluorescência

(IF) com

(IF) com

atcs

atcs

monoclonais

monoclonais





Apenas em laborat

Apenas em laborat

ó

ó

rios de referência/investiga

rios de referência/investiga

ç

ç

ão

ão





Custos elevados

Custos elevados



(16)

Exame directo da amostra

Exame directo da amostra

3. Outros procedimentos

3. Outros procedimentos





An

An

á

á

lise directa

lise directa

á

á

c

c

. gordos cadeia curta por cromatografia

. gordos cadeia curta por cromatografia

g

g

á

á

s

s

-

-

l

l

í

í

quida

quida

(GLC)

(GLC)



Sangue: com algum valor; não utilizado por rotinaSangue: com algum valor; não utilizado por rotina 

Material purulento: pouco sensMaterial purulento: pouco sensíível; pouco especvel; pouco especíífico; dispendiosofico; dispendioso





Sondas DNA/PCR

Sondas DNA/PCR



DisponDisponííveis para um nveis para um nºº limitado de agentes, não comercialmentelimitado de agentes, não comercialmente





Microscopia campo escuro/ contraste fase

Microscopia campo escuro/ contraste fase



DemontraDemontraççãoão de de espiroquetasespiroquetas; pouco interesse pr; pouco interesse prááticotico





Testes serol

Testes serol

ó

ó

gicos

gicos



Uso limitado; controverso. ex.: aglutinaUso limitado; controverso. ex.: aglutinaçção ão latexlatex ((C. C. difficiledifficile))





EIA (m

EIA (m

é

é

todos

todos

imunoenzim

imunoenzim

á

á

ticos

ticos

)

)



(17)

Processamento laboratorial das amostras

Processamento laboratorial das amostras

1. Selec

1. Selec

ç

ç

ão dos meios de cultura

ão dos meios de cultura





Maioria das infec

Maioria das infec

ç

ç

ões são

ões são

polimicrobianas

polimicrobianas

>>>> meios

>>>> meios

selectivos

selectivos

e

e

não selectivos

não selectivos





selec

selec

ç

ç

ão

ão

pretendida vai depender de: tipo de amostra

pretendida vai depender de: tipo de amostra

volume da amostra

volume da amostra

recursos econ

recursos econ

ó

ó

micos do laborat

micos do laborat

ó

ó

rio

rio





Como m

Como m

í

í

nimo:

nimo:



Meio não selectivo; incubar em Meio não selectivo; incubar em aerobioseaerobiose e anaerobiosee anaerobiose 

Meio selectivo para microrganismos como por ex. grupo do Meio selectivo para microrganismos como por ex. grupo do BacteroidesBacteroides fragilisfragilis

Importante

(18)

Processamento laboratorial das amostras

Processamento laboratorial das amostras

2. Prepara

2. Prepara

ç

ç

ão das amostras para a sementeira

ão das amostras para a sementeira





Grande volume l

Grande volume l

í

í

quido: concentrar por centrifuga

quido: concentrar por centrifuga

ç

ç

ão; semear o sedimento

ão; semear o sedimento





Zaragatoa

Zaragatoa

: extrac

: extrac

ç

ç

ão suave, em pequeno volume (0.5 a 1 ml) de caldo

ão suave, em pequeno volume (0.5 a 1 ml) de caldo

tioglicolato

tioglicolato





Tecidos: homogeneiza

Tecidos: homogeneiza

ç

ç

ão em 1 ml caldo

ão em 1 ml caldo

tioglicolato

tioglicolato

; suave e r

; suave e r

á

á

pida

pida



(19)

Processamento laboratorial das amostras

Processamento laboratorial das amostras

3. Incuba

3. Incuba

ç

ç

ão em anaerobiose

ão em anaerobiose





Pretende

Pretende

-

-

se uma incuba

se uma incuba

ç

ç

ão em atmosfera sem O

ão em atmosfera sem O

22

livre

livre





Composi

Composi

ç

ç

ão habitual: 5% H

ão habitual: 5% H

22

, 5% CO

, 5% CO

22

, 80% N

, 80% N

22





Escolha entre os diferentes sistemas de produ

Escolha entre os diferentes sistemas de produ

ç

ç

ão de anaerobiose

ão de anaerobiose

condicionada por diversos parâmetros: o principal são os recurso

condicionada por diversos parâmetros: o principal são os recurso

s

s

econ

econ

ó

ó

micos

micos





Qualquer um deles

Qualquer um deles

é

é

satisfat

satisfat

ó

ó

rio para o isolamento dos anaer

rio para o isolamento dos anaer

ó

ó

bios

bios

mais frequentemente implicados em doen

mais frequentemente implicados em doen

ç

ç

a humana

a humana



 Jarra anaerobioseJarra anaerobiose 

 Saco anaerobioseSaco anaerobiose 

 Câmara anaerobioseCâmara anaerobiose 

(20)

Jarra de anaerobiose

Jarra de anaerobiose





Custo inicial moderado/ elevado

Custo inicial moderado/ elevado





Custo manuten

Custo manuten

ç

ç

ão moderado

ão moderado

--

Sistema GAS PAK

Sistema GAS PAK

--

Sistema

Sistema

evacua

evacua

ç

ç

ão

ão

-

-

substitui

substitui

ç

ç

ão

ão

: anaerobiose mais r

: anaerobiose mais r

á

á

pida

pida

+ catalisador

+ catalisador paladiumpaladium: caro: caro + indicador de anaerobiose

+ indicador de anaerobiose

vantagem

vantagem simples e convenientesimples e conveniente pouco espa

pouco espaççoo permite uso de t

permite uso de téécnicas convencionaiscnicas convencionais desvantagem

desvantagem exposiexposiçção prolongada ao ar durante inspecão prolongada ao ar durante inspecçção/ ão/ subculturassubculturas anaerobiose

(21)

Saco de anaerobiose (

Saco de anaerobiose (

anaerobic

anaerobic

bag

bag

)

)





Custo inicial baixo

Custo inicial baixo





Custo manuten

Custo manuten

ç

ç

ão elevado:

ão elevado:

disposable

disposable

vantagem

vantagem simples; permite uso de tsimples; permite uso de téécnicas convencionaiscnicas convencionais pouco espa

pouco espaççoo permite inspec

permite inspecçção sem quebrar anaerobioseão sem quebrar anaerobiose desvantagem

desvantagem exposiexposiçção prolongada ao ar durante ão prolongada ao ar durante subculturassubculturas anaerobiose

anaerobiose ““lentalenta”” s

(22)

Câmara de anaerobiose

Câmara de anaerobiose





Custo inicial elevado

Custo inicial elevado





Custo manuten

Custo manuten

ç

ç

ão moderado/ elevado

ão moderado/ elevado

vantagem

vantagem anaerobiose anaerobiose ““imediataimediata””

processamento de amostras em anaerobiose

processamento de amostras em anaerobiose

inspec

inspecçção sem quebrar anaerobioseão sem quebrar anaerobiose isolamento segundo t

isolamento segundo téécnicas convencionaiscnicas convencionais desvantagem

desvantagem prepreçço muito elevadoo muito elevado ocupa muito espa

ocupa muito espaççoo “

“timetime consumingconsuming”” manuten

(23)

Roll

Roll

tube

tube

(tubo de

(tubo de

Hungate

Hungate

; VPI

; VPI

-

-

AL)

AL)





Tecnicamente

Tecnicamente

bizarro

bizarro





Custo inicial moderado

Custo inicial moderado





Custo manuten

Custo manuten

ç

ç

ão moderado

ão moderado

vantagem

vantagem permite inspecpermite inspecçção tubos sem quebrar anaerobiose ão tubos sem quebrar anaerobiose desvantagem

desvantagem tecnicamente diftecnicamente difíícil (exige muito treino)cil (exige muito treino) dif

difíícil isolamento estirpes em cultura puracil isolamento estirpes em cultura pura não permite observa

(24)

Control

Control

de anaerobiose

de anaerobiose





Qu

Qu

í

í

mico:

mico:

indicadores

indicadores





Biol

Biol

ó

ó

gico:

gico:

anaer

anaer

ó

ó

bios estritos

bios estritos

Fusobacterium

Fusobacterium

Porphyromonas

Porphyromonas

aer

(25)

Identifica

Identifica

ç

ç

ão de bact

ão de bact

é

é

rias anaer

rias anaer

ó

ó

bias

bias

a.

a.

Presuntiva

Presuntiva





Sens

Sens

.

.

antimicrobianos

antimicrobianos

colistina

colistina

vancomicina

vancomicina

kanamicina

kanamicina

metronidazol

metronidazol





Provas bioqu

Provas bioqu

ímicas

í

micas

catalase

catalase

produ

produ

ç

ç

ão

ão

indol

indol

redu

redu

ç

ç

ão nitratos

ão nitratos

polianetol

polianetol

sulfonato

sulfonato

s

s

ó

ó

dio

dio

crescimento em meio com sais biliares

crescimento em meio com sais biliares

alanina

alanina

peptidase

peptidase

urease

urease

lecitinase

lecitinase

/

/

lipase

lipase





Testes

Testes

cromog

cromog

é

é

nicos

nicos

: kits de identifica

: kits de identifica

ç

ç

ão r

ão r

á

á

pida (4 a 24 h)

pida (4 a 24 h)

ß

ß

glicosidase

glicosidase

ß

ß

galactosidase

galactosidase

alfa

alfa

glicosidase

glicosidase

alfa

(26)

Identifica

Identifica

ç

ç

ão de bact

ão de bact

é

é

rias anaer

rias anaer

óbias

ó

bias

b. Definitiva

b. Definitiva



 muito demoradamuito demorada 

 muito trabalhosamuito trabalhosa 

 muito caramuito cara O

O ““goldgold standardstandard”” resulta da combinaresulta da combinaçção dos vão dos váários mrios méétodostodos





Cromatografia

Cromatografia

g

g

á

á

s

s

-

-

l

l

í

í

quida

quida

(GLC)

(GLC)



 ananáálise dos produtos finais do metabolismo (lise dos produtos finais do metabolismo (áácc. gordos cadeia curta). gordos cadeia curta) 

 áácc. . butbutííricorico, , valvalééricorico, , isovalisovalééricorico: marcadores prim: marcadores primááriosrios 

 áácc. l. lááctico, ctico, succsuccííniconico, , fumfumááricorico, f, fóórmicormico





Sistemas r

Sistemas r

á

á

pidos de identifica

pidos de identifica

ç

ç

ão

ão



 bateria bateria miniaturizadaminiaturizada de provas bioqude provas bioquíímicasmicas 

 API 20A (API 20A (BioMBioMéérieuxrieux): 16 ): 16 carbohidratoscarbohidratos; ; indolindol, , ureaseurease, , gelatinasegelatinase, , esculinaesculina, , cat

catáálaselase –– leitura visual, leitura visual, ààs 24s 24--48 horas48 horas 

 ATB 32A (ATB 32A (BioMBioMéérieuxrieux): automatizado; 4): automatizado; 4--12 horas12 horas 

 MinitekMinitek (BBL)(BBL) 

 AnAn--IdentIdent ((AnalitabAnalitab)) 

 ANI ANI CardCard ((VitekVitek): computorizado): computorizado 

 API API ZymZym ((BioMBioMéérieuxrieux): 50 provas): 50 provas





M

M

é

é

todos alternativos

todos alternativos



 Cromatografia Cromatografia áácc. gordos cadeia longa da parede celular. gordos cadeia longa da parede celular 

 Sondas DNASondas DNA 

(27)

Teste de Sensibilidade aos

Teste de Sensibilidade aos

Antimicrobianos

Antimicrobianos





Até

At

é

h

h

á

á

alguns anos:

alguns anos:

padrões de susceptibilidade das bact

padrões de susceptibilidade das bact

é

é

rias anaer

rias anaer

ó

ó

bias

bias

são previs

são previs

í

í

veis e est

veis e est

á

á

veis

veis





Presentemente:

Presentemente:

antibimicrobianos

antibimicrobianos

de largo espectro

de largo espectro

antibioterapia

antibioterapia

mal conduzida

mal conduzida

novos

novos

antibacterianos

antibacterianos

O TSA tornou

(28)

Teste de Sensibilidade aos

Teste de Sensibilidade aos Antimicrobianos

Antimicrobianos

M

M

é

é

todos

todos





Diluiç

Dilui

ção em

ão em agar

agar

-- permite testar a maioria dos agentespermite testar a maioria dos agentes

-- complicado e morosocomplicado e moroso

-- uso em laboratuso em laboratóórios de referênciarios de referência





Microdilui

Microdilui

ç

ç

ão

ão

-- não adequado a estirpes de crescimento lentonão adequado a estirpes de crescimento lento

-- não permite testar não permite testar metronidazolmetronidazol





Macrodilui

Macrodilui

ç

ç

ão

ão

-- permite determinar MBCpermite determinar MBC

-- bastante morosobastante moroso



(29)

Teste de Sensibilidade aos

Teste de Sensibilidade aos

Antimicrobianos

Antimicrobianos

Problemas pr

Problemas pr

á

á

ticos

ticos





Variabilidade entre as diferentes t

Variabilidade entre as diferentes t

é

é

cnicas

cnicas





O resultado TSA pode ser

O resultado TSA pode ser

err

err

ó

ó

neo

neo

(infec

(infec

ç

ç

ão

ão

polimicrobiana

polimicrobiana

)

)

Deve

Deve

obrigatoriamente

obrigatoriamente

ser executado em isolados de:

ser executado em isolados de:

--

hemoculturas

hemoculturas

--

SNC (ex. abcesso)

SNC (ex. abcesso)

--

infec

infec

ç

ç

ões graves (ex.

ões graves (ex.

endocardite

endocardite

)

)

--

em cultura pura

em cultura pura

--

que não responderam a terapêutica

que não responderam a terapêutica

antibacteriana

antibacteriana

pr

pr

é

é

via

via

--

de infec

de infec

ç

ç

ões requerendo terapêutica prolongada

ões requerendo terapêutica prolongada

(30)

Sintese

Sintese

(1)

(1)





são as bact

são as bact

é

é

rias que mais frequentemente colonizam o corpo

rias que mais frequentemente colonizam o corpo

humano

humano





muitos dos agentes implicados em infec

muitos dos agentes implicados em infec

ç

ç

ão fazem parte das

ão fazem parte das

popula

popula

ç

ç

ões microbianas aut

ões microbianas aut

ó

ó

ctones

ctones





o laborat

o laborat

ó

ó

rio ser

rio ser

á

á

incapaz de conseguir o seu isolamento a menos

incapaz de conseguir o seu isolamento a menos

que:

que:





colheita da amostra seja adequada

colheita da amostra seja adequada





transporte da amostra nas condi

transporte da amostra nas condi

ç

ç

ões

ões

ó

ó

ptimas

ptimas





maioria das infec

maioria das infec

ç

ç

ões são

ões são

polimicrobianas

polimicrobianas

, envolvendo estirpes

, envolvendo estirpes

aer

aer

ó

ó

bias e anaer

bias e anaer

ó

ó

bias >>>> dificulta o isolamento laboratorial e a

bias >>>> dificulta o isolamento laboratorial e a

sua valoriza

(31)

Sintese

Sintese (2)(2) 

 o isolamento e identificao isolamento e identificaçção dos anaerão dos anaeróóbios bios éé um processo lento, trabalhoso e um processo lento, trabalhoso e dispendioso

dispendioso



 o microbiologista deve fornecer informao microbiologista deve fornecer informaçções dentro de um tempo ões dentro de um tempo úútiltil O processamento de anaer

O processamento de anaeróóbios oscila entre uma bios oscila entre uma ““bacteriologia exaustivabacteriologia exaustiva”” e um e um

“relato presuntivorelato presuntivo””



 a escolha ta escolha téécnica deve resultar de uma discussão scnica deve resultar de uma discussão sééria e aturada entre ria e aturada entre microbiologistas e cl

microbiologistas e clíínicos, fortemente condicionada pelos recursos financeiros nicos, fortemente condicionada pelos recursos financeiros dispon

disponííveisveis 

 os laboratos laboratóórios devem ser escalonados em nrios devem ser escalonados em nííveis (I, II, III), em funveis (I, II, III), em funçção do não do níível de vel de identifica

identificaçção que são capazes de atingirão que são capazes de atingir



NNíível Ivel I •• morfologia colmorfologia colóóniasnias •

• morfologia ao morfologia ao gramgram dos isolados em cultura purados isolados em cultura pura 

NNíível IIvel II •• susceptibilidade a susceptibilidade a antimicrobianosantimicrobianos (discos)(discos) •

• provas bioquprovas bioquíímicas simplesmicas simples 

NNíível IIIvel III •• provas bioquprovas bioquíímicasmicas •

• cromatografia cromatografia ggááss--llííquidaquida •

(32)

Bacilos anaer

Bacilos anaer

ó

ó

bios

bios

gram

gram

positivo,

positivo,

esporulados

esporulados

G

Géénero nero ClostridiumClostridium



 habitathabitat •• solosolo •

• vegetaisvegetais •

• tubo digestivo (Homem e animais)tubo digestivo (Homem e animais) •

• nascentes nascentes ááguagua •

• sedimento marinho sedimento marinho 

 a grande maioria das espa grande maioria das espéécies são cies são mesmesóófilasfilas; ; psicrpsicróófilasfilas; ; termtermóófilasfilas 

 a maioria são comensais, não provocando doena maioria são comensais, não provocando doenççaa 

 principal mecanismo de principal mecanismo de patogenicidadepatogenicidade: toxinas (: toxinas (exotoxinasexotoxinas; natureza proteica), ; natureza proteica), transform

transformááveis em veis em anatoxinasanatoxinas (vacinas)(vacinas) 

 tradicionalmente provocam infectradicionalmente provocam infecçções exões exóógenasgenas •

• botulismobotulismo •

• gangrena gasosa, gangrena gasosa, ppóóss--traumtraumááticatica •

• ttéétanotano •

• toxitoxi--infecinfecççõesões alimentaresalimentares 

 actualmente as infecactualmente as infecçções endões endóógenas são muito mais comunsgenas são muito mais comuns 

(33)

Clostridium

Clostridium

perfringens

perfringens

(e outros das gangrenas gasosas)

(e outros das gangrenas gasosas)



 a maioria das espa maioria das espéécies de cies de ClostridiumClostridium pode ser causa de gangrenapode ser causa de gangrena 

 habitantes intestino humano e de animaishabitantes intestino humano e de animais 

 5 tipos (A a E)5 tipos (A a E) •• tipo A: principal agente de doentipo A: principal agente de doençça humanaa humana •

• tipo C: agente da enterite tipo C: agente da enterite necrotizantenecrotizante 

 produz vproduz váários tipos de toxinasrios tipos de toxinas •

•toxinatoxina responsresponsáável pela vel pela liselise de de hemhemááciascias •

•enterotoxinaenterotoxina -- toxitoxi--infecinfecççãoão alimentaralimentar •

•toxinatoxina activa contra PMN, plaquetas, cactiva contra PMN, plaquetas, céélula muscularlula muscular •

•colagenasecolagenase, , hialuronidasehialuronidase, , …… 

 as estirpes que causam doenas estirpes que causam doençça humana são as que existem no solo ou tubo a humana são as que existem no solo ou tubo digestivo

digestivo



 a infeca infecçção ocorre geralmente por contaminaão ocorre geralmente por contaminaçção traumão traumáática ou cirtica ou cirúúrgicargica 

 pode ainda ser pode ainda ser reponsreponsáávelvel porpor •

• infecinfecçções intra abdominaisões intra abdominais •

• abortamento sabortamento séépticoptico •

• septicemia psepticemia póós abortamentos abortamento •

(34)

Gangrena gasosa

Gangrena gasosa

Factores predisponentes Factores predisponentes  anaerobioseanaerobiose  isquemiaisquemia  pH pH áácidocido 

 favorecem a proliferafavorecem a proliferaçção de microrganismosão de microrganismos 

 toxinas e enzimas >>> libertatoxinas e enzimas >>> libertaçção de gão de gáás s -- crepitacrepitaçção tão tíípicapica

Diagn

Diagnóstico microbiolóstico microbiolóógicogico 

sangue: sangue: hemoculturashemoculturas 

ppúúss 

fragmentos tecidosfragmentos tecidos 

gramgram: numerosos bacilos : numerosos bacilos gramgram+, em +, em ppúúss com fraca reaccom fraca reacççãoão leucocit

leucocitááriaria >>> >>> desbridamentodesbridamento circirúúrgico imediatorgico imediato

Preven

Preven

ç

ç

ão

ão



evitar contaminaevitar contaminaçção de feridas com terraão de feridas com terra 

(35)

Clostridium

Clostridium

tetani

tetani





agente do t

agente do t

é

é

tano

tano





isolado a

isolado a

aprtir

aprtir

intestino equ

intestino equ

í

í

deos e bovinos

deos e bovinos





capacidade de

capacidade de

esporular

esporular

no solo, permanecendo vi

no solo, permanecendo vi

á

á

vel por muito tempo

vel por muito tempo





produz

produz

exotoxina

exotoxina

proteica

proteica

-

-

tetanospasmina

tetanospasmina

-

-

antig

antig

é

é

nica

nica





transform

transform

á

á

vel em

vel em

anatoxina

anatoxina

(vacina)

(vacina)



(36)

T

T

é

é

tano

tano



 quadro clquadro clíínico surge habitualmente apnico surge habitualmente apóós contaminas contaminaçção feridaão ferida



 úúlceras varicosaslceras varicosas 

 cordão umbilicalcordão umbilical 

 focos dentfocos dentááriosrios 

 ““traumatismostraumatismos”” puerppuerpéériorio ou pou póós abortamentos abortamento



 importância dos factores profissionaisimportância dos factores profissionais 

agricultoresagricultores 

jardineirosjardineiros 

 penetrapenetraçção e multiplicaão e multiplicaçção no local >>> libertaão no local >>> libertaçção toxinaão toxina 

difusão difusão retroretro--axonalaxonal atatéé sinapses medularessinapses medulares 

inibe os neurinibe os neuróónios inibitnios inibitóórios >>> rios >>> paralisia paralisia espespáásticastica Quadro

Quadro ““ttíípicopico”” incuba

incubaçção 6 a 15 diasão 6 a 15 dias 1

1ºº sintoma: sintoma: trismustrismus ((mmúúscsc. mastiga. mastigaçção)ão) outras

outras contracturascontracturas morte r

morte ráápida: espasmo da laringepida: espasmo da laringe Imunidade

(37)

Clostridium

Clostridium

botulinum

botulinum



 habitat: intestino animais; contamina terrenos >>> contamina habitat: intestino animais; contamina terrenos >>> contamina áágua, vegetais gua, vegetais …… 

 agente do agente do botulismobotulismo: : toxitoxi--infecinfecççãoão alimentar, de halimentar, de háá longa data conhecidalonga data conhecida 

 actualmente consideramactualmente consideram--se 4 tipos de se 4 tipos de botulismobotulismo



 alimentaralimentar 

 feridas (muito raro)feridas (muito raro) 

 recrecéémm--nascidonascido 

 indind. >12 meses, sem outras causas. >12 meses, sem outras causas



 7 tipos de toxinas (7 tipos de toxinas (antigantigéénicasnicas): A a G): A a G



 tipo A, B, E e F: as mais frequentemente implicadas em doentipo A, B, E e F: as mais frequentemente implicadas em doençça humanaa humana 

 a toxina a toxina éé produzida na fase de crescimento exponencial >>> libertadaproduzida na fase de crescimento exponencial >>> libertada 

(38)

Botulismo

Botulismo

Quadro

Quadro

t

t

í

í

pico

pico

(em Portugal) (em Portugal) 

 alimento: presunto caseiroalimento: presunto caseiro



 anaerobiose, temperatura estanaerobiose, temperatura estáávelvel 

 abate porco durante perabate porco durante perííodo digestivoodo digestivo





toxina

toxina

é

é

absorvida pelo tubo digestivo

absorvida pelo tubo digestivo



 incubaincubaçção: 24 a 36 horasão: 24 a 36 horas 

 invasão: vinvasão: vóómitos; sinais mitos; sinais inespecinespecííficosficos 

 estado: paralisias; cestado: paralisias; cóólicas; licas; altalt. secre. secreççõesões





outros alimentos implicados

outros alimentos implicados

  enlatadosenlatados   mariscos mariscos   vegetaisvegetais   peixepeixe

Diagn

(39)

Clostridium

Clostridium

difficille

difficille



 habitat no intestino humano e de animaishabitat no intestino humano e de animais 

 isolado a partir do solo, feno, areiaisolado a partir do solo, feno, areia



 isolado a partir do intestino de recisolado a partir do intestino de recéémm--nascidos, em 50% dos casosnascidos, em 50% dos casos 

 em crianem criançças com mais de 2 anos: 4%as com mais de 2 anos: 4% 

 adultos que receberam adultos que receberam antibioterapiaantibioterapia: at: atéé 46%46%



 causa principal de:causa principal de: diarreia diarreia ppóóss--antibioterapiaantibioterapia colite

colite pseudomembranosapseudomembranosa



 mais frequente com mais frequente com clindamicinaclindamicina, , ampicilinaampicilina, , cefalosporinascefalosporinas 

 tratadacomtratadacom vancomicinavancomicina



 factores virulênciafactores virulência:: toxina A (toxina A (enterotoxinaenterotoxina)) toxina B (

toxina B (citopcitopááticatica)) inibidor da

inibidor da motilidademotilidade intestinalintestinal 

 DiagnDiagnóósticostico:: isolamento do agenteisolamento do agente teste de aglutina

teste de aglutinaçção pelo ão pelo latexlatex detec

(40)

Bacilos anaer

Bacilos anaer

ó

ó

bios

bios

gram

gram

positivo, não

positivo, não

esporulados

esporulados



 grupo que inclui os ggrupo que inclui os géénerosneros

  BifidobacteriumBifidobacterium   EubacteriumEubacterium   PropionibacteriumPropionibacterium   ActinomycesActinomyces   ArachniaArachnia   RothiaRothia   LactobacillusLactobacillus 

 membros PMA pele e superfmembros PMA pele e superfíícies mucosas (boca, intestino, genitais) cies mucosas (boca, intestino, genitais) do Homem e animais

do Homem e animais



 muitas espmuitas espéécies são consideradas oportunistascies são consideradas oportunistas 

 podem causar infecpodem causar infecçções graves, com risco de vidaões graves, com risco de vida 

(41)

Actinomyces

Actinomyces



 GGéénero que inclui innero que inclui inúúmeras espmeras espééciescies 

 membros de PMA da boca e mucosas do Homem e outros animaismembros de PMA da boca e mucosas do Homem e outros animais Actinomyces

Actinomyces israelliisraelli



 o mais o mais ““importanteimportante””



 agente da agente da actinomicoseactinomicose



 ActinomicoseActinomicose



 60% 60% cervicofacialcervicofacial



 15% tor15% toráácicacica



 20% abdominal20% abdominal



 5% outros tipos ex. DIU5% outros tipos ex. DIU



 tipicamente tipicamente polimicrobianapolimicrobiana



 raramente o raramente o ActinomycesActinomyces éé isolado em cultura puraisolado em cultura pura



 crescimento muito lentocrescimento muito lento



 morfologia tmorfologia tíípica semelhante fungos (filamentos pica semelhante fungos (filamentos ““ramificadosramificados””))



 ttíípicos picos ““grãos de enxofregrãos de enxofre”” na descarga da lesão: na descarga da lesão: ““colcolóóniasnias”” macroscmacroscóópicaspicas



(42)

Propionibacterium

Propionibacterium

acnes

acnes





habitante da pele

habitante da pele





implicado em quadros de

implicado em quadros de





endocardite

endocardite

(

(

proteses

proteses

valvulares)

valvulares)





septicemias

septicemias





papel importante, talvez não como

papel importante, talvez não como

patog

(43)

Bifidobacterium

Bifidobacterium

B.

B.

denticum

denticum

(

(

A.eriksonii

A.eriksonii

, B.

, B.

eriksonii

eriksonii

)

)





parece ser o

parece ser o

ú

ú

nico com potencial patog

nico com potencial patog

é

é

nico

nico





isolado de:

isolado de:





c

c

á

á

rie dent

rie dent

á

á

ria

ria





fezes

fezes





exsudado vaginal

exsudado vaginal





pneumonias

pneumonias





caracter

caracter

í

í

stica a produ

stica a produ

ç

ç

ão de

ão de

á

á

c

c

. ac

. ac

é

é

tico/

tico/

á

á

c

c

. l

. l

á

á

ctico na razão 3:2

ctico na razão 3:2

B.

B.

longum

longum

B. breve

B. breve



(44)

Eubacterium

Eubacterium





habitante cavidade oral Homem e animais

habitante cavidade oral Homem e animais





isolado frequentemente a partir das fezes e solo

isolado frequentemente a partir das fezes e solo





isolado em cultura mista:

isolado em cultura mista:





abcessos e feridas (cabe

abcessos e feridas (cabe

ç

ç

a, osso, pele, pelve)

a, osso, pele, pelve)





bacteriemias

bacteriemias

,

,

endocardites

endocardites

(+ raramente)

(+ raramente)

E.

E.

lentum

lentum

: esp

: esp

é

é

cie mais frequente

cie mais frequente

B. breve (

B. breve (

spp

spp

.

.

nov.

nov.

), E.

), E.

timidum

timidum

, E.

, E.

brachy

brachy

:

:

infec

infec

ç

ç

ão

ão

periodontal

periodontal

Diagn

Diagn

ó

ó

stico microbiol

stico microbiol

ó

ó

gico

gico





cromatografia

cromatografia

g

g

á

á

s

s

-

-

l

l

í

í

quida

quida



(45)

Arachnia

Arachnia

A.

A.

propionica

propionica

:

:

semelhan

semelhan

ç

ç

as com

as com

Propionibacterium

Propionibacterium





Actualmente

Actualmente

Propionibacterium

Propionibacterium

propionicus

propionicus

(

(

spp

spp

nov

nov

.)

.)



(46)

Bacilos anaer

Bacilos anaer

ó

ó

bios

bios

gram

gram

negativo

negativo



 Inclui membros dos GInclui membros dos Géénerosneros



 BacteroidesBacteroides ((PorphyromonasPorphyromonas e e PrevotellaPrevotella))

  FusobacteriumFusobacterium   WolinellaWolinella   LeptotrichiaLeptotrichia   DesulfomonasDesulfomonas   ButyrivibrioButyrivibrio   succinivibriosuccinivibrio   AnaerovibrioAnaerovibrio   AnaerobiospirillumAnaerobiospirillum   SelenomonasSelenomonas 

 membros de PMA de animais e humanosmembros de PMA de animais e humanos



 bocaboca



 tracto respirattracto respiratóório superiorrio superior



 intestinointestino



 aparelho genitalaparelho genital



 encontrados em mais de 50% das amostras clencontrados em mais de 50% das amostras clíínicas que contêm anaernicas que contêm anaeróóbiosbios 

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