Simulações de dinâmica molecular
Estudo do nanovazamento de hidrogênio confinado por simulações de dinâmica molecular
... por simulações de Dinâmica Molecular ...As simulações foram rea- lizadas com temperaturas de 171 K a 372 K e pressões de 50 MPa a 200 ...por simulações de ...várias simulações ...
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Estudo computacional da fluorescência do triptofano em proteínas por meio de simulações de dinâmica molecular
... biologia molecular e bioquímica, tais como as proteínas e o DNA, são complexas e possuem muitos átomos (> 10 3 ...ambiente molecular envolva um número de partículas muito ...as simulações de ...
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Propriedades termodinâmicas de fases poliméricas de C60 estudadas por simulações de dinâmica molecular
... simples, tem comprimento 1.54 Å[29] e a distância entre centros de massa é 9.34 Å[30]. Assumindo que estes desvios são causados pelo tipo de ligação, é seguro afirmar que nesta situação o potencial AIREBO trata a ligação ...
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Estudos da interação de peptídeos antimicrobianos com modelo de membrana por simulações de dinâmica molecular
... de simulações de Dinâmica Molecular ...realizadas simulações no equilíbrio com a finalidade de amostrar o comportamento geral do ...realizamos simulações de DM com a utilização do ...
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Simulações de dinâmica molecular do receptor ativador da proliferação de peroxissomos y com o agonista parcial GQ16
... realizamos simulações de dinâmica molecular do PPAR ligado a um agonista parcial recentemente descoberto, o ...a dinâmica do PPAR ...as simulações observamos que esta permaneceu ...
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Avaliação dos mecanismos de ação do peptídeo sintético Mo-CBP3-PEPIII contra Candida spp. através de bioquímica quântica e simulações de dinâmica molecular.
... Docking Molecular é possível observar as interações entre um ligante com uma ...as simulações de dinâmica molecular (Trott and Olson, ...
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Simulações de dinâmica molecular dos receptores do hormônio tireoidiano
... amica molecular dos LBDs dos receptores do hormˆ onio ...amica molecular s˜ ao usadas, e novas metodologias e t´ ecnicas de an´ alise de dados s˜ ao ...
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Propriedades dinâmica, termodinâmica e estrutural da água e do metanol por simulações de dinâmica molecular.
... Nos ´ ultimos anos, a ´ agua tem sido um objeto de estudo incans´ avel devido as suas pro- priedades anˆ omalas. Parte da explica¸c˜ ao para este comportamento se deve a capacidade de cada mol´ ecula de ´ agua poder ...
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Desenvolvimento de sistema computacional para simulações de dinâmica molecular a pH constante
... concernment. Molecular Dynamics simulations are widely used to study the most diverse biological systems due to the reliability of its re- ...common Molecular Dynamics, performed with GROMACS, and an ...
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Simulações de dinâmica molecular do receptor ativado de proliferadores de peroxissomos isoforma y
... performed molecular dynamics simulations to investigate the dynamics of PPARγ in the presence of rosiglitazone and nonanoic, capric and lauric ...of molecular dynamics to investigate the possible ...
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Formação de agregados proteicos na presença de líquidos iónicos e a aplicação de simulações de dinâmica molecular
... A dinâmica conformacional das proteínas está, de certa forma, codificada nas suas estruturas, embora também seja variável com o meio, e é normalmente um elemento crítico para a sua ...pela dinâmica, que é ...
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Estudo das interações de complexos de inclusão flavonoide/ciclodextrina com modelos de membrana biológica por simulações de dinâmica molecular
... de simulações computacionais, as diferentes formas de interação dos flavonoides com a ciclodextrina e do complexo formado por bicamadas lipídicas, a fim de contribuir para um melhor entendimento do processo de ...
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Defensina nsd7 de Nicotiana suaveolens acoplada ao ácido fosfatídico: avaliações sobre o mecanismo molecular através da análise de bioquímica quântica e simulações de dinâmica molecular.
... de dinâmica molecular para revelar dados estruturais e mecanismos moleculares não expostos na ...de dinâmica molecular corroborou com dados experimentais, mostrando que, na ausência da ...
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Simulações por dinâmica molecular de sistemas biológicos relacionados à hidrólise de biomassa lignocelulósica
... mediante simulações de dinâmica molecular na primeira parte deste trabalho de doutorado, parte cuja introdução será brevemente apresentada nesta ...
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Dinâmica molecular de zeólitos com matriz flexível
... por simulações de Dinâmica Molecular (DM) são bastante úteis para ajudar a elucidar o posicionamento dos cátions trocáveis na estrutura zeolítica e as suas respectivas ...realizamos simulações ...
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Simulações por dinâmica molecular de compostos do tipo ABO3 (SrTiO3 e CaTiO3)
... O advento das simulações computacionais nos permite construir sistemas cristalinos que podem ou não existir na natureza. Estes sistemas compostos por um conjunto de átomos ou moléculas podem ser dispostos de ...
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Aula 20: Iniciando simulações com dinâmica molecular de soluto em vácuo e solução aquosa com o programa GROMACS
... II. Cálculos quânticos para otimização de geometria e cargas atômicas Antes de iniciar as simulações é recomendado realizar cálculos com mecânica quântica (QM) para obter a geometria otimizada da molécula. Neste ...
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Dinâmica molecular
... amica Molecular, atrav´ es da apresenta¸c˜ ao de seus fundamentos e da implementa¸c˜ ao do mesmo, al´ em de duas aplica¸c˜ oes, em um fluido de Lennard-Jones, e em um sistema composto por part´ıculas coloidais ...
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Análise por simulações pela dinâmica molecular do complexo proteína-DNA do domínio ETS da proteína PDEF : fatores intrínsecos ao DNA
... A proteína mostrada é o fator de transcrição PDEF (prostate-derived ETS factor, código PDB: 1YO5), com sua seqüência de DNA complementar, o domínio HTH da proteína está dest[r] ...
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4. Dinâmica Molecular
... Em estudos de nanoestruturas é de grande interesse avaliar a diferença estrutural entre duas moléculas. No caso de fármacos estas diferenças estruturais podem corresponder a um polimorfismo que poderia levar um ...
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