Mantenha desligado
Mantenha desligado
ou sem som.
ou sem som.
Introdução à Química
Farmacêutica & Medicinal
Parte 4
Introdu
Introdu
ç
ç
ão
ão
à
à
Qu
Qu
í
í
mica
mica
Farmacêutica & Medicinal
Farmacêutica & Medicinal
Parte 4
Parte 4
http://www.farmacia.ufrj.br/lassbio
Laboratório de Avaliação e Síntese de Substâncias Bioativas
Programa de Desenvolvimento de Fármacos - ICB
Sum
Sum
á
á
rio
rio
;
o FÁRMACO e o medicamento; benefício social; a QUÍMICA Medicinal;
DEFINIÇÃO
; o processo de
descoberta
; novos fármacos; a INDÚSTRIA farmacêutica; o
mercado farmacêutico mundial & do BRASIL; 5-Top em vendas 2011; os fármacos
sintéticos;
a linha do
TeMPO da
Química Medicinal; o berço da Química Medicinal;
Ernest forneau
;
Alfred Burger
; moléculas
pioneiras
;
MORFINA
; alcaloides;
STREPTEASE molecular; efeito da metila; analgésicos SINTÉTICOS; penicilina;
Alexander
Fleming
;
Ernest Chain;
Howard FLOREY
; AAS; teoria das assinaturas;
bent
Samuelsson
;
Sune
bergstron;
John
VANE
; características estrutrais dos FÁRMACOS;
dissecação
molecular; pontos farmacofóricos; o PARADIGMA de
Fischer
: modelo
chave-fechadura; BIORRECEPTOREs; as razões moleculares DA ação dos fármacos; a
quiralidade; TIPOS de interações FÁRMACOS-biorreceptores; os alfabetos bioquímicos;
AS
ligações
frágeis;
Topografia
3D
dos
BIORRECEPTORES;
QUÍMICA
COMPUTACIONAL; QUEM são OS BIORRECEPTORES; grupamentos farmacofóricos,
auxofóricos
e toxicofóricos; SIMILARIDADE
MOLECULAR; reconhecimento
MOLECULAR; as fases DA ação dos FÁRMACOS; FASE farmacocinética;
metabolismo
dos fármacos; CYP450; ANIMAIS transgênicos; o papel dos produtos NATURAIS; curare;
BLOQUEADORES ganglionares; os índios e os indóis; DIGOXINA, decano dos
fÁRMACOS; domesticando moléculas; bióforos naturais; quinina; anti-maláricos;
FÁRMaCOS anti-câncer; o MAR como fonte de fármacos; HIV;
FÁRMACOS e serpentes
;
os inibidores da ECA; estratégias industriais; CONCEITO de composto-PROTÓTIPO;
Planejamento RACIONAL; abordagem fisiológica; MOLÉCULAS inteligentes;
propranolol; maraviroc
; fármacos bilionários: as estatinas; a importância dos fatores
estruturais; fármacos me-too;
epílogo
;
LASSBio
;
bibliografia
; de FARMACOS e
S. H. Ferreira
S. H. Ferreira
1934
1934-
-S.H. Ferreira, A Bradykinin
S.H. Ferreira, A Bradykinin--potentiating potentiating factor (BFP) present in the venon of factor (BFP) present in the venon of
Bothrops jararaca, Brit. J. Pharmacol.
Bothrops jararaca, Brit. J. Pharmacol.
1965, 1965, 2424, 163., 163.
O
OH
HS
H
3
C
H
O
N
M. A. Ondetti, D. W. Cushman & B. Rubin,
M. A. Ondetti, D. W. Cushman & B. Rubin, Chronicles of Drug DiscoveryChronicles of Drug Discovery, vol. 2, , vol. 2, J.S. Bindra & D. Lednicer, Eds., Wiley, Nova Iorque, 1983, p. 1
J.S. Bindra & D. Lednicer, Eds., Wiley, Nova Iorque, 1983, p. 1--3232
Bradicinina
Bradicinina
D. W.
D. W. Cushman & Cushman & M. A. M. A. OndettiOndetti
M Rocha e Silva
M Rocha e Silva
1910
1910
-
-
1983
1983
jararac
jararac
á
á
W T Beraldo
W T Beraldo
Sistema Renina
Sistema Renina
-
-
Angiotensina
Angiotensina
1934 – Harry Goldblat (EUA) 1940 – Bruno Menendez (ARG) 1949 – Maurício Rocha e Silva (BR) 1965 – Sérgio H. Ferreira (BR)
Anti
Estrat
Estrat
é
é
gias indu
gias indu
striais
striais
de desco
berta de
de desco
berta de
f
Qu
Qu
í
í
mica Combinat
mica Combinat
ó
ó
ria
ria
A pesquisa de novos f
A pesquisa de novos f
á
á
rmacos na ind
rmacos na ind
ú
ú
stria farmacêutica
stria farmacêutica
tem estrat
tem estrat
é
é
gias distintas daquelas das Universidades.
gias distintas daquelas das Universidades.
Estrat
Estrat
Estrat
é
é
gias industriais
gias industriais
GM Keseru,GM Makara, Hit discovery and hit
DOWNLOAD
DOWNLOAD
DA
DA
ESTRUTURA PROT
ESTRUTURA PROT
É
É
ICA
ICA
elabora
elabora
ç
ç
ão do modelo
ão do modelo
PROTEIN DATA BANK (PDB)
PROTEIN DATA BANK (PDB)
SELE
SELE
Ç
Ç
ÃO DA
ÃO DA
ESTRUTURA
ESTRUTURA
DE REFERÊNCIA
DE REFERÊNCIA
ANCORAMENTO DOS
ANCORAMENTO DOS
LIGANTES NO S
LIGANTES NO S
Í
Í
TIO
TIO
DETERMINA
DETERMINA
Ç
Ç
ÃO DA ENERGIA LIVRE
ÃO DA ENERGIA LIVRE
DE LIGA
DE LIGA
Ç
Ç
ÃO TE
ÃO TE
Ó
Ó
RICA (
RICA (
∆
∆
∆
∆
∆
∆
∆
∆
G
G
ligaligaççãoão)
)
CONSTRU
CONSTRU
Ç
Ç
ÃO
ÃO
DOS
DOS
LIGANTES
LIGANTES
DETERMINA
DETERMINA
Ç
Ç
ÃO
ÃO
DOS PONTOS DE
DOS PONTOS DE
LIGA
LIGA
Ç
Ç
ÃO
ÃO
Sybyl, Version 8.0, Tripos Associates: St. Louis, MO, 2007 (Licença # 7512)
Spartan Pro; Wavefunction, Inc. 18401 Von Karman Avenue, Suite 370. Irvine, California 92612, USA (Licença # 1-001259 )
An
An
á
á
lise conformacional
lise conformacional
(m
(m
é
é
todo semi
todo semi
-
-
emp
emp
í
í
rico AM1)
rico AM1)
FlexX
Metodologia: Estudos de
SBDD
Avila, C.M.; Romeiro, N.C. Revista Virtual de Química 2010, 2, 000
Modos de liga
Modos de ligaçção do imatinibe com a ABL. Os ão do imatinibe com a ABL. Os áátomos de hidrogênio foram eliminados para tomos de hidrogênio foram eliminados para facilitar a visualiza
facilitar a visualizaçção. Ligaão. Ligaççõesões--H estão representadas por linhas pontilhadas verdes.H estão representadas por linhas pontilhadas verdes.
Aplica
Phe359 His361 Asp381 Phe382 Tyr253 Glu286 Met290 Thr315 Phe317 Ile313
Estrutura do imatinibe complexado no dom
Estrutura do imatinibe complexado no domíínio da nio da hh--ABLABL--K (cK (cóódigo no PDB: 2HYY; digo no PDB: 2HYY;
Resolu
Resoluçção= 2,4 ão= 2,4 ÅÅ) obtida por ancoramento molecular com o programa FlexX (licen) obtida por ancoramento molecular com o programa FlexX (licençça # 7512).. a # 7512).. Valor de energia livre de liga
Conceito
do
Conceito
do
Compost
o
Composto
Composto
-
-
prot
prot
ó
ó
tipo
tipo
“
“
O
O
composto
composto
-
-
prot
prot
ó
ó
tipo
tipo
é
é
o
o
primeiro
primeiro
derivado
derivado
p
p
u
u
r
r
o
o
,
,
identificado
identificado
em uma
em uma
s
s
é
é
rie congênere
rie congênere
de
de
novas substâncias
novas substâncias
,
,
bioensaiadas
bioensaiadas
em
em
modelos
modelos
animais
animais
padronizados
padronizados
,
,
relacionados
relacionados
à
à
patologia
patologia
a ser
www.uff.br/rvq
www.uff.br/rvq
O desenho de mol
O desenho de mol
é
é
culas
culas
candidatas a f
candidatas a f
á
á
rmacos
rmacos
é
O planeja
mento
racional
1924-2010 –Sir James W. Black Premio Nobel 1988 O N H CH3 OH CH3 ICI, Inglaterra (1965) Propranolol (InderalR)
A invenção do propranolol
J. Black et al., Br. J. Pharmacol. Chmother. 1965, 25, 577
James W. Black, 1988 - "Pronethalol always seemed to us to be a prototype drug, good enough to answer questions of principle, but not good enough to be marketable"
O
N
H
CH
3CH
3 propranolol 1964OH
HO HO H N CH3 OH R adrenalina HO HO H N OH CH3 CH3 isoprenalina / isoproterenol Cl Cl H N OH CH3 CH3 1958 - DCI -bloquedorA inven
Maraviroc
Maraviroc
CCR5 farmacóforo
(2007 [US] / 2009 [BR]) (2007 [US] / 2009 [BR])1996
1996
-
-
Programa CCR5
Programa CCR5
antagonista
antagonista
500.000 compostos
500.000 compostos
High
High
-
-
throughput
throughput
screening
screening
C Barber, D Pryde, From HTS to market: the discovery and development of maraviroc, a CCR5 antagonist for the treatment of HIV, Accounts in Drug Discovery – Case studies in Medicinal Chemistry, JC Barrish, PH Carter, PTW Cheng e R Zahler, Eds., RSC Pub., 2011, p.183-2143
Worldwide Medicinal Chemistry, Pfizer Ltd, Sandwich, Kent, UK Worldwide Medicinal Chemistry, Pfizer Ltd, Sandwich, Kent, UK
CCR5
GPCR
quimiocina
PTN
rhodopsina
quimiotecas
HTS
1997 - UK-107543
Afinidade CCR5: 0,6 µM
Ligante eficaz (agonista)
hERG-K+ (396nM)
CYP450 (2D6) 40nM
AS de Miranda, CM Avila, FC da Silva, RO Lopes,
Rev. Virtual Quim., 2010, 2 (2), 130
3D por homologia
combinatórias
eliezer 2012 H N N N H3C O N H
heme
Fe
cLog P
cLog P
Restri
Restri
ç
ç
ão
ão
conformacional
conformacional
D Kuritzkes, S Kar, P Kirkpatrick, Nature Rev Drug Discov. 2008, 7, 15
650 nM
650 nM
75 nM (antiviral) (RS)
75 nM (antiviral) (RS)
CYP2D6 negativo
CYP2D6 negativo
2 nM (antiviral)
2 nM (antiviral)
/ sem atividade antiviral
/ sem atividade antiviral
IC
IC
5050= 2 nM
= 2 nM
tropano
tropano
2007
2007
1997
1997
A descobert
a das
estatinas
Estatinas: do protótipo natural ao super-fármaco
LDL = LIPOPROTE
LDL = LIPOPROTEÍÍNA DE BAIXA DENSIDADE = COLESTEROL NA DE BAIXA DENSIDADE = COLESTEROL RUIMRUIM
N
CH
3CH
3F
HN
O
CO
2H
OH
HO
CH3 H O O H3C CH3 O HO O mevastatina 1975Similaridade Molecular ?
Similaridade Molecular ?
Similaridade Molecular ?
Bioss
Bioss
í
í
ntese do colesterol
ntese do colesterol
CH3 O H2C P O O P OH O OH OH CH3 CH3 H3C CH3 CH3 HO pirofosfato de isopentenila pirofosfato de isopentenila colesterol colesterol mevalolactona mevalolactona
A.Endo, J. Antibiot. A.Endo, J. Antibiot. 1976, 29, 1346 1976, 29, 1346 Penicillium citrinum Penicillium citrinum Idem, Ibid, 1979,32,852 Idem, Ibid, 1979,32,852 Monascus ruber Monascus ruber (compactina) (compactina)
A.Endo, J. Med. Chem. 1985, 28, 01
Mevilonina Mevilonina
Prot
Prot
ó
ó
tipo natural
tipo natural
Sim
Simvastatin
vastatin (ZoccorR) MK-733 1988 J. Med. Chem. 1986, 29, 849Similaridade
Similaridade
molecular
molecular
19871987 –– MS&D (MevacorMS&D (MevacorRR))
γγγγ γγγγ-lactona-lactona J.Med.Chem. 2002,45, 5609. US$ 5,5 bi US$ 5,5 bi (2007) (2007)
H
CH
3O
O
H
3C
C H
3O
H O
O
Lovastatin (MK Lovastatin (MK--803)803)1980 – Merck & Co.
Aspergillus terreus O H3C H CH3 O H3C CH3 CH3 O HO O
1
1
975 975 ––Mevastatina (ML
Mevastatina (ML
-
-
263b
263b
Arthur A. PatchettH
CH
3O
O
H
3C
CH
3O
HO
O
H
3C
Pr
Pr
ó
ó
-
-
f
f
á
á
rmaco
rmaco
IC IC5050= 11,2 nM= 11,2 nMponto
ponto
hidrof
hidrofóóbicobico aquiral aquiral IC IC5050= 44,1 nM= 44,1 nM
mevastatina
mevastatina
abertura lactona
abertura lactona
sistema decalina sistema decalina ÉÉster quiralster quiral
lactona
lactona
á
álcool allcool alíílicolico
CH3 O O O HO O CH3 H3C H * * * * * * * CH3 O OH CO2H HO O CH3 H3C H * * * * * * * HO β ββ β CYP3A4 CYP2D6 CYP2C9 CH3 O OH CO2H HO O CH3 H3C H * * * * * * *ββββ CH3 OH CO2H HO * * * *ββββ CH3 OH CO2H HO * *ββββ
Segunda gera
Segunda gera
ç
ç
ão
ão
OH CO2Na HO N CH3 CH3 F H
fluvastatina
fluvastatina
SubSub--unidade hidrofunidade hidrofóóbica (arombica (aromática)ática)
CH3 CH3 F Ar O O HO OH HO CO2H Ar = N-heterociclo
Qumiotipo das estatinas
Qumiotipo das estatinas
Qumiotipo das estatinas
IC
IC
IC5050 = 8,2 nM= 8,2 nM
IC
IC5050= 5,4 nM= 5,4 nM
á
ácido (cido (
N
N
--pirrol)pirrol)--3,53,5--didi--hidrhidróóxixi--heptanheptanóóicoicoAr
Ar
IC IC5050 = 3,4 nM= 3,4 nM Kowa Pharmaceuticals Biodisponibilidade=12% Biodisponibilidade=12% Biodisponibilidade = Biodisponibilidade = 60%60% Biodisponibilidade = 20% Biodisponibilidade = 20% Bruce RothSimilaridade Molecular
Similaridade Molecular
Similaridade Molecular
N HO CO2H OH FPitavastatina
Pitavastatina
Rosuvastatina
Rosuvastatina
Atorvastatina
Atorvastatina
O mercado mundial das estatinas em 2009 = US$ 27 bi
O mercado mundial das estatinas em 2009 = US$ 27 bi
2010
2010
US$ 12,5 bi (2011)
N
CH
3CH
3F
HN
O
CO
2H
OH
HO
Atorvastatina
Atorvastatina
1991
1991
•
•
Sintetizada, em 1985, por Bruce Roth
Sintetizada, em 1985, por Bruce Roth
[
[B. D. Roth, "The discovery and development of B. D. Roth, "The discovery and development of atorvastatin, a potent novel hypolipidemic agent atorvastatin, a potent novel hypolipidemic agent””, , Prog. Med. Chem.
Prog. Med. Chem. 2002, 2002, 4040, 1–, 1–22]22]
Patente US 5273995 Pfizer (1991):
Patente US 5273995 Pfizer (1991):
12 etapas = 4,2%
12 etapas = 4,2%
•
•
Nova s
Nova s
í
í
ntese Prof. Luiz Carlos Dias
ntese Prof.
Luiz Carlos Dias
&
&
Dr
Dr Adriano S Vieira
Adriano S Vieira
, IQ
, IQ
-
-
UNICAMP,
UNICAMP,
em
em 2010
2010
, pelo INCT
, pelo
INCT
-
-
INOFAR:
INOFAR:
super blockbuster
super blockbuster
super blockbuster
super blockbuster
super blockbuster
super blockbuster
super blockbuster
super blockbuster
––––
––––
drug
drug
drug
drug
drug
drug
drug
drug
LC Dias, A S Vieira, EJ Barreiro,
LC Dias, A S Vieira, EJ Barreiro,
Processo de obten
Processo de obten
ç
ç
ão
ão
de atorvastatina c
de atorvastatina c
á
á
lcica utilizando novos intermedi
lcica utilizando novos intermedi
á
á
rios
rios
PI 018110015039 (p
PI 018110015039 (p
rotocolado no INPI, em 25/04/2011)
rotocolado no INPI, em 25/04/2011)
11 etapas = 19,3%
11 etapas = 19,3%
•
Inovação
Incremental
Inova
Inova
ç
ç
ão
ão
Incremental
Rota sint
Rota sint
é
é
tica do INCT
tica do INCT
-
-
INOFAR para a atorvastatina
INOFAR para a atorvastatina
Otimiza
Otimiza
ç
ç
ão do Composto
ão do Composto
-
-
prot
prot
ó
ó
tipo
tipo
vasoconstrição pulmonar
trombose in situ
remodelamento vascular
insuficiência ventricular
direita progressiva
óbito
NH
N
N
N
H
3C
H
3C
S
O
O
N
N
H
3C
O
CH
3O
sildenafil
PDE
PDE
-
-
5
5
Hipertensão arterial pulmonar
Hipertensão arterial pulmonar
Bioisosterismo* Bioisosterismo*
LM Lima & EJ Barreiro,
LM Lima & EJ Barreiro, Bioisosterism: A Useful Strategy for Molecular Modification and Bioisosterism: A Useful Strategy for Molecular Modification and Drug Design, Drug Design,
Current Medicinal Chemistry
Current Medicinal Chemistry, 2005, , 2005, 1212, 23, 23--4949
F
F
á
á
rmacos para Disfun
rmacos para Disfun
ç
ç
ão Er
ão Er
é
é
til
til
eliezer 2012
Inibidores de PDE
Inibidores de PDE
-
-
5
5
HTS
HTS
HTS
HTS
HTS
HTS
Hipertensão arterial pulmonar
N N N NH diamino-quinazolina N NH CH3 N N N N N NH N NH CH3 CH3 H3C
PDE
PDE
-
-
5 x PDE
5 x PDE
-
-
6
6
PDE
PDE
-
-
5 x PDE
5 x PDE
-
-
6
6
PDE
PDE
-
-
5 IC
5 IC
5050= 0,4 nM
= 0,4 nM
PF
PF
-
-
489.791
489.791
Hipertensão arterial pulmonar
O CO2H HO CH3 OH Prostaciclina
alc
alc
ó
ó
ol al
ol al
í
í
lico
lico
C
C
-
-
16
16
eno
eno
é
é
ter de enol
ter de enol
β
β
ω
ω
Hipertensão arterial pulmonar
Otimiza
Otimiza
ç
ç
ão do Prot
ão do Prot
ó
ó
tipo
tipo
H N N N O H3CO H3CO CH3 H N N N O Cl Cl Cl H N N O F F N EC50 = 550 M EC50 = 240 M EC50 = 15 MLBDD
LBDD
A import
ância dos
A import
ância dos
fatores
fatores
estrutura
is
A importância dos fatores
estruturais
H
3
C-O-H
H-O-H
H
3
C-CH
2
-O-H
Dose !
Dose !
canais iônicos = GLUr
canais iônicos = GLUr
/ GABA
/
GABA
A
A
(?
(?
? ?
?
?
)
)
m
m
etanol
etanol
etanol
etanol
Como atua o
A escolha do alvo
A escolha do alvo
-
-
terapêutico
terapêutico
é
é
etapa crucial
etapa crucial
...e depende da fisopatologia
...e depende da fisopatologia
indomethacin
indomethacin
CAS 53
CAS 53--8686--11
C
C1919HH1616ClNOClNO44 Charles A. Winter & T. Y. ShenCharles A. Winter & T. Y. Shen
Merck Research Laboratories Merck Research Laboratories
Qu
Qu
í
í
mica Medicinal
mica Medicinal
Farmacologia
Farmacologia
2
2--{1{1--[(4[(4--chlorophenyl)carbonyl]chlorophenyl)carbonyl]--55--methoxymethoxy--22--methylmethyl--11HH--indolindol--33--yl}acetic acidyl}acetic acid
1 9 6 3 1 9 6 3 N CO2H CH3 O H3CO Cl 5 3 serotonina serotonina
• Ensaio do edema da pata induzido por
carragenina
Tratamento na pata Cg
Tratamento na pata Cg
Tratamento na pata Cg
Administração oral da substância
Administra
Administra
ç
ç
ão oral da substância
ão oral da substância
Determinação do volume da pata
Determina
Determina
ç
ç
ão do volume da pata
ão do volume da pata
Liberação de mediadores endógenos (bradicinina, serotonina, histamina, citocinas, PG’s...) Liberação de mediadores endógenos (bradicinina, serotonina, histamina, citocinas, PG’s...)
CO2H O CO2H NH O CH3 Cl Cl H3C CO2H H2 C NH Cl Cl CO2H N CO2H CH3 O H3CO Cl CH3 F CO2H CH3 CH3 N H O CH3 CO2H H3C N N O O HC3 H S N OH O N H N O O CH3 CH2 H3CO CH3 O AAS ácido meclofenâmico diclofenaco indometacina ibuprofeno H3C flubiprofeno etodolaco fenilbutazona piroxicam nabumetona
N N O O H3C H N N O OH H3C N N HO O H3C O O OCH2CH3 H3CH2CO H H 1,3-dicarbonilado fenilbutazona H-ácido equilibrio ceto-enólico enol enol ceto ceto malonato de dietila acetoacetato de alquila (síntese malônica)
piroxicam
Parâmetros cinéticos e de Inibição PGHS-1 PGHS-2
Km ácido araquidônico 5,6 µM 5.4 µM Atividade ciclooxigenase 34 nM AA/min /mg proteína 39 nM AA/min /mg proteína Atividade peroxidase 31 nM H2O2/min /mg proteína 30 nM H2O2/min /mg proteína Acetilação pelo AAS Ser 530 Ser 516
Efeito do AAS (COX) Inibida Não afetada Parâmetros cinéticos e de Inibição PGHS-1 PGHS-2
Km ácido araquidônico 5,6 µM 5.4 µM Atividade ciclooxigenase 34 nM AA/min /mg proteína 39 nM AA/min /mg proteína Atividade peroxidase 31 nM H2O2/min /mg proteína 30 nM H2O2/min /mg proteína
Acetilação pelo AAS Ser 530 Ser 516
Efeito do AAS (COX) Inibida Não afetada
CO2H NH2
CH3 H3C
Ácido araquidônico
•
•
Inflama
Inflama
ç
ç
ão
ão
•
•
Câncer
Câncer
•
•
Endot
Endot
é
é
lio
lio
vascular
vascular
•
•
Rins
Rins
•
•
C
C
é
é
rebro
rebro
•
•
Plaquetas
Plaquetas
•
•
Estômago
Estômago
•
•
Rins
Rins
Ácido araquidônicoCoxibes
1999
1999 ––lanlanççamentoamento 09/2004
09/2004 ––retirado*retirado* (APPROVe test)
(APPROVe test)
2004
2004 --US$ 2.5 bilionUS$ 2.5 bilion
* P. Juni
* P. Juni et alet al., ., ““Risk of cardiovascular events and rofecoxib:cumulative metaRisk of cardiovascular events and rofecoxib:cumulative meta--analysisanalysis””, , LancetLancet2004, 2004, 364364, 2021, 2021
Deracoxib* (Deramaxx
Deracoxib* (DeramaxxRR))
Cimicoxib, Tiracoxib
ISBN ISBN--10 3527325492 10 3527325492 Setembro de 2010 Setembro de 2010 ISBN ISBN--10 3527325492 10 3527325492
Janos Fischer is research laboratory head at Richter Ltd., Budap
Janos Fischer is research laboratory head at Richter Ltd., Budapest, Hungary. est, Hungary.
Robin Ganellin is Emeritus Professor of Medicinal Chemistry at U
Robin Ganellin is Emeritus Professor of Medicinal Chemistry at University College London, UK. niversity College London, UK.
Similaridade Molecular
Similaridade Molecular
Os sutis efeitos do grupamento metila
COX-2
COX-1
COX-2
COX-2
COX-2
COX-1
Em
Em verdeverde o diclofenacoo diclofenaco e em laranjae em laranja o lumiracoxibeo lumiracoxibe; Em ; Em
B
B
observaobserva--se as fortes interase as fortes interaçções do ões do carboxilato comcarboxilato com ArgArg--120120 e ligae ligaççãoão--H com TyrH com Tyr--355355 na COXna COX--11; a presen; a presençça da isoleucinaa da isoleucina--384384, , nesta
nesta isoformaisoforma, induz orienta, induz orientaçção distinta dos pontos farmacofão distinta dos pontos farmacofóóricos dos inibidores, permitindo ricos dos inibidores, permitindo que a
que a metilametila do do lumiracoxibelumiracoxibe previna estas interaprevina estas interaçções, possões, possííveis na veis na COXCOX--22. Nesta isoforma, . Nesta isoforma, ambos inibidores tem intera
ambos inibidores tem interaççõesões--H com TyrH com Tyr--385385 enquanto que o lumiracoxibeenquanto que o lumiracoxibe interage interage tamb
tambéém com a Serm com a Ser--530530. Em suma temos, neste caso, um duplo efeito. Em suma temos, neste caso, um duplo efeito--Me do ligante e do Me do ligante e do biorreceptor. biorreceptor. CO2H NH Cl Cl H
Surface showing the active site of CnCYP51. Colors indicate sites as follows:
green, the P1 site; purple, the P2 site; blue, the P3 site; red, the P4 site.
Both the front side (A) and the back side (B) of the active site are displayed
C.Sheng, Z.Miao, H.Ji, J. Yao, W. Wang, X. Che, G. Dong, J. Lü, W. Guo, W. Zhang, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2009, 53, 3487-3495.
La
n
o
st
e
ro
l
1
4
αααα
-D
e
m
e
th
y
la
se
a)
b)
Sutil efeito do grupamento metila
N N N Cl O CH3 Cl CH3 H2N N N N Cl O CH3 Cl CH3 H3CO H3C Tipifarnib Análogo T cruzya) EC50 = 4 nM 6,0 pM hPFT b) IC50 = 0,7 nM > 50 M (<< toxicidez) T cruzy PFT inativo hCYP450 (CYP3A4)
a) inibição da esterol 14 -demetilase (14DM) b) proteína farnesiltransferase humana
J. M. Kraus ., 2009, , 1639
Fase III como anti-câncer
J. M. Kraus et al., J. Med. Chem. 2010, 53, 3887
rotamêros
rotamêros
(4 isomêros)
Efeito de mudanças sutis: análogos
J. M. Kraus
J. M. Kraus
et al., J. Med. Chem.
et al., J. Med. Chem.
2009
2009
,
,
52
52
, 1639
, 1639
Liga
Liga
ç
ç
ão
ão
-
-
H (d/a)
H (d/a)
ambidente
ambidente
Cl
Cl
Cl
Cl
O
O
Me
Me
O
O
CH
CH
33h
h
-
-
PFT
PFT
tipifarnib
tipifarnib
h
Efeito de mudanças sutis: análogos
J. M. Kraus
J. M. Kraus et al., J. Med. Chem. 2009et al., J. Med. Chem. 2009, , 52, 163952, 1639
h
J. M. Kraus
J. M. Kraus
et al., J. Med. Chem.
et al., J. Med. Chem.
2009
2009
,
,
52
52
, 1639
, 1639
N OCH3 N N Cl O CH3 Cl CH3 H3C H
Diferen
Diferen
ç
ç
a
a
conformacional
conformacional
S
Síítio ligatio ligaççãoão--HH
Benzopirano
Benzopirano
-
-
5
5
-
-
substitu
substitu
í
í
do
do
Benzopirano
Benzopirano
-
-
7
7
-
-
substitu
substitu
í
í
do
do
S
Síítio ligatio ligaççãoão--HH
Receptor
Receptor
hipot
hipot
é
é
tico
tico
similaridade molecular
similaridade molecular
Anti
Anti--arrarríítmtmiiccoo
¨
¨
encaixe induzido
encaixe induzido
¨
¨
H Verli & E.J. Barreiro,
H Verli & E.J. Barreiro, ““Um paradigma da QuUm paradigma da Quíímica Medicinal: a Flexibilidade dos Ligantes e Receptoresmica Medicinal: a Flexibilidade dos Ligantes e Receptores””,,
Quim. Nova Quim. Nova2005, 2005, 2828, 95, 95--102102 NH S O O H3C O O N CH3
Regioisômeros
Regioisômeros
Conforma
Conforma
ç
ç
ões
ões
equivalentes
Aplicand
o a
Aplicand
o a
similarid
ade
similarid
ade
estrutura
l
estrutura
l
sistema terfenílico
Desenho molecular de novos derivados
Desenho molecular de novos derivados
antiinflamat
antiinflamat
ó
ó
rios bispiraz
rios bispiraz
ó
ó
licos
licos
Similaridade Molecular
Similaridade Molecular
Similaridade Molecular
S NH2 O O N N F3C CH3 celecoxibe (1999)inibidor COX-2 / COX-1
N N N N CH3 H3C CH3 S NH2 O O celecoxibe celecoxibe
unidade
unidade
farmacof
farmacof
ó
ó
rica
rica
GF
GF
sistema terfenílico
Novo padrão molecular
Novo padrão molecular
Novo padrão molecular
Novo padrão molecular
bispirazola
bispirazola
Desenho estrutural dos novos derivados bispiraz
Desenho estrutural dos novos derivados bispiraz
ó
ó
licos
licos
sistema
bispirazólico
Transposi
Transposiççãoão
do do GFGF S NH2 O O N N F3C CH3 N N N N CH3 H3C CH3 S NH2 O O N N N N CH3 H3C CH3 S NH2 O O
S
S
é
é
rie Congênere
rie Congênere
Alquila Alquila Arila Arila Alquila Alquila N N N N R' H3C R NH S O O CH3
N N N N H3C NH S O O CH3 N N N N CH3 H3C CH3 NH S O O CH3 N N N N H3C CH3 NH S O O CH3 N N N N Ph H3C Ph NH S O O CH3 N N N N CH3 H3C NH S O O CH3 LASSBio-321 LASSBio-367 LASSBio-356 LASSBio-445 LASSBio-456
S
N N N N CH3 H3C NH2 N N N N CH3 H3C NH2 LASSBio-715 N N N N H3C NH2 N N N N CH3 H3C NH2 CH3 N N N N Ph H3C NH2 Ph M
DI
DI
50
50
Max. Eff.
Max. Eff.
CELECOXIB CELECOXIB
87,7
µ
µ
µ
µmol/kg
35%
LASSBio
LASSBio
715
715
44,3
µ
µ
µ
µmol/kg
39%
LASSBio
LASSBio
445
445
54,6
µ
µ
µ
µmol/kg
37%
CgIRPE
CgIRPE
*
*
Patent: PI 9902960-0 (29/04/99)
NSAI/2
NSAI/2
aagera
gera
ç
ç
ão
ão
M
Atropoisomerismo
Atropoisomerismo
MP Veloso
MP Veloso et al., Synthesis and characterization of the atropisomeric et al., Synthesis and characterization of the atropisomeric relationships of a substituted
relationships of a substituted NN--phenyl-phenyl-bipyrazole derivative withbipyrazole derivative with Antiinflammatory properties,
Atropoisomerismo
Atropoisomerismo
enantiomêros
S O O HN NH2 Ar N N S S O O NH2 H N O H3C S O O NH H2N Ar N N S S O O NH2 HN O H3C
CAi
COX-2i
N N F3C S O O NH2 CH3 N N F3C S O O NH2 CH3 CELECOXIBE CELECOXIBE ACETAZOLAMIDA ACETAZOLAMIDASimilaridade Funcional:
Similaridade Funcional:
N
N
-
-
aril
aril
-
-
fenilsulfonamida
fenilsulfonamida
Similaridade Funcional:
Similaridade Funcional:
fenilsulfonamida
fenilsulfonamida
Sulfonamida diur
Sulfonamida diurééticatica
Similaridade Molecular
Similaridade Molecular
Adm. C & V
Adm. C & V
p.o.
p.o.
em coelhos glaucomatosos reduz a pressão intra
em coelhos glaucomatosos reduz a pressão intra
-
-
ocular.
ocular.
Celexoxibe (
Celexoxibe (
C
C
) = COX
) = COX
-
-
2/CA II, < hipertensão renal induzida por COX
2/CA II, < hipertensão renal induzida por COX
-
-
2i
2i
’
’
s
s
C
C
apresenta efeito na ausência de COX
apresenta efeito na ausência de COX
-
-
2 outros mecanismos (?)
2 outros mecanismos (?)
Induz apoptose em linhagens de c
Induz apoptose em linhagens de c
é
é
lulas pulmonares cancerosas
lulas pulmonares cancerosas
A Weber et al., “Unexpected nanomolar inhibition of carbonic anhydrase by COX-2 selective celecoxib...”,
J. Med. Chem.2004, 47, 550 N S N SO2NH2 N H O H3C acetazolamida C4H6N4O3S2 CAS # 59-66-5
W=H
W=H
W=F
N H N N S CH3 O F
SB
SB
-
-
203580
203580
N H N N S CH3 O FSB
SB
-
-
203580
203580
N N S CF3 H3C NH2 O Ocelecoxibe
celecoxibe
Sistema
Sistema
terfen
terfen
í
í
lico
lico
Gilberto S. da Silva
Gilberto S. da Silva, LM Lima, CAM Fraga, LM Lima, CAM Fraga
CMR Sant
CMR Sant’’Anna, EJ Barreiro, Anna, EJ Barreiro,
Bioorg. Med. Chem. Lett.
Bioorg. Med. Chem. Lett.20052005, , 1515, 3506 , 3506
As
As
As
As bases moleculares
moleculares
moleculares
moleculares
da inibi
da inibi
da inibi
da inibiçççção da MAPK
ão da MAPK
ão da MAPK
ão da MAPK
p38 pelo celecoxibe
p38 pelo celecoxibe
p38 pelo celecoxibe
p38 pelo celecoxibe
Similaridade Molecular
Similaridade Molecular
Similaridade Molecular
H
ib
rid
ac
i
H
ib
rid
ac
i
ó
ó
n
M
ol
ec
ul
ar
n
M
ol
ec
ul
ar
N N S O O NH2 CH3 F3CIC
IC
5050(PGHS
(PGHS
-
-
2) = 8.7
2) = 8.7
µ
µ
M
M
LASSBio
LASSBio
-
-
1145
1145
RB LacerdaRB Lacerda et alet al. . Bioorg Med ChemBioorg Med Chem2009, 2009, 1717, 74, 74
celecoxib
celecoxib
SB
SB
-
-
203580
203580
PGHS
PGHS
-
-
2i
2i
MAPK p38i
MAPK p38i
N N H N S O CH3 F ring fusion ring fusion ring fusion ring fusionED
ED
5050(AcOH sol) = 22.7
(AcOH sol) = 22.7
µ
µ
M/Kg
M/Kg
aza spacer
aza spacer
Capsaicin
Capsaicin
-
-
induced
induced
hyperalgesia
N
N
H
N
S
O
CH
3F
N CH3 CH3 F HN O CO2H OH HOReconhecendo a
Reconhecendo a
similaridade
similaridade
molecular
molecular
“
“
...
...
discovery
discovery
consists
consists
of
of
seeing
seeing
what
what
what
what
what
what
what
what
everybody
everybody
everybody
everybody
everybody
everybody
everybody
everybody
else
else
else
else
else
else
else
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has
has
seen
seen
and
and
thinking
thinking
what
what
no
no
b
b
ody
ody
else
else
has not thought
has not thought
has not thought
has not thought
has not thought
has not thought
has not thought
has not thought
...
...
”
”
Albert Szent
Albert Szent
-
-
Gy
Gy
ö
ö
rgi
rgi
(1893
(1893
-
-
1986)
1986)
O processo racional de planejamento
O processo racional de planejamento
de novos f
N N N N N N N Cl O O O O O MeO OMe OMe O O O H3C HO OH N H S H N H3C O O N CH3 H3C N CH3 O O H3CO O N CH3 H3C O HO CH3 H H N H S H N H3C O O N CH3 H3C O N OH H2N N OH O CH3 N CH3 CH3 H3C H3C OH O O N H S H N H3C O O N CH3 H3C N H S H N H3C O O N CH3 H3C H3C O O S H N O O O N OH O CH3 N CH3 CH3 H3C H3C OH O O N N CH3 Cl HO N HN N N H3C O O S H N O O O N CH3 CH3 O N CH3 CH3 H3C O O S H N O O O N N CH3 Cl HO N HN N N O O O O O MeO OMe OMe O O O H3C HO OH N N N N N N N Cl N N CH3 Cl HO N HN N N H3C O O S H N O O O H3C O O S H N O O O
Ep
Ep
í
í
logo
logo
AJ Williams, S Ekins, AM Clark, JJ Jack, RL Apodaca, Mobile apps
AJ Williams, S Ekins, AM Clark, JJ Jack, RL Apodaca, Mobile apps
for chemistry
for chemistry
in the world of drug discovery,
Quimioteca com 1765 compostos
L. E. Dardenne, LNCC
A quimioteca do
A quimioteca do
LASSBio tem
LASSBio tem
1765 compostos
1765 compostos
originais
originais
Banco de dados de mol
Banco de dados de mol
é
é
culas =
culas =
Novos prot
•
•
São in
São in
São in
São in
São in
São in
São in
São in
úúúú
úúúú
meras as estrat
meras as estrat
meras as estrat
meras as estrat
meras as estrat
meras as estrat
meras as estrat
meras as estrat
éééé
éééé
gias de
gias de
gias de
gias de
gias de
gias de
gias de
gias de
desenho molecular da
desenho molecular da
desenho molecular da
desenho molecular da
desenho molecular da
desenho molecular da
desenho molecular da
desenho molecular da
Qu
Qu
Qu
Qu
Qu
Qu
Qu
Qu
íííí
íííí
mica
mica
mica
mica
mica
mica
mica
mica
Medicinal
Medicinal
Medicinal
Medicinal
Medicinal
Medicinal
Medicinal
Medicinal
que podem ser empregadas ,
que podem ser empregadas ,
que podem ser empregadas ,
que podem ser empregadas ,
que podem ser empregadas ,
que podem ser empregadas ,
que podem ser empregadas ,
que podem ser empregadas ,
separadamente ou combinadas, para
separadamente ou combinadas, para
separadamente ou combinadas, para
separadamente ou combinadas, para
separadamente ou combinadas, para
separadamente ou combinadas, para
separadamente ou combinadas, para
separadamente ou combinadas, para
construir
construir
construir
construir
construir
construir
construir
construir
----
----
se in
se in
se in
se in
se in
se in
se in
se in
úúúú
úúúú
meros quimiotipos de
meros quimiotipos de
meros quimiotipos de
meros quimiotipos de
meros quimiotipos de
meros quimiotipos de
meros quimiotipos de
meros quimiotipos de
distintas s
distintas s
distintas s
distintas s
distintas s
distintas s
distintas s
distintas s
éééé
éééé
ries congêneres, visando
ries congêneres, visando
ries congêneres, visando
ries congêneres, visando
ries congêneres, visando
ries congêneres, visando
ries congêneres, visando
ries congêneres, visando
identificarem
identificarem
identificarem
identificarem
identificarem
identificarem
identificarem
identificarem
----
----
se novos compostos
se novos compostos
se novos compostos
se novos compostos
se novos compostos
se novos compostos
se novos compostos
se novos compostos
----
----prot
prot
prot
prot
prot
prot
prot
prot
óóóó
óóóó
tipos, candidatos a novos
tipos, candidatos a novos
tipos, candidatos a novos
tipos, candidatos a novos
tipos, candidatos a novos
tipos, candidatos a novos
tipos, candidatos a novos
tipos, candidatos a novos
ffff
Ú
Ú
nico programa de p
nico programa de p
ó
ó
s
s
-
-
gradua
gradua
ç
ç
ão (M/D)
ão (M/D)
com este perfil na Am
com este perfil na Am
é
é
rica Latina
rica Latina
Interface Química-Biologia em Química Medicinal
“
“Medicinal chemistry or pharmaceutical chemistry is a discipline Medicinal chemistry or pharmaceutical chemistry is a discipline at the at the intersection of chemistry and pharmacology involved with designi
intersection of chemistry and pharmacology involved with designing, ng, synthesizing and developing drugs.
synthesizing and developing drugs.””
Slide 95 EJB10
A recente criação da PG (M&D) em Farmacologia e Química Medicinal ilustra nova perspectiva de horizonte na PG da UFRJ, pois é a primeira com o perfi desta proposta interdisciplinar na AL.l
www.ivfrj.ccsdecania.ufrj.br/portaldosf
Bibliografia
Química Nova
http://www.scielo.br/qn
L. M.
L. M.
LIMA,
LIMA
Química Medicinal moderna: desafios e contribuição brasileira
Quím. Nova 2007, 30, 1456-1468
Livro "Química Medicinal: As Bases Moleculares da Ação dos Fármacos“
http://www.artmed.com.br/
www.uff.br/rvq
www.uff.br/rvq
www.farmacia.ufrj.br/lassbio
“
“
...Para achar
...Para achar
á
á
gua
gua
é
é
preciso
preciso
descer terra adentro,
descer terra adentro,
encharcar
encharcar
-
-
se no lodo.
se no lodo.
Mas h
Mas h
á
á
os que preferem
os que preferem
olhar os c
olhar os c
é
é
us,
us,
e esperar pelas chuvas...
e esperar pelas chuvas...
”
”
Oduvaldo Vianna Filho
(em “Cúmplice da Paixão”, Dênis de Moraes
Ed. Nórdica, RJ, 1990; Ed. Record, RJ, 2001)
.
eliezer 2012