Proposta de Dissertação de Mestrado
Aluna: Juliana Lilian Duque
Orientador: Dr. Ricardo Rodrigues Ciferri
Área: Banco de Dados
Universidade Federal de São Carlos - UFSCar
Departamento de Computação - DC
Roteiro
Título do Trabalho
Contexto em que se insere
Anemia Falciforme
Objetivo
O projeto de pesquisa “Anemia Falciforme”
Motivação e relevância
Detalhamento do Trabalho de Pesquisa
Cronograma Geral
Roteiro
Título do Trabalho
Contexto em que se insere
Anemia Falciforme
Objetivo
O projeto de pesquisa “Anemia Falciforme
Motivação e relevância
Detalhamento do Trabalho de Pesquisa
Cronograma Geral
Título do Trabalho
Extração de Informação em Artigos Científicos no
Formato PDF: tratamento e sintomas relacionados
à doença Anemia Falciforme.
Roteiro
Título do Trabalho
Contexto em que se insere
Anemia Falciforme
Objetivo
O projeto de pesquisa “Anemia Falciforme”
Motivação e relevância
Detalhamento do Trabalho de Pesquisa
Cronograma Geral
Contexto em que se insere
A Anemia Falciforme é uma doença hematológica
hereditária que causa destruição crônica das células
vermelhas do sangue.
Roteiro
Título do Trabalho
Contexto em que se insere
Anemia Falciforme
Objetivo
O projeto de pesquisa “Anemia Falciforme”
Motivação e relevância
Detalhamento do Trabalho de Pesquisa
Cronograma Geral
Hemácias
Sangue é composto pelo plasma e por três tipos de
células:
hemácias (glóbulos vermelhos), glóbulos brancos e
Hemoglobina
Hemoglobina (proteína no interior das hemácias;
rica em ferro)
Transporta o oxigênio;
Cor vermelha do sangue.
O que é Anemia?
Diminuição da Hemoglobina no sangue
Ocorre por:
O que é Anemia Falciforme (AF)?
Doença genética e hereditária
Afeta principalmente a população negra
Substituição da Hemoglobina A pela
Hemoglobina S
Dificuldade de passar pelas veias
Não pode ser amenizada nem com alimentação nem com ferro
Origem da AF
Provavelmente desenvolveu-se na África
Autodefesa do organismo humano contra a Malária
Comum na Europa mediterrânea, no Oriente Médio e
nas regiões da Índia;
Processos migratórios e colonização.
Como um indivíduo nasce com AF?
Como um indivíduo nasce com AF?
Como um indivíduo nasce com AF?
Complicações
Bebês
infecções e dores com inchaço nas mãos e nos pés.
Crianças maiores
dores mais localizadas nas pernas, nos braços e na
barriga.
Adulto
dores nos ossos
Sintomas
1.
Crise de Dor
2.
Cor amarela nos olhos (icterícia) e Palidez
Icterícia - mesmo sintoma da Hepatite.
3.
Síndrome Mão-Pé
4.
Úlcera de perna
5.
Síndrome Torácica Aguda
Diagnóstico
Teste do pezinho.
Exames de triagem:
Teste de afoiçamento;
Teste da mancha.
Exame confirmatório:
Eletroforese de hemoglobina.
Tratamento
1.
Hidratação adequada
2.
Uso de Ácido Fólico
3.
Uso de Hidroxiuréia
4.
Reposição sangüínea
5.
Uso de Penicilina
Roteiro
Título do Trabalho
Contexto em que se insere
Anemia Falciforme
Objetivo
O projeto de pesquisa “Anemia Falciforme”
Motivação e relevância
Detalhamento do Trabalho de Pesquisa
Cronograma Geral
Objetivo
Extrair de artigos científicos no formato PDF
escritos em inglês informações sobre tratamentos e
sintomas relacionados à doença Anemia Falciforme.
A extração de informação será usado para auxiliar
médicos e pesquisadores da área de saúde e
biológica.
Roteiro
Título do Trabalho
Contexto em que se insere
Anemia Falciforme
Objetivo
O projeto de pesquisa “Anemia Falciforme”
Motivação e relevância
Detalhamento do Trabalho de Pesquisa
Cronograma Geral
O projeto de pesquisa “Anemia Falciforme”
Este trabalho de pesquisa está sendo desenvolvido
em parceria com docentes da Universidade de São
Paulo (Profa. Dra. Cristina Dutra de Aguiar Ciferri
e Prof. Dr. Thiago Alexandre Salgueiro Pardo) e
Universidade Metodista de Piracicaba (Profa. Dra.
Marina Teresa Pires Vieira) no projeto de pesquisa
intitulado “Anemia Falciforme”.
O projeto de pesquisa “Anemia Falciforme”
Ambiente para analisar os dados da doença Anemia
Falciforme;
Visa extrair informações de forma semi-automática
de um conjunto de artigos científicos em formato
não-estruturado, armazenar estas informações em
um banco de dados relacional;
Após preparar um data warehouse para permitir
suporte a consulta analíticas;
Aplicar algoritmos de mineração de dados para
Roteiro
Título do Trabalho
Contexto em que se insere
Anemia Falciforme
Objetivo
O projeto de pesquisa “Anemia Falciforme”
Motivação e relevância
Detalhamento do Trabalho de Pesquisa
Cronograma Geral
Motivação e Relevância
O surgimento da mineração de textos (FELDMAN and
SANGER, 2007; JUNIOR, 2007; KAO, 2007, STAVRIANOU,
et al, 2007) foi motivado pela necessidade de se descobrir, de
forma semi-automática, informações (e.g., padrões e anomalias)
em textos (ÁLVAREZ 2007);
O uso dessa técnica permite recuperar informações, extrair
dados, resumir documentos, descobrir padrões, associações e
regras, além de realizar análises qualitativas ou quantitativas em
documentos de texto (MATOS, 2008).
Roteiro
Título do Trabalho
Contexto em que se insere
Anemia Falciforme
Objetivo
O projeto de pesquisa “Anemia Falciforme”
Motivação e relevância
Detalhamento do Trabalho de Pesquisa
Cronograma Geral
Roteiro
Título do Trabalho
Contexto em que se insere
Anemia Falciforme
Objetivo
O projeto de pesquisa “Anemia Falciforme”
Motivação e relevância
Detalhamento do Trabalho de Pesquisa
Cronograma Geral
Cronograma Geral
Atividade 1: Cursar disciplinas no segundo semestre de
2009;
Atividade 2: Estudos sobre conceitos básicos de mineração
de textos, recuperação e extração da informação, além de
processamento de linguagem natural;
Atividade 3: Acompanhamento das atividades do projeto de
pesquisa “Anemia Falciforme”;
Atividade 4: Levantamento bibliográfico sobre mineração
de texto para extração de informação de artigos científicos,
com ênfase no domínio médico e biológico;
Cronograma Geral
Atividade 5: Elaboração da monografia do Exame de
Qualificação;
Atividade 6: Preparação para o Exame de Qualificação;
Atividade 7: Desenvolvimento da proposta;
Atividade 8: Realização de testes e validação da proposta;
Atividade 9: Elaboração da Dissertação de Mestrado;
Atividade 10: Preparação para a defesa da Dissertação de
Mestrado; e
Bibliografia Inicial
ÁLVAREZ, A. C. Extração de Informação de Artigos Científicos: uma abordagem baseada em indução
de regras de etiquetagem. 2007. 131 f. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) –
Universidade de São Paulo - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação, São Carlos, 2007.
ARANHA, C. N.; PASSOS E. A Tecnologia de Mineração de Textos. Revista Eletrônica de Sistemas
de Informação. Rio de Janeiro: Ed. PUC - Rio, n. 2, 2006. 4p.
CHEN, H. (2001). Knowledge Management Systems: A Text Mining Perspective. University of
Arizona (Knowledge Computing Corporation), Tucson, Arizona.
CHEN, H., FULLER, S. S., FRIEDMAN, C., HERSH, W. Medical Informatics: Knowledge
Management and Data Mining in Biomedicine. Springer, 2005. 647 p.
FELDMAN, R., SANGER, J. The Text Mining Handbook: Advanced Approaches in Analyzing
Unstructured Data. Cambridge University Press, 2007. 391 p.
JUNIOR, J. R. C. Desenvolvimento de uma Metodologia para Mineração de Textos. 2007. 96 f.
Dissertação (Mestrado em Engenharia Elétrica) – Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, 2007.
Bibliografia Inicial
KAO, A., POTEET, S. R. Natural Language Processing and Text Mining. Springer, 2007. 259 p.
MATOS, P. F. Metodologia de Pré-processamento Textual Voltada à Extração de Informação em
Artigos Científicos do Domínio Biomédico. 2008. 116 f. Monografia de Qualificação de Mestrado (Mestrado em Ciência da Computação), Universidade Federal de São Carlos, Departamento de Computação, São Carlos, 2008.
POLICLIN. Anemia Falciforme. Disponível em: <http://www.policlin.com.br/drpoli/103/>. Acesso
em: 26 ago. 2008.
POPOWICH, F. Using Text Mining and Natural Language Processing for Health Care Claims
Processing. ACM SIGKDD Explorations, Volume 7, Issue 1, June 2005.
PROJETO SCA. Sickle Cell Anemia. Disponível em: <http://sca.dc.ufscar.br>. Acesso em: 5 out.
2009.
STAVRIANOU, A., ANDRITSOS, P., NICOLOYANNIS, N. (2007). Overview and Semantic
Issues of Text Mining. ACM SIGMOD Record, Volume 36, Issue 3, September 2007.
TAN, A. H. (1999). Text Mining: The State of the art and the Challenges. In Proceedings, PAKDD'99
