IBSP – Instituto Biológico de São Paulo - 1 laboratório de sequenciamento:
• Seção de Bioquímica Fitopatológica
IBu – Instituto Butantã - 1 laboratório de sequenciamento:
• Centro de Biotecnologia do Instituto Butantan
IAC – Instituto Agronômico de Campinas - 2 laboratórios de sequenciamento:
• Centro de Citricultura Sylvio Moreira
• Centro de Genética, Biologia Molecular e Fitoquímica FCFRP - USP de Ribeirão Preto da USP
Projetos que dão continuidade às pesquisas iniciadas pelo Genoma Xylella:
1. AEG – Agronomiacal & Environmental Genomes – representado em S-1 - setor 1.
2. GFX - Genoma Funcional da Xylella – representado em S-2 - setor 2.
Legenda - Projeto AEG - Agronomical & Environmental Genomes
FAPESP – Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo PGF – Programa Genoma Fapesp
ONSA – Organization for Sequencing and Analysis PGX – Projeto Genoma Xylella
AEG – Agronomical and Envirnmental Genomes USDA – United States Department of Agriculture XFV – Projeto Xylella fastidiosa das vinhas
LX – Projeto Leisonia xyli subsp. xyli da cana-de-açúcar
COPERSUCAR – Cooperativa dos Produtores de Açúcar e Álcool SASP – Secretaria de Agricultura de São Paulo
CCSM-IAC – Centro de Citricultura “Sylvio Moreira” do IAC IB-USP – Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo ESALQ-USP – Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiróz”
FCAV-UNESP – Faculdade de Ciências Agronômicas e Veterinárias da Universidade Estadual Paulista CBMEG-UNICAMP – Centro de Biologia Molecular e Genética da UNICAMP
Laboratórios 1 a 15 localizados em:
1. Instituto Agronômico de Campinas
2. Faculdade de Ciências Agronômicas - UNESP de Botucatu 3. Instituto Biológico de São Paulo
4. Instituto de Ciências Biomédicas 5. Instituto de Química
6. Universidade de Mogi das Cruzes 7. ESALQ
8. ESALQ
9. CENA – Centro de Energia Nuclear Aplicada à Agricultura –USP
10. FCAV-UNESP – Faculdade de Ciências Agronômicas e Veterinárias da UNESP 11. FCAV-UNESP – Faculdade de Ciências Agronômicas e Veterinárias da UNESP 12. Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto – USP
13. Instituto de Biologia – UNICAMP 14. Universidade Federal de São Carlos
15. Faculdade de Ciências Agronômicas e Veterinárias – UNESP de Botucatu
Legenda PGF - Projeto Genoma Funcional da Xylella
FAPESP - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo PGX - Projeto Genoma Xylella
GFX – Genoma Funcional Xylella USP – Universidade de São Paulo
UNAERP – Universidade de Ribeirão Preto FAT – Fundação André Toselo
IAC – Instituto Agronômico de Campinas UMC – Universidade de Mogi das Cruzes
UNICAMP – Universidade Estadual de Campinas FUNDECITRUS - Fundação para defesa da Citricultura UNESP – Universidade Estadual Paulista
IBSP – Instituto Biológico de São Paulo
SASP – Secretaria de Agricultura do estado de São Paulo ESALQ – Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiróz”
CENA – Centro de Energia Nuclear Aplicado à Agricultura IQ – Instituto de Química
Legenda - Genoma Xanthomonas axonopodis pv citri
FAPESP – Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo PGF – Programa Genoma Fapesp
PXC – Projeto Xanthomonas axonopodis pv citri
IQ-USP – Departamento de Bioquímica do Instituto de Química -USP
IC-UNICAMP – Laboratório de Bioinformática do Instituto de Computação - Unicamp FCAVJ- UNESP – Depto. Tecnologia e Depto. Morfologia e Fisiologia Animal
Faculdade de Ciências Agronômicas e Veterinárias de Jaboticabal - UNESP Laboratórios de sequenciamento e anotação de genoma:
1. Departamento de Bioquímica –IQ - USP
2. Departamento de Patologia /Laboratório de Biologia Molecular de Patógenos Aviários Faculdade de Medicina veterinária e Zootecnia – USP 3. Depto. Microbiologia do Instituto de Ciências Biomédicas – USP
4. Departamento de Tecnologia e Departamento de Biologia Aplicada à Agropecuaria
Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal – UNESP 5. Departamento de Microbiologia do Instituto de Ciências Biomédicas – USP
6. Departamento de Bioquímica – IQ-USP
7. Departamento de Patologia de Plantas – ESALQ-USP
8. Centro de Citricultura Sylvio Moreira – Instituto Agronômico de São Paulo 9. Departamento de Bioquímica - Inst. Química Araraquara –UNESP
10. Depto. de Genética - Faculdade Medicina de Ribeirão Preto – USP
11. Depto. Ciências Biológicas - Fac. Ciências Farmacêuticas Araraquara – UNESP 12. Centro de Energia Nuclear na Agricultura
13. Depto. Tecnologia e Depto. Morfologia e Fisiologia Animal Faculdade de Ciências Agronômicas e Veterinárias de Jaboticabal
Legenda - Projeto Genoma Cana - Fapesp - EST Sugar Cane Project
FAPESP - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo SUCEST - Sugar Cane EST Project (Genoma Cana)
COPERSUCAR - Cooperativa dos Produtores de Açúcar e Álcool
CTI-UFPE - Centro de Tecnologia da Informação - Universidade Federal de Pernambuco ONSA- Ornanization for Sequencing and Analysis
CBMEG - Centro de Biologia Molecular e Genética - UNICAMP
ICU-BIOINFO - Instituto de Computação- UNICAMP - Laboratório de Bioinformática UFAL - Universidade Federal de Alagoas
USP - Universidade de São Paulo
UNAERP - Universidade de Ribeirão Preto UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro UNESP - Universidade Estadual Paulista UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina IPA - Instituo Tecnológico do Pará
UMC - Universidade de Mogi das Cruzes UNIVAP - Universidade do Vale do Paraíba
PUCPR - Pontifícia Universidade Católica do Paraná UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte UFNF - Universidade Estadual do Norte Fluminense IAC - Instituo Agronômico de Campinas
UFSCar - Universidade Federal de São Carlos LNLS - Laboratório Nacional de Luz Síncroton
Grupos de Data-mining - DM precedidos de um algarismo, que indica o número de grupos de pesquisa em uma mesma instituição.
Duas letras que identificam o grupo de pesquisa na base de dados da Fapesp.
Legenda - GHC - Projeto Genoma Humano do Câncer
ILPC - Instituto Ludwig de Pesquisas Contra o Câncer - Seção brasileira GenBank - Banco internacional de dados em genômica e proteômica Unigene - Banco internacional de dados em genômica e proteômica
EMBM - European Molecular Biology Net - Banco internacional de dados em genômica e proteômica NCBI - National Center for Biotechnology Information
TIGR - The Institute for Genomic Research GCC - Projeto Genoma Clínico do Câncer UNICAMP - Universidade Estadual de Campinas FMUSP - Faculdade de Medicina - USP
USP-RP - USP de Ribeirão Preto
UNIFESP - Universidade Federal Paulista IQ-USP -Instituo de Química - USP
CEPID - Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão
HTVI - Projeto Trancriptoma de Genes Expressos do Câncer de Câncer Human Trancript Validation Initiative
ILPC-I - Instituto Ludwig de Pesquisas Contra o Câncer Internacional ICRF - Imperial Cancer Research Fund
Iowa-U - Universidade de Iowa OSC - Outside Sequencing Centers - centros de pesquisa que vão progressivamente aderindo ao projeto.
Legenda – Projeto Rede Genoma Brasileiro - PGB – Sequenciamento da bactéria Cromobacterium violaceum
1. Laboratório de Biologia Molecular/INPA-AM
2. Centro de Apoio Multidisciplinar/Universidade do Amazonas 3. Laboratório de Polimorfismo de DNA/Universidade Federal do Pará 4. Laboratório de Genética Molecular/Universidade Federal de Alagoas
5. Laboratório de Biologia Molecular/Universidade Estadual de Santa Cruz - Ilhéus-BA 6. Laboratório de Moléculas Biologicamente Ativas/ Universidade Federal do Ceará 7. Departamento de Biologia/Universidade Federal Rural de Pernambuco
8. Laboratório de Mutagênese/Universidade Federal do Rio Grande do Norte 9. Laboratório de Biotecnologia Genômica/Universidade Católica de Brasília 10. Laboratório de Biologia Molecular/Universidade de Brasília
11. Laboratório de Biologia Molecular/Universidade Federal de Goiás
12. Centro Nacional de Pesquisas de Milho e Sorgo/Embrapa-Sete Lagoas/MG
13. Laboratório de Biodiversidade e Evolução Molecular/Universidade Federal de Minas Gerais 14. Laboratório de Genética e Bioquímica/Universidade Federal de Minas Gerais 15. Núcleo de Análise de Genoma e Expressão Gênica/Universidade Federal de Minas Gerais
16. Laboratório de Metabolismo Macromolecular/Universidade Federal de Rio de Janeiro 17. Instituto Nacional de Câncer/RJ 18. Fundação André Tosello/Campinas-SP
19. Departamento de Biologia Celular, Molecular e Bioagentes Patogênicos/Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto/USP
20. Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais/PUC-PR
21. Departamento de Bioquímica/Universidade Federal do Paraná 22. Centro Nacional de Pesquisas em Soja/Embrapa-Londrina-PR
23. Departamento de Microbiologia e Parasitologia/Universidade Federal de Santa Catarina 24. Laboratório de Genética e Biologia Molecular/PUC-RS
@
LE
Rede Genoma Regional
1. Projeto em Rede do Centro-Oeste: Genoma Funcional e Diferencial de Paracoccidioides brasiliensis 1.1. EMBRAPA Gado de Corte
1.2. EMBRAPA Pantanal 1.3. EMBRAPA Arroz e Feijão 1.4. Universidade de Brasília – UnB 1.5.Universidade Federal de Goiás – UFG
1.6. Universidade Federal do Mato Grosso – UFMT 1.7. Universidade do Estado de Mato Grosso – UNEMAT 1.8. Universidade de Cuiabá - UNIC
1.9. Universidade Federal do Mato Grosso do Sul – UFMS 1.10. Universidade Estadual do Mato Grosso do Sul – UEMS
1.11. Universidade Para o Desenvolvimento do Estado e da Região do Pantanal – UNIDERP
2. Rede Genoma do Estado de Minas Gerais - Genoma expresso do Schistossoma mansoni 2.1. Universidade Federal de Minas Gerais – UFMG,
2.2. Universidade Federal de Ouro Preto – UFOP 2.3. Universidade Federal de Viçosa – UFV 2.4. Universidade Federal de Lavras – UFL 2.5. Universidade Federal de Uberlândia – UFU
2.6. Centro de Pesquisas Renê Rachou – CPQRR/FIOCRUZ 2.7. EMBRAPA Milho e Sorgo
3. Genoma do Nordeste – ProGeNe -Seqüenciamento de Leishmania chagasi 3.1. Universidade Federal de Alagoas – UFAL
3.2. Universidade Estadual de Feira de Santana – UEFS, Universidade Estadual de Santa Cruz – UESC 3.3 Universidade Federal do Ceará – UFC
3.4. Universidade Estadual do Maranhão – UEMA 3.5. Universidade Federal do Maranhão – UFMA, 3.6. Universidade Federal da Paraíba – UFPB 3.7. Universidade Federal de Pernambuco – UFPE 3.8. Universidade Federal Rural de Pernambuco – UFRPE 3.9. Empresa Pernambucana de Pesquisa Agropecuária – IPA 3.10. Universidade Federal do Piauí – UFPI
3.11. Universidade Federal do Rio Grande do Norte - UFRN
4. Programa Genoma do Estado do Paraná - Genoma estrutural e funcional da bactéria fixadora de nitrogênio endofítica Herbaspirillum seropedicae
4.1. Universidade Federal do Paraná 4.2. Universidade Estadual de Londrina 4.3. Universidade Estadual de Maringá 4.4.Universidade Estadual de Ponta Grossa 4.5. Instituto Agronômico do Paraná, 4.6. EMBRAPA Soja
4.7. EMBRAPA Agrobiologia 4.8. Universidade de São Paulo
4.9. Universidade Federal do Rio de Janeiro 4.10.Universidade Federal do Rio Grande do Sul
5. Rede Genoma do Rio de Janeiro – RioGene: Genoma da bactéria Gluconacetobacter diazotrophicus 5.1. Universidade Federal do Rio de Janeiro – UFRJ
5.2. EMBRAPA Agrobiologia
5.3. EMBRAPA Recursos Genéticos e Biotecnologia 5.4. Laboratório Nacional de Computação Científica – LNCC 5.5. Universidade Estadual do Norte Fluminense – UENF 5.6. Universidade do Estado do Rio de Janeiro – UERJ 5.7. Universidade Federal do Paraná – UFPR
5.8. FAPERJ 5.9. FAPESP.