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Dinâmica molecular

PMEMD-HW : simulação por dinâmica molecular usando hardware reconfigurável

PMEMD-HW : simulação por dinâmica molecular usando hardware reconfigurável

... Por fim, o artigo mostra que algoritmos baseados em grade são interessantes para mapear a função de Green, necessária para o cálculo das forças de Coulomb. Esse mé- todo, chamado Multigrid, é visto em diversos artigos ...

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Interação de nanotubos de carbono e cadeias de polifluoreno: Dinâmica molecular e...

Interação de nanotubos de carbono e cadeias de polifluoreno: Dinâmica molecular e...

... A dinâmica molecular nos permite explorar o espaço de fase do sistema devido a sua ergodicidade, ou seja, a média temporal das configurações que o sistema adota ao longo de uma simulação de dinâmica ...

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SIMULAÇÃO, POR DINÂMICA MOLECULAR, DAS INTERAÇÕES ÁGUA-ETANOL-NaCl COM FOSFOLIPÍDEOS DE MEMBRANA

SIMULAÇÃO, POR DINÂMICA MOLECULAR, DAS INTERAÇÕES ÁGUA-ETANOL-NaCl COM FOSFOLIPÍDEOS DE MEMBRANA

... Eritrócitos, hemácias ou células vermelhas do sangue, são células únicas dentre as células de mamíferos. São isentas de organelas e núcleo, contendo em seu interior hemoglobina, circundada por uma membrana celular. ...

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Análise de dados de desnaturação proteica obtida por simulações de dinâmica molecular

Análise de dados de desnaturação proteica obtida por simulações de dinâmica molecular

... 17 Todos os aspetos importantes relacionados com as simulações de dinâmica molecular estão relatados em [Brito 2004]. O objetivo deste trabalho é, não só expor todos os detalhes destas simulações, mas ...

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Estudo da estrutura e dinâmica molecular em filmes de polifluorenos e correlações...

Estudo da estrutura e dinâmica molecular em filmes de polifluorenos e correlações...

... Na prática, esta metodologia é implementada associada à rotação da amostra em torno do ângulo mágico. Dessa forma, é obtida alta resolução do espectro, definindo as linhas de cada grupo químico presente no polímero. ...

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Estudo das interações de peptídeos antimicrobianos e sistemas miméticos de membrana por dinâmica molecular

Estudo das interações de peptídeos antimicrobianos e sistemas miméticos de membrana por dinâmica molecular

... por dinâmica molecular mostraram que os peptídeos de Jeleína I tendem a formar agregados que se assemelham a pequenas esferas em grupos de quatro moléculas de peptídeo e que agem dessa forma sobre o ...

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Simulação por dinâmica molecular de óxidos alcalino-terrosos

Simulação por dinâmica molecular de óxidos alcalino-terrosos

... de Dinâmica Molecular para simular e ob- servar os efeitos da temperatura e da pressão hidrostática sobre os óxidos de cálcio (CaO), estrôncio (SrO) e bário ...variável dinâmica, o que nos propicia o ...

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Estudo espectroscópico da dinâmica molecular e empacotamento em semicondutores o...

Estudo espectroscópico da dinâmica molecular e empacotamento em semicondutores o...

... da dinâmica molecular de grupos específicos em cadeias poliméricas com diferentes ...agregação molecular, a estrutura e a dinâmica desses ...peso molecular não foi possível obter ...

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Simulações por dinâmica molecular de compostos do tipo ABO3 (SrTiO3 e CaTiO3)

Simulações por dinâmica molecular de compostos do tipo ABO3 (SrTiO3 e CaTiO3)

... Um método mais abrangente, denominado por Dinâmica Molecular (DM), gera o espaço de fases de um sistema a partir da solução numérica das equações de movimento. As primeiras simulações foram desenvolvidas ...

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Dinâmica molecular e formação de domínios em copolímeros em bloco estudados por RMN...

Dinâmica molecular e formação de domínios em copolímeros em bloco estudados por RMN...

... Como discutido anteriormente, quando o sistema de spins é tirado da situação de equilíbrio ele fica sujeito ao fenômeno da relaxação, que é descrito por decaimentos observados em RMN. Os tempos de relaxação carregam ...

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Estruturação do Eumenine Mastroparano por dinâmica molecular em misturas de TFE-água

Estruturação do Eumenine Mastroparano por dinâmica molecular em misturas de TFE-água

... O tetradecapeptídeo Eumenine mastoparano – AF (EMP-AF) extraído do veneno de vespa, em solução aquosa contendo trifluoretanol (TFE) mostra conformação helicoidal anfipática de acordo com os dados de Ressonância Magnética ...

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DINÂMICA MOLECULAR NO ENSEMBLE CANÔNICO

DINÂMICA MOLECULAR NO ENSEMBLE CANÔNICO

... de Dinâmica Molecular, precisamos usar a variável tempo em sua escala real e não virtual, lembrando que na abordagem real possuimos a desvantagem de trabalhar com equações que não são mais canônicas, como ...

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Estudos computacionais de esfingomielinases D: docking, dinâmica molecular e métodos híbridos QM/MM

Estudos computacionais de esfingomielinases D: docking, dinâmica molecular e métodos híbridos QM/MM

... Esfingomielinase D (SMase D) é uma enzima conhecida por catalisar a clivagem de esfingomielina em ceramida-1-fosfato e colina, atividade presente apenas em aranhas do gênero Loxosceles (aranhas marrom) e em bactérias ...

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Dinâmica molecular semi-quântica com aplicação em moléculas diatômicas

Dinâmica molecular semi-quântica com aplicação em moléculas diatômicas

... Todos os m´etodos num´ericos de integra¸c˜ao s˜ao baseados em algoritmos de diferen¸cas finitas que resultam da discretiza¸c˜ao do tempo. Em dinˆamica molecular, o c´alculo das for¸cas s˜ao bastante complicados, o ...

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Dinâmica molecular de sistemas iônicos poliatômicos: modelos polarizável e não-p...

Dinâmica molecular de sistemas iônicos poliatômicos: modelos polarizável e não-p...

... Mulliken propôs quc, dadas duas espécies, "a" e "b", a energia necessária para "a" retirar um elétron de "b" é Ib - A a, onde I e A são o potencial de ion[r] ...

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Integração geométrica e uma aplicação à dinâmica molecular

Integração geométrica e uma aplicação à dinâmica molecular

... dinˆamica molecular, tˆem sido propostos e implementados ao longo dos anos algoritmos alternativos - passam por m´etodos multipasso, tais como os m´etodos Gear expl´ıcitos, e pela fam´ılia ...dinˆamica ...

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Estudo da fusão de superfície da prata por dinâmica molecular

Estudo da fusão de superfície da prata por dinâmica molecular

... A fus˜ao de superf´ıcie foi prevista teoricamente cerca de 30 anos antes de ser observada experimentalmente. Com o desenvolvimento de computadores mais velozes e com maior capacidade de processamento e da elabora¸c˜ao de ...

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Dinâmica molecular no núcleo de Trypanosoma cruzi

Dinâmica molecular no núcleo de Trypanosoma cruzi

... O modo como se formam os sítios dos diversos processos nucleares, incluindo a replicação do DNA, está começando a ser esclarecido. Dois modelos têm sido propostos: modelo determinístico e auto-organização do núcleo. No ...

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QuimFisica3Cap2 (Dinâmica Molecular das Reações)[Aula]

QuimFisica3Cap2 (Dinâmica Molecular das Reações)[Aula]

... • Dinâmica das Colisões Moleculares: Colisões Reativas; Superfícies de Energia Potencial; Alguns Resultados de Experimentais e Teóricos.. – Catálise Homogênea & Heterogênea..[r] ...

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QuimFisica3Cap2 (Dinâmica Molecular das Reações)[Aula]

QuimFisica3Cap2 (Dinâmica Molecular das Reações)[Aula]

... ➔ Termodinâmica Estatística Termodinâmica Estatística: Realiza a ligação entre as propriedades macroscópicas (termodinâmicas) e as propriedades microscópicas (quanto-mecânicas). ➔ A c[r] ...

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