REPOSITORIO INSTITUCIONAL DA UFOP: Localização física do BAC clone AL 619337 no genoma de Schistosoma mansoni utilizando a técnica de FISH (fluorescence in situ hybridization).

!

"#

$

%&

'()**+ %

&% , $&

-

%$

. %

$&

/ 0

1

2 3 4 4

2 5 6 / 7

2 5 /

!

"

#

$

%

#

&

! "#!$ % &' (

)

*

+ $

!

, $

-$ "

.

$

, & , $ % 0 $ % % $

$ /

, - . , . / 0 1 23$ % %

% 1 / $ $ % 2 %

&- $ * /

, $ % $

/ ! % 3 $ & %

-3 % /

, - 4 % 567 $ 8 % 59 8$59 8

,: - 6 $ - 0# - % %

0 % % 3

% /

, 63$ % % % / !

% &- /

, , , $ - - ;- ,

-, <- * - 0 - = - = - > - ? - ? $ - ? - $ - 3 $

-" <- - @ - A - % + %

% & /

, - % 467 ' %38 56B B 8 %

$ % % % & /

, 1 ! $ 1 $ C - D - D -

-3 1 - = - > - ? - - % $<- % + $ % 0

3 % / , & $ % $ ,

? $ % % 1 3 $ % %

/ , , % 0 3 $ % % $ %

% % %

+ $ % $ %

% % / , , " - 1 $ 60

$ % % $ % % $ % %

&-/ , .1 ! $ % % 1 +

&-$ % % 3 % + / , = %

% % &- + &- $ % % & %

+ / ,0 3 $ % + &- %

2 % % & / , % % $ %

+ % 0 3 / , * % + $ % 0

3 /

, % ! $ . , . ? $ . , . '

-. , -. 0# $ - . , . , $ #$ % $ - . , . 3 - . , .

9 % - . , . - . , $ - . , . " ! - . , .

% 0 3 $ % % % $

% + &- %

6 0 $ % /

7 8 0 4 8 % 0 &- %

&- % 1 /

, ? 2 7 1 $ - % 3 $ % $

-% + % &- /

, ? 2 7 1 $ $ % ? $ =

& 59 8 % % % +

&-/ , % + 3 / , - >3 - ?< -

-9% - ) # % 0 3 /

, ? 2 7 ' $ % 3 - , - = $

-? - 3 $ " 2 % 0 3 % + /

, ? 2 7 $ % 0 - %

, ? 2 7 & $ - % $ - ,

-* - % 3 + /

, 2 ! & 3 - - $ - - " $ - 0 "

% 3 + /

, - - , - -

-$% - 0 2 - ? - ? - ? - $ - " 9 % % $

% + % 3 /

, . , * % E % % $ % % 1 %

$ 6 0$ % + / ,

! ! 99 " # 9 : ;$ % ,

% % 1 0 * + &- $ & ?

-% 0 3 /

, ? 2 7 ! *', +(& *$ % * ,

,#2 - " ! % 0 &- % % % %

% 0 % + &- /

, , ? 2 7 $ !""+&' "() 10 %

6 $ - % % + &- / , ,

? $ ,# < % 0 % &- 8/ $

% &- % + % % 2 % 6 %

&' /

, , % 2 &' % * %

3 $ 1 %

+ &- % + % % + /

? 2 7 # $ !""+&' "() 10$ % , 3 %

&- $ % % % + / , 9 $ - 3 $ " %

&' % 0 % % + / ,

8 % %

3 &- $ + $ % +

<

F

$

3

?

9 2

...;

?

&

...;

?

2

...;

"

...;

2

$ ...;

'

'

...

(&( ) * + ! &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&', (&, ) &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&'-(&- ) &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&'. (&/ ) + 0 &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&'1

(&2 ) + > 3

45 6 ) 6 7 89&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&(( (&. ) # " &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&(/ (&1 ) * 0 :5; 4< ;= > ?9&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&(.

(&@ ) * A > 6* > 0

<

B

''

2:

...

,-,&( ) 3 &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&,/ ,&, ) 3 + "C &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&,/

'''

#

...

-&( ) 5 * > &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&,. -&, ) * D !E * ,* &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&,.

-&- ) # C$ + 5 $

&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&,. -&/ ) AF C$ &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&,@ -&2 ) G &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&-(

-&. ) > 0 < ?&&&&-,

-&1 ) +B 6* * 4#*H: I+ 9&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&---&@ ) * 6* B " &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&-/ -&J ) # 6* * &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&-. -&(' ) 6* # &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&-1 -&(( ) F C$ &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&-1

<

B

'6 "

...

/&( ) 5 * &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&/-/&, ) * D 5 !E * ,* &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&/1

/&- ) # C$ + 5 $

&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&/J

/&/ ) G &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&2( /&2& ) > 0 < &&&&&&&&&&&&&2-/&.& ) +B 6* * 4#*H: I+ 9&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&22 /&1& ) ; > 4 :5;9&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&2@

6

, $

...

6'

$

G ...

1-6''

$ ...

6'''

B $ ...

.

B

?

9 2

?@ % A& A >

&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&-,

A& ) I * >

0 :5;&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&& /2 /.

A& ) D !E "

,-'-2J2 ! * ,* C 2(

A& >I

"

B

?

&

?@ %

@89 () &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&'2

@89 ;) I ! $ C"

&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&,,

@89 * I ! $ 0

$ C B F C$

&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&-(

@89 = ) I ! $ D !E "

* ,* ,-'-2J2 &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&2'

@89 B) $C F 0

3 D

C &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&2,

@89 ') I ! $

&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&2-@89 +) I ! $ C K

&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&2.

@89 C ) C D >

"

B

@89 ) * ' @L + " "!

6* * ,* B " C &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&2J

@89 (<) $C

C : "

AM# 5 H2( !

C &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&.(

@89 (() $C

C : " 4 :9 N+:55O

*H: ; G !

,

B

?

2

* I ) I : * $ ) <* =

= D I ?

!II ) ! I 0 I D

6* ) P B 0

6G ) B " G C

G ) B

+5G ) + ! 5 !E G ) <+B 5 ! G ?

+ G* ) P + 0

+# A A + # ) <+ # =

A =?

: I N ) 7 >

:5; ) ;= >

:G ) : " ) < : D = ?&

Q ) Q ) ('

-A:6+ ) + : 5 !E A

AGI I G A

# ) # ) ( RA

# ) # ) ('.

# ) #

) #

) # ) ('-A

# ) # ) ('-#

I6* ) I6*

6* ) 6*

µ ) # ) ('.

,

B

µ#) # ) ('.#

6 : 6 : C S ) <6 C

D = : C ?&

) 6 ) ('J

I ) T A ) < I ?

I ) I ) < = D I ?

: ) :

)

; ) ; K

R ) U

I6* ) P I 0

I A ) C G D I ) <I

A D = D ?

I6* ) I6* K

5 5 ) 5 C 5

5 ) 5

5:6+ ) + I : 5 !E ) <5D :

5 ! ?

5 6 ) I ) <5 D 6 7 8?

5I5 ) 5 !E I 5 ) <5 I 5 ! ?

55I ) I S 5 !E 5 ) <5 5 ! I ?

5GI ) 5 !E I ) <5D G I 5 ! ?&

G+ ) G G + G*

G: I ) : ! ) <GD : C I D?

G ) G D B

)

U6GI ) 6V U $ I S ) <U 6 C G

I ?

,

B

W; ) > # 5 V ) <W ; D > ?

9

B

"

* + ! 0 D < D > ? <

X$ ? < D ? 0 K C

! C " $ "

& Y 0 &

F K "

C 3 !E

& * C 3 C

!E 6* Z B !E &

3 C"

& + > C" C

6* K * M*

0 :5; 4 9 0 C F &

6 D 6* * *A.(J--1 * ,* C

C > 0 :5;&

,@ D C 3 D

V 0 C$ F & > 3

C C : ! C$ C

0 3 * :G D > C

> D

B W $C C & 6 C

D B N ! 6* > 0

"C C & G D > C S

& G C S C Z C

! S

,

B

2

$

GD D= 6*

C > = :5; = C D =& GD C C

D = & G 7 D D * 6*

7 D = :5; D ! D 7 8& GD * 6*

7 = D = (/ G = C

= D Q 7 = & D 7 =

C D = = & GD 7 C B

D & GD * 6* 7 D= > D

D D 7 7 D C D

D= > 7 D * :G 3 & D 7

7 D : D C D 7

C = D &

7 C D C= D D & W 7

D D C C D D = C

D & GD : :G C 7 3 D

= 7 C &GD 7 D D D

D C D D W D C D

D D D N C D D D 7 D D

> * C C 6*&W D D 7 8 7 D

D D= 6*

> = :5; C D 7 & *C D ! C D

C D 8 7 C D ! > & : 7 D

D D= C D C C D C

&-(

&-,

(5(5 #D& - # &9 # $ #E8 #- ## , #&

+ $ D ! 0 D

< D > ? < X$ ? < D ? 0

F K V V " $

C $ # $ & [ K C

& *C " $ "

4W; (JJ-9&

# .'' DS $ $ C0 1/

" B C &

,'' DS C 4777&7D & R R D R &D 9& 6 0

$ ! B (, DS C

! 2''&''' (&'''&''' C C 4Q > (J@J95*

C ! D $ 0

5 %

! " & * ! 0

! & + 0 ! 0

0 C D 4# # (JJ-9&

* ! V V $ "

0 ! 0

$C & + D 3 K 0

& + C

!E C 4W; RG I ,'',9& Q >

(J@J # !

C ! !

& # ! C $

D S

&

-U$ $ !

> " 0

C > 0

! " C > & 0

0

" ! S

D &

(5;5 9 #

-0 0 !

C B C & # " 0

$ $ " & 5 0

B C B D

D C C B 3 ! $

D $ & * C ! D

$ C ! D C $ !

& * D C

! K & + 1 &

D $ C C

D C ! C B Z B 0

& * 0

& C

0 D > -''

4U (J@(9& * C

3 C > !

D C

&-/

4 > ,''-9& 0 ! $

C " & + C 3 ! $

C :& :

(2' ,'' :: ! F

3 $ ! $ C D

! > (&

@89 ( ) ) F # C > (\

, 9 "$ $ ;\ "

D $ *\ $ %

&#D 9 #- ,!&: D9 ,?9 & #& 8%$?9 S =\ A

C &9 ?9 $ B\ $ D

C G ,&, '\ $ ! C

&-2

&#E8 #- ##H,8 +\ ! K 99&%-& # %@I"%& C\ # 0

D $ 0 C J\

B 0

C" 0 ('\ A

C & A C !

C C D &

(5*5 &% , $

6 0 !

4, ](.9 K (

B 45D ^ # > (J.'\ 5D (J1J9&

0 ! C 0 D 0

NW D 0 D 0

NN 45D ^ # > (J.'\ 5D ^ (J@(9&

+ B , 1 B ('@ / @L

!E 6* (''' \ -2 /'L

!E 6* 0 B ('' \

!E 6* V 45 (J@,9&

+ > 6*

45 (JJ/9 I+5G+5 $

4 6 ,'''9 + ! 5 !E G

4<+B 5 ! G +5G ?9 B

C > 4U 3 8 ,''-9&

C 0 > ! B (/''' B

& + 1,'' B 2'L B !

C & 5 C C 0 >

&-.

C !E & $

! " !

C D !E "

! 0

V &

(5=5 &#-8$ $ F 9 A $ $& @&%.- $

C K "C 0

D ! C

& C C

3 D

>

!E "C 4# # ^ ;

(JJ-9&

* 0 C > C >

0 & + (/

> D 4(J@( 9 > !

C C D $ &

(@ < ? C ) C

C > $ C & +

D 0 C C

C S $C

4 D (J@( \ 6 (JJ,9& !

B & V

> > C 0 C (/ -/

&-1

+ :+#5* >

C C C C

! & + 0

K 4< ?9 C > C F

Z 0 "C & C ! C

" C C $ ! " !

" C

C 45D (J@-9&

0 # C F

0 > !

! C K

C & * $

6* B !E < ? !

C !E 45 (J@,9& *

0 < ? > !E 6*

D > 6* K

6* C & + B

I6* K 4 I6*9 45 (J@/9& < ?

0 (' Q B B ('' >

D & * C 0

I6* 2&@ (@ ,@ ! S C

6* 45 (J@/\ U Q

(J@29& * C " K 0 C

B ('L D D

" F B K 45

(J@/9& * 0 < ? C > C

B $ 4W (J@J\ 7 (JJ2\ _ 8

&-@

C S 6* C B

C C

S & + S

I6*4 9 ! S D $ D

45 (JJ(9 0 6* 4 6*9 ! 0 D D

4 (JJ(9& 0 I

4 I9 ! C 6*

"C > > 6* 45 8 (J@2\ # ^

(J@19 C B

0 C & * > 6* /1.

V C

W( 4W (J@J9 4(JJ(9

0 I ! C > " 0

C !E ! $ B

$ & T$ 3

0 C > 0

I & G 0 " * I

I* 4<I * C D 6*?9 4(JJ-9& 6 C

> S C 0 > S $C %

4 U > 9 4 9 # 46 0 9

4 S 9 ! 4 D 9 ! C

C & # J'L > C

C C ! > C 0 !

C C & T$ C K

C !E C D 4 ! J'L9 -''

$ !E

C & + 0 6

&-J

C > 6* Z B

0 C 4 D (J@( \ 5

(J@/\ U Q (J@2\ # D (J@/\ U (JJ(9&

* $ C D 6* C

B

0 4 (JJ(9 I C ! >

4A ,'''9& # 6*

D C

4 (JJ29 6* B D

!

C 0 6* 4T (JJ19

C 0 6* < ? 3

S , . !

0 > " 6*

4 ^ W (JJ.9 > $ C !

0 $ 45 (JJ.9&

I 4,'',9 S A+

I& 6 C C .,, < ? 0 /@1 !E

& . S C

C & C

" A+ B "

D 3

D & : " A+ 0 V $

C ! ! !

B A+& + D

F B F C

0 Z I

&-('

* C > C $

" 0 &

D

" ! S Z

D ! &

(5B5 &#-8$ $ &% , $& > 9 J&- &% , $ 0 >

&% ,& &-K 9L1

6 0 J' D $ 3

&

V !E ! 0

4 (JJ19 # 4# 7 (JJ19 0

4 (JJ@9& #

D$ V ! 3 > 0 3

; 4<; 3 ) ; ?9 ! "

4 ,'''9 C

D ! $ C &

! D !

! C !

C > B

C 0

B ! 3 C !

! B C C 3$ B &

" 3 ! C

& G % !

B C N W

&-((

4 7 D (JJ@\ # > (JJ-9& * 0 C > $

% C

4G 8 (JJ/\ G (JJ,9 ! K

> ! C $ C 0 45 (J@,\

# 7 (J@J\ T D (JJ-\ # # (JJ-9&

D C (JJ,

! ! C 3

4< 3 ) 5 ?9& 5

> # 5 V 4<W; R 6 RW 8 5 C

I D?9 G G 4<G G

) G I?9 0 ! $ " ! Z

& C

! " $ 4 ,'''9&

0 ! C

D > $ 3 !

C & + C

S ! " \

$ K 6* B >

> C \

0 C B 0 ! C

D 4T D (JJ-\ A 7 ^ T D (JJ29 ! > $

\ Z C 3

D C 4W ^ T D (JJJ9&

* C 3 C > !

0 " 4 # (JJ-9&

C ! 0 4W ^ T D

(JJJ9%

(& * \ ) $ 6* $ $

&-(,

\ ,& C $ )

!E 6* "

C 0 C S Z $ Z

\ -& : 3 !

" !E

6* \ /& I > C"

) > K C

6* 0 ! C C

D & G

> C $

&

: C 0

! !E ! 3$ > & *

+ ! 5 !E G 4<+5G ?9 4

,'''9&

* C K ! &

(.-&''' +5G C & *

!E -'&J@@ S +5G

% 5 !E +5G 4

+5G ! ) 5 *+ `9 C !

B J,L & * $

5 *+ ! 11L "

C (L 3$ D ,'L

3$ D 22L C D 4U 3 8

,''-9&

* : ! 4G: I ) 5*9 C

3 (-# !E K " B

&-

(-0 ! 0 !E &

+ C @# !E " 6*

C S * *

4D %RR777& & R R ,8(R (R9&

T$ : 5 : > !E

* 0 ( (# &

4D %RR777& & & 8R 3 R5a R9&

> 5 6

C"

K C 6* * &

* > > D > S

& >

K * >

C 4< ;= > ? ) :5;9

* C" 0 $ B 3

0 C ! C 4W D (JJ,\

(JJ-9& # $ ! C C 3

D % &

5 6 C 3 0

0 C" 4W ^ T D (JJJ9 Z >

0 Z !E &

(5'5 D& ,&%- "# $ &% , $

,1'# 0 ! !

3$ !E !E D$

"C 0 " $

&-(/

0 & "

!E B

$ 4W ^ T D (JJJ9&

$ C"

C 6* ! >

& M* 4<M * C D ?9

> C 6* $

4: (JJ'\ (JJ,9&

* C 6* K

D 0 -2' Q M* C > & + C

D > C "C α

5 (J@J C$ 0

D > C 4< ;= > ? ) :5;9

4G 8 (JJ29& C !E 6*

I6* 0 >

! 6* ! 0 &

3 C >

C" C !E M*

C " C 6* $

D 0 (''Q * 4< * C

D ?9 4A ,'''9& +

B >

M* & + ,-&@'@ *

J-!E B * D <C !E ?

B /'' C $

& * C

C ! ! !E /2L

&-(2

!E C " α45

(J@J9 +5G !E &

3 * C Z > K

0 :5;& C > I6*

, " !E (@5 I6* B & *

$ ! C

!

> > C " & !

$ > C" C 0 :5;

C $C >

C " Z &

(5+5 -. % $& / 0M 8 9&# &% & /NA9 $ - %O1

> 0 D >

K 0 ! 0 0

" K

! " C $ C

B 45D ^ # > (J.'9& B D > I6*

6* C I6* B 0

45 D ^ (J.@9& ^ (J.J T D (J.J

D " > >

K 6* 0 !

D" I6* 6* > 0 0 & *

C " C B 0

< ? $ K 0 & 6 B I6*

> 0 D > 6*

&-(.

* > D" $ 0 6* K

V !E

K "C & $ S 0

> K !E 6* D 4T

^ (J1(\ (J129 4T (J1-\

; ( * 7 (J1.\ # D (J11\ (J1@9 >

K 6* "C 4 ^

(J1'\ *D ^ 6 3 3 (J1/\ 8 ^ 8 (J@'9 >

K !E I6* D 4; (J1,9

0 4+ ^ I (J129 > K

D α D 4M (J1@\ D (J@(\

; (J@(9 α β 4; (J1@9

" 0 "C " 4#

(J1,9 5U/' 45 (J1.9 ): 4; (J@(9 >

K "C 6* C

4I (J@(9 0 > I6* 4;

(J1-9 D > S &

V B V "

$C C D > S & +

D 3 D Z C D" 6*

K D > > !E

B V 0 0 C

! 6* C !

D > B 0

4; (J1@9& 3 >

C " $ C

> S & 6 D $

&-(1

! !E "C

4 D (J@(\ ; (J@(9&

C S 0 C

D > ! 0 C

D > D > C > &

6 ! "C 6*

B 0 F

6* K $

C D > 4; (J@,9&

* $ D ! 6* I6* >

# # " 0

6* # C 0

:(,2 ;- I6*

* & " β B

C C $C !

F $ & + C

"C & * 0 0

C C !

B C D > & + 0

! !

! $ B

! D & * 0

C !E 0 C >

D > C$ &

C C > D > C

C C I6* 6*

& * B 6* "

2 C > 0 4 (J@( 9 C >

&-(@

4 (J@( 9& 6 C C I6*

C D > & C C

$ Z D" I6* 6*

K F

C & * 0

C C 4U 3 Q

(J@,9& + I6* 6* 0

" 0 &

C > C C "C

D" I6* R 6* K 4I 8 (J119&

B 6*

C C 3 C C 4; (J@J9&

* C 0 / >

4< ? , 9

$ C > $ &

> :5;

C !E C C Z

0 3$ B ! >

C$ C & > S

K :5; C > !

0 * 46 8 ,'''9

F $ D 4N (J@J9

F V !

-4 7 ,''(9 +

0 4Q ,''-9 F

D 4 (JJJ\ : ,'',9 45 > 8

,''(9 > 4 D ,''(\ D ,'',\9 4# & (JJ@9

4T 8 ,'''\

&-(J

5 (JJ@9 4M ;& ,''-9 4: D ,''-9

4Q 8 D ,'''9 4I 8 ,'''\ # C (JJJ\ ;

(JJJ9& V C !E

> C 0 &

* 0 :5; C

K D & B !

,, D ! "

U C 6* B V

6* ! 0 "

< ? K 45D 8D ,'''9& ! ((

5" T C :5; C

> B Z 0 =J-/ '- Z

B =(-- '. 4G CC (JJJ9& * C

D 45#69 0 K !

C C " C C &

5#6( V

5#6, ! C " D Z! C 5#6(&

B" 0 :5; C " > ! V 5#6,

4U (JJJ9&

U$ S K C C

0 3 > :5;

4W 8 (JJ@9& + D 0 > !

S C > 0

0 " & * 0 C

! 0

& ; 3 " <8 ?

$ &

0 :5; ! 0 "C V

&-,'

K C 3 ! 0 " & +

! >

0 < % ? 0 .

:5; 4 :5;9 ! C C

"C C

C &4 D ,''(\ # (JJ1\ 5 D (JJ.9& *

$ > # !

K > D 0 C $

D 45 D ,'',9&

# > S C > :5; C" >

; C K +5G

S "

4; Q (JJJ9&

(5C > ! $& % &% , $& 8- %$ -. % $& /

; (J@J > Z

C" ! "

C > C S , 0 W(

! 6* "C C 4W (J@J9

! C >

D - W&

C " 5#α 6* C 0 >

4; (JJ-9& 0 C"

C ! ; ^ A U (JJ2 D

> >

&-,(

+ C"

> V > C" 0

> ! B %

4D %RRC '(& & & 8R R R D a &D 9

@89 ;) I ! $ C"

C G 8 (JJ2& * V

D C C C

> & V M*

" &

> > * 5 6 !

! C"

! !E

D !

&-,,

* C" :5; 0 0 ! C >

F C

!E *

> !E

C C S ! D

# 6

# 6

,/

;5(5 AJ&- F &9

+ 0 :5; 4 9

> C" C 6* K

A ! " #

&

;5;5 AJ&- F # #D& "P #

(& 5 * >

0 :5;&

,& * C 0 "

$ &

-& A > C 6* *

1

,2

1

,.

*5(5 > & & ! $ # %&# $& #&9&, $ #

6 C K * ((

" A ,''' C *

!E 0 $ !E B

</ . " ? >

4D %RRC & &7 D & R RI # 8 9&

C" * !E 0 3

$ 3 G: I&

*5; > %G ,&%- $ #&EIQ% $ ; &, A % # $& $ $ #

6 > 6 :

4D %RR777& & & D& 9 !E " * ,* C Z

C 4 +5G 559&

D C > Z !E

3 : 5 > C

" $ K 3 !E

G: I 5*6 +I 4D %RR777& & & 8R R R R a 9&

*5*5 9&D 9 $& 9 , ## , # &- P?# # D 9- 9 $& #D 9 #- # & 8%$?9 # $&

* D K D C

' 2 ! ' (L 4 R 9 J 2 $ >

C _& C ( 2 !

1

,1

+ JJ 2L 4# 89 P * 0 4# 89 -%( 4 R 9 &

3 D ! ,@

C " & * C !

F D F C & 6 "

C $

& B" ! C C C

D K D > C &

C -' Z &

C C

, C B & C C B

D > > C ! C

C $  (2 ! C

C B 3 C (' & * 0 C

0 D V (@

+ 2 & + C 2 >

S ! D 0 !E

C$ & * C Z

(' & * C C

C K C Z (&2''

2 Z & C C @ '

C B C 0

B" ! & *

C C Z C Z (&2''

2 & * 0

C C >& * V

C "! C 0 C

, ' C B ),'b 0

1

,@

* V " 0 $C F C

> 3 D C C " &

> 3 ,( -' C 0

C B & * F >

S 0 C 45: #*9 (L

C C ' '1# , $

B" & * F C

Z ! $C R F

$C C D $ !

3 F & F

C 3 D &

*5=5 9&D 9 $& R, % # %-&%$ 9 , ## , # ,&- P?# #

* F >

; K 4 D 9 < ?&

C > ! B 1'L&

,' C B

0 & F C + JJ 2L 4# 89

& 0 C B C 3

F & * D C" F !

0 & *

C B 0 D

C 3 0 & * F C

C" -'

C C -1b $B $ "

1

,J

:+#5* (L 3 !

C$ &

F C 0 )1'b

B & 6 F $

0 &

> F

+ JJ 2L 4# 89 D ! C

!E &

* F >

1

-'

@89 * I ! $ 0

$ C B F C$ ) *

D F > A& *

D K D &

$ P " C B 0 D

C C & G

C !

C B & * F C$ 0

1

-(

*5B &#-& $& @ 8- % ! & 8 9 ,&$ $ D 9 & - % #

3 D ! S 0 C B

$ >

0 & +

"C

C" 0 & + ! 3

& C >

" ! G (%

& - % 9A $9

-# & 4 *9 #

) 4; A9 6

- 4 6*9

0 ) * 4 +* :9 A

A& ) A >

&

> 0 C B C C

> 3 ,@ C & * C

C / C B

& * 0 C B C

! ! ! C

C (''µ R & + C !

! 5 2L & * C D >

1

-,

C - "! &

C C (''' 2 & *

C C C

' @ C B & * S C >

F & *

F C 45: #*9 (L C C ' '1#

, $ B"

& * F C

Z $C

! 0 "

&

*5'5 9 - D @&, $& 8- %$ ,.- $ M O

* F C$ C ; 4U 9

' ,# -' Z & * F C $

C 4 ;9,45: #*9 2L 4 R 9

D 22b (' & *

F C $ B

55 ,H 0 D

22b (' & + F C > $

# _ % /L 45: #*9 C C

1' # ; . @ 4/ @ 6 ; /c / 2 Q,; /R(A ;, 9& + ,

D Z & * F C $

1

--*5+5 S-9 ! $& $& %&# $& 0 1

6* * C > _:* +6 (''

4_:* +69 3 0 C K &

B 6* 0 4#

& (J@J9 D &

* K 0 6* * ! 3 C C

2 A 4AV 9

C (, 2 R & + ! C -1 b

,('I # B (/ (. D & >

( ('' C

= 2''

S (. D & * C



2'

C /2'' /b ,' 0

& * C C > "!

< ? B"

U B (' G ; 2' #R+ G* (' #R ; @

> I6* 4A C G D 9 C (''µ R & *

(' ' ,# 6 ;R(L5 5&

; > V ! >

2 & * C

(' >

$ 4U 9 -# C D & ; >

V D

(2 & 5 C 1&2'' /b -'

"! $B

1

-/

_:* +6 ('' 4_:* +69 3 > 0 5" +*+ 4

9 / _ G d2' # # 5\ ' 12# 6 ; 1 '\

(2L: 4 R 9\ ( 2L G B ('' 4 R 9e& f ! C

"! 6* * & * C

(' _ d2' # # 5\ (# 6

;1 '\ (2L: 4 R 9e& + C >& C 6*

* C " > ' @ _

d2' #G ; A ;@ 2\ ( ,2# 6 \ (2L: 4 R 9e Z .2b & +

C 2 > S ' @ A D

( 2 & * ' @ C

2.'µ 4U 9 6* " &

V C D >

C Z (2&''' -' /b & * C C

"!

B (''µ + 4# 89 1'L & I

C S C

C > ! "! B 6*

& * C 6* C

C $ > C # _& 5

> C C 0

,.' ,@' C 3 C

6* B -''µ R &

*5C F ! $ &S-9 "$

6* B " C > D >

111 2 1 V C ! !

1

-2

G (

6* * ,* ) -µ4JJ' 6*9\

111 && ('H (µ \

5* ('µ RµA ) ' (µ

P # _ 0 !& & & ('µ ) / Jµ

# B"

+ > 1114A C D g9) ( 'µ

: -1b , D

G ,

6* * ,*) -µ 4JJ' 6*9\

2 1 && ('H (µ \

5* ('µ Rµ ) ' (µ

P # _ 0 !& & & ('µ ) / Jµ

# B"

+ > 6 14A C D g9 ) ( 'µ

: -1b , D

* S C ! 1'b (' &

! "! C C

' @L C > 2 : 111 > 6*

B " & * 6* C D C

+ " 0

& C C C F AM# 5N # -'/'

1

-.

*5)5 9 ! $& $& %&

6* * : I:#+

<A 5= ? 4 : R IA9 C & @''

6* * C C " ('µ ;, > 0

! (''b 2

C D , &

* C C S

6* %

,'µ < ? , 2H \

2µ 6G ('H (/ G \

(/µ ;, > I6* \

(µ > 3 4 /' Rµ\

* C 2'µ C D > B"

C -1b -D & * C

! .2b (' & C

C C &

6* S

%

(/2µ ;, > > \

1/µ 6 2#\

,µ 6* 5 45: #*9\

,µ 6* K 5 D \

/.1µ + JJ 2L 4#+I Q9 C ),'b \

+ C D > B" +IG #*G#UR &

D : U B& * C C Z

1

-1

C > C & A"! C

C ,'

& C /'µ C

4: 9 C & + 6*

C C /b 0 > &

*5(<5 &#% -89 ! $ 9 $

/2µ C B 45: #*9 -'L 4 % 9

(2µ 55 ,'H & -'µ

,'µ 6*

C &4: 9 + C D >

B" & C ! 12b

(' 6* -1b -'

Z F C$

6* 0 &

*5((5 &#% -89 ! $ R, % %-&%$ 9 , ## , # ,&- P?# #

C S %

( ) 55 ,H ;(, 2

2 55 ,'H \

/2 ;, > \

1

-@

, ) 1'L

-2 JJ 2L 4#+I Q9\

(2 ;, > \

- ) (''L

2' JJ 2L 4#+I Q9\

> S

F ( 55 ,H ;(, 2 / 2 & +

F C C , 1'L 2 &

C F C C - (''L C 2

& S F C Z

6* & G

C F 6* &

*5(;5 / A9 $ !

6* 2'µ

C Z F 0

C$ & * F C C C 4*

6 G#9 F V C

C 55 ,H C & + 3

C C C -1b C ,' D &

*5(*5 &-& ! $ % DT# / A9 $ !

* S C

%

1

-J

,' C 4: 9\

2 ! 55 ,'H \

,2 $ _\

, ) 55 ,H

(' ! 55 ,'H \

/' $ _\

- ) 55 ,H

(' ! 55 ,'H \

/' $ _\

/ ) G 6 4' (# 6 ; -R' (L: + *A9

2 ! (# 6 ; -4U 9\

' 2 ! ('L : + *A 45: #*9\

/2 $ _\

* ( , C D /,b -2 C

! S 0 & C C

! F D B

& * F C ( Z /,b (' & * C

F C C , 0 Z /, b

(' & * F C C - Z

! 0 C (' & F C C

/ Z (' &

C Z F V V 2'µ

1

/'

5 ! 42LA 69

2µ ! (# 6 ; -4U 9\

, 2µ (L: + *A 45: #*9\

,2µ ! ('L A 46 09

P # _\

(2µ P # _\

* F C C C C

2 F V 55 ,H&

G ! C C ! F B

F C B" C & f F V

C 2'µ 3 * :G

%

5 * :G 4 :G (%('' 6 2LA 9

2µ ! (# 6 ; -4U 9\

, 2µ (L : + *A 45: #*9\

,2µ ! ('L 46 09

$ _\

(/µ $ _\

(µ 3 :G 4 IA9\

* F C C C -1b

F V 55 ,H ( D & I C !

F C C "

> 6 4' (# 6 ; -R' (L

: + *A9& G C > Z & +

C B Z C < " ? !

F C > (,'

I # 2 & G > C "

C & B C B"

1

/(

C ,'µ C 4( C

5: #* c ' , C C ' (# ; 1 / c ' @ 5: #*9 (µ

C " 45: #*9 ' 2 R (,µ C / .

, C 4 * :R5: #*9 ' '2 R & F

" C D D

& I B F

B" F C /b F

V " -' &

_ K > F C

S &

*5(= > A#&9F ! 9 # TD $& 8 9&# Q% & D-89 $& , @&%#

* F C " AM# 5 H2(

! C

> F AM# 5 N # -'/'& + F

C & * C C

S :5 ('' B

C #: I 5 G : &

D !E ! C C

> N+:55 *B D !

C 0 C &

: C > F AM# 5

N # -'/' ! 0 C &

* C C S :5 /'' B & * C C

9

/,

9

/-=5(5 > & & ! $ # %&# $&

(J * !E 0

*

< ? C !E $ * & + (J

* C > > K !

* ,* ! ! G (&

& ! $& %&# $& & & % $ # 0 9-& (1

T$ @ ! $ %& $&%- $ $& $ %& T$ @ $

&% %L %- @

* (* ''@ (2 * )-( @ ;(11((2

;(11((/

(' *A.(/'1-;(11((2 *A.(21(2 *A.(21(2

* ,* ',( (1 * )@( J ;(@,-@1_;(@,-@@

<C ;,'(21J *A.(J--1

;(@,-@@

* -* '(. A '. * )./ -

;(@'/1-;(@'/1/

6R

* /* '(1 ; (/ * ).@ 1 ;(@('(2

;(@('(/

(< *A.(1J./ ;(@('(/ *A.(.('2 ;(1J(2'

* 2* ''- (J * )J (' ;(12-1(_;(12-1'

<; ;(12-1' *A.(/JJ(

;(1@'-/

* .* ',/ (/ * )J.;1 ;(@/(1@_;(@/(11

(B *A.,((-( ;(@/(1@ *A.,((..

;(@/,(-* 1;(@/,(-* ',@ : (- * )('J+1 ;(@21/(_;(@21/'

(( *A.,,.J' ;(@21/( ;(@2.22

* @* ',@ T '- * )(((+, ;(@2JJ@_;(@2JJ1

<+ *A.,,J/. ;(@2JJ@ ;(JJ/@2 ;,'@J@2

* J* ',J + (, * )((/ . ;(@.-JJ

;(@.-J@ (= ;,'-(,. *N.J/J2/ *N.J/J2, +5G2/ *A.,--/2 ;(@.-J@

* ('* '-( Q (, * )(,, . ;(@.../

9

//

& ! $& %&# $& & & % $ # 0 9-& ;1

T$ @ ! $ %& $&%- $ $& $ %& T$ @ $

&% %L %- @

* ((* '-- (. * )(-' @ ;(@1,2,_;(@1,2(

(; ;,'((1 *A.,/,'

;(@1,2 ;,('1(

* (,* '-1 ,( * )(/2 (( ;(@@J((

;(@@J('

<* ;,'@@/@ *A.,2@2'

;(@@J((

* (-* '-1 + ,- * )(/2 (, ;(@@@@J

;(@@@@@ <= *A.,2@,@ ;(@@@@J *A.(-,,J ;(1.,1' ;,'1J-1 ;,'.'-J

;(1J1'-* (/;(1J1'-* '-@ (( * )(2(;. ;(@J.2/_;(@J.2- <B% *A.,/2-2

*A.,.2J(

;(@J.2-* (.;(@J.2-* ''2 '1 * )(J / ;(1.'22

;(1.'2/ (* ;,'(-'- ;,'/'1-;,'22@/ ;,'JJ1/ *A.(,JJ2 ;,''@--;(1.'22 *A.,.2,1 ;(@J2@J ;,'/@.. ;,'.,,1 ;,'J./' ;,'1/,2 ;,'@,/@ ;,'(1-1 ;,'[email protected];,'@.-J

* (1* ''2 ,' * ),';(' ;(1.,J-_;(1.,J,

(+ *A.(-,2( ;(1.,J, *A.(,.(. ;(12..1

* (@* ''J ,/ * )-.;(, ;(112',

;(112'-<) *A.(//.,

;(112'-* (J;(112'-* 6R * )(2.*J 6R

A& ) I * >

0 :5;& * C >

A ! " # 4A #9 >

C

4< 8?9&* * ! &

9

/2

6 C / ! $ I # 8

!E " B * ,* ! C

! & 6 C

> > C S %

Repeat Annotations

SW perc perc perc query position in query matching repeat position in repeat score div. del. ins. sequence begin end (left) repeat class/family begin end (left) ID

180 0.0 0.0 0.0 AL619337 91 110 (622) + (ATG)n Simple_repeat 2 21 (0) 1

Masked Sequence:

>AL619337

ERROR: undefined OFFENDING COMMAND: d

STACK:

[-string- -string- -string- -string- -string- -string- -string-

-string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -string- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- -null- ]