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Masque utilisé

No documento Transport électronique dans l’ADN (páginas 135-139)

Chapitre III Dépôt d’ADN

II. Surface à contraste chimique

II.2. Objectif

II.3.2.2. Masque utilisé

Le masque que l’on a utilisé est représenté sur la figure III.05. On a des carrés de 100µm de coté. On a une densité variable de petite carrés à l’intérieur de ces carrés de 100µm.

La résolution du scanner ne permet pas de distinguer les détails dans les ouvertures. On ne voit que des motifs de 100µm. On s’attend à avoir un niveau de fluorescence qui dépend du taux de couverture. En particulier on a 30% de couverture pour le deuxième et le troisième motif (cf. figure III.05) mais avec une répartition différente. Cela nous permet de vérifier l’influence de la géométrie des motifs sur le greffage. Le taux de couverture du dernier motif est 12%.

effet on n’a pas à chercher longtemps les plus petits motifs. De plus, on sait sans ambiguïté si on est bien sur une zone correspondant au masque. En effet le scanner de l’AFM a une amplitude de 15µm dans le plan xOy. On peut donc observer le motif en entier. On ne mesure pas d’artefact.

-NH2

Hauteur 2.0nm

Figure III.06 : Etat de la surface après une ouverture dans la première molécule. Dans ce cas l’ouverture a été faite dans une couche silanisée amine. On trouve le double de la hauteur attendue.

SiO2

Figure III.05 : Le masque optique utilisé pour les tests de mise au point de la méthode de greffage avec contraste chimique. On a quatre motifs répétés quatre fois. Ce sont des carrés de 100µm de coté composés de carrés de plus petite taille. La couverture dans chaque carré par rapport au plus grand est de 30%, 30% et 12%..

100µm

30% 30% 12%

-NH2 –CF3

La zone silanisée amine ne donne pas toujours du signal en fluorescence

-NH2 SiO2

?

Pas cohérent

Celui qui marche le mieux

-CH3 -NH2

La zone silanisée amine ne donne pas toujours du signal en fluorescence

-NH2 –CH=CH2

La zone silanisée amine ne donne pas de signal en fluorescence

SiO2 -NH2

La zone silanisée amine ne donne pas de signal en fluorescence

–CH=CH2 -NH2

Figure III.07 : Résultats représentatifs de tous les essais de greffage avec contraste chimique. La combinaison la plus reproductible est la silanisation méthyle puis amine dans les ouvertures. Pour toutes les autres combinaisons soit le silane amine ne s’est pas greffés, soit on a carrément l’inverse de la combinaison attendu (image barrée d’une croix). Les images encadrées en pointillé correspondent à ce qu’on attendait. L’échelle des couleurs est la même que celle de la figure III.03.

-NH2 -CH3

Matrice Ouverture

L’ensemble des résultats est résumé sur la figure III.07. La combinaison la plus reproductible est la silanisation pleine plaque du silane terminé méthyle, puis le greffage de l’amine dans les ouvertures.

Le désaccord principal que l’on observe sur certaines lames est que les zones silanisées amine ne donnent aucun signal en fluorescence, ou bien le signal n’est pas homogène sur la surface. En revanche les autres molécules donnent le signal attendu (correspondant au niveau de fluorescence du silane pleine plaque cf. II.3.1.). Il y a une exception pour le silane terminé méthyle qui a donné pour une lame un signal important alors qu’on attendait un niveau de fluorescence faible (i.e. une couleur sombre). Ces désaccords peuvent avoir comme origine la pollution de la surface. Elle provient en partie de la résine optique utilisée bien que ce ne soit pas la seule cause. Plusieurs observations vont dans ce sens. En effet, la solution contenant la rhodamine COCHO de l’IBL a cessé d’être active lorsqu’on y a trempé des lames sur lesquelles il restait de la résine optique. De plus, les lames traitées dans les bains de silanisation qui contenait d’autres lames avec de la résine optique n’ont pas donné de signal, suggérant un mauvais greffage de l’amine ou la consommation de la fonction amine par la résine optique. Par conséquent, avant chaque étape chimique, il faut prendre soin d’enlever toute trace de résine. Il est néanmoins difficile avec le peu d’expériences effectuées d’affirmer quelle est l’origine exact des désaccords dans les niveaux de fluorescence observés.

100µm

Figure III.08 : Contraste chimique obtenu sur une lame de microscope. La matrice est un silane OTS (terminaison méthyle). On a greffé un silane amine dans les ouvertures. Le niveau de fluorescence de chaque zone est en accord avec le niveau que l’on peut attendre pour un greffage pleine plaque. On

On donne sur la figure III.08 le résultat obtenu avec une matrice de silane OTS (terminaison méthyle) avec un silane terminé amine dans les ouvertures. On peut noter l’homogénéité du résultat. On trouve à peu près pour chaque zone le niveau de fluorescence mesurée dans le cas où la silanisation est pleine plaque. Le fait que cette combinaison marche le mieux provient certainement du fait qu’on a utilisé une couche d’accroche en polystyrène qui protège la surface de la pollution dû à la résine optique.

La figure III.06 représente l’état de la surface après l’étape de gravure du premier silane et après avoir enlevé la résine. On peut constater qu’il y a des débris sur la surface. La zone gravée est très bien définie. On passe en quelques nm du silane terminé amine à la surface de SiO2. La hauteur du film moléculaire est de 2nm. Cela correspond à deux fois la hauteur de la molécule utilisée. Ce n’est pas étonnant de trouver une hauteur plus importante pour le silane terminé amine puisqu’il a tendance à polymériser sur la surface [cf . chapitre II]

[Martel 2000].

On notera qu’on a moins de problèmes de pollution avec les résines électroniques : PMMA et Copolymère. En effet les tests de greffage de différents silanes donne une hauteur de la molécule en accord avec la hauteur attendue. Tous ces résultats sont donnés au chapitre II. En revanche, l’inconvénient de l’utilisation de ces résines est le temps d’écriture au masqueur électronique (plusieurs heures d’écriture avec la nécessité de travailler sous vide).

C’est pour cette raison que nous avons choisi les résines optiques.

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